微生物学考研笔记.docx

微 生 物 学
第一章绪论
一、什么是微生物
（一）定义：
传统定义：微生物（microorganism,microbe）是一切肉眼看不见或看不清的微小生物的总称。它们是一些个体微小（一般小于0.1mm）、构造简单的低等生物。
现代定义：一般是指绝大多数凭肉眼看不见或看不清，必须借助显微镜才能看见或看清，以及少数能直接通过肉眼看见的单细胞、多细胞和无细胞结构的微小生物的总称。
（二）类群：
1.原核类：细菌（真细菌，古生菌），放线菌，蓝细菌，支原体，立克次氏体，衣原体等。
2.真核类：真菌（酵母菌，霉菌，蕈菌），原生动物，显微藻类
3.非细胞类：病毒，亚病毒（类病毒，拟病毒，朊病毒）
（三）特点：
小（个体微小） µ m（微米）级：光学显微镜下可见（细胞）
n m（纳米）级：电子显微镜下可见（细胞器，病毒）

简（构造简单） 单细胞
微生物 简单多细胞
非细胞（即“分子生物”）

低（进化地位低） 原核类：细菌（真细菌，古生菌），放线菌，蓝细菌，支原体，立克次氏体，衣原体等。
真核类：真菌（酵母菌，霉菌，蕈菌），原生动物，显微藻类。
非细胞类：病毒，亚病毒（类病毒，拟病毒，朊病毒）
1mm=103 µ m=106 nm=107 Ǻ
分辨率：肉眼:0.1mm；显微镜:0.2 µ m；电子显微镜:10 Ǻ
二、为什么要学习微生物
1．微生物无处不在
2．微生物对人类有利也有害。因此，发掘、利用、改造和保护有益微生物；控制、消灭和改造有害微生物
3．最终目的:为人类社会的进步服务
细菌数亿/g土壤，土壤中的细菌总重量估计为： 10034 × 10 12 吨
每张纸币带细菌：900万个
人体体表及体内存在大量的微生物：
皮肤表面：均10万个 细菌/平方厘米
口腔：细菌种类超过500种
肠道： 微生物总量达100万亿
粪便干重的1/3是细菌， 每克粪便的细菌总数为：1000 亿个
每个喷嚏的飞沫含4500-150000个细菌
福：1、微生物在许多重要产品中所起的不可替代的作用，例如：面包、奶酪、啤酒、抗生素、疫苗、维生素、酶等重要产品的生产.
2、体内的正常菌群是人及动物健康的基本保证；帮助消化、提供必需的营养物质、组成生理屏障
3、是人类生存环境中必不可少的成员，有了它们才使得地球上的物质进行循环.
4、以基因工程为代表的现代生物技术的发展及其美妙的前景也是微生物对人类作出的又一重大贡献。
祸：鼠疫 艾滋病(AIDS) 癌症 肺结核 虐疾 霍乱 埃博拉病毒 疯牛病 SARS 禽流感
三、微生物学与人类进步的关系
（一）微生物与医疗保健（在医疗保健战线上的六大“战役”）
1．外科消毒术的建立 2．寻找人畜病原菌 3．免疫防治法的应用 4．化学治疗剂的发明
5．抗生素治疗的兴起 6．用遗传工程和生物工程技术使微生物生产生化药物
（二）微生物与工业发展（微生物在工业发展过程中的六个里程碑）
1．自然发酵与食品、饮料的酿造 2．罐头保藏 3．厌氧纯种发酵技术
4．深层液体通气搅拌培养 5．代谢调控理论在发酵工业上的应用 6．生物工程的兴起
（三）微生物学促进了农业进步
（四）微生物与能源、生态和环境保护
（五）微生物学对生物学基础理论研究的贡献
1．以微生物作为研究对象解决了生物学上的许多重大争论问题
2．是分子生物学的三大来源和三大支柱之一
3．遗传学研究对象的微生物化促使经典遗传学发展为分子遗传学
4．微生物与基因工程
5．高等生物研究和利用中的微生物化趋向方兴末艾
6．微生物学中的一套独特实验技术迅速扩散到生命科学的各研究领域
四、微生物的共性(五大共性)
1.体积小, 结构简单，表面积/体积比值大
杆菌的平均长度：2 微米； 1500个杆菌首尾相连= 一粒芝麻的长度；
10-100亿个细菌加起来重量 = 1毫克
大的比表面积特别有利于它们和周围环境进行物质、能量、信息的交换。微生物的其它很多属性都和这一特点密切相关。
2.代谢活力强, 吸收多, 转化快
