中华绒螯蟹甲壳肽EsCrus3和EsCrus4表达模式与免疫功能.pdf
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1、doi:10.7541/2023.2023.0076中华绒螯蟹甲壳肽EsCrus3和EsCrus4表达模式与免疫功能陈剑平1,2 冯广朋1,2*李新苍1,2*(1.上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306;2.中国水产科学研究院东海水产研究所,农业农村部东海渔业资源开发利用重点实验室,上海 200090)摘要:研究从中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)中克隆并鉴定了两个型甲壳肽(Crustin)基因,分别命名为EsCrus3和EsCrus4。随后通过生物信息学、基因表达分析、蛋白表达与纯化、免疫功能验证等研究手段,分析了这2个新型抗菌肽的表达、结构和功能。EsCrus3的c
2、DNA序列全长567 bp,开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)为351 bp,编码116个氨基酸(Amino acid,aa);EsCrus4序列全长743 bp,ORF区288 bp,编码95个aa。两者都含有信号肽、富半胱氨酸的结构域(Cysteine-rich region,CRR)和WAP(Whey acidic protein)结构域。EsCrus3和EsCrus4氨基酸序列的一致性仅为30.77%,并且进化分析显示EsCrus3和EsCrus4分别位于两个具有分类意义的分支上,提示两者生物学功能可能存在差异。EsCrus3和EsCrus4均在卵巢中高度表达且
3、具有相似的表达水平,在金黄色葡萄球菌(Staphyloccocus aureus)和嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)刺激时呈上调表达趋势,其中EsCrus3响应速度更快,在刺激2h时上调表达,EsCrus4则在刺激后1224h时显著上调。重组蛋白EsCrus3和EsCrus4对革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌和真菌均具有不同程度的结合活性,并且对不同微生物多糖结合活性也存在明显差异。EsCrus3对革兰氏阳性菌的肽聚糖(PGN)和脂磷壁酸(LTA)具有很高结合活性,对革兰氏阴性菌的脂多糖(LPS)和真菌-葡聚糖也有一定结合活性,而EsCrus4只对PGN具有显著结合活性。上述
4、研究结果表明EsCrus3响应病原刺激更迅速、与病原多糖结合能力更强,提示其在卵巢的免疫防御体系中发挥更重要作用。此外,EsCrus3和EsCrus4序列和功能的差异为新型药物的挖掘提供了基础数据。关键词:抗菌肽;型Crustin;表达分析;结合活性;中华绒螯蟹中图分类号:Q344+.1 文献标识码:A 文章编号:1000-3207(2023)11-1838-11 中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis),俗称河蟹、大闸蟹,是我国水产养殖主要养殖对象之一。与其他无脊椎动物类似,中华绒螯蟹依靠先天免疫系统抵御病原微生物的感染1。抗菌肽是无脊椎动物免疫系统的重要效应因子,在清除宿主体内病
5、原微生物过程中发挥关键作用2。甲壳动物抗菌肽主要包括甲壳肽(Crustin)、抗脂多糖因子(Anti-lipopolysac-charide factor,ALF)、对虾素(Penaeidin)及溶菌酶(Lysozyme)等家族3。甲壳肽家族为富含半胱氨酸的阳离子抗菌肽,分子量大小在714 kD,序列N端含有信号肽序列,C端含有乳清酸性蛋白(Whey acidic protein,WAP)结构域4。WAP结构域内含有8个保守的半胱氨酸,可形成四对二硫键,又称为“4DSC”结构域,其在分子内部形成1个疏水核心5。在不同甲壳肽信号肽序列和WAP结构域之间的区域常存在序列和结构差异,根据该区域结构模
6、式不同,将甲壳肽分为五种主要类型6。甲壳动物中常见型,型甲壳肽则主要存在于膜翅目昆虫中7。1个物种通常含有多个甲壳肽分子,呈现多样的生物学功能。例如,拟穴青蟹(Scylla paramamosain)中已报道8个甲壳肽基因,其中5个型甲壳肽810,3个属于型甲壳肽1113,它们大多数具有微生物结合活性,并具有抗细菌、真菌和病毒的功能。中华绒螯蟹中第 47 卷 第 11 期水 生 生 物 学 报Vol.47,No.11 2023 年 11 月ACTA HYDROBIOLOGICA SINICAN o v.,2 0 2 3 收稿日期:2023-03-06;修订日期:2023-04-18基金项目:国
