植物抗寒基因及ICE-CBF-COR信号转导研究进展.pdf
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1、引用本文格式田 一 粟,姜 明,张 启 宇 植 物 抗 寒 基 因 及 ICE-CBF-COR 信 号 转 导 研 究 进 展 J 农 业 工 程,2023,13(5):131-137 DOI:10.19998/ki.2095-1795.2023.05.024 TIAN Yisu,JIANG Ming,ZHANG Qiyu Progress on cold resistance genes and ICE-CBF-COR signaling inplantsJAgricultural Engineering,2023,13(5):131-137植物抗寒基因及 ICE-CBF-COR 信号转导研
2、究进展田一粟,姜明,张启宇(中国农业大学烟台研究院,山东 烟台 264670)摘要:包括冷胁迫和冻胁迫在内的低温逆境胁迫是造成农作物减产的主要因素之一。研究转录因子 CBF 调节的植物低温应答途径对于揭示植物面对低温胁迫时的分子反应有重要意义。针对植物抗寒基因及 ICE-CBF-COR 信号通路的研究,从植物抗寒基因、信号通路和激素与组蛋白调控等多个方面对当下植物抗寒基因的研究进展进行了综述,表明 ICE-CBF-COR 是不同转录因子、调控因子、蛋白质、生理因子和其他操纵因子相互作用以增强冷胁迫的中心途径;同时也发现ICE-CBF-COR 信号通路在针对植物生长发育、花期调节、保鲜贮藏和遗传
3、育种等相关研究中同样起着至关重要的作用,并对未来研究与发展的前景进行了展望,以期为植物抗寒基因的研究提供参考与理论支持,同时也为植物的生长发育、花期调节、保鲜贮藏和遗传育种提供理论指导。关键词:ICE 基因;CBF 基因;COR 基因;低温胁迫;ICE-CBF-COR 信号通路;激素调控;组蛋白修饰中图分类号:S184文献标识码:A文章编号:2095-1795(2023)05-0131-07DOI:10.19998/ki.2095-1795.2023.05.024Progress on Cold Resistance Genes and ICE-CBF-COR Signaling in Pla
4、ntsTIAN Yisu,JIANG Ming,ZHANG Qiyu(Yantai Institute of China Agricultural University,Yantai Shandong 264670,China)Abstract:Low temperature stress,including cold stress and freezing stress,which is one of the main factors causing crop yield reduc-tionIt is of great significance to study low temperatu
5、re response pathway regulated by transcription factor CBF for revealing molecularresponse of plants to low temperature stressResearch progress of plant cold resistance gene and ICE-CBF-COR signal pathway was re-viewed from plant cold resistance gene,signal pathway,hormone and histone regulation and
6、other aspectsResults showed that ICE-CBF-COR was central pathway for interaction of different transcription factors,regulatory factors,proteins,physiological factors andother manipulation factors to enhance cold stressAt the same time,it was also found that ICE-CBF-COR signal transduction pathwayals