吸收营养物质和排出废物，有最大的代谢速率。从单位重量来看，微生物的代谢强度比高等生物大几千倍到几万倍。
消耗自身重量2000倍食物的时间：
大肠杆菌：1小时
人：500年（按400斤/年计算）
（发酵乳糖的细菌1小时内可以分解其自身重1000-10000倍的乳糖）
产阮假丝酵母（Candida utilis）合成蛋白质的能力比大豆强100倍，比食用公牛强10万倍。
3.生长旺, 繁殖快
大肠杆菌一个细胞重约10 –12 克，平均20分钟繁殖一代， 24小时后，就有了72代，其子代数量可达4722366500万亿个，重量达到4722吨；
48小时后：2.2 × 1043个后代，重量达到2.2 × 10 25吨，相当于4000个地球重量
实际上，由于各种原因，细菌的指数分裂速度只能维持几个小时，液体培养基中，细菌细胞的数量一般仅能达到108-109个/ml
生产效率高，发酵周期短
4.分布广，种类多（多样性）
在各种自然环境界中（土壤、水体、空气，动植物体内和体表，万米高空，万米海底，强酸、强碱、高热的极端环境，常年封冻的冰川等）都生存有大量的微生物
微生物的种类多主要体现在下列5个方面：物种的多样性；微生物的生理代谢类型的多样性；代谢产物的多样性；遗传基因的多样性；生态类型的多样性
5.适应性强, 易变异
微生物对极端恶劣的环境的适应能力，堪称“世界之最”。个体小，数量多，单细胞（大多数），繁殖快，分布广泛，与外界环境直接接触，即使自发变异的频率很低（10-5-10-10），也可以在短时间内产生大量变异后代。
福：抗生素效价提高，酶活性提高，代谢产物产量提高等
祸：耐药性的产生
五、微生物学及其研究内容与分科
微生物学(Microbiology)定义：是一门在细胞、分子或群体水平上研究微生物的形态构造、生理代谢、遗传变异、生态分布和分类进化等生命活动基本规律，并将其应用于工业发酵、医药卫生、生物工程和环境保护等实践领域的科学。
根本任务：1.发掘、利用、改造和保护有益微生物 2.控制、消灭和改造有害微生物
最终目的：为人类社会的进步服务
六、微生物学发展简史
影响认识微生物的四大障碍：
1.个体过于微小 2.群体外貌不显 3.种间杂居混生 4.形态与其作用的后果很难被认识
（一）可分为五个时期
1.史前期：约8000年前-1676
实质：朦胧阶段
8000年前我国就开始出现了曲蘖酿酒；
4000年前埃及人已学会烘制面包和酿制果酒；
2500年前我国发明酿酱、醋，用曲治消化道疾病；
公元六世纪(北魏时期)贾思勰的巨著“齐民要术”详细地记载了制曲、酿酒、制酱和酿醋等；
公元九世纪到十世纪我国已发明用鼻苗法种痘；
16世纪，古罗巴医生G.Fracastoro：疾病是由肉眼看不见的生物(living creatures)引起的；
1641年，我国明末医生吴又可也提出“戾气”学说，认为传染病的病因是一种看不见的“戾气”，其传播途径以口、鼻为主。
2.初创期：1676-1861
实质：形态描述阶段
开创者：列文虎克（Robert Hooke）
1664年，英国人虎克（Robert Hooke）曾用原始的显微镜对生长在皮革表面及蔷薇枯叶上的霉菌进行观察。
3.奠基期：1861-1897
实质：生理水平研究阶段 开创者：巴斯德，德国人柯赫
特点：①建立了一系列研究微生物所必要的独特方法和技术，从而解决了认识微生物的第二、三、四个障碍；②借助于良好的研究方法，开创了寻找病原微生物的“黄金时期”；③把微生物学的研究从形态描述推进到生理学研究的新水平；④开始客观上以辩证唯物主义的“实践一理论一实践”的思想方法指导科学实验；⑤微生物学以独立的学科形式开始形成，但当时主要还是以其各应用性分支学科的形式存在
微生物学奠基人：法国化学家巴斯德
(1) 彻底否定了“自然发生”学说：著名的曲颈瓶试验无可辩驳地证实，空气内确实含有微生物，是它们引起有机质的腐败。
(2) 免疫学——预防接种：首次制成狂犬疫苗
