生物传感器在新冠病毒检测中的应用_朱子煜.pdf
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1、综述 Review *E-mail: 共同第一作者(These authors contributed equally to this work)Received December 3,2022;published February 15,2023.Project supported by the National Key Research&Development Program of China(No.2019YFA0904104).项目受国家重点研发计划(No.2019YFA0904104)资助.Acta Chim.Sinica 2023,81,253263 2023 Shanghai I
2、nstitute of Organic Chemistry,Chinese Academy of Sciences http,/sioc- 253 化 学 学 报 化 学 学 报 ACTA CHIMICA SINICA 生物传感器在新冠病毒检测中的应用 朱子煜 梁阿新 浩天瑞霖 唐珊珊 刘淼 解炳腾 罗爱芹*(北京理工大学生命学院 分子医学与生物诊疗工业和信息化部重点实验室 北京 100081)摘要摘要 自新型冠状病毒肺炎(COVID-19)爆发以来,准确高效、快速便捷的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)筛查越来越在疫情防控中体现出其重要性.传统的检测方法无法满足短时间内 SARS-CoV-
3、2 大规模感染时的检测需求.生物传感技术具有灵敏度高、选择性好、低成本、易于微型化等优点,其检测时间短的优势还可用于开发即时检测设备,是临床诊断中实时检测 SARS-CoV-2 的潜在替代方案.本综述简要阐述了光学生物传感器、电化学生物传感器、可穿戴式生物传感器、磁性生物传感器、金纳米颗粒生物传感器以及适配体生物传感器的构建方法、工作原理,并总结了其在新冠病毒检测领域的最新应用.最后本综述对生物传感器在新冠病毒检测领域的技术瓶颈与未来的发展趋势进行了总结与讨论.关键词关键词 新冠病毒;生物传感器;检测 The Application of Biosensors in the Detection
4、 of SARS-CoV-2 The Application of Biosensors in the Detection of SARS-CoV-2 Zhu,Ziyu Liang,Axin Haotian,Ruilin Tang,Shanshan Liu,Miao Xie,Bingteng Luo,Aiqin*(Key Laboratory of Molecular Medicine and Biotherapy,the Ministry of Industry and Information Technology,School of Life Science,Beijing Institu
5、te of Technology,Beijing 100081)Abstract Since the outbreak of COVID-19,it is becoming important to screen SARS-CoV-2 with high accuracy,high effi-ciency,and rapidness,for epidemic prevention and control.Conventional detection technologies can not satisfy the require-ments of examining massive peopl
6、e in a very short time.Biosensor technology,with the advantages of high sensitivity,good selectivity,low cost,easy miniaturization,and short detection time,is being used to develop real-time detection equipment,thus as a potential alternative for real-time detection of SARS-CoV-2 in clinical diagnos
7、is.In the present study,the authors summarized the construction methods and principles for optical biosensors,electrochemical biosensors,wearable biosensors,magnetic biosensors,gold nanoparticle biosensors,and aptamer biosensors,followed by the introduction of the current appli-cation of multiple bi
8、osensors in SARS-CoV-2 detection.Conclusively,the technical bottlenecks and future development trends of biosensors in SARS-CoV-2 detection are proposed.Keywords SARS-CoV-2;biosensor;detection 1 引言 新型冠状病毒(SARS-CoV-2)是冠状病毒家族的新型毒株,可侵染人体的呼吸道而引起新型冠状病毒肺炎(COVID-19),具有变异性强、传染性强,传播范围广等特点,给人们的生活和医疗等方面带来了严重的负
