8-第八章--位点特异性重组与DNA的转座PPT课件.ppt
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1、第八章第八章 位点特异性重组与位点特异性重组与DNA的转座的转座1.1.保守性位点特异性重组保守性位点特异性重组保守性位点特异性重组保守性位点特异性重组2.2.位点特异性重组的生物学作用位点特异性重组的生物学作用位点特异性重组的生物学作用位点特异性重组的生物学作用3.3.转座转座转座转座4.4.转座子及其调控转座子及其调控转座子及其调控转座子及其调控本章内容本章内容1 1-重组的两种形式重组的两种形式重组的两种形式重组的两种形式2 2-一、一、保守性位点特异性重组(保守性位点特异性重组(CSSR)1.1.位点特异性重组发生在目标位点特异性重组发生在目标位点特异性重组发生在目标位点特异性重组发生
2、在目标DNADNA上的特异序列中。上的特异序列中。上的特异序列中。上的特异序列中。噬菌体基因组嵌入噬菌体基因组嵌入宿主染色体中。宿主染色体中。3 3种种CSSRCSSR重组方式。重组方式。3 3-参与保守性位点特异性重组的结构。参与保守性位点特异性重组的结构。4 4-位点特异性重组的分子机制:位点特异性重组的分子机制:attPattP和和attBattB交错切割发生重组。交错切割发生重组。噬菌体的噬菌体的噬菌体的噬菌体的attP attP attP attP 为为为为P.O.PP.O.PP.O.PP.O.P ,细菌的细菌的细菌的细菌的attBattBattBattB为为为为 B.O.B B.O
3、.B B.O.B B.O.B O O O O 为为为为 attP attP attP attP 和和和和attBattBattBattB相同的核心序列,长相同的核心序列,长相同的核心序列,长相同的核心序列,长15bp15bp15bp15bp,重组发生在此序列中。,重组发生在此序列中。,重组发生在此序列中。,重组发生在此序列中。attP 235 bp attB 23 bp attP 235 bp attB 23 bp attP 235 bp attB 23 bp attP 235 bp attB 23 bp P-O-P P-O-P P-O-P P-O-P B-O-B B-O-B B-O-B B-
4、O-B -152 0 +82 -11 0 +11 -152 0 +82 -11 0 +11 -152 0 +82 -11 0 +11 -152 0 +82 -11 0 +11 G C T T T T T T A T A C T A A G C T T T T T T A T A C T A A G C T T T T T T A T A C T A A G C T T T T T T A T A C T A A C G A A A A A A T A T G A T TC G A A A A A A T A T G A T TC G A A A A A A T A T G A T TC G A
5、 A A A A A T A T G A T T 5 5-2.2.位点特异性重组酶利用共价蛋白位点特异性重组酶利用共价蛋白位点特异性重组酶利用共价蛋白位点特异性重组酶利用共价蛋白-DNA-DNA中间体切割中间体切割中间体切割中间体切割分离与连接分离与连接分离与连接分离与连接DNADNA。-位点特异性重组酶有两个家族:丝氨酸重组酶与酪氨酸位点特异性重组酶有两个家族:丝氨酸重组酶与酪氨酸位点特异性重组酶有两个家族:丝氨酸重组酶与酪氨酸位点特异性重组酶有两个家族:丝氨酸重组酶与酪氨酸重组酶。重组酶。重组酶。重组酶。丝氨酸重组酶与酪氨酸重组酶使用的共价蛋白丝氨酸重组酶与酪氨酸重组酶使用的共价蛋白-DN
6、A-DNA中间体。中间体。6 6-重组酶的家族与功能重组酶的家族与功能重组酶的家族与功能重组酶的家族与功能7 7-丝氨酸重组酶催化的重组。丝氨酸重组酶催化的重组。8 8-二、二、位点特异性重组的生物学作用位点特异性重组的生物学作用 细胞与病毒用位点特异性重组可实现各种各样细胞与病毒用位点特异性重组可实现各种各样细胞与病毒用位点特异性重组可实现各种各样细胞与病毒用位点特异性重组可实现各种各样的生物学功能。的生物学功能。的生物学功能。的生物学功能。-噬菌体利用重组机制在感染时将本身噬菌体利用重组机制在感染时将本身噬菌体利用重组机制在感染时将本身噬菌体利用重组机制在感染时将本身DNADNA嵌入到宿嵌