(3) 发现并证实发酵是由微生物引起的：化学家出生的巴斯德涉足微生物学是为了治疗酒病”和“蚕病”
(4)其他贡献 巴斯德消毒法：60～65℃作短时间加热处理，杀死有害微生物
细菌学奠基人：德国人柯赫
（1）微生物学基本操作技术方面的贡献
a）细菌纯培养方法的建立 土豆切面 → 营养明胶 → 营养琼脂（平皿）
b）设计了各种培养基，实现了在实验室内对各种微生物的培养
c）流动蒸汽灭菌
d）染色观察和显微摄影
（2）对病原细菌的研究作出了突出的贡献：
a）具体证实了炭疽杆菌是炭疽病的病原菌
b）发现了肺结核病的病原菌；（1905年获诺贝尔奖）
c）证明某种微生物是否为某种疾病病原体的基本原则——著名的柯赫原则
1、在每一相同病例中都出现这种微生物；
2、要从寄主分离出这样的微生物并在培养基中培养出来；
3、用这种微生物的纯培养接种健康而敏感的寄主，同样的疾病会重复发生；
4、从试验发病的寄主中能再度分离培养出这种微生物来。
4.发展期：1897-1953
实质：生化水平研究阶段
开创者：E.Büchner,生物化学奠基人
特点：(1)进入了微生物生化水平的研究。并发现代谢途径的同一性。对无细胞酵母菌“酒化酶”进行研究。以研究微生物对维生素需要、酶的特性、寻找和研究抗生素以及逐步深入到以研究它们的遗传变异和基因为主的新阶段。因此，微生物学家就从“微生物猎人”而发展为“维生素猎人”、“酶猎人”、“抗生素猎人”和“基因猎人”了。(2)应用微生物的分支学科更为扩大，出现了抗生素等新学科。(3)开始出现微生物学史上的第二个“淘金热”一一寻找各种有益微生物代谢产物的热潮。(4) 一门以研究微生物基本生物学规律的综合学科----普通微生物学开始形成，代表人物是美国加里福尼亚大学伯克利分校的M．bd roffD，(5) 各相关学科和技术方法相互渗透，相互促进，加速了微生物学的发展。
5.成熟期：1953-
实质：分子生物学水平研究阶段
开创者：J.Watson,F.Crick。分子生物学奠基人
特点：(1)微生物学从一门在生命科学中较为孤立的以应用为主的学科，迅速成长为一门十分热门的前沿基础学。(2)在基础理论的研究方面，逐步进入到分子水平的研究，微生物迅速成为分子生物学研究中的最主要的对象。(3)在应用研究方面，向着更自觉、更有效和可人为控制的方向发展，至70年代初，有关发酵工程的研究已与遗传工程、细胞工程和酶工程等紧密结合，微生物已成为新兴的生物工程中的主角。
七、我国微生物的发展：
汤飞凡：沙眼病原体的分离和确证
抗生素的总产量已耀居世界首位
两步法生产维生素C的技术居世界先进水平
八、主要参考书
周德庆 著：微生物学教程（第一、二版）
武汉大学、复旦大学编：微生物学.（第二版）
沈萍 著： 微生物学.
九、复习题
1．简述微生物的定义和类群
2．试述微生物学与人类进步的关系
3．试述微生物的共性，讨论其对人类的利弊
4．简述微生物的发展简史上5个时期的特点和代表人物
5．试述微生物学的多样性

第二章原核微生物的形态、构造与功能
一、研究意义
1.形态是入门的向导，构造是研究的基础。 2.提高定向筛选的效率。
3.掌握发酵进程。 4.及时检测杂菌。 5.分类鉴定中应用。
微生物分为三大类群（根据进化地位、性状上明显差别）
1.原核微生物(prokaryotes)
2.真核微生物（eukaryotic microorganisms）
3.非细胞微生物(acellular microorganisms)
原核微生物与真核微生物属于细胞型微生物
二、原核生物的定义及种类
1．原核生物：指一大类细胞核无核膜包裹，只存在称作核区的裸露DNA的原始单细胞生物。包括两大类群真细菌（eubacteria）（包括普通细菌、放线菌、蓝细菌、枝原体、立克次氏体和衣原体等）和古生菌（archaea）
