生物化学与分子生物学八课件9市公开课金奖市赛课一等奖课件.pptx
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1、目目 录录蛋白质合成蛋白质合成与加工与加工Protein Synthesis and Processing第十八章第十八章第第1页页第第1页页目目 录录1954年年,Paul Zamecnik及及其其同同事事试试验验证证实实体体内内蛋蛋白白质质是是由由氨氨基基酸酸合合成成。1956年年,他他们们发发觉觉了了氨氨基基酰酰-tRNA合合成成酶。酶。1958年年,M.B.Hoagland和和Zamecnik又又发发觉觉蛋蛋白白质质生生物物合成需要可溶性合成需要可溶性RNA为中介。为中介。1961年年,Howard Dintzis证证实实血血红红蛋蛋白白肽肽链链合合成成方方向向是是从从N-末端向末端向
2、C-末端进行。末端进行。19611966年年间间,Nirencerg、Matthaei和和Khorana先先后后拟拟定了定了64个遗传密码。个遗传密码。19731976年年,麦麦胚胚无无细细胞胞体体系系、兔兔网网织织无无细细胞胞体体系系分分别别建立,蛋白质合成详细过程终于揭晓。建立,蛋白质合成详细过程终于揭晓。第第2页页第第2页页目目 录录l蛋白质生物合成蛋白质生物合成,即,即翻译翻译(translation)l翻译过程翻译过程就是将核酸中就是将核酸中核苷酸序列核苷酸序列编码遗传信息,编码遗传信息,通过通过遗传密码遗传密码破译方式解读为蛋白质分子中破译方式解读为蛋白质分子中20种种氨基酸排列顺
3、序氨基酸排列顺序。第第3页页第第3页页目目 录录蛋白质合成体系构成蛋白质合成体系构成Components Required for Protein Biosynthesis第一节第一节 第第4页页第第4页页目目 录录参与蛋白质生物合成三种参与蛋白质生物合成三种RNA:lmRNA(messenger RNA,信使信使RNA)lrRNA(ribosomal RNA,核糖核蛋白体核糖核蛋白体RNA)ltRNA(transfer RNA,转移转移RNA)辅助因子包括辅助因子包括:起始因子起始因子(initiation factor,IF)延长因子延长因子(elongation factor,EF)释放
4、因子(终止因子)释放因子(终止因子)(release factor,RF)等等 氨基酰氨基酰-tRNA合成酶合成酶(aminoacyl-tRNA synthetase)第第5页页第第5页页目目 录录一、一、mRNA是蛋白质是蛋白质/多肽链合成模板多肽链合成模板l在遗传信息传递过程中,在遗传信息传递过程中,DNA转录生成转录生成mRNA,mRNA作为蛋白质合成直接模板,指导蛋白作为蛋白质合成直接模板,指导蛋白质多肽链合成。质多肽链合成。l mRNA包括包括5-非翻译区非翻译区(5-untranslated region,5-UTR)开放阅读框架区开放阅读框架区(open reading fram
5、e,ORF)3-非翻译区非翻译区(3-untranslated region,3-UTR)第第6页页第第6页页原核生物原核生物mRNA真核生物真核生物mRNA非翻译区非翻译区核蛋白体结合位点核蛋白体结合位点起始密码子起始密码子终止密码子终止密码子编码序列编码序列PPP53蛋白质蛋白质PPPmG-53蛋白质蛋白质AAA目目 录录第第7页页第第7页页目目 录录(一)(一)mRNA含有含有64种密码子种密码子mRNA分分子子上上每每3个个核核苷苷酸酸构构建建一一个个密密码码子子,编编码码某某一一特特定定氨氨基基酸酸或或作作为为蛋蛋白白质质合合成成起起始始、终终止止信信号号,称称为为三三联联体体密密码