7、家自然科学基金面上项目(31972795);上海市中华绒螯蟹现代农业产业技术体系项目(沪农科产字2017-4号);中国水产科学研究院基本科研业务费(2020TD41)资助 Supported by the National Natural Science Foundation of China(31972795);Shanghai Chinese Mitten Crab Modern Agricultural Industrial Technology System Project(Hu Nong Ke Chan Zi 2017-4);theCentral Public-Interest Sc
8、ientific Institution Basal Research Fund,CAFS(2020TD41)作者简介:陈剑平(1992),男,硕士研究生;主要从事河蟹生理与免疫学研究。E-mail:通信作者:冯广朋,男,博士,研究员;E-mail:F 李新苍,男,博士,研究员;E-mail:*共同通信作者也有2个型甲壳肽14,15和2个型甲壳肽16,17被报道,参与不同免疫反应。此外,对虾中也发现了大量具有抗微生物功能的甲壳肽分子 1820。卵巢是雌性中华绒螯蟹的生殖器官,对中华绒螯蟹的繁育和养殖具有重要意义。本研究将通过生物信息学分析、基因表达分析、蛋白表达与纯化、免疫学功能验证,从中华绒
9、螯蟹卵巢组织中鉴定2个型甲壳肽分子,分析其免疫相关功能,明确这2个抗菌肽的功能差异及作用,丰富甲壳动物生殖系统免疫理论。1 1 材料与方法 1.11.1 实验材料中华绒螯蟹中华绒螯蟹亲蟹,购于江苏省高邮湖,雌蟹(97.0311.09)g,雄蟹(125.0310.38)g,于实验室养殖缸中暂养1周温度(203),pH 8.10.4,适应实验环境。实验前挑选附肢完整,体表无损伤,活力强的个体作为实验对象。菌株和载体实验中所用菌株均为本实验室保藏或购买,9种保藏菌株包括3种革兰氏阳性菌:金黄色葡萄球菌(Staphyloccocus aureus)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)和
10、巨大芽孢杆菌(Bacil-lus megaterium),5种革兰氏阴性菌:大肠杆菌(Es-cherichia coli)、嗜水气单胞菌(Aeromonas hydro-phila)、溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)、副溶血性弧菌(Vibrio parahemolyticus)和哈维氏弧菌(Vibrioharveyi),1种真菌:白色念珠菌(Candida albicans)。大肠杆菌DH5和DE3感受态细胞购于北京全式金生物技术有限公司。所用pMD19-T载体购于TaKaRa公司(中国大连),pET-32a表达载体购自Novagen公司(德国)。主要试剂与设备RNAiso
11、 Plus、反转录试剂盒、LA Taq酶、质粒提取试剂盒、TB GreenPremix Ex Taq酶、T4连接酶、限制性核酸内切酶购于TaKaRa公司;胶回收试剂盒购于北京全式金生物技术有限公司;DNase I为Promega(美国)公司产品;氨苄青霉素(Amp)、异丙基-D-硫代半乳糖苷(IPTG)购于上海生工生物工程有限公司;Ni-NTAHis Bind Resin购于Merck(美国);胰蛋白胨、酵母提取物、两种肽聚糖(PGN,来自于金黄色葡萄球菌和枯草芽孢杆菌)、脂磷壁酸(LTA,来自于枯草芽孢杆菌)、脂多糖(LPS,来自于大肠杆菌0111:B4)、-葡聚糖(来自于海带)和3,3,5
12、,5-四甲基联苯胺(TMB)购于Sigma(美国);其余试剂均为国产分析纯。主要仪器包括:梯度PCR仪(Eppendorf,Master-cycler X50s)、荧光定量PCR仪(Thermo,ABI Quant-Studio 6 Flex)、多功能酶标仪(TECAN,SPARK10)、超微量紫外可见光分光光度计(Thermo,NanoDropOne)、多功能成像系统(Bio-rad,Doc XRS+)及微孔板全自动洗板机(BioTek,50TS)等。1.21.2 实验方法样品采集与总RNA提取将中华绒螯蟹置于冰中麻醉,用含有预冷抗凝剂(0.14 mol/L氯化钠、0.1 mol/L葡萄糖、
