位点介绍—傅咏南.pptx
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1、www.zgysyy.org基因位点功能详解基因位点功能详解www.zgysyy.orgDNA损伤修复损伤修复 DNA的遗传保守性是维持物种相对稳定的主要因素,的遗传保守性是维持物种相对稳定的主要因素,但是在生物体内外环境多种因素影响下,也会出现但是在生物体内外环境多种因素影响下,也会出现DNA损伤(也称为突变)。绝大部分损伤被机体内一整套十损伤(也称为突变)。绝大部分损伤被机体内一整套十分有效的修复系统所修复,有些损伤则可以造成生物体分有效的修复系统所修复,有些损伤则可以造成生物体的不可逆伤害,出现细胞衰老、死亡和形成肿瘤。因此的不可逆伤害,出现细胞衰老、死亡和形成肿瘤。因此基因修复能力可以
2、评估个体疾病发生的风险,尤其是癌基因修复能力可以评估个体疾病发生的风险,尤其是癌症的发生的风险。症的发生的风险。www.zgysyy.org DNADNA损伤修复损伤修复损伤修复损伤修复v DNA的遗传保守性是维持物种相对稳定的主要因素,但是在生物体内外环境多种因素影响下,也会出现DNA损伤(也称为突变)。绝大部分损伤被机体内一整套十分有效的修复系统所修复,有些损伤则可以造成生物体的不可逆伤害,出现细胞衰老、死亡和形成肿瘤。因此基因修复能力可以评估个体疾病发生的风险,尤其是癌症的发生的风险。www.zgysyy.org www.zgysyy.orgDNA损伤修复与遗传损伤修复与遗传碱基切除修复
3、碱基切除修复碱基切除修复碱基切除修复 DNA lyaseDNA lyaseSingle base damage Single base damage DNA glycosylase DNA glycosylase核苷酸切除修复核苷酸切除修复核苷酸切除修复核苷酸切除修复XPA,XPB/ERCC3,XPC,XPD/ERCC2,XPA,XPB/ERCC3,XPC,XPD/ERCC2,Bulky nucleotideBulky nucleotideXPE,XPF,XPG/ERCC5,TFIIH,XPE,XPF,XPG/ERCC5,TFIIH,damage,including damage,includ
4、ing ERCC1,p34,p38,p41,p44,p62,ERCC1,p34,p38,p41,p44,p62,UV photo-products&UV photo-products&hssL1,HHR23A,HHR23B,hSSB,hssL1,HHR23A,HHR23B,hSSB,chemical carcinogen-chemical carcinogen-ERCC4,CSB/ERCC6,PCNA,ERCC4,CSB/ERCC6,PCNA,induced adducts induced adducts DNA polymerase,DNA ligaseDNA polymerase,DNA
5、ligase 错配修复错配修复错配修复错配修复hMLH1,hPMS1,hPMS2,hMSH2,hMLH1,hPMS1,hPMS2,hMSH2,Base mismatchBase mismatchhMSH3,hMSH6/hGTBPhMSH3,hMSH6/hGTBP 重组修复重组修复重组修复重组修复 HsRAD51,HsRAD52,HsRAD54,HsRAD51,HsRAD52,HsRAD54,Double strand breaksDouble strand breaks ERCC1,XPF,XRCC1,XRCC2,ERCC1,XPF,XRCC1,XRCC2,V(D)J recombinatio
6、nV(D)J recombinationXRCC3,XRCC4,XRCC5,XRCC6,XRCC3,XRCC4,XRCC5,XRCC6,XRCC7,XRCC8,XRCC9XRCC7,XRCC8,XRCC9www.zgysyy.orgPARP1多聚多聚ADP核糖转移酶核糖转移酶 多聚ADP核糖转移酶,又简写为ADPRT,位于第一号染色体1q41-q42位置。基因全长47.3kb,mRNA全长3861bp,共有23个外显子,该突变位点位于第17个外显子。PARP1编码多聚ADP核糖转移酶。这种酶通过聚ADP核糖基化反应修正多种核蛋白。这种修正以DNA为基础,参与多种重要的细胞活动例如:分化,增殖,
7、肿瘤转移等。同时也参与分子水平的活动,例如修复DNA受损的细胞等等。www.zgysyy.orgXRCC1人类人类X射线交错互补修复基因射线交错互补修复基因1 人类X射线交错互补修复基因1,位于第19号染色体1q13.2-13.3位置。基因全长32.3kb,mRNA全长2087bp,共有17个外显子,编码634个氨基酸的蛋白。XRCC1编码的蛋白对因电离辐射和烷基化物引起的DNA单链断裂能起到有效的修复作用。XRCC1编码的蛋白与DNA连接酶III、聚合酶、多聚ADP核糖转移酶交互作用,参与DNA的碱基切除修复(Base Excision Repair,BER)通路。www.zgysyy.or