7、o played a crucial role in plant growth and development,flowering period regulation,fresh storage,genetic breeding and other re-lated research,and prospect of future research and development was prospectedIt is expected to provide reference and theoretical sup-port for research of plant cold resista
8、nce genes,and also provide theoretical guidance for plant growth and development,flowering peri-od regulation,fresh storage,genetic breedingKeywords:ICE,CBF,COR,cold-acclimation,ICE-CBF-COR signaling pathway,hormone regulation,histone modification 0引言由于自然环境的恶化,天气变化无常,如出现异常低温或者高温情况,给农作物的生产带来巨大的伤害。受低温
9、连阴雨极端天气的影响,2015 年安徽省近万亩水稻减产绝收,造成巨大损失,暴露出农业靠天吃饭的弱质性1。为了应对低温造成的减产影响,一般是采取保温措施2。但这种解决办法比较被动,不能从根本上应对低温。因此研究包括农作物在内的植物抗寒基因有重要的意义,可以提高农作物的抗寒性,从而降低低温减产的影响。国内外研究人员对此开展了研究工作,取得了很多的成果。为了更全面地了解植物抗寒基因,以及相关的研究进展,本研究对近几年国内外植物抗寒基因、相关的信号通路及其调控因 收稿日期:2022-10-16修回日期:2023-01-19作者简介:田一粟,本科生,主要从事植物逆境生理、水产养殖研究E-mail:张启宇
10、,通信作者,硕士,讲师,主要从事数字渔业、休闲渔业、农业信息技术研究E-mail:第 13 卷 第 5 期农业工程Vol.13No.52023 年 5 月AGRICULTURAL ENGINEERINGMay 2023子等研究成果进行综述,以期为植物抗寒基因的研究提供参考与理论支持,同时也为植物的生长发育、花期调节、保鲜贮藏和遗传育种提供理论指导。1植物抗寒性研究背景 1.1植物低温胁迫信号转导低温作为主要逆境因子之一,影响植物的生长及地理分布,严重时会造成植物的死亡。冷胁迫和冻胁迫也是造成农作物减产的主要因素之一。而当植物面临非生物环境胁迫时,植物体会产生一系列相应变化来应对外界的不良环境。
11、如在遇到低温和冷害时,植物体内的低温信号响应通路会使植物发生一系列生理生化变化,让植物体的生长减缓,从而有利于面对低温胁迫时进行抵抗。植物冷诱导基因(COR)是由冷胁迫调节的一类基因,能在某些特定的条件(低温、短日照等)被激活以产生冷调节蛋白,进而提高植物的抗寒性。研究发现,COR 基因启动子区域中有与低温胁迫有关的脱水响应性元件(DRE)的顺式作用元件(CRT),部分 COR 基因依赖 C-环肽结合转录因子(CBF)激活,即通过 ICE-CBF-COR 信号通路,使 CBF(C-repeatbinding transcription factordehydrate responsive el
12、ementbinding factor,DREB)与启动子区上的 CRT/DRE 顺式作用元件特异性结合激活抗寒反应3。C-环肽结合转录因子表达诱导剂 ICE(inducer ofCBF expression)位于 CBF 冷响应通道上游,是冷诱导基因之一,在冷胁迫或冻胁迫下,能够作为转录因子与 CBF3 的启动子特异结合,诱导 CBF 的表达,从而提高植物的耐寒性,而 CBF 基因是植物 CBF 抗冷途径的枢纽,主要通过调控下游相关抗冷基因的表达,增强抵御寒冷的能力。由于依赖转录因子 CBF 调节的信号途径是当下调控机理最为大家熟知的植物低温应答途径,因此也将其作为重点关注的内容之一。虽然目