2．古生菌（Archaea）：一类生活在条件十分恶劣的极端环境（如高温、高盐、高酸等）下的古老的微生物。“伯杰氏手册”将古生菌分为5个主要类群：产甲烷菌、极端嗜盐菌、还原硫酸盐细菌、极端嗜热S0代谢菌、无细胞壁古生菌。它们的细胞结构（如细胞壁结构和化学、膜脂类结构、分子生物学及代谢）既不完全相同于原核生物，也不同于真核生物，但其结构与真细菌更为接近。
3．原核生物6种类群
细菌
化能营养
“三菌” 放线菌
光能营养：蓝细菌

人工培养 ：支原体
“三体” 立克次氏体
专行细胞寄生
衣原体
第一节 细菌（bacteria，bacterium 单数）
细菌：细胞细短（直径约0.5um,长0.5~5um）；结构简单；胞壁坚韧；二分裂繁殖；水生性强；单细胞原核生物
生活特性：喜温暖、潮湿、富含有机物；微碱环境（大多数）；腐生或寄生，好氧或厌氧，自养或异养
本节内容
一、 细胞的形态、构造及功能
（一）个体形态和排列
基本形状：球状、杆状、螺旋状
1、球状(球菌coccus， cocci)
细胞个体呈球形或椭圆形，不同种的球菌在细胞分裂时会形成不同的空间排列方式，常被作为分类依据。
2、杆状（杆菌bacillus, bacilli)
细胞呈杆状或圆柱形，一般其粗细（直径）比较稳定，而长度则常因培养时间、培养条件不同而有较大变化。杆状细菌的排列方式常因生长阶段和培养条件而发生变化，一般不作为分类依据。
3、螺旋状（螺旋菌spirilla,spirilla）
弧菌：菌体只有一个弯曲，其程度不足一圈，形似“C”字或逗号，鞭毛偏端生。
螺旋菌：菌体回转如螺旋，螺旋满2—6环，螺旋数目和螺距大小因种而异。鞭毛二端生。细胞壁坚韧,菌体较硬。
螺旋体：菌旋转周数在6环以上，菌体柔软，用于运动的类似鞭毛的轴丝位于细胞外鞘内。
4、其它形状
1）柄杆菌（prosthecate bacteria）细胞上有柄（stalk）、菌丝（hyphae）、附器（appendages）等细胞质伸出物，细胞呈杆状或梭状，并有特征性的细柄。一般生活在淡水中固形物的表面，其异常形态使得菌体的表面积与体积之比增加，能有效地吸收有限的营养物；
2）星形细菌（star-shaped bacteria ）
3）方形细菌（square-ahaped bacteria）
4）异常形态（畸形，衰颓型）
环境条件的变化： 正常形态

物理、化学因子的刺激 阻碍细胞正常发育 环境条件恢复正常
培养时间过长 细胞衰老
营养缺乏 异常形态
自身代谢产物积累过多
常用的染色方法
简单染色法
正染色 革兰氏染色法
鉴别染色法 抗酸性染色法
死菌 芽孢染色法
姬姆萨染色法
细菌染色法 负染色： 荚膜染色法等

活菌：用美蓝或TTC（氧化三苯基四氮唑）等作活菌染色
（二）大小
1、范围
一般细菌的大小范围：测量单位——um（微米）
球菌：0.5 ~ 1 um （直径）
杆菌：0.2~ 1 um （直径） X 1~ 80 um（长度）
螺旋菌：0.3~ 1 um （直径） X 1~ 50 um（长度）(长度是菌体两端点之间的距离，而非实际长度)
2、测量方法
显微镜测微尺；显微照相后根据放大倍数进行测算
3、细菌大小测量结果的影响因素
个体差异；干燥、固定后的菌体会一般由于脱水而比活菌体缩短1/3-1/4；染色方法的影响，一般用负染色法观察的菌体较大；幼龄细菌一般比成熟的或老龄的细菌大；环境条件，如培养基中渗透压的改变也会导致细胞大小的变化。
（三）构造
一般构造：一般细菌都有的构造
特殊构造：部分细菌具有的或一般细菌在特殊环境下才有的构造
1、细胞壁（cell wall）
（1）概念：是紧贴细胞质膜外侧的一层厚实、坚韧的外被。
（2）证实细胞壁存在的方法：
1）细菌超薄切片的电镜直接观察；
2）质、壁分离与适当的染色，可以在光学显微镜下看到细胞壁；
3）机械法破裂细胞后，分离得到纯的细胞壁；
4）制备原生质体，观察细胞形态的变化；
（3）细胞壁的功能：
1）固定细胞外形和保护细胞免受外力损伤；
2）为细胞的生长、分裂和鞭毛运动所必需；
3）渗透屏障，阻拦酶蛋白和某些抗生素等大分子物质（分子量大于800）进入细胞；
