周期蛋白和周期蛋白依赖性激...期进程中的调控机制研究进展_潘剑锋.pdf
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1、 潘剑锋 等/周期蛋白和周期蛋白依赖性激酶及相关激酶抑制剂在细胞周期进程中的调控机制研究进展 Chinese Journal of Biotechnology http:/ Apr.25,2023,39(4):1525-1547 DOI:10.13345/j.cjb.220478 2023 Chin J Biotech,All rights reserved 资助项目:国家自然科学基金(31860627)This work was supported by the National Natural Science Foundation of China(31860627).*Correspon
2、ding author.E-mail: Received:2022-06-16;Accepted:2022-11-14;Published online:2022-12-08 1525 生物工程学报 周期蛋白和周期蛋白依赖性激酶及相关激酶抑制剂在细胞周期进程中的调控机制研究进展 潘剑锋1,尚方正1,马荣1,戎友俊1,张燕军1,2,3,4*1 内蒙古农业大学动物科学学院,内蒙古 呼和浩特 010018 2 农业农村部肉羊遗传育种重点实验室,内蒙古 呼和浩特 010018 3 内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室,内蒙古 呼和浩特 010018 4 内蒙古自治区山羊遗传育种工程技术研究中心,内
3、蒙古 呼和浩特 010018 潘剑锋,尚方正,马荣,戎友俊,张燕军.周期蛋白和周期蛋白依赖性激酶及相关激酶抑制剂在细胞周期进程中的调控机制研究进展J.生物工程学报,2023,39(4):1525-1547.PAN Jianfeng,SHANG Fangzheng,MA Rong,RONG Youjun,ZHANG Yanjun.Advances of the regulatory mechanism of cyclin,cyclin-dependent kinases and related kinase inhibitors in cell cycle progressionJ.Chines
4、e Journal of Biotechnology,2023,39(4):1525-1547.摘 要:在细胞发育过程中,细胞周期起着至关重要的作用。细胞周期进程主要受细胞周期蛋白依赖性激酶(cyclin dependent kinase,CDK)、周期蛋白和内源性 CDK 抑制剂(cyclin-dependent kinase inhibitors,CKI)调控。其中,CDK 是主要的细胞周期调节因子,可与周期蛋白结合形成周期蛋白-CDK 复合物,从而使数百种底物磷酸化,调控分裂间期和有丝分裂进程。各类细胞周期蛋白的活性异常,可引起不受控制的癌细胞增殖,导致癌症的发生与发展。因此,了解 CD
5、K 的活性变化情况、周期蛋白-CDK 的组装以及 CKI 的作用,将有助于了解细胞周期进程中潜在的调控过程,为癌症与疾病的治疗和 CKI 治疗药物的研发提供基础。本文关注了 CDK 激活和灭活的关键事件,并总结了周期蛋白-CDK 在特定时期及位置的调控过程,以及相关 CKI 治疗药物在癌症及疾病中的研究进展,最后简单阐述了细胞周期进程研究面临的问题和存在的挑战,以期为后续细胞周期进程的深入研究提供参考和思路。关键词:周期蛋白依赖性激酶;周期蛋白;周期蛋白依赖性激酶抑制剂;癌症;细胞周期 综 述 ISSN 1000-3061 CN 11-1998/Q 生物工程学报 Chin J Biotech
6、http:/ 1526 Advances of the regulatory mechanism of cyclin,cyclin-dependent kinases and related kinase inhibitors in cell cycle progression PAN Jianfeng1,SHANG Fangzheng1,MA Rong1,RONG Youjun1,ZHANG Yanjun1,2,3,4*1 College of Animal Science,Inner Mongolia Agricultural University,Hohhot 010018,Inner
7、Mongolia,China 2 Key Laboratory of Meat Sheep Genetics and Breeding,Ministry of Agriculture and Rural Affairs of the Peoples Republic of China,Hohhot 010018,Inner Mongolia,China 3 Key Laboratory of Animal Genetics,Breeding and Reproduction in Inner Mongolia Autonomous Region,Hohhot 010018,Inner Mong
8、olia,China 4 Goat Genetics and Breeding in Inner Mongolia Autonomous Region Engineering Technology Research Center,Hohhot 010018,Inner Mongolia,China Abstract:Cell cycle plays a crucial role in cell development.Cell cycle progression is mainly regulated by cyclin dependent kinase(CDK),cyclin and end