7、入到宿嵌入到宿嵌入到宿主染色体中。主染色体中。主染色体中。主染色体中。-位点特异性重组可用于改变基因表达。位点特异性重组可用于改变基因表达。位点特异性重组可用于改变基因表达。位点特异性重组可用于改变基因表达。-位点特异性重组还广泛用于位点特异性重组还广泛用于位点特异性重组还广泛用于位点特异性重组还广泛用于DNADNA复制、同源重组和复制、同源重组和复制、同源重组和复制、同源重组和细胞分裂周期中保持环状细胞分裂周期中保持环状细胞分裂周期中保持环状细胞分裂周期中保持环状DNADNA分子的结构完整。分子的结构完整。分子的结构完整。分子的结构完整。9 9-1.1.嵌合酶可促进病毒基因组与宿主细胞嵌合酶
8、可促进病毒基因组与宿主细胞嵌合酶可促进病毒基因组与宿主细胞嵌合酶可促进病毒基因组与宿主细胞染色体的嵌合和分离。染色体的嵌合和分离。染色体的嵌合和分离。染色体的嵌合和分离。2.2.噬菌体噬菌体噬菌体噬菌体 的分离需要一种新的的分离需要一种新的的分离需要一种新的的分离需要一种新的DNADNA弯曲蛋白。弯曲蛋白。弯曲蛋白。弯曲蛋白。重重组组位位点点。I IH HF F弯弯曲曲D DN NA A进进入入D DN NA A结结合合位位点点模模型型。1010-3.Hin 3.Hin重组酶反转重组酶反转重组酶反转重组酶反转DNADNA片段使其他基因表达。片段使其他基因表达。片段使其他基因表达。片段使其他基因
9、表达。沙门氏菌感染人类细胞的电镜图沙门氏菌感染人类细胞的电镜图沙门氏菌重组催化DNA反转4.Hin4.Hin重组需要一个重组需要一个重组需要一个重组需要一个DNADNA增强子。增强子。增强子。增强子。5.5.重组酶将环状多聚重组酶将环状多聚重组酶将环状多聚重组酶将环状多聚DNADNA分子转化为单体。分子转化为单体。分子转化为单体。分子转化为单体。6.6.其他机制。其他机制。其他机制。其他机制。1111-转座因子的发现转座因子的发现B.McClintockB.McClintock的玉米遗传研究的玉米遗传研究的玉米遗传研究的玉米遗传研究 19511951年年年年,B.McClintockB.McC
10、lintock根根根根据据据据长长长长期期期期对对对对玉玉玉玉米米米米的的的的遗遗遗遗传传传传研研研研究究究究,提提提提出出出出了了了了转转转转座座座座(transpositiontransposition)的的的的概概概概念念念念,提提提提出出出出基基基基因因因因可可可可以以以以移移移移动动动动的的的的新观点。新观点。新观点。新观点。ShapiroShapiro的的的的E.coliE.coli半乳糖操纵子研究半乳糖操纵子研究半乳糖操纵子研究半乳糖操纵子研究 半乳糖操纵子半乳糖操纵子半乳糖操纵子半乳糖操纵子 galK galK galK galK基因编码半乳糖激酶;基因编码半乳糖激酶;基因编码
11、半乳糖激酶;基因编码半乳糖激酶;galT galT galT galT基因编码半乳糖尿苷酰转移酶;基因编码半乳糖尿苷酰转移酶;基因编码半乳糖尿苷酰转移酶;基因编码半乳糖尿苷酰转移酶;galE galE galE galE基因编码半乳糖异构酶。基因编码半乳糖异构酶。基因编码半乳糖异构酶。基因编码半乳糖异构酶。三、转座三、转座半乳糖操纵子半乳糖操纵子1212-1.1.一些遗传元件通过转座(一些遗传元件通过转座(一些遗传元件通过转座(一些遗传元件通过转座(transpositiontransposition)转到)转到)转到)转到新的染色体位置上。新的染色体位置上。新的染色体位置上。新的染色体位置上
12、。2.2.有有有有3 3种类型的转座因子。种类型的转座因子。种类型的转座因子。种类型的转座因子。-DNA-DNA转座子转座子转座子转座子-类病毒反转座子类病毒反转座子类病毒反转座子类病毒反转座子-poly-A-poly-A反转座子反转座子反转座子反转座子1313-基因组中的转座子:出现位置与分布基因组中的转座子:出现位置与分布1414-原核生物转座因子原核生物转座因子类型类型(1 1)插入序列插入序列插入序列插入序列(insertion sequence,ISinsertion sequence,IS)E.coli K12 E.coli K12中有中有中有中有IS1,IS2,IS3,IS4,I