9、面影响1-5.SARS-CoV-2 是一种单链核糖核酸(RNA)包膜病毒,主要由刺突表面糖蛋白(spike protein,S 蛋白)、包膜蛋白(envelope protein,E 蛋白)、基质蛋白(matrix protein,M蛋白)和核衣壳蛋白(nucleocapsid protein,N 蛋白)四种蛋白组成6.由于潜伏时间长、传播速度快且存在40%45%的无症状感染7,自2019年12月首次报道以来,COVID-19 在全球范围内呈大流行趋势,严重威胁了公共卫生安全.虽然已经研发出灭活病毒疫苗、腺病毒载体疫苗、重组亚单位疫苗等新冠疫苗,但因有限的接种率与 SARS-CoV-2 的强变
10、异性(如有阿尔法、德尔塔以及奥密克戎等变体)8-11,全球疫情扩散速率仍呈增大趋势.因此,开发一种高灵敏、快速、低成本、易于微型化的即时检测方法(POCT)对 SARS-CoV-2 进行准确筛查显得尤为重要.目前,SARS-CoV-2 的检测主要是对病毒核酸、病毒抗原及抗体进行监测12-13.其中,核酸检测主要是针对SARS-CoV-2病毒的RNA基因序列测序,采用的技术包括基因测序技术、实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应DOI:10.6023/A22120483 化化 学学 学学 报报 综述 254 http,/sioc- 2023 Shanghai Institute of Organic
11、Chemistry,Chinese Academy of Sciences Acta Chim.Sinica 2023,81,253263 技术、环介导等温扩增技术、微滴式数字聚合酶链式反应技术以及 CRISPR 核酸检测技术.核酸检测技术具有灵 敏 度 高、特 异 性 强 等 优 点,其 已 被 广 泛 用 于SARS-CoV-2 的检测.实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应技术(RT-PCR)是目前应用最为普遍的核酸检测技术,其检测原理分为以下几个步骤:(1)将病原体逆转录为 cDNA;(2)以逆转录的 cDNA 为模板进行多轮 PCR 循环扩增;(3)用荧光探针对扩增产物进行检测和分析.PC
12、R 技术反应体系中的 taqMan 探针具有检测特异性高、灵敏度较强的特点.尽管如此,RT-PCR 具有多个缺点,包括原理复杂、周转时间长、对操作人员要求比较高、检测仪器昂贵、易出现假阴性结果.因此,RT-PCR技术不适用于低成本、便携式 SARS-CoV-2 快速检测.抗体检测,主要是针对抗原物质刺激基体产生的与抗原特异性结合的免疫球蛋白.当 SARS-CoV-2 进入人体中,会分别在 57 d 和 1015 d 内产生 IgM 和 IgG抗体.通过检测人体样本中特异性抗体的存在及含量来判断人体是否感染病毒.抗体检测常用的方法有酶联免疫吸附测定(ELISA)12-14、免疫层析(胶体金)法和
13、化学发光免疫分析法等方法,其中 ELISA 应用较为普遍.ELISA被用于检测血清中SARS-CoV-2抗体,与PCR检测相比,检测成本更低,分析时间更短.但因可检测水平的抗体在症状出现后 1014 d 产生,ELISA 不适合诊断早期感染,主要用于血清学筛查和流行病学研究.抗原检测,主要是利用病毒抗原蛋白的单克隆抗体来直接检测相应的抗原蛋白,主要是针对病毒的固有组织成分,包括固有的蛋白质.抗原检测具有成本低、速度快和操作简单的优点,但其结果并不能单独用于确定用户是否感染 SARS-CoV-2 病毒,需要结合其他的诊断结果来确认是否感染病毒.SARS-CoV-2 检测对准确性和检测时间要求较高
14、,而传统检测方法耗时长,存在检测结果不准确的情况,因此开发新型生物检测技术十分必要15-21.表 1 总结了SARS-CoV-2 检测方法的最新研究.生物传感器是一种对生物物质敏感并将其浓度转换为光学信号或电信号进行检测的仪器.该分析系统由固定化的生物敏感材料识别元件(包括酶、抗体、抗原、微生物、细胞、组织、核酸等生物活性物质)、适当的理化换能器(如氧电极、光敏管、场效应管、压电晶体等)及信号放大装置构成22,具有分析速度快、超灵敏、高选择性、成本低和易操作等优势23-24,被认为是一种能有效检测疾病标志物的潜在新方法.我们实验室目前已制备基于分子印迹技术、免标记免疫电化学、荧光传感技术、光电
15、化学传感技术的多种疾病标志物生物传感器,并完成对不同目标物(如癌胚抗原、人免疫球蛋白G、溶菌酶、高半胱氨酸、胆固醇等)定量检测工作25-29;此外,将制备的聚合物作为传感单元与电化学工作站、荧光分光光度计、紫外光谱及超高效液相色谱仪分析设备联用对目标物进行定量检测与分析,在生物传感器构建与检测方面积累了丰富的实验数据和经验.本综述主要简介了用于检测新冠病毒的电化学传感器、光学传感器、可穿戴生物传感器以及基于纳米材料(金纳米、磁性纳米颗粒)生物传感器的研究进展(图 1),并对生物传感器检测新冠病毒未来的发展做出了展望.图图 1 新型生物传感器检测新冠病毒概述示意图 Figure 1 Overvi
16、ew of novel biosensors to detect SARS-CoV-2表表 1 不同 SARS-CoV-2 检测方法的比较 Table 1 Comparison of different SARS-CoV-2 detection methods Techique Apparatus Time required Sensitivity Detection limit Detection range 参考文献 Chest CT scan CT machine 97%,25%30 RT-PCR PCR apparatus 4 h 71%31 MNPs with RT-PCR PCR
17、apparatus Around 30 min 10 copies 32 Colorimetric assay Water bath 30 min 97.6%60 copies per L 601000 copies per L 33 ELISA reder ELISA machine 2 h 87.3%34 Plasmonic biosensor Dual-functional LSPR System 3.7 RNA copies 0.1 fmol/L 0.110 fmol/L 35 Electrochemical biosensor Electrochemical work station