4）细菌特定的抗原性、致病性以及对抗生素和噬菌体的敏感性的物质基础；
（4）革兰氏染色、细胞壁的化学组成与结构：
革兰氏染色法1）结晶紫初染2）碘溶液媒染3）乙醇脱色
4）沙黄复染：革兰氏阴性细菌呈红色，革兰氏阳性细菌呈深紫色
G+菌：单层，厚（20~25nm），组分简单，90%肽聚糖（含量高，交联紧密），10%磷壁酸
G-菌：多层，薄（10~15nm），组分复杂，内壁层：肽聚糖（含量低,交联疏松），外膜有脂多糖、磷脂、脂蛋白
1）G+细菌的细胞壁
G+细菌的细胞壁特点：厚度大（20~25nm）化学组分简单，一般只含90%肽聚糖和10%磷壁酸。
肽聚糖（peptidoglycan）：又称粘肽(mucopeptide)、胞壁质(murein)或粘质复合物
G+细菌的细胞壁 （mucocomplex），是真细菌细胞壁中的特有成分。
磷壁酸（teichoic acid）：又称“垣酸”，结合在革兰氏阳性细菌细胞壁上一种酸性多糖
A、肽聚糖：厚约20~25nm，由40层左右的网格状分子交织成的网套覆盖在整个细胞上。
（N—乙酰胞壁酸——原核生物所特有的已糖）
肽聚糖单体由三部分组成：1、双糖单位 2、四肽尾 3、肽 桥
双糖单位中的β-1,4-糖苷键很容易被溶菌酶(lysozyme)所水解，从而引起细菌因肽聚糖细胞壁的“散架”而死亡。
由四个氨基酸分子按L型与D型交替方式连接而成。
D型氨基酸和DAP可保护肽聚糖免受肽酶的水解。
肽桥：短肽尾中的第四个氨基酸残基D-丙氨酸的羧基通过肽键与相邻另一短肽尾中的第三个氨基酸的氨基相连。但有些细菌的肽桥不是两个短肽尾直接的连接，而是通过一个短肽作为肽桥连接于两条短肽尾的氨基酸之间，例如金黄色葡萄球菌中的短肽为5个甘氨酸残基组成。大部分革兰氏阴性菌中的肽桥不需要短肽而直接通过D-丙氨酸和碱性氨基酸的氨基相连而成。
目前所知的肽聚糖已超过100种，在这一“肽聚糖的多样性”中，主要的变化发生在肽桥上。
B、磷壁酸：革氏阳性细菌细胞壁上特有的化学成分（酸性多糖）
按成分分为 甘油磷酸
核糖醇磷酸
按结合部位分为 壁磷壁酸
膜磷壁酸
壁磷壁酸，它与肽聚糖分子间进行共价结合（以末端磷酸二酯键连接在M第6位碳原子上），含量会随培养基成分而改变，一般占细胞壁重量的10%，有时可接近50%。用稀酸或稀碱可以提取。
跨越肽聚糖层并与细胞膜相交联的膜磷壁酸（又称脂磷壁酸），由甘油磷酸链分子与细胞膜上的磷脂进行共价结合后形成。其含量与培养条件关系不大。可用45%热酚水提取，也可用热水从脱脂冻干细菌中提取。
磷壁酸的主要生理功能（自学）：p19
1、细胞壁形成负电荷环境，增强细胞膜对二价阳离子的吸收，提高膜结合酶的活力；二价阳离子，特别是高浓度的Mg2+。的存在，对于保持膜的硬度，提高细胞膜上需Mg2+的合成酶的活性极为重要。
2、贮藏磷元素；
3、增强某些致病菌对宿主细胞的粘连、避免被白细胞吞噬以及抗补体的作用；
4、革兰氏阳性细菌特异表面抗原的物质基础； 可作为细菌分类、鉴定的依据
5、噬菌体的特异性吸附受体；
6、能调节细胞内自溶素(autolysin)的活力而调节细胞壁的增长，防止细胞因自溶而死亡。
C、细胞壁中含有一些特殊成分的革氏阳性细菌
大部分G+细菌细胞壁含脂量很低，但棒杆菌属、分支杆菌属诺卡氏菌属的细胞壁却含有丰富的称为分支菌酸（Mycolic acid）的枝链羟基脂质：
R1— CH—CH—COOH R1， R2为很长的碳氢链

OH R2
分支菌酸与肽聚糖复合在一起。分支杆菌具有抗酸染色的特性，是由于细胞壁中含分支菌酸的缘故。
分支菌酸被认为与这些细菌（白喉棒杆菌，结核分支杆菌）的致病性有关。
用抗酸性染色（一种鉴别染色技术）对宿主体内的分枝杆菌病原体（红色，非抗酸性细菌呈兰色）进行检测
A族链球菌细胞壁中有特异性的M蛋白，它有抗吞噬作用。