13、前对 ICE-CBF-COR 的作用效果与部分机制的相关研究与解释已比较充分,但对于影响信号通路的具有包括正向激活作用与反向抑制作用在内的不同调节因子的作用,仍然还在很漫长的不断探索的过程之中,而基于此的探索可以促进对转录水平和翻译后水平上对 CBF 介导的冷信号通路的理解。1.2ICE-CBF-COR 信号通路CBF 调节的信号途径是目前调控机理揭示最为清楚的植物低温应答途径。低温信号通过激活转录因子,调节下游冷反应基因(COR)的表达,从而启动植物的抗寒反应。低温信号的转导也至少可通过依赖和不依赖 CBF 两种途径实现。已经证实了使植物产生低温抗性的主效途径是依赖 CBF 的冷信号转导通路
14、,使得ICE-CBF-COR 信号通路成为研究的热点之一4。1.3组蛋白修饰为提高植物抗寒性提供可能在染色质上的组蛋白尾有多种位点上的修饰,组蛋白的 N 端尾部突出在 DNA 环流之外并表现为各种共价修饰的底物,包括磷酸化、乙酰化、泛素化、ADP核糖基化、生物素化和甲基化等5。组蛋白的修饰一般不能单独地起作用,需要组蛋白尾部的不同修饰组合共同调节,形成修饰的级联6。可作为一种重要的表观遗传学标志。组蛋白的磷酸化在 DNA 损伤、DNA 修复、DNA复制和重组等基因的复制与修复上发挥着重要作用7-8。而组蛋白的乙酰化与去乙酰化在真核生物调控转录的起始和基因的延伸中起着重要的作用7,9。组蛋白的甲
15、基化是在赖氨酸和精氨酸上的共价修饰作用,复合物中,往往通过组蛋白和相关 DNA 的共价修饰来修饰染色质。不同位点甲基化及甲基化的不同程度会引发不同的效应。在基因表达的激活、抑制或者是延伸中都能够起到一定的作用。而对于相关基因,任何修饰都不能单独地作为表达状态的指标5,10-12。针对组蛋白修饰的研究已有许多显著的成果,作为重要的表观遗传学标志,对其的深入研究有着重要意义。2植物低温胁迫分子研究基础 2.1冷响应基因控制植物抵御低温胁迫越来越多的证据表明,大多数的冷胁迫耐受性是在 CBF 的靶点,即 COR 基因影响下表达产生的。目前,植物已经获得高度复杂的系统来应对寒冷的胁迫。为了稳定植物细胞
16、膜免受冻伤,部分植物会产生一系列生理生化变化,如钙离子流入、细胞骨架重排、控制冷反应基因转录、调节激素水平和反应、产生超氧化物歧化酶(ROS)及重塑表观遗传修饰等方式13-14。2.2植物低温胁迫下转录因子 2.2.1ICE 基因ICE 基因属于螺旋环螺旋(bHLH)转录因子家族,用以调控冷调控基因的表达,主要的分子功能是与 CBF 基因的下游结合。ICE 基因的同源物在小麦中已被鉴定为两种不同的 CBF 表达诱导剂 TaICE41 和 TaICE87。在拟南芥中过表达 TaICE41 或 TaICE87,能够增强其在冷适应下耐低温的能力,与冷调节基因的表达较高有关。这也表明了 ICE 同源物
17、在冷胁迫响应中具有重要意义15。2.2.2CBF 基因CBF 基因是一类含激活增强子结合蛋白 2/乙烯反应因子(AP2/ERF)结构域的转录因子,是由 3 个转录激活子(CBF1-3)组成的,CBF 基因本身是由寒冷诱 132 农业工程农学与生物技术 导的,存在于冷响应基因的启动子中,并诱导其转录。其转录网络在拟南芥等植物的冷适应中起着关键作用16。在 CBF 家族中,关于不同转录激活子发挥的作用,不同人有着不同的看法。研究表明,每个 CBF 转录因子在冷适应中起重要且等效的作用17-19。CBF2 对 CBF1和 CBF3 表达有负调节作用,CBF1 和 CBF3 的调控方式与 CBF2 不
18、同,CBF1 和 CBF3 并不参与调节其他 CBF基因,而是通过激活相同的 CBF 靶基因子集来调节冷适应20。通过 TaCBF14 和 TaCBF15 在大麦、小麦中表达的试验发现,CBF 基因能够显著提高转基因植物的耐寒性,是提高植物耐寒性的关键成分,一定程度上也具有平衡耐寒性和植物生长的作用21。而因为CBF 基因家族在染色体上的分布位置相近,具有较高的同源性,所以诱导 CBF 基因过表达,虽然会提高转基因植株的抗冻能力,但在一定程度上也会抑制其生长。2.2.3COR 基因COR 基因一般是指由冷调控基因编码的保护性物质。COR 基因蛋白和蔗糖、甘氨酸、甜菜碱及脯氨酸渗透液的积累,有助
19、于在冷应激期间维持植物细胞中膜和细胞器的完整性。包括渗透蛋白和低温保护蛋白在内的这些保护物质的积累能够促进冷适应和耐冻性的提高。VOGEL J T 等22在 2005 年首次发现了非 CBF 基因蛋白调节的 COR 基因,并且发现拟南芥锌指蛋白(ZAT12)转录因子能够调节 24 个 COR 基因,包括 9个冷诱导基因和 15 个冷抑制基因。证明有部分 COR基因的诱导与表达是不通过 CBF 作为媒介的途径实现的。但不足之处是至今对非 CBF 介导的信号转导途径的研究一直不够深入,仍有较大的研究空间。2.2.4MYB 转录因子大家族MYB(V-myb avian myeloblastosis
