LncRNA SNHG16通过靶向miR-421_MPC-1轴改善脓毒症诱导的肾炎和细胞凋亡.pdf
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1、广西医科大学学报JOURNAL OF GUANGXI MEDICAL UNIVERSITY2023Jul.40(7)LncRNA SNHG16通过靶向miR-421/MPC-1轴改善脓毒症诱导的肾炎和细胞凋亡*杨丹平,郭峻氚,刘艳,肖东(新疆维吾尔自治区人民医院重症医学科,乌鲁木齐830000)摘要目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)SNHG16对脓毒症诱导的肾细胞炎症和细胞凋亡的改善作用与机制。方法:应用内毒素脂多糖(LPS)在体外诱导人近端肾小管上皮细胞(HRPTEC)构建脓毒症样肾细胞模型,细胞分为对照组和LPS组。将LPS组的HRPTEC分为SNHG16过表达组(LPSSNHG1
2、6组),过表达空载体组(LPSvector组),SNHG16过表达联合miR-421 拟似物处理组(LPSSNHG16miR-421 mimic组),SNHG16过表达联合线粒体丙酮酸载体-1(MPC-1)小干扰RNA(siR-NA)沉默处理组(LPSSNHG16si-MPC-1组)。应用荧光素酶报告基因检测验证miR-421序列与SNHG16序列的结合情况以及miR-421与MPC-1 3-UTR的结合情况。用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测各组HRPTEC中SNHG16和miR-421表达水平,western blotting检测各组HRPTEC中cleaved-caspase 3
3、、Bcl-2、MPC-1的表达水平,细胞计数试剂盒(CCK-8)法检测各组HRPTEC的增殖率,流式细胞术检测细胞凋亡率。酶联免疫吸附实验(ELISA)检测各组细胞培养上清中肿瘤坏死因子-(TNF-)、白细胞介素-1(IL-1)、白细胞介素-6(IL-6)的水平。结果:与对照组比较,LPS组的细胞增殖率降低(P0.05),细胞凋亡率增加(P0.05),细胞中miR-421、cleaved-caspase 3和Bcl-2的表达增加(均P0.05),而细胞中SNHG16和MPC-1的表达减少(均P0.05),细胞培养上清中TNF-、IL-1、IL-6的表达增加(均P0.05)。LPS处理联合SNH
4、G16过表达增加了细胞增殖率(P0.05),减少了细胞凋亡(P0.05),抑制了细胞培养上清中TNF-、IL-1、IL-6的表达(均P0.05)。而SNHG16组的上述作用均被miR-421-mimic部分逆转(P0.05)。在LPS+SNHG16中加入si-MPC-1后,LPS+SNHG16组的上述作用均被si-MPC-1部分逆转(均P0.05)。结论:LncRNA SNHG16通过靶向miR-421/MPC-1轴改善脓毒症诱导的肾细胞炎症和细胞凋亡。关键词长链非编码RNASNHG16;微小RNA-421;线粒体丙酮酸载体1;脓毒症急性肾损伤;细胞凋亡中图分类号:R692文献标志码:A文章编
5、号:1005-930X(2023)07-1107-09DOI:10.16190/ki.45-1211/r.2023.07.005LncRNA SNHG16 improving sepsis-induced nephritis and apoptosis by targeting miR-421/MPC-1 axisYang Danping,Guo Junchuan,Liu Yan,Xiao Dong.(Department of Critical Medicine,Peoples Hospital of Xinji-ang UygurAutonomous Region,Urumqi 83000
6、0,China)AbstractObjective:To investigate the effect and mechanism of long non-coding RNA(lncRNA)SNHG16 onsepsis-induced renal cell inflammation and apoptosis.Methods:Human renal proximal tubular epithelial cells(HRPTEC)was induced by lipopolysaccharide(LPS)in vitro to construct a sepsis-like renal c
7、ell model.The cellswere divided into control group and LPS group.HRPTEC in LPS group were divided into SNHG16 overexpres-sion group(LPS+SNHG16 group),overexpression empty vector group(LPS+vector group),SNHG16 overexpres-sion combined with miR-421 mimic group(LPS+SNHG16+miR-421 mimic group)and SNHG16
8、 overexpressioncombined with mitochondrial pyruvate carrier-1(MPC-1)small interfering RNA(siRNA)silencing group(LPS+SNHG16+si-MPC-1 group).Luciferase reporter gene detection was used to verify the binding of miR-421 se-quence to SNHG16 sequence and the binding of miR-421 to MPC-1 3-UTR.Real-time flu
9、orescence quantitativepolymerase chain reaction(RT-qPCR)was used to detect the expression levels of SNHG16 and miR-421 in HRPT-EC of each group,western blotting was used to de-tect the expression levels of cleaved-caspase 3,Bcl-2 and MPC-1 in HRPTEC of each group,cell count-ing kit-8(CCK-8)method wa
10、s used to detect the*基金项目:新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(No.2021D01C156)通信作者,E-mail:收稿日期:2023-01-13 1107广西医科大学学报2023 Jul.40(7)proliferation rate of HRPTEC of each group and the apoptosis rate was detected by flow cytometry.The levels oftumor necrosis factor-(TNF-),interleukin-1(IL-1)and interleukin-6(IL-6)in cell
11、 culture supernatant ofeach group were detected by enzyme-linked immunosorbent assay(ELISA).Results:Compared with the controlgroup,the cell proliferation rate of LPS group decreased(P0.05),the apoptosis rate increased(P0.05),andthe expressions of miR-421,cleaved-caspase 3 and Bcl-2 increased(all P0.