大多数金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）细胞壁中有葡萄球菌A蛋白（SPA），它与肽聚糖共价结合，对胰酶敏感，有抗吞噬和抗噬菌体的作用。
2）革兰氏阴性细菌的细胞壁
A、肽聚糖（参见P16）
埋藏在外膜层之内，是仅由1~2层肽聚糖网状分子组成的薄层(2~3nm)，含量约占细胞壁总重的10%，故对机械强度的抵抗力较革兰氏阳性菌弱。
革兰氏阳性菌与阴性菌肽聚糖结构的差别：
没有特殊的肽桥，只形成较为疏稀、机械强度较差的肽聚糖网套
内消旋二氨基庚二酸（m-DAP)（只在原核微生物细胞壁上发现）
肽聚糖只存在于真细菌中，古生菌和真核生物细胞壁中没有肽聚糖。
D-谷氨酸、D-丙氨酸、m-DAP在蛋白质中未出现过。
B、外膜(outer membrane)（参见P19）
又称外壁层，位于革兰氏阴性细菌细胞壁外层，可分为内、中、外三层，从内到外由脂蛋白、磷脂和脂多糖等若干种蛋白质组成的膜。
脂多糖（lipopolysaccharide，LPS）
位于细胞壁最外层的一层较厚的类脂多糖类物质(相对分子质量在1 0000以上)由三部分组成：类脂A（内毒素的主要成分）、核心多糖、O-特异侧链（O-多糖，O-抗原）
O-特异侧链糖的种类、顺序和空间构型是菌株特异的，是抗原特异性的物质基础
KDO：2-酮-3-脱氧辛糖酸；Hep：L-甘油-D-甘露庚糖；Man：甘露糖；Rha：鼠李糖；Gal：半乳糖；Abe：阿可比糖
LPS层的主要功能：
1）LPS结构的多变，决定了革兰氏阴性细菌细胞表面抗原决定簇的多样性；
根据LPS抗原性的测定，沙门氏菌(Salmonella)的抗原型多达2107种，一般都源自O-特异侧链种类的变化。这种多变性是革兰氏阴性细菌躲避宿主免疫系统攻击，保持感染成功的重要手段。也可依此用灵敏的血清学方法对病原菌进行鉴定，在传染病的诊断中有其重要意义。
2）LPS负电荷较强，与磷壁酸相似，也有吸附Mg2+、Ca2+等阳离子以提高其在细胞表面浓度的作用，对细胞膜结构起稳定作用。
3）类脂A是革兰氏阴性细菌致病物质——内毒素的物质基础；
4）具有控制某些物质进出细胞的部分选择性屏障功能；
5）许多噬菌体在细胞表面的吸附受体；
外膜蛋白(outer membrane protein)
嵌合在LPS和磷脂层外膜上的蛋白。有20余种，但多数功能尚不清楚。
孔蛋白（porins）是由三个相同分子量（36000）蛋白亚基组成的一种三聚体跨膜蛋白，中间有一直径约1nm的孔道，通过孔的开、闭，可对进入外膜层的物质进行选择。
非特异性孔蛋白：可通过分子量小于800~900的任何亲水性分子
特异性孔蛋白：只容许一种或少数几种相关物质通过，如维生素B12和核苷酸等。
脂蛋白(lipoprotein)是一种通过共价键使外膜层牢固地连接在肽聚糖内壁层上的蛋白，分子量约为7200。
C、周质空间(periplasmic space, periplasm),又称壁膜间隙
在革兰氏阴性细菌中，一般指其外膜与细胞膜之间的狭窄空间（宽约12~15nm），呈胶状。
周质空间是进出细胞的物质的重要中转站和反应场所。
在周质空间中，存在着多种周质蛋白（periplasmic proteins）：水解酶类；合成酶类；结合蛋白；受体蛋白；
D. 粘合位点：P19
革兰氏阴性菌细胞壁的许多部位，外膜与质膜直接接触，是加固革兰氏阴性菌细胞壁并支撑外膜的另一结构。
有人认为物质可通过粘合位点进入细胞而不必穿越周周空间。
革兰氏阳性和阴性细菌一系列生物学特性的比较（参见周德庆P16）
3）革兰氏染色原理
革兰氏染色的阳性或阴性，与细胞的物理结构有关。
细胞壁结构与革兰氏染色的关系

革氏阳性菌
革氏阴性菌
肽聚糖
含量高，交联密
含量低，交联疏松
脂类
一般无
含量高
乙醇作用
脱水作用
脂溶作用

孔径缩小，结构更紧密
孔径增大，结构变得疏松

大分子复合物滞留
大分子复合物溶出
结果
紫色
红色

（5）细胞壁缺陷细菌：（参见P21）
自发突变——L型细菌