13、30 mmol/L柠檬酸三钠、26 mmol/L 柠檬酸、10 mmol/L EDTA;pH 4.6)的无菌注射器从螯足基部抽取血淋巴,在4时850g离心15min收集血细胞,随后加入细胞裂解液吹打均匀,进行总RNA提取。取血后解剖中华绒螯蟹,采集心脏、肝胰腺、鳃、胃、肠、卵巢、精巢和肌肉组织,PBS(140 mmol/L氯化钠,10 mmol/L磷酸二氢钠;pH 7.4)洗涤23次后,加入细胞裂解液进行组织匀浆,离心后进行总RNA提取。总RNA提取步骤参考RNAiso Plus使用说明进行。cDNA合成将DNase 添加到总RNA中以去除样品中污染的DNA,琼脂糖凝胶电泳分析RNA完整性,超
14、微量分光光度计检测总RNA浓度和纯度。总RNA质量符合要求后,按照反转录试剂盒(PrimeScriptTM RT Master Mix)的使用说明合成cDNA。甲壳肽基因cDNA克隆通过对实验室测得的中华绒螯蟹转录组数据分析,获得2个甲壳肽样分子,随后使用Primer Premier 5.0软件在基因序列两端分别设计扩增引物(表 1),通过PCR扩增、测序验证基因序列。以中华绒螯蟹卵巢cDNA为模板,通过PCR扩增目的基因,反应体系参照LATaqTM Version 2.0 plus dye说明书配制:LA Taq酶25 L,灭菌水20 L,上下游引物各2 L(10 mol/L),模板cDNA
15、(200 ng/L)1 L。PCR反应程序:95预变性3min;94变性30s,53退火30s,72延伸40s,共35个循环;最后72延伸10min。获得的目的片段经过胶回收试剂盒回收纯化后,连接至pMD19-T载体,再转化到DH5感受态细胞内,送往上海生工测序。生物信息学分析利用软件Expasy(http:/web.expasy.org/translate/)预测EsCrus3和EsCrus4编码的氨基酸序列;软件BLASTP(http:/blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi/)分析EsCrus3和EsCrus4与其他物种甲壳肽蛋白的相似性。多重序列比对由DNAM
16、AN软件和GeneDoc软件生成。蛋白理论分子量(MW)和等电点(pI)基于在线软件Expasy(http:/web.expasy.org/compute_pi/)计算。在线软件SignalIP(http:/www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)用于预测11 期陈剑平等:中华绒螯蟹甲壳肽EsCrus3和EsCrus4表达模式与免疫功能1839蛋白信号肽21。MEGA 11软件用于分析不同类型甲壳肽间的进化关系。甲壳肽基因组织分布分析以合成的中华绒螯蟹不同组织cDNA为模板进行荧光定量PCR反应。20 L反应体系参照试剂盒(TB Green PremixEx TaqT
17、M)说明书配制:TB Green 10 L、ROX参比染料0.4 L、上下游引物各0.8 L(10 mol/L)、无菌水6 L、cDNA模板2 L;甲壳肽基因定量引物与内参引物见表 1。qRT-PCR程序设置如下:95 3min;95 10s,60 40s,40个循环;6095熔解曲线分析。所有实验均使用单独的模板并设置3次重复。利用公式2Ct分析EsCrus3和EsCrus4在不同组织的相对表达水平。病原刺激后甲壳肽基因表达模式分析为分析EsCrus3和EsCrus4是否响应病原菌刺激,本研究首先通过注射病原菌的方式感染中华绒螯蟹,随后通过qRT-PCR分析它们的表达模式,实验期间停止喂食。
18、实验组分别注射200 L的金黄色葡萄球菌 2108 CFU(Colony-Forming Units)或200 L嗜水气单胞菌(2107 CFU),对照组注射相同体积的PBS。在细菌注射后0、2h、6h、12h、24h及48h,每组的每个时间点分别随机挑选3只蟹,取卵巢组织提取总RNA,反转录后进行qPCR检测,通过公式2Ct分析22EsCrus3和EsCrus4在不同细菌刺激后的表达模式。甲壳肽原核重组表达根据EsCrus3和Es-Crus4序列,设计含有特定酶切位点(BamH 和Hind)的表达引物(表 1),随后通过PCR扩增目的片段,目的片段酶切后与表达载体pET-32a连接;将阳性质
19、粒转化大肠杆菌(DE3)感受态细胞,获取表达菌株。阳性菌株培养至对数期时加入0.5 mmol/L的IPTG,28条件下诱导培养12h,菌液离心后收集菌体,加入PBS重悬菌体并进行超声破碎。通过聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分析蛋白表达情况,随后利用Ni-NTA His Bind Resin纯化蛋白,蛋白溶度通过Bradford法测定。微生物结合活性检测微生物结合实验用于评价EsCrus3和EsCrus4与不同类型微生物的结合活性,实验步骤参照Zhu等23报道的方法。重组蛋白(150 g/mL)分别与实验材料中的9种微生物(2108 CFU)于28振荡孵育1h。离心后用TBS(50 mm