6、码(triplet codon),也称,也称遗传密码子遗传密码子(genetic codon)。起始密码起始密码(initiation codon):AUG 终止密码终止密码(termination codon):UAA、UAG、UGA 第第8页页第第8页页遗遗遗遗传传传传密密密密码码码码表表表表目目 录录第第9页页第第9页页目目 录录1.遗传密码含有通用性遗传密码含有通用性遗传密码含有通用性遗传密码含有通用性(universal)(二)遗传密码含有(二)遗传密码含有几种特性几种特性l从原核生物生物(包括病毒、细菌等)、真核生从原核生物生物(包括病毒、细菌等)、真核生物以及人类都共同使用同一套
7、遗传密码。物以及人类都共同使用同一套遗传密码。l已发觉少数例外,如动物细胞线粒体、植物细胞已发觉少数例外,如动物细胞线粒体、植物细胞叶绿体。叶绿体。2.密码子含有方向性密码子含有方向性(direction)l起始密码子总是位于起始密码子总是位于mRNA开放阅读框架开放阅读框架5末端,末端,终止密码子位于终止密码子位于3末端。末端。l翻译方向是从翻译方向是从5到到3末端。末端。第第10页页第第10页页目目 录录3.遗传密码含有连续性遗传密码含有连续性(commaless)l 密密码码子子按按5 3方方向向每每3个个一一组组阅阅读读框框架架顺顺序序翻翻译译,无标点、不重叠,即无标点、不重叠,即连续
8、性连续性lmRNA开开放放阅阅读读框框架架内内发发生生一一个个或或两两个个碱碱基基插插入入或或缺缺失失,可可引引起起移移码码突突变变(frameshift mutation)。翻译蛋白质氨基酸顺序则发生改变。翻译蛋白质氨基酸顺序则发生改变。第第11页页第第11页页目目 录录4.遗传密码含有简并性遗传密码含有简并性(degeneracy)目目 录录l简并性,即简并性,即同一个氨基酸含有多个密码子,同一个氨基酸含有多个密码子,或者多个密码子代表一个氨基酸现象。或者多个密码子代表一个氨基酸现象。l遗传密码中,除色氨酸和甲硫氨酸仅相应遗传密码中,除色氨酸和甲硫氨酸仅相应一个密码子外,其余氨基酸都有一个
9、以上一个密码子外,其余氨基酸都有一个以上密码子为其编码。密码子为其编码。第第12页页第第12页页简并性简并性简并性简并性(degeneracy)(degeneracy)目目 录录第第13页页第第13页页目目 录录5.5.遗传密码含有摆动性遗传密码含有摆动性遗传密码含有摆动性遗传密码含有摆动性(wobble)编码同一氨基酸不同密码子互称同义密码编码同一氨基酸不同密码子互称同义密码子;同义密码子之间差异通常只在第子;同义密码子之间差异通常只在第3位位碱基上,密码子第碱基上,密码子第3位碱基与位碱基与tRNA反密码反密码子不严格恪守碱基配对规律,而是摆动碱子不严格恪守碱基配对规律,而是摆动碱基配对。
10、基配对。第第14页页第第14页页U摆动配对摆动配对目目 录录第第15页页第第15页页目目 录录密码子、反密码子配对摆动性tRNA反密码子反密码子第第1位碱基位碱基IUGACmRNA密码子密码子第第3位碱基位碱基U、C、AA、GU、CUG第第16页页第第16页页目目 录录二、二、一个一个tRNA只能转运一个氨基酸但只能转运一个氨基酸但一个氨基酸可由几种一个氨基酸可由几种tRNA转运转运反密码环反密码环氨基酸臂氨基酸臂第第17页页第第17页页目目 录录tRNAtRNA三级结构示意图三级结构示意图三级结构示意图三级结构示意图第第18页页第第18页页目目 录录三、三、rRNA与蛋白质构成核糖体与蛋白质
