基于网络药理学探讨小承气汤治疗术后肠梗阻作用机制.pdf
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1、 收稿日期:作者单位:中国医科大学附属盛京医院辽宁 沈阳 基金项目:辽宁省中医药临床学(专)科能力建设项目()通信作者 :./.基于网络药理学探讨小承气汤治疗术后肠梗阻作用机制戚 运陈苏宁 摘 要 目的基于网络药理学方法探讨小承气汤治疗术后肠梗阻的潜在分子机制方法从中药系统药理学数据库()中筛选出小承气汤的活性成分和作用靶点从、和 数据库中检索与术后肠梗阻相关的靶点通过映射药物和疾病靶点得到预测靶点利用 平台构建预测靶点的蛋白质蛋白质相互作用 网络使用 数据库对预测靶点进行 富集分析和 通路分析运用 软件构建活性成分靶点信号通路网络图结果预测结果显示共为小承气汤鉴定了 种活性成分和 个相应的靶
2、点 注释分析揭示了 个生物学过程主要涉及对药物的反应、一氧化氮生物合成过程的正向调节、平滑肌细胞增殖的正向调节、趋化因子生物合成过程的正向调节等 个细胞组分主要涉及细胞外空间、细胞外区域、质膜外侧 个分子功能主要涉及细胞因子活性、酶结合、生长因子活性、蛋白质同二聚活性等 富集分析结果表明有 条通路与术后肠梗阻相关主要包括肿瘤坏死因子信号通路、信号通路、细胞受体信号通路等结论小承气汤可能通过调节免疫炎症反应、生理应激、细胞凋亡等机制发挥治疗术后肠梗阻的作用 本研究为小承气汤的进一步基础研究和临床应用提供了理论依据关键词 小承气汤术后肠梗阻网络药理学 ()()().()().()()().:引言术
3、后肠梗阻()是腹部手术后的常见并发症 常以腹胀、进食后呕吐、无排气排便为主要临床表现约占腹部手术患者的 其发生与术中麻醉用药、神经反射抑制、炎症反应、应激等多种因素有关 术后肠梗阻不仅会延长患者的住院时间增加围手术期费用而且影响患者手术后恢复增加再次手术和术后感染的风险 小承气汤()源自伤寒论由大黄、枳实、厚朴三味药组成具有轻下热结、除满消痞之功效 小承气汤作为一种常用的中药方剂在国内各医疗机构得到广泛应用既有成方或颗粒剂可供选择也可根据患者具体情况调配 小承气汤对术后肠梗阻有显著的治疗效果但其作用机制尚不明确网络药理学是一种新兴的药物分析方法其基于系统生物学、多向药理学和网络分析能够构建“有
4、效成分靶点基因疾病”网络从整体角度揭示药物与疾病的相互作用这种方法对于复杂实用药物与临床 年第 卷第 期 .成分药物特别是中药复方的作用机制分析具有明显优势 本文运用网络药理学方法从有效成分、靶点、信号通路等方面分析了小承气汤治疗术后肠梗阻的可能机制并为后续的实验和临床研究提供了理论依据 材料与方法 小承气汤有效成分及靶点的筛选 从中药系统药理学数据库(:/)中检索小承气汤中大黄、枳实、厚朴三味中药的全部化学成分并根据药物在体内的吸收、分布、代谢和排泄性质(、)筛选出口服生物利用度()和类药性()的化学成分及其相应靶点 术后肠梗阻相关靶点的筛选以“”为关键词分别在(:/./)、(:/./)、(