20、viral oncogenehomolog)转录因子大家族在植物的低温胁迫响应中也发挥着相对重要的作用。研究人员将 MYB 转录因子从耐低温的甘蔗中分离并转入到烟草,能够显著增强烟草对低温胁迫的耐受性,跨膜螺旋结构蛋白 HHP 蛋白的合成也可通过 MYB96 诱导,并与 CBF 基因上游调控因子相结合,激活 CBF 途径,促使相关基因表达23-24。2.2.5其他参与植物低温应答调控的转录因子还有钙调蛋白结合的转录激活子(CAMTA)、NAC(矮牵牛无顶端分生组织 NAM、拟南芥结构域转录调节超家族蛋白ATAF1、ATAF2 和杯状子叶基因(CUC2)、维管植物锌指蛋白(VOZ)、WRKY 转
21、录因子、锌指蛋白(ZFP)及乙烯不敏感 3(EIN3)等。其中,WRKY转录因子是极为重要的调控蛋白家族,也是 ABA 响应信号网络中的关键节点25。3基于 ICE-CBF-COR 信号转导途径的分子水平调控 3.1ICE-CBF-COR 信号通路大量的试验发现,植物低温响应信号通路重要的转录激活因子主要有 ICE1、ICE2、CBF1-3 和 MYB15,而下游的 COR 基因家族、脱水素家族蛋白 ERD10、脱水素家族蛋白 ERD14 及干燥反应蛋白 29A(RD29A)等是该信号通路中重要的功能应答基因26。3.1.1ICE 元件:CBF 分子信号监督者ICE 基因在上游起作用,诱导和调
22、节 c-重复序列结合因子(CBF)的表达27。ICE 基因编码冷信号通路上游的转录因子。ICE 的bHLH 结合域可以与下游的冷调控基因发生特异性的相互作用。ICE 携带保守的 bHLH 结合域,其在碱性区域的氨基酸序列与其他 bHLH 蛋白高度相似。用于与下游冷调控基因的特异性相互作用。其蛋白能够通过与脱水响应性元件结合蛋白(CBF3/DREB1A)启动子中的顺式元件结合,诱导 CBF/DREB1 调控因子发挥作用7,28。3.1.2CBF 元件:信号转导关键指挥官CBF(CBF1、CBF2 和 CBF3)属于 AP2/ERF 多基因家族,可在植物的冷信号通路中被 ICE 激活。CBF依赖型
23、通路是目前研究的比较透彻的冷信号通路,主要是依靠 ICE1-CBF-COR 途径实现27,29。CBF 依赖型通路中,当植物在低温环境下时,CBF 上游的 ICE1 转录因子会增加表达量,从而促进下游的 CBF 基因的转录,随着 CBF 的增加又会促进下游的 COR 基因的表达。而在大麦中通过过表达 TaCBF14/TaCBF15 能够增强大麦中冷调控基因 HvCOR14b 的表达,增加耐寒性21。这也说明 CBF 既能被 ICE 激活,同时又能够激活 COR基因的表达,在信号通路中有着不可替代的关键作用。3.1.3COR 元件:冷适应环节的重要执行者CBF2 和 CBF3 通过调节不同的下游
24、 COR 基因集,在指导冷反应方面起着更重要的作用。超过 2/3 的 COR基因由 2 个或 3 个 CBF 共同调节,主要参与细胞信号转导和代谢过程;不到 1/3 的基因受 1 个 CBF 调控,上调基因在冷相关非生物胁迫反应中得到富集30。CBF 与 COR 基因启动子中的 CRT/DRE 序列结合,可以在应对低温胁迫时直接进行转录激活16。COR 相关基因只在受低温诱导后才能表达,抗寒能力也随之出现和提高。在模式植物拟南芥低温胁迫试验中发现了多个 COR 基因如 COR15a、COR78、COR47 等31。3.2植物激素通过信号转导途径参与冷适应调节一些研究也表明,ICE1-CBF-C
25、OR 转录级联可能在 田一粟等:植物抗寒基因及 ICE-CBF-COR 信号转导研究进展 133 冷胁迫过程中整合如碳水化合物的积累、ROS 的清除和整合的植物激素信号通路等应激反应通路,以促进叶片耐冻性的改善。3.2.1脱落酸:COR 正向诱导剂脱落酸(ABA)是重要的植物激素,在植物适应生物和非生物胁迫中起着重要的作用32。拟南芥中ABA 缺陷突变体在诱导 COR 基因表达的过程中也出现了部分问题,缺乏 ABA 时,植物在抗冻性方面也存在有一些缺陷,表明了 ABA 作为一种植物激素参与了冷信号传导过程并在其中发挥着一定的作用33-34。3.2.2乙烯:CBF 转录激活因子试验表明,过表达小
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