11、构成核糖体 目目 录录 蛋白质合成场合蛋白质合成场合第第19页页第第19页页目目 录录核核核核糖糖糖糖体体体体构构构构成成成成目目 录录原核生物核糖体原核生物核糖体 70 S Mt 2.7106 真核生物核糖体真核生物核糖体 80S Mt 4.2106第第20页页第第20页页目目 录录核糖体在蛋白质合成中有主要作用:核糖体在蛋白质合成中有主要作用:核糖体两亚基上含有结合核糖体两亚基上含有结合mRNA位点,尚位点,尚有与起始因子、延长因子、释放因子及各种酶有与起始因子、延长因子、释放因子及各种酶结合位点;并且含有两个结合位点;并且含有两个tRNA结合位点;结合位点;A位位点是氨基酰点是氨基酰tR
12、NA结合位点,结合位点,P位点是肽酰位点是肽酰tRNA结合位点。结合位点。通过将通过将mRNA、氨基酰、氨基酰-tRNA和相关蛋白因子放置在正确位置来调整蛋白质和相关蛋白因子放置在正确位置来调整蛋白质合成。合成。核糖体是合成蛋白质场合。核糖体是合成蛋白质场合。第第21页页第第21页页目目 录录l20种氨基酸(种氨基酸(AA)l酶及众多蛋白因子,如酶及众多蛋白因子,如氨基酰氨基酰-tRNA合成合成酶、起始因子酶、起始因子(initiation factor,IF)、延延长因子(长因子(elongation factor,EF)、释放释放因子(因子(release factor,RF)。lATP、
13、GTPl无机离子无机离子四、蛋白质合成体系还需要其它辅助因子四、蛋白质合成体系还需要其它辅助因子第第22页页第第22页页目目 录录大肠杆菌蛋白质合成大肠杆菌蛋白质合成5 5个阶段所需化合物个阶段所需化合物1氨基酸活化氨基酸活化20种氨基酸种氨基酸20种氨基酰种氨基酰-tRNA合成酶合成酶32种(或多于种(或多于32种)种)tRNAATP、Mg2+2起始起始mRNAN-甲酰甲硫氨酰甲酰甲硫氨酰-tRNAfmermRNA上起始密码子(上起始密码子(AUG)30S核糖体亚基核糖体亚基50S核糖体亚基核糖体亚基起始因子(起始因子(IF-1,IF-2,IF-3)GTP、Mg2+3延长延长含有功效含有功效
14、70S核糖体(起始复合物)核糖体(起始复合物)密码子特异氨基酰密码子特异氨基酰-tRNA延长因子(延长因子(EF-Tu,EF-Ts,EF-G)GTP、Mg2+4终止与释放终止与释放mRNA上终止密码上终止密码释放因子(释放因子(RF-1,RF-2,RF-3)5折叠和翻译后加工折叠和翻译后加工特异酶、辅助因子、除去起始残基和信号肽所需化合物,特异酶、辅助因子、除去起始残基和信号肽所需化合物,水解过程,末端残基修饰,磷酸、甲基、羧基、碳水化合物或辅水解过程,末端残基修饰,磷酸、甲基、羧基、碳水化合物或辅基结合到蛋白质上基结合到蛋白质上阶段阶段必需化合物必需化合物1氨基酸活化氨基酸活化20种氨基酸种
15、氨基酸20种氨基酰种氨基酰-tRNA合成酶合成酶32种(或多于种(或多于32种)种)tRNAATP、Mg2+2起始起始mRNAN-甲酰甲硫氨酰甲酰甲硫氨酰-tRNAmRNA上起始密码子(上起始密码子(AUG)30S核糖体亚基核糖体亚基50S核糖体亚基核糖体亚基起始因子(起始因子(IF-1,IF-2,IF-3)GTP、Mg2+3延长延长含有功效含有功效70S核糖体(起始复合物)核糖体(起始复合物)密码子特异氨基酰密码子特异氨基酰-tRNA延长因子(延长因子(EF-Tu,EF-Ts,EF-G)GTP、Mg2+4终止与释放终止与释放mRNA上终止密码上终止密码释放因子(释放因子(RF-1,RF-2,
16、RF-3)5折叠和翻译后加工折叠和翻译后加工特异