13、S5IS1,IS2,IS3,IS4,IS5。E.coli E.coli的的的的F F因子中有因子中有因子中有因子中有IS2,IS3(4IS2,IS3(4个个个个),),,。末末末末端端端端的的的的序序序序列列列列相相相相同同同同或或或或相相相相近近近近,但但但但方方方方向向向向相相相相反反反反,称称称称为为为为反反反反向向向向重重重重复复复复序序序序列列列列(IRIR),与与与与其其其其相相相相连连连连的的的的宿宿宿宿主主主主DNADNA末末末末端端端端会会会会产产产产生生生生正正正正向向向向重重重重复序列(复序列(复序列(复序列(DRDR)。)。)。)。仅仅仅仅编编编编码码码码与与与与转转转
14、转座座座座有有有有关关关关的的的的转转转转座座座座酶酶酶酶,转转转转座座座座酶酶酶酶交交交交错错错错切切切切割割割割宿宿宿宿主主主主DNADNA,然后,然后,然后,然后ISIS插入,插入,插入,插入,ISIS两端形成两端形成两端形成两端形成DRDR。1515-ISIS的结构与功能的结构与功能的结构与功能的结构与功能1616-部分部分部分部分ISIS的结构的结构的结构的结构 ISIS种类种类种类种类长度长度长度长度(bpbp)IR IR(bpbp)ID ID(bpbp)靶的选择靶的选择靶的选择靶的选择拷贝数拷贝数拷贝数拷贝数IS1IS176876823239 9随机随机随机随机5-85-8IS2
15、IS21327132741415 5热点热点热点热点5 5IS4IS414281428181811/1211/12AAANAAAN2020TTTTTT1-21-2IS5IS51195119516164 4热点热点热点热点不详不详不详不详IS10RIS10R1329132922229 9NGCTNAGCNNGCTNAGCN不详不详不详不详IS903IS9031057105718189 9随机随机随机随机不详不详不详不详1717-靶重复的形成靶重复的形成1818-(2 2)复合转座子()复合转座子()复合转座子()复合转座子(composite transposoncomposite transp
16、oson)两两两两端端端端由由由由ISIS元元元元件件件件组组组组成成成成,元元元元件件件件相相相相同同同同或或或或不不不不相相相相同同同同,方方方方向向向向相相相相同同同同或不相同;两端元件都有功能或仅一侧元件有功能。或不相同;两端元件都有功能或仅一侧元件有功能。或不相同;两端元件都有功能或仅一侧元件有功能。或不相同;两端元件都有功能或仅一侧元件有功能。中中中中心心心心区区区区域域域域编编编编码码码码抗抗抗抗性性性性标标标标记记记记,不不不不同同同同复复复复合合合合转转转转座座座座子子子子的的的的抗抗抗抗性性性性标标标标记不同,例如记不同,例如记不同,例如记不同,例如KanKanr r 、C
17、amCamr r 、StrStrr r 、BleBler r 等。等。等。等。两个两个两个两个ISIS元件能够使它们之间的元件能够使它们之间的元件能够使它们之间的元件能够使它们之间的DNADNA序列转座。序列转座。序列转座。序列转座。复合转座子的结构复合转座子的结构1919-真核生物真核生物转座因子转座因子 玉米的转座因子玉米的转座因子玉米的转座因子玉米的转座因子(1 1)McClintockMcClintockMcClintockMcClintock的发现的发现的发现的发现 玉玉玉玉米米米米的的的的红红红红色色色色花花花花青青青青素素素素合合合合成成成成受受受受多多多多基基基基因因因因控控控
18、控制制制制,使使使使胚胚胚胚乳乳乳乳呈呈呈呈紫紫紫紫色色色色。其其其其中中中中任任任任一一一一基基基基因因因因突突突突变变变变都都都都使使使使色色色色素素素素合合合合成成成成受受受受阻阻阻阻,胚胚胚胚乳乳乳乳变变变变白白白白。如如如如果果果果发发发发生生生生回回回回复复复复突突突突变变变变,会会会会导导导导致致致致斑斑斑斑点点点点产产产产生生生生。McClintockMcClintockMcClintockMcClintock发发发发现现现现,色色色色素素素素基基基基因因因因C C C C突突突突变变变变是是是是由由由由“可可可可移移移移动动动动的的的的控控控控制制制制因因因因子子子子”引引引
19、引起起起起的的的的,称称称称为为为为解解解解离离离离因因因因子子子子(dissociator dissociator dissociator dissociator,Ds,Ds,Ds,Ds),它它它它可可可可插插插插入入入入C C C C基基基基因因因因中中中中。另另另另一一一一可可可可移移移移动动动动的的的的控控控控制制制制因因因因子子子子是是是是激激激激活活活活因因因因子子子子(activator,Acactivator,Acactivator,Acactivator,Ac),AcAcAcAc能能能能激激激激活活活活DsDsDsDs转转转转入入入入C C C C基基基基因因因因,也也也也能
