TCMATHF:a bioinformatics platform to predict pharmacological action of drug and dynamic molecular changes against from myocardial infarction to heart failure.pdf
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1、中国药理学与毒理学杂志2023年9月第37卷增刊1Chin J Pharmacol Toxicol,Vol 37,Suppl 1,Sep 2023sioninjury;cardiacmicrovascularendothelialcells;network pharmacology;molecular dockingFoundationitem:NationalNaturalScienceFoundation of China(82030124);National Natural Science Foundation of China(82174015);Science and Technol
2、ogy Innovation Project of ChinaAcademyofTraditionalChineseMedicine(CI2021A04609)First author:Cao Ce,E-mail:Corresponding author:LIU Jianxun,E-mail:W2-4-2基于药理实验及网络药理学探讨冠心苏合胶囊治疗急性心肌梗死的作用机制钱 铭1,2,熊 媛2,程 龙3,杨 慧1,3(1.南京大学医学院附属鼓楼医院药学部,江苏南京 210008;2.中国药科大学附属南京鼓楼医院,江苏 南京 210008;3.南京中医药大学附属南京鼓楼医院,江苏 南京 21000
3、8)摘要:目的 使用药理学实验结合网络药理学揭示冠心苏合胶囊(GXSH)治疗急性心肌梗死(AMI)的药效作用及靶点机制。方法 构建异丙肾上腺素诱导的AMI小鼠模型,灌胃给予GXSH(0.5,1和2 mgkg-1),观察各组小鼠心脏组织病理学变化,检测肌酸激酶(CK)、肌酸激酶同工酶(CK-MB)、乳酸脱氢酶(LDH)、肌钙蛋白(cTnT)、谷草转氨酶(AST)、谷丙转氨酶(ALT)的水平。通过TCMSP和ETCM数据库检索GXSH的化学成分,SwissTargetPrediction 和 GeneCards 数据库获取活性成分潜在靶点和AMI的靶点,构建“XSH活性成分-AMI靶点”网络,并于
4、DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析。结果 HE染色显示GXSH明显减轻AMI小鼠心肌组织损伤,降低CK、CK-MB、LDH、cTnT、AST 和 ALT 水平(P0.05)。网络药理学收集整理得到95个GXSH治疗AMI的潜在靶点,富集于流体剪切应力与动脉粥样硬化、AGE-RAGE 信号通路、氧化应激等信号通路。结论GXSH具有显著的防治AMI作用,其机制可能与调控流体剪切应力与动脉粥样硬化、AGE-RAGE信号通路、氧化应激等信号通路有关。关键词:冠心苏合胶囊;急性心肌梗死;网络药理学;作用机制基 金 项 目:国 家 自 然 科 学 基 金 青 年 项 目(82204720);中 央
5、 高 校 基 本 科 研 业 务 费(3332022085)作者简介:钱 铭,E-mail:通讯作者:杨 慧,E-mail:W2-4-3TCMATHF:a bioinformatics platform to predictpharmacologicalactionofdruganddynamicmolecularchangesagainstfrommyocardial infarction to heart failureXIYujie1,2,TANGXuan1,GUOFeifei1,YANG Hongjun1,2,3(1.Institute of Chinese Materia Medic
6、a,ChinaAcademy of Chinese Medical Sciences,Beijing100700,China;2.Beijing Key Laboratory of Traditional Chinese Medicine Basic Research on Prevention and Treatment for Major Diseases,Experimental Research Center,China Academy of Chinese Medical Sciences,Beijing 100700,China;3.China Academy of Chinese
7、 Medical Sciences,Beijing 100700,China)Abstract:OBJECTIVETo investigate thecharacteristics and regulations of medication indifferent stages of disease by constructing adynamic disease network and a cellular featurenetwork spanning from myocardial infarction toheart failure.METHODSBased on transcript
8、ome and single-cell sequencing data from amouse model of left anterior descending coronary artery ligation,a dynamic early-middle-latenetwork and cellular feature network were constructed by integrating differential gene expression trends and biological functions.The robustness of the perturbation e
9、ffect of traditional Chinese medicine(TCM)on the disease networkwas calculated based on multi-target TCM,andwe acquired the foundational data by analyzingthe results of effectiveness.The predictive platform was scrutinized and assessed with regardsto the functional attributes of FDA approved-drugs a
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