8、gPARP1与XRCC1、DNA-polymerase-、DNA ligase III为BER(Base Excision Repair)制造蛋白结合物,而BER是受损DNA的主要修复途径之一。www.zgysyy.orgPARP-1,PARP-2,PARP-3和和XRCC1在在SSBR和和BER中的作用中的作用 www.zgysyy.orgERCC2切除修复复合物切除修复复合物2 切除修复复合物2(ERCC2),位于13号染色体19q13.3位置,共有23个外显子。基因全长19.0kb,mRNA全长2355bp,编码含761个氨基酸的蛋白。核苷酸切除修复通路是几条DNA损伤修复通路之一,由E
9、RCC2编码的蛋白参与转录偶联的核苷酸切除修复,并且是基本转录因子复合物BTF2/TFIIH的一个组成成分。www.zgysyy.org注:注:ERCC2又名又名XPDwww.zgysyy.orgERCC1切除修复复合物切除修复复合物1 核苷酸外切修复蛋白可以修复铂类制剂引起的DNA损伤,ERCC1是核苷酸外切修复家族中一个重要成员。它编码297个氨基酸的蛋白,与ERCC11、XPF和ERCC4形成复合物而发挥功能,这种复合物可能是重组修复和核苷酸外切修复所必须。www.zgysyy.orgERCC1参与的参与的NER修复路径修复路径www.zgysyy.orgMTHFR亚甲基四氢叶酸还原酶亚
10、甲基四氢叶酸还原酶 MTHFR主要作用是在叶酸代谢通路中将5,10-亚甲基四氢叶酸转化为具有生物学功能的5-甲基四氢叶酸盐。5-甲基四氢叶酸盐可以进一步进入甲基传递通路,通过同型半胱氨酸的重新甲基化过程间接得为DNA甲基化和蛋白质甲基化提供甲基并且使血液中的同型半胱氨酸量保持在一个较低的水平。此外叶酸的中间代谢产物在核苷酸合成过程中也有重要的作用,通过单碳代谢为嘌呤环形成提供碳原子。MTHFR基因的缺陷可以导致多个机体必须生化途径的紊乱,包括细胞周期调控、DNA复制、DNA以及蛋白质甲基化修饰等,并进而引发神经管缺陷、癌症、心脑血管等多种疾病。www.zgysyy.org饮食饮食叶酸叶酸叶酸叶
11、酸蝶酰单谷氨酸蝶酰单谷氨酸蝶酰多聚谷氨酸蝶酰多聚谷氨酸四氢四氢叶酸叶酸5,10-甲酰甲酰四氢叶酸四氢叶酸10-甲酰甲酰四氢叶酸四氢叶酸二氢叶酸二氢叶酸5,10-亚甲基亚甲基四氢叶酸四氢叶酸甲硫氨酸甲硫氨酸5-甲基甲基四氢叶酸四氢叶酸同型半同型半胱氨酸胱氨酸半胱氨酸半胱氨酸甲硫氨酸合成酶甲硫氨酸合成酶(MTR)+维生素维生素B12MTHFR1298A-C677C-TdTMPDNA合成与合成与损伤修复损伤修复dUMPS-腺苷甲硫氨酸腺苷甲硫氨酸S-腺苷腺苷同型半胱氨酸同型半胱氨酸DNA蛋白质蛋白质甲基化甲基化四氢四氢叶酸叶酸合成合成核苷酸核苷酸胱硫醚胱硫醚甲基转移酶ATPPP+Pi胱硫醚-合成酶丝
12、氨酸丝氨酸还原酶MTRR66A-G甲基甲基www.zgysyy.orgDNA损伤修复与肿瘤损伤修复与肿瘤 通路基因肿瘤BERUNG、hSMUG1、TDG、MBD4、hOGG1、MYH、NTH1、MPG、MBD4/1、ADPRT、APEx1/2、XRCC1、FEN1、POLI、LIG1/3、MGMT头颈鳞上皮细胞癌、乳腺癌、宫颈癌、结直肠癌、胃癌、食道癌肺癌 肺癌NERXpc、XPA、hHR23B/HR23A、RPA1/RPA2XPB、XPD、XPG、ERCC1、XPF、CSAPCNA、BRCA 1、BRIP1、DDB1/DDB2LIG4肺癌、乳腺癌、膀胱癌、结直肠癌等MMRMSH2、MSH3、
13、MSH6、MLH1、PMS1/2头颈鳞上皮癌、卵巢癌、食道癌、结直肠癌SBRMUS81、PRKDC、KU70、ku80、XRCC4XRCC3、XRCC2、RAD54B/RAD54L、RAD52RAD51C、RAD50、BRCA1/BRCA2、MRE11ANBS1肺癌、乳腺癌、卵巢癌、脑膜瘤等www.zgysyy.orgXRCC1与肺癌易感性与肺癌易感性 XRCC1参与的DNA修复通路的遗传性或获得性缺陷将破坏基因的完整性,导致细胞向恶性转变,从而影响个体对肿瘤疾病的易感性。分子生物学研究表明,XRCC1基因上第399号氨基酸Arg-Gln的替代,可能可以加强XRCC1蛋白与DNA-致癌物加合物
14、的结合能力,从而影响个体的肿瘤易感性。张文娟,修复基因XRCC1多态性与肺癌遗传易感性关系研究样本性质:样本为郑州大学第一、二附属医院和河南胸科医院的149 例河南汉族肺癌病例和157例正常人对照。XRCC1Arg/ArgArg/GlnGln/Gln肺癌组725423对照组7966122-4.583P-value-0.032OR-2.20695%CI-1.0554.612结果与结论:Arg399Gln突变型在病例组与肺癌的发生中度相关(OR=2.206,95%CI,1.0554.612)。www.zgysyy.orgXRCC1与食管癌易感性与食管癌易感性 分子生物学研究表明,XRCC1基因上第
15、194号氨基酸Arg-Trp的替代,可能引起XRCC1活性降低,导致个体的DNA修复能力下降。在对中国人群超过1000例病例对照的研究中发现,XRCC1Arg194Trp与食管癌发生存在显著关联。Xing D和Qi J等Polymorphisms of DNA repair genes xrcc1 and xpd and their associations with risk of esophageal squamous cell carcinoma in a chinese population样本性质:中国人群433例食管癌病例和524例健康对照。XRCC1 Arg194TrpCCCTT
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