9、ogenous CDK inhibitor(CKI).Among these,CDK is the main cell cycle regulator,binding to cyclin to form the cyclin-CDK complex,which phosphorylates hundreds of substrates and regulates interphase and mitotic progression.Abnormal activity of various cell cycle proteins can cause uncontrolled proliferat
10、ion of cancer cells,which leads to cancer development.Therefore,understanding the changes in CDK activity,cyclin-CDK assembly and the role of CDK inhibitors will help to understand the underlying regulatory processes in cell cycle progression,as well as provide a basis for the treatment of cancer an
11、d disease and the development of CDK inhibitor-based therapeutic agents.This review focuses on the key events of CDK activation or inactivation,and summarizes the regulatory processes of cyclin-CDK at specific times and locations,as well as the progress of research on relevant CDK inhibitor therapeu
12、tics in cancer and disease.The review concludes with a brief description of the current challenges of the cell cycle process,with the aim to provide scientific references and new ideas for further research on cell cycle process.Keywords:cyclin dependent kinase(CDK);cyclin;cyclin dependent kinase inh
13、ibitor(CKI);cancer;cell cycle 细胞周期蛋白依赖性激酶(cyclin dependent kinase,CDK)是丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶家族成员,通过介导不同底物磷酸化,参与细胞周期调控和转录调节1。大多数 CDK 具有 CDK激酶结构域、周期蛋白结合位点、磷酸化修饰位点和 T-loop(称为激活环)基序等2-3。当CDK 与其特定的周期蛋白非共价结合时 CDK的 T-loop 被置换,从而暴露底物 ATP 结合位点并重新排列活性位点的关键残基,激活CDK 活性4-5。迄今为止,已有数十种 CDK(CDK1/2/4/6/7/9 等)和周期蛋白(cyclinA/B/D
14、/E/F/G/H 等)被确认,并在细胞周期调控中发挥重要作用,例如 cyclinD-CDK4/6 启动细胞周期进 程,cyclinE-CDK2调 控S期 进 入,cyclinA-CDK2 调控 S 期 DNA 复制,cyclinA/B-CDK1 触发有丝分裂等6-7。由于大多数 CDK 异常表达与癌症进展有关,因此研发 CDK 抑制剂作为抗癌靶向药物引 潘剑锋 等/周期蛋白和周期蛋白依赖性激酶及相关激酶抑制剂在细胞周期进程中的调控机制研究进展 :010-64807509: 1527 起了学界极大关注8。近 20 年来,至少有数十种靶向 CDK 的药物在临床试验中进行了研究,然而却仅有极少数被批
15、准用于临床治疗9-10。在研究早期,发现的 CDK 抑制剂多为泛 CDK抑制剂与多 CDK 抑制剂,其虽可有效抑制多种 CDK 或其他激酶,但表现出来的明显副作用,阻碍了这两类抑制剂进入市场与开展临床治疗。因此,为获得更安全、有效、副作用小的 CDK 抑制剂用于临床治疗,研究者对选择性 CDK 抑制剂展开了研究。2015 年第一种选择性 CDK4/6 抑制剂帕博西尼(palbociclib)被美 国 食 品 药 品 监 督 管 理 局(Food and Drug Administration,FDA)批准用于治疗乳腺癌11。之后,3 种选择性 CDK4/6 抑制剂瑞博西尼(ribociclib
16、)、阿贝西利(abemaciclib)、曲拉西利(trilaciclib)也相继上市并用于临床治疗12。此外,当前被鉴定的选择性 CDK 抑制剂,主要靶向 CDK1、CDK2、CDK4/6、CDK7 等13-14。在临床研究中 CDK 抑制剂不仅可以被用于治疗各类癌症,还可以被用于治疗各类非癌症疾病,例如炎症性疾病、中枢神经系统疾病和感染性疾病等15。这表明 CDK 在许多癌症与非癌症疾病的病理过程中发挥着重要作用。本文介绍了 CDK 激活或灭活过程的关键事件、特定时期及位置的周期蛋白-CDK 的研究进展、相关 CDK 抑制剂在癌症和非癌症疾病中的应用情况及研发进展。最后,简单阐述了细胞周期研
17、究领域面临的问题和存在的挑战,旨在为细胞周期研究领域的发展提供研究思路。1 CDK 活性激活的关键事件 CDK 是驱动真核细胞周期的丝氨酸/苏氨酸特异性蛋白激酶,在其特定时期激活或灭活可使细胞周期进程有序进行16-17。CDK 激活需要满足如下条件:(1)需要与周期蛋白结合;(2)CDK 激活位点的磷酸化和抑制位点的去磷酸化;(3)不与 CDK 抑制剂(cyclin-dependent kinase inhibitors,CKI)结合等。有趣的是只有当周期蛋白与 CDK 结合形成周期蛋白-CDK 复合物时,CDK 上的激活位点磷酸化和抑制位点去磷酸化,才会激活 CDK 的活性,而活化的 CDK