12、05).However,the expressions ofSNHG16 and MPC-1 in cells decreased(all P0.05),and the expressions of TNF-,IL-1 and IL-6 in cell cul-ture supernatant increased(all P0.05).LPS treatment combined with SNHG16 overexpression increased thecell proliferation rate(P0.05),decreased the apoptosis(P0.05),and in
13、hibited the expressions of TNF-,IL-1 and IL-6 in cell culture supernatant(all P0.05).However,the above effects of SNHG16 group were partial-ly reversed by miR-421-mimic(P0.05).The above effects of LPS+SNHG16 group were partially reversed bysi-MPC-1 after adding si-MPC-1 to LPS+SNHG16(all P0.05).Conc
14、lusion:LncRNA SNHG16 can improvesepsis-induced renal cell inflammation and apoptosis by targeting miR-421/MPC-1 axis.Keywordslong non-coding RNA SNHG16;small RNA-421;mitochondrial pyruvate carrier 1;sepsis-inducedacute kidney injury;apoptosis脓毒症引起的急性肾损伤(acute kidney injury,AKI)是一种严重威胁患者生命健康的肾脏疾病1-3,
15、过度炎症反应和肾细胞凋亡是脓毒性AKI的关键过程3。已知过度炎症浸润可直接影响肾实质,促进肾小管细胞凋亡,从而诱发AKI2,4。而减轻脓毒性AKI动物的过度炎症状态已被证明对脓毒性AKI有益,包括改善肾细胞的凋亡和炎症5。然而,关于调控脓毒性AKI炎症反应和细胞凋亡机制的研究仍然较少。长链非编码RNA(long noncoding RNAs,lncRNA)是一类长度大于200 bp的内源性RNA,已被多次报道在脓毒症和AKI疾病的诊断和治疗中具有重要意义6-8。小核仁 RNA 宿主基因 16(SN-HG16)是一种位于染色体 17q25.1 上的 lncRNA9,可通过靶向miR-15a/16
16、表达在内毒素脂多糖(lipo-polysaccharide,LPS)诱导RAW264.7细胞炎症中发挥抗炎作用10。然而,并不清楚SNHG16对脓毒性AKI炎症和肾细胞凋亡的调控作用和机制。LPS是革兰氏阴性菌细胞壁外壁的重要组成部分,目前广泛用于建立脓毒性AKI模型11。本研究利用LPS处理人近端肾小管上皮细胞(human renal proximal tu-bular epithelial cells,HRPTEC)在体外模拟脓毒性AKI 模型,并探讨过表达 SNHG16 对 LPS 诱导的AKI细胞模型中的炎症反应和细胞凋亡的作用和下游分子机制。1材料和方法1.1试剂与耗材HRPTEC
17、购于上海弘顺生物科技有限公司。10%胎牛血清(FBS)和杜尔贝科改良Eagle培养基(DMEM)购于美国HyClone公司。兔抗线粒体丙酮酸载体-1(mitochondrial pyruvate carrier 1,MPC-1)的一抗anti-MPC-1、兔抗切割模式的半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶 3(cleaved-caspase 3)的一抗 anti-cleaved-caspase 3、兔抗凋亡蛋白Bcl-2的一抗anti-Bcl-2以及兔抗磷酸甘油醛脱氢酶(glyceraldehyde-phosphate dehydrogenase,GAPDH)的 一 抗 anti-GAPDH 均购于美国 C
18、ell Signaling Technology 公司。蛋白免疫印迹(western blotting)的二抗(山羊抗兔 IgG)购于赛默飞世尔科学公司。微小 RNA(microRNA,miR)-421 的拟似物(miR-421-mimic)以及阴性对照寡核苷酸(miR-NC)购于广州日博生物技术。LPS购于美国Sigma公司。细胞计数试剂盒(CCK-8)试剂盒、白细胞介素(IL)-6/肿瘤坏死因子-(TNF-)/IL-1的酶联免疫吸附试验(ELISA)试剂盒、Annexin V/碘化丙啶(PI)细胞凋亡染色试剂盒购于上海碧云天公司。重组的荧光素酶报告基因购于上海吉玛公司。SNHG16的pcD