实验室或宿主体内形成 基本去尽——原生质体（G+）
人工去壁
缺壁细菌 部分去除——球状体（G-）

在自然界长期进化中形成——枝原体
1）L型细菌（L-form of bacteria）
细菌在某些环境条件下（实验室或宿主体内）通过自发突变而形成的遗传性稳定的细胞壁缺陷变异型。
因英国李斯德（Lister）预防研究所首先发现而得名（1935年，念珠状链杆菌 Streptobacillus moniliformis）
大肠杆菌、变形杆菌、葡萄球菌、链球菌、分枝杆菌和霍乱弧菌等20多种细菌中均有发现，被认为可能与针对细胞壁的抗菌治疗有关。
特点：没有完整而坚韧的细胞壁，细胞呈多形态；
有些能通过细菌滤器，故又称“滤过型细菌”；
对渗透敏感，在固体培养基上形成“油煎蛋”似的小菌落（直径在0.1mm左右）；
2）原生质体（protoplast）
在人为条件下，用溶菌酶处理或在含青霉素的培养基中培养而抑制新生细胞壁合成而形成的仅由一层细胞膜包裹的，圆球形、对渗透压变化敏感的细胞，一般由革兰氏阳性细菌形成。
特点：对环境条件变化敏感，低渗透压、振荡、离心甚至通气等都易引起其破裂；
有的原生质体具有鞭毛，但不能运动，也不被相应噬菌体所感染；
在适宜条件（如高渗培养基）可生长繁殖、形成菌落，形成芽孢。及恢复成有细胞壁的正常结构；
比正常有细胞壁细菌更易导入外源遗传物质，是研究遗传规律和进行原生质体育种良好实验材料。
3）球状体(sphaeroplast) ，又称原生质球
采用上述同样方法，针对革兰氏阴性细菌处理后而获得的残留部分细胞壁（外壁层）的球形体。与原生质体相比，它对外界环境具有一定的抗性，可在普通培养基上生长。
4）支原体(Mycoplasma)
在长期进化过程中形成的、适应自然生活条件的无细胞壁的原核生物。因它的细胞膜中含有甾醇(一般原核生物没有)，所以即使缺乏细胞壁，其细胞膜仍有较高的机械强度。
青霉素的杀菌作用
作用原理：β-内酰胺环的结构与肽聚糖单体五肽尾末端D-Ala- D-Ala二肽结构相近，因而可竞争性地抑制转肽酶的活性，抑制肽聚糖单体间的交联，形成缺损的细胞壁。
作用特点：对生长旺盛的革氏阳性菌有明显的抑制作用。
青霉素b-内酰胺环结构与D-丙氨酸末端结构相似，从而能占据D-丙氨酸的位置与转肽酶结合，并将酶灭活，肽链之间无法彼此连接，抑制了细胞壁的合成。
溶菌酶的作用：
通过水解N-乙酰葡萄糖胺与N-乙酰胞壁酸间的β-1,4-糖苷键，引起细胞壁“散架”，形成细胞壁完全脱去或部分除去的原生质体（革氏阳性菌）或球状体（革氏阴性菌）。
在低渗溶液中，原生质体或球状体因吸水膨胀并最终导致破裂而死亡；
在等渗蔗糖溶液中，能得到原生质体或球状体。
古生菌的细胞壁（周德庆p16）
古生菌除了热原体属没有细胞壁外，其余都有与真细菌类似功能的细胞壁。
古生菌细胞壁中没有真正的肽聚糖，而是由假肽聚糖、糖蛋白或蛋白质构成。
假肽聚糖：
双糖单位：N-乙酰葡糖胺 β –1，3糖苷键
N-乙酰塔罗糖胺 （不被溶菌酶水解）
肽尾：L-Glu, L-Ala, L-Lys 3个
肽桥：L-Glu 1个氨基酸组成
2、细胞膜（cell membrane）
细胞质膜（cytoplasmic membrane），又称质膜（plasma membrane）、细胞膜（cell membrane）或内膜（inner membrane），是紧贴在细胞壁内侧、包围着细胞质的一层柔软、脆弱、富有弹性的半透性薄膜，厚约7～8nm，由磷脂（占20%～30%）和蛋白质（占50%～70%）组成。
观察方法：
质壁分离后结合鉴别性染色在光学显微镜下观察；原生质体破裂；超薄切片电镜观察；
电镜观察到的细胞质膜，是在上下两暗色层之间夹着一浅色中间层的双层膜结构，这与细胞膜的化学组成有关。
（1）化学组成：磷脂（20~30%）；蛋白质（50~70%）
A. 磷脂
亲水的极性端；疏水的非极性端