20、能能能使使使使DsDsDsDs从从从从C C C C中中中中转转转转出出出出,这这这这就就就就是是是是Ac-DsAc-DsAc-DsAc-Ds系统。系统。系统。系统。2020-玉米色斑的形成玉米色斑的形成2121-(2 2 2 2)玉米的控制因子家族)玉米的控制因子家族)玉米的控制因子家族)玉米的控制因子家族 McClintockMcClintockMcClintockMcClintock还还还还发发发发现现现现了了了了Spm-DspmSpm-DspmSpm-DspmSpm-Dspm系系系系统统统统。每每每每个个个个家家家家族族族族都都都都有自主性因子和非自主性因子。有自主性因子和非自主性因子
21、。有自主性因子和非自主性因子。有自主性因子和非自主性因子。自自自自主主主主性性性性因因因因子子子子有有有有切切切切离离离离和和和和转转转转座座座座能能能能力力力力。可可可可插插插插入入入入任任任任何何何何位位位位点点点点产产产产生生生生不不不不稳稳稳稳定定定定的的的的或或或或可可可可“突突突突变变变变”(mutablemutablemutablemutable)等等等等位位位位基基基基因因因因。自自自自主主主主性性性性因因因因子子子子的的的的丢丢丢丢失失失失,可可可可使使使使可可可可变变变变的的的的等等等等位位位位基基基基因因因因变变变变成成成成稳稳稳稳定定定定的的的的等等等等位基因。位基因。
22、位基因。位基因。非非非非自自自自主主主主性性性性因因因因子子子子是是是是稳稳稳稳定定定定的的的的,自自自自身身身身不不不不能能能能转转转转座座座座,来来来来源源源源于于于于失失失失去去去去反反反反式式式式作作作作用用用用功功功功能能能能的的的的自自自自主主主主因因因因子子子子,而而而而这这这这种种种种功功功功能能能能是是是是转转转转座座座座所所所所必须的。必须的。必须的。必须的。控控控控制制制制因因因因子子子子家家家家族族族族是是是是通通通通过过过过这这这这两两两两种种种种因因因因子子子子相相相相互互互互作作作作用用用用来来来来划划划划定定定定的的的的。一一一一个个个个家家家家族族族族由由由由
23、单单单单个个个个类类类类型型型型的的的的自自自自主主主主因因因因子子子子组组组组成成成成,这这这这些些些些因因因因子子子子由很多种非自主因子相伴随。由很多种非自主因子相伴随。由很多种非自主因子相伴随。由很多种非自主因子相伴随。2222-玉米玉米玉米玉米Ac-DsAc-Ds系统的结构系统的结构系统的结构系统的结构 AcAc序序序序列列列列由由由由含含含含5 5个个个个内内内内含含含含子子子子的的的的单单单单个个个个基基基基因因因因编编编编码码码码,其其其其产产产产物物物物为为为为转转转转座座座座酶酶酶酶,末端有末端有末端有末端有11bp11bp的的的的IRIR和和和和8bp8bp的的的的DRDR
24、。DsDs是是是是由由由由AcAc缺缺缺缺失失失失产产产产生生生生的的的的,Ds9Ds9缺缺缺缺失失失失194bp194bp;Ds6Ds6只只只只保保保保留留留留2Kb2Kb。转座酶失活但保留完整的转座酶作用位点(包括末端)。转座酶失活但保留完整的转座酶作用位点(包括末端)。转座酶失活但保留完整的转座酶作用位点(包括末端)。转座酶失活但保留完整的转座酶作用位点(包括末端)。Ac-DsAc-Ds属属属属于于于于非非非非复复复复制制制制型型型型转转转转座座座座,发发发发生生生生转转转转座座座座后后后后,它它它它们们们们从从从从供供供供体体体体位位位位置置置置上消失。上消失。上消失。上消失。2323
25、-果蝇的果蝇的果蝇的果蝇的P P因子因子因子因子(1 1)果蝇的)果蝇的)果蝇的)果蝇的“杂种不育杂种不育杂种不育杂种不育”品系品系品系品系 某某某某些些些些果果果果蝇蝇蝇蝇品品品品系系系系杂杂杂杂种种种种后后后后代代代代现现现现一一一一系系系系列列列列缺缺缺缺陷陷陷陷,在在在在P-MP-M系系系系统统统统的的的的杂杂杂杂交中,子一代具有正常的体细胞组织,但性腺不能发育。交中,子一代具有正常的体细胞组织,但性腺不能发育。交中,子一代具有正常的体细胞组织,但性腺不能发育。交中,子一代具有正常的体细胞组织,但性腺不能发育。P()P()F P()P()F1 1 正常能育正常能育正常能育正常能育 M(
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