20、ol/L Tris-HCl和150 mmol/L氯化钠;pH7.5)洗涤沉淀3次,并取最后1次洗涤液(Wash)制样。随后菌体中加入200 L 7%SDS温和振荡10min,离心收集洗脱液(Elution)制样。菌体沉淀(Pellet)经TBS洗涤3次后制样。重组蛋白EsCrus3和EsCrus4作为阳性对照,通过Western Blot检测蛋白与微生物结合情况。依据洗涤液、洗脱液或沉淀中是否存在目的蛋白,判断蛋白与微生物的结合活性。微生物多糖结合实验酶联免疫吸附实验(Enzyme-Linked Immunosorbnent Assay,ELISA)用于评价EsCrus3和EsCrus4与5种
21、不同来源的微生物多糖的结合活性。ELISA操作过程参照文献24中方法。取100 L多糖悬液(20 g/mL)至96孔板中进行包被,阴性对照孔中加入等体积TBS。包被结束后加入200 L BSA(5 mg/mL)于37封闭2h,随后加入TBST(0.05%Tween 20)洗涤4次。取100 L梯度稀释后的01 mol/L重组蛋白EsCrus3、Es-Crus4或Trx(标签蛋白,阴性对照),分别加入洗涤后的96孔板中,室温孵育3h,TBST洗涤4次。每孔中加入100 L辣根过氧化物酶标记的His标签抗体(15000稀释),于37孵育2h,TBST洗涤4次。加入100 L现配的0.01%TMB发
22、色液,发色至颜色不再明显变化,加入50 L H2SO4(2 mol/L)终止反应,在450 nm波长处测定吸光度。所有实验操作重复3次,每次实验设置3个复孔。液体抑菌实验通过液体抑菌实验评价Es-Crus3和EsCrus4抑菌活性,具体操作参照文献25所述方法。分别向96孔板中加入50 L TBS梯度稀表 1 实验所用引物序列Tab.1 Sequence of primers used in this study引物名称Primer引物序列Sequence(53)扩增引物cDNAcloningEsCrus3FGACCAAGCACACAACAACTAEsCrus3RCGCTCAGACTTATCA
23、GCTTAEsCrus4FCCTAACCAAAGCCTGCAAGATEsCrus4RTGATGTTAGTGGTCAACGAC定量引物Real-timePCREsCrus3QFGCAAAGACCACAACGACCAAAEsCrus3QRTTCCGAAGTCACAAACTCCATCAEsCrus4QFCCTCATCAGTCAGGTGTAAAAAGCEsCrus4QRGGGGCACTCAGGGTCGTAG表达引物 ProteinexpressionEsCrus3PFAGGCCATGGCTGATATCGGATCCACATCAGTGCCGCCGCCGCCGCCACAGGACEsCrus3PRGTGCTC
24、GAGTGCGGCCGCAAGCTTGTGAGGAATATCGAACGGCGEsCrus4PFAGGCCATGGCTGATATCGGATCCTCATCAGTCAGGTGTEsCrus4PRGTGCTCGAGTGCGGCCGCAAGCTTGTGGTCAACGACCAG内参引物-actin-actin-FGCATCCACGAGACCACTTACA-actin-RCTCCTGCTTGCTGATCCACATC1840水 生 生 物 学 报47 卷释(01 mol/L)的重组蛋白EsCrus3、EsCrus4或Trx,再分别加入50 L PB培养基(1%胰蛋白胨,0.5%氯化钠;pH 7.5)稀释的实验
25、材料中所述的9种微生物(1105 CFU)。置于28孵育16h,而后在600 nm波长处测定吸光度,检测抑菌活性。本实验最小生长抑制浓度定义为与阴性对照相比获得显著生长抑制的最低蛋白质浓度。所有实验重复3次,每次实验设置3个复孔。2 2 结果 2.12.1 两个甲壳肽的序列特征从中华绒螯蟹转录组数据中获得的2条甲壳肽样基因序列,分别命名为EsCrus3和EsCrus4。经基因克隆、测序后,确认EsCrus3全长567 bp,开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)为351 bp,编码116个氨基酸(Amino acid,aa),包含N端信号肽21个aa,C端WAP结构域50个
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