在极性头的甘油3C上，不同种微生物具有不同的R基，如磷脂酸、磷脂酰甘油、磷脂酰乙醇胺、磷脂酰胆碱、磷脂酰丝氨酸或磷脂酰肌醇等。
非极性尾则由长链脂肪酸通过酯键连接在甘油的C1和C2位上组成，其链长和饱和度因细菌种类和生长温度而异。
在生理温度下，脂肪酸末端排列成固定的晶格。
不饱和脂肪酸的双键可导致膜结构的变形。当磷脂分子中二者同时存在时，在一定条件下就阻碍了形成晶格结构所需要的有秩序排列。
膜的流动性很大程度上取决于不饱和脂肪酸的结构和相对含量。细胞膜上长链脂肪酸的链长和饱和度因细菌种类和生长温度而异，通常生长温度要求越高的种，其饱和度也越高，反之则低。
甾醇类物质
由磷脂分子形成的双分子膜中加入甾醇类物质可以提高膜的稳定性
B. 膜蛋白
约占细菌细胞膜的50%～70%，比任何一种生物膜都高，而且种类也多。-----细胞膜是重要的代谢活动中心。
根据作用 功能蛋白：担负生理机能（转运蛋白、电子传递蛋白、ATP合成酶、合成细胞壁及糖被的酶）
结构蛋白：维持膜结构
根据分布 整合蛋白（integral protein）或内嵌蛋白（intrinsic protein）
周边蛋白（peripheral protein）或膜外蛋白(extrinsic protein)
（２）结构
液态镶嵌模型(fluid mosaic model) P24
①膜的主体是脂质双分子层；
②脂质双分子层具有流动性；
③整合蛋白因其表面呈疏水性，故可“溶”于脂质双分子层的疏水性内层中；
④周边蛋白表面含有亲水基团，故可通过静电引力与脂质双分子层表面的极性头相连；
⑤脂质分子间或脂质与蛋白质分子间无共价结合；
⑥脂质双分子层犹如一“海洋”，周边蛋白可在其上作“漂浮”运动，整合蛋白则似“冰山”状沉浸在其中作横向移动。
细胞膜是高度有序且不对称的系统，同时又是柔韧、动态的。
流动性：1）膜经受一定程度变形而不被破坏
2）膜中各种成分按需要调整分布，表现出膜的多种功能
不对称性：保证膜的方向性功能 如：能量转换中质子梯度产生物质的传递
（３）细胞膜的生理功能（参见P 24）
①物质运输,选择性地控制营养物质和代谢产物的运送；
②渗透屏障,维持细胞内正常的渗透压；
③合成细胞壁和糖被的各种组分（肽聚糖、磷壁酸、LPS、荚膜多糖等）的重要基地；
④膜上含有氧化磷酸化或光合磷酸化等能量代谢的酶系，是细胞的产能场所；
⑤鞭毛基体的着生部位和鞭毛旋转的供能部位；
（４）间体（mesosome）：
细胞质膜内褶而形成的泡囊状、管状或层状的构造。多见于革兰氏阳性细菌。
不同看法：青霉素酶分泌、DNA复制、分配以及细胞分裂有关；
“间体”仅是电镜制片时因脱水操作而引起的一种赝像
（5）古生菌细胞膜的独特性和多样性 参见周德庆p20
① 古生菌与真细菌细胞膜中的磷脂有明显差异
真细菌：磷酸甘油酯
古生菌：异戊二烯甘油醚
② 古生菌细胞膜中存在着独特的单分子层或单、双分子层混合膜
3、细胞质和内含物P25
细胞质（cytoplasm）是细胞质膜包围的除核区外的一切半透明、胶状、颗粒状物质的总称。含水量约80%。
细胞质的主要成分为核糖体、贮藏物、酶类、中间代谢物、各种营养物和大分子的单体等，少数细菌还有类囊体、羧酶体、气泡或伴孢晶体等有特定功能的组分。
一些内含物无膜包裹，自由存在于细胞质中，如多聚磷酸盐颗粒、藻青素颗粒和一些糖原颗粒；另一些内含物则由单层膜（不是典型的双层膜）所包裹，如聚β-羟丁酸颗粒、某些糖原和硫粒、羧酶体及气泡等。
内含物膜在组成上各不相同，有些为蛋白质，而另一些则包含脂类。
（１）颗粒状贮藏物(reserve materials) P26
各种有机或无机物质的颗粒，主要功能是贮存（碳化合物、无机物和能源），也可将分子连接为特定的形式来降低渗透压。
糖原：大肠杆菌、克雷伯氏菌、芽孢杆菌和蓝细菌等
碳源及能源类 聚β-羟丁酸（PHB）：固氮菌、产碱菌和肠杆菌等
硫粒：紫硫细菌、丝硫细菌、贝氏硫杆菌等
贮藏物 氮源类 藻青素：蓝细菌
藻青蛋白：蓝细菌