18、则会在 CKI 的作用下被抑制,因此 CDK 的激活需要满足这 3 个关键事件。1.1 与周期蛋白结合形成复合物 周期蛋白(cyclin)是一类在细胞周期调控过程中表达量呈周期性变化的蛋白质,周期蛋白最初是由 Tom Evans在 1983年研究海胆细胞周期时发现,主要通过激活 CDK 活性和其他细胞周期相关的酶,进而控制细胞周期进程的蛋白质家族18-19。在脊椎动物中,周期蛋白包括 A、B、D、E、F、G 和 H 等类型,可在特定时期与特定 CDK 结合构成周期蛋白-CDK 复合物,例如 cyclinD-CDK4/6、cyclinE-CDK2、cyclinA-CDK2、cyclinH-CDK
19、7、cyclinA-CDK1 和cyclinB-CDK1 等3,20。每一组周期蛋白-CDK 可通过触发下一组周期蛋白-CDK 以及其他相关细胞周期蛋白的表达,调控各个阶段细胞周期的有序进行7。另外,周期蛋白拥有如下基本结构与特征,包括氨基酸结构域(又称为细胞周期蛋白盒)、破坏框、脯氨酸/谷氨酸/丝氨酸/苏氨酸(pro-glu-ser-thr,PEST)序列等3。这些结构与特征调控周期蛋白与 CDK 结合、周期蛋白的泛素化降解、G1 期周期蛋白更新等过程3。此外,不同种类的周期蛋白只在细胞周期特定时期表达和调节特定 CDK。随着细胞周期的进展,周期蛋白产生效应后立即降解21。但有趣的是 CDK
20、 的浓度不会随着周期进程变化而波 ISSN 1000-3061 CN 11-1998/Q 生物工程学报 Chin J Biotech http:/ 1528 动。因此,在细胞周期进程中其活性的激活则是细胞周期各阶段进程能顺利进行的关键。此外,周期蛋白的降解是由后期促进复合物(anaphase-promoting complex/cyclosome,APC/C)在 M 期后期至 G1 期后期的活动,以及 SCF(Skp1-Cul1-F-box)-Skp2(S-phase kinase-associated protein 2)复合物在 G1 期后期至 M 期早期的活动所致22-23。另外,在胚胎
21、干细胞中周期蛋白的表达模式明显与体细胞不同24。例如小鼠胚胎干细胞具有更高且持续的 cyclinA/E 蛋白质表达水平,且在整个细胞周期中 cyclinA/E 的相关激酶 CDK2 被持续性激活25。表明周期蛋白在细胞周期进程中的表达模式不是一成不变,且在不同细胞类型中表达存在差异。因此,在探究不同细胞类型周期进程中,应注意对细胞周期蛋白表达模式的确认及验证,见图 1A。1.2 CDK 特定位点的磷酸化修饰 CDK 与周期蛋白结合是其具有活性的必备条件,但仅有周期蛋白结合还不足以激活CDK,必须在 CDK 特定位点的磷酸化或去磷酸化才能使其活性得以激活。人类和小鼠体细胞周期研究中发现,WEE
22、激酶家族是驱动 CDK抑制位点磷酸化主要的蛋白质激酶家族,该家族主要由这 3 类蛋白质 WEE1、膜相关酪氨酸/苏氨酸蛋白激酶 1(protein kinase membrane associated tyrosine/threonine 1,PKMYT1)和WEE1B 构成,主要通过介导 Tyr15 和 Thr14 位点的磷酸化,降低 CDK 的活性26-28。WEE 激酶家族所造成的 CDK 活性降低,致使大量周期蛋白-CDK 无活性,从而导致该复合物在细胞周期下一阶段开始前大量积累27。而一种在进化上保守的磷酸酶细胞分裂周期 25(cell division cycle 25,Cdc25
23、),可通过移除 CDK 上由 WEE激酶介导的抑制性磷酸基团,重新激活周期蛋白-CDK29-30。有趣的是,重新活化的周期蛋 白-CDK还可抑制WEE激酶的活性,并防止WEE 激酶再一次灭活 CDK31。同时,在人类体细胞中发现活化的周期蛋白-CDK 还可磷酸化激活Cdc25 的活性,使得周期蛋白-CDK 可在短期内急剧增加,这表明了一种周期蛋白-CDK 活性激活的反馈调控机制32。在 CDK 的激活中,除抑制位点磷酸化外,激活位点的磷酸化也是决定CDK 活性激活的关键。在人类和小鼠体细胞中发现,CDK 激活激酶(CDK-activating kinase,CAK)可通过磷酸化 CDK 的 T
24、hr161 位点,激活CDK 活性,从而确保细胞周期有序且精确地进行33-34。综上所述,CDK 激活需要如下两种模式:通过 Cdc25 将 WEE 激酶介导的抑制性磷酸基团去除,称为抑制位点去磷酸化;通过CAK 将 CDK 的激活位点磷酸化,称为激活位点磷酸化。而只有这两种磷酸化模式同时在CDK 上进行,才可激活 CDK 的活性。因此,在细胞周期进程中对 CDK 特定位点磷酸化状态的探究就显得尤为关键,见图 1B。1.3 CDK 活性抑制剂 在细胞周期中存在多种 CKI,激酶 4 抑制因子(inhibitors of kinase 4,INK4)家族(p16INK4A、p15INK4B、p1
25、8INK4C和 p19INK4D等)、抑制蛋白(CDK interaction protein/kinase inhibitor protein,CIP/KIP)家族(p21Cip1、p27Kip1和 p57Kip2等)以及核糖体蛋白抑制 CDK(ribosomal protein-inhibiting CDKs,RPICs)7。这些 CKI 主要通过与周期蛋白-CDK 相互作用,阻止周期蛋白与对应的CDK 结合,从而抑制 CDK 活性,造成细胞周期进程停滞 3 5。其中,INK4 家族仅抑制cyclinD-CDK4/CDK6,而 CIP/KIP 家族则具有更广泛的特异性,可抑制 cyclin
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