18、 Few min 0.21 fmol/L 0.63 fmol/L 0.63 fmol/L 1 mol/L 36 Field-effect transistor-based biosensor Semiconductor analyzer 2.42102 copies/mL 37 化化 学学 学学 报报 综述 Acta Chim.Sinica 2023,81,253263 2023 Shanghai Institute of Organic Chemistry,Chinese Academy of Sciences http,/sioc- 255 2 用于检测新冠病毒的生物传感器 2.1 基于光
19、学方法的生物传感器检测新冠病毒 光学生物传感器能够把待识别生物分子通过光学信号的变化显示出来,进而实现对化学、生物信息的定量分析,具有检测速度快、灵敏度高和高通量检测等优点.光学生物传感器以被测物质与探测试剂反应后引发的光信号作为探测基础,一般由传感层、光信号转换与放大处理模块等几个功能模块组成.传感层是对被测定物质具有高选择性识别能力的感受器,是光学生物传感器的核心部件,其作用是提取与各种被测定生物量有关的光信息.光信号转化与放大处理模块是将光信号放大并最终转化成电信号从而反映生物浓度的装置38.作为实时检测(PoC)的光学生物传感,横向流动免疫检测(LFIA)的检测条被认为更适用于在偏远地
20、区和公共卫生中心即时检测 SARS-CoV-239(图 2).LFIAs 背后的传感原理是检测分析物(抗原或抗体)借助与标签(如金纳米颗粒、荧光分子和量子点)共轭的二级抗体,促进颜色变化的视觉感知,从而检测分析物的浓度.LFIA 检测条用于快速检测 SARS-CoV-2 受到了广泛关注40-41.Wen 等42利用金纳米颗粒作为标签,开发了一种用于检测患者血清中SARS-CoV-2IgG抗体的LFIA检测条.SARS-CoV-2 核衣壳蛋白被固定在 LFIA 条带上,作为捕获受体,而抗人IgG偶联金纳米颗粒被用作信号,在分析物与金纳米粒子共轭抗体相互作用时,将产生一条红色的线,表明样品中存在分
21、析物.研制的 LFIA 条在更少的样本量(患者血清 10 mL)中实现了快速检测(1015 min),灵敏度提高至 69.1%43.此外,还研究了同时检测IgG和IgM病毒抗体而不是单一病毒抗体的免疫层析试纸,以提高灵敏度44.结果表明,该方法早期(7 d)敏感性较低,中期(814 d)至晚期(15 d)敏感性较高,证实发病 7 d 后可释放抗体.RT-PCR 结果验证了该条带对 SARS-CoV-2 检测的有效性,为 LFIAs 快捷光化学生物传感检测 SARS-CoV-2 开辟了一条新途径.荧光纳米团簇和量子点表现出优异的光学性能,在光学生物传感器中得到广泛应用45.荧光纳米材料的光学行为
22、是由于量子减少和增加的表面体积比.此外,他们展示了颜色可调发射,产生了大的斯托克位移和更高的量子产率46.荧光标签,与光纤一起被证明是一种更简单的方法来开发传感器探针.Huang 等47报道了一种局部表面等离子体偶联荧光光纤生物传感器(LFI-GNPs),用于增强对 SARS-CoV-2 核衣壳蛋白的检测.他们使用了PMMA光纤,其中解密部分被固定化生物识别抗体和与荧光团偶联的标记.传感器显示为 0.1 pg/mL 灵敏度,比传统的 ELISA 测试高一倍,并被证明是高通量传感的合适候选者.此外,Huang 还开发了一种利用聚碳酸酯的低成本微流控平台,以荧光分子为标记,对 IgG/IgM/SA
23、RS-CoV-2 抗原进行多路检测.该平台集成了自制的荧光检测分析仪、SARS-CoV-2 诊断微芯片和多种免疫测定法,用于检测三种生物标志物(IgG、IgM 和抗原).通过检测 IgG 和 IgM 来评价微流体诊断系统对 SARS-CoV-2 感染进展的监测性能.5 例患者 IgG 阳性与临床诊断结果符合率均为 100%;只有 1例患者检测结果为假阴性,可能是感染第 2 天 IgM 水平未明显升高所致.上述结果表明,该免疫检测平台对新冠病毒的诊断具有较高的敏感性和特异性,为新冠病毒检测提供一种新的检测方法.该传感器的显著特点是操作简单、成本低和可即时检测等48.光学生物传感器具有安全、可直接
24、使用和低成本的优点49.荧光、表面等离子体和比色法技术以前都曾用于检测 HIV、埃博拉病毒、诺如病毒和流感病毒等.这些技术已被用于纳米生物传感器,以实现靶向病毒检测.光学生物传感器也可以用作即时(PoC)诊断工具.其中包括用于改善光学成像荧光分析的核酸放大芯片(LOC)技术,特别是针对单个病毒成像,有潜力用于跟踪和监测病毒复制、细胞相互作用和终止,以便更快、更有效地开发治疗方案.应用这些成像技术检测SARS-CoV-2 的研究正在进行中.然而,光学生物传感器稳定性较差,面对干扰时无法保持准确性,目前市场上只有为数不多的用于病毒检测的光学生物传感器.图图 2 基于横向免疫分析的 SARS-CoV
25、-2 病毒感染检测34 Figure 2 Detection of SARS-CoV-2 virus infection based on horizontal immunoassay34 化化 学学 学学 报报 综述 256 http,/sioc- 2023 Shanghai Institute of Organic Chemistry,Chinese Academy of Sciences Acta Chim.Sinica 2023,81,253263 2.2 基于电化学方法的生物传感器检测新冠病毒 电化学生物传感器采用固定电极作为基础电极,将生物活性分子作为分子识别物固定在电极表面,然后
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