19、NA3.1过表达质粒(SNHG16)和空质粒(vector)、MPC-1小干扰 RNA(Small interfering RNA of MPC-1,si-MPC-1)及其阴性对照(si-NC)、Trizol试剂均购于美国In-vitrogen公司。Lipofectamine3000试剂购于美国Thermo Fisher Scientific公司。SYBR Green MasterMix和PrimeScript RT Reagent试剂盒购于日本Ta-kara公司。1.2细胞培养 1108将HRPTEC置于37、5%CO2的细胞培养箱中,于含10%FBS的DMEM培养基中培养。每24 h更换新
20、鲜培养基,当细胞融合度达到80%,用胰蛋白酶以13的比例进行传代,将对数生长期23代的HRPTEC用于后续实验。1.3细胞转染和分组根据制造商的说明,使用Lipofectamine3000试剂进行HRPTEC转染。在6孔板(2105个细胞/孔)中,分别用6 g/mL SNHG16和6 g/mL vector,6 g/mL si-MPC-1和6 g/mL si-NC,或50 nmol/L的miR-421-mimic和miR-NC转染24 h。HRPTEC分为对照组和LPS组,在24孔板中,LPS组细胞(2105个/孔)以10 g/mL LPS处理细胞24 h,对照组不进行细胞处理。将 LPS 处
21、理后的HRPTEC 分为 LPSSNHG16 组(10 g/mL LPS 和6 g/mL SNHG16转染处理细胞24 h),LPSvector组(10 g/mL LPS 和 6 g/mL vector 转染处理细胞24 h),LPSSNHG16miR-421 mimic 组(10 g/mL LPS 联合 6 g/mL SNHG16 和 50 nmol/L miR-421-mimic共转染处理细胞24 h),LPSSNHG16si-MPC-1 组(10 g/mL LPS 联合 6 g/mL SNHG16和6 g/mL si-MPC-1共转染处理细胞24 h)。收集细胞沉淀和培养物上清液对各组细
22、胞进行后续分析。1.4定量PCR(qPCR)检测根据制造商说明使用Trizol试剂从各组HRPT-EC 中提取总 RNA。根据制造商说明使用 Prime-Script RT Reagent Kit反转录5 g总RNA从而合成cDNA。采 用 StepOnePlus 系 统 和 SYBR GreenMaster Mix进行qPCR。GAPDH作为内参基因,使样品中靶基因的表达水平的标准统一。用相对定量方法(2Ct)计算表达水平的倍数变化。本研究使用的引物由生工生物工程(上海)技术有限公司合成:MPC-1 正:5-CAT CTC AAA CAG ATG TCTGAC-3;MPC-1 反:5-TAA
23、 TGT CTC CGT GCACAG TCT T-3。SNHG16 正:5-CAG TCA GCCTCA GTT TCC AA-3;SNHG16 反:5-AGG CAGGGC TGC TGA T-3。miR-421 正:5-CGG CGGGGC CTC ATT AAA TGT T-3;miR-421 反:5-CAG TGC AGG GTC CGA GGT AT-3。GAPDH正:5-ATG ACT CTA CCC ACG GCAAG-3;GAP-DH 反:5-CTG GAA GAT GGT GAT GGG TT-3。U6 正:5-TTG ACT CCA CAA AAG GGA AGAAG-3
24、,U6 反:5-TCC AGA GGT CTG TTG AATCCG-3。1.5双荧光素酶报告试验为证明SNHG16与miR-421之间的结合关系,将野生型结合位点的序列或含有突变型结合位点的序列分别克隆到表达萤火虫荧光素酶载体中。用 Lipofectamine3000 将 野 生 型 SNHG16(SN-HG16-WT)和突变型 SNHG16(SNHG16-MUT)荧光素酶报告载体分别与miR-421 mimic或miR-NC共转染到HRPTEC中(1105细胞/孔);24 h后使用荧光素酶报告基因检测试剂盒评估荧光素酶活性。另外,用Lipofectaminee3000将野生型MPC-1 3
25、-UTR(MPC-13-UTR-WT)和突变型MPC-1 3-UTR(MPC-13-UTR-MUT)的荧光素酶报告载体分别与miR-421 mimic或miR-NC共转染到HRPT-EC(1105个细胞/孔)中;24 h后使用荧光素酶报告基因检测试剂盒评估荧光素酶活性。1.6CCK-8细胞增殖实验将细胞以 1 500 个/孔的密度接种到 96 孔板中。根据“1.3项”中的处理方法,各组处理时长为0 h、24 h、48 h和72 h。每个时间点到后在培养细胞中加入CCK-8试剂(10 L/孔),在37 培养箱中再孵育2.5 h。光密度(OD)作为相对存活细胞数的指标,在450nm波长下用酶标仪读
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