5、:/./)和(:/./)个数据库中检索术后肠梗阻的相关靶点并综合各个数据库的结果得出术后肠梗阻的可能作用靶点 小承气汤与术后肠梗阻靶点的标准化及映射 将筛选出的小承气汤和术后肠梗阻相关靶点分别在(:/)中进行标准化选择“”作为种属条件得到统一的基因名称 然后将这些基因名称在 平台(:/)中进行映射找出小承气汤和术后肠梗阻共有的靶点并用韦恩图表示 蛋白质相互作用()网络的构建 将小承气汤和术后肠梗阻的共有靶点基因输入 数据库(:/)应用多重蛋白分析功能选择“”作为物种设定相互作用阈值为“()”构建了蛋白质相互作用网络图 在该图中节点表示由单个蛋白编码基因产生的所有蛋白质边表示蛋白质之间的相互作用
6、证据 功能富集分析及 通路富集分析 将小承气汤和术后肠梗阻的共有靶点基因输入 数据库(:/)并设置 为“”为“”为“”然后选择 中的“”“”“”和 中的“”进行 功能富集分析和 通路富集分析并对结果进行数据可视化 有效成分靶点通路网络图 将小承气汤的有效成分、靶点和通路的预测结果进行整合并用 软件绘制了“有效成分靶点信号通路”的网络图 结果 小承气汤有效成分及靶点的筛选本文从 数据库中检索了小承气汤的全部化学成分共计 种其中大黄 种枳实 种厚朴 种 然后根据 标准以 和 为筛选条件剔除了没有靶点的化学成分最终得到了 种有效化合物和 个相关靶点 这些化合物包括大黄 种枳实 种厚朴 种 按照 值的
7、大小排序 种化合物的来源、值和 值如表 所示表 小承气汤部分有效成分基本信息化合物代码化合物名称 值()值来源.大黄.枳实.枳实.枳实.枳实.厚朴.枳实.厚朴.枳实.大黄()().枳实.枳实().大黄().枳实实用药物与临床 年第 卷第 期 .续表 化合物代码化合物名称 值()值来源.大黄.大黄.大黄.枳实.枳实().大黄.大黄().枳实.枳实.枳实.枳实.枳实.大黄.枳实.大黄.枳实.枳实 注:口服生物利用度:类药性 术后肠梗阻相关靶点的筛选及药物与疾病靶点的映射 在、和 个数据库中以“”为关键词检索术后肠梗阻的相关靶点并去除重复项共得到 个靶点 然后将这些靶点在 数据库中进行标准化得到统一
8、的基因名称 将这些基因名称在 平台中进行映射找出小承气汤和术后肠梗阻共有的靶点共计 个并用韦恩图表示如图 所示图 小承气汤治疗术后肠梗阻靶点韦恩图 网络的构建 将小承气汤和术后肠梗阻的 个共有靶点输入 数据库构建了蛋白质相互作用网络图并在图 中展示 在该图中节点表示蛋白质边表示蛋白质之间的相互作用关系 该网络包含 个节点和 个边平均节点度为 图 小承气汤治疗术后肠梗阻靶点 网络图 功能富集分析及 通路富集分析将小承气汤和术后肠梗阻的共有靶点基因输入 数据库进行 功能富集分析和 通路富集分析 结果显示共有 个生物学过程被富集主要包括对药物的反应、一氧化氮生物合成过程的正向调节、平滑肌细胞增殖的正
9、向调节、趋化因子生物合成过程的正向调节等 个分子生物学功能被富集主要包括细胞因子活性、酶结合、生长因子活性、蛋白质同二聚活性等 个细实用药物与临床 年第 卷第 期 .胞学组分被富集主要包括细胞外空间、细胞外区域、质膜外侧等(见图)此外共有 条 信号通路被富集按照 值从小到大排序主要包括肿瘤坏死因子信号通路、信号通路、细胞受体信号通路等(见图)这些结果在图 中用气泡图表示其中气泡的大小反映了该通路涉及的基因数量颜色反映了富集显著性 有效成分靶点信号通路网络图构建 采用 软件绘制小承气汤和术后肠梗阻的“有效成分核心靶点信号通路”网络图(见图)图 清晰地显示了小承气汤的 种有效成分、个靶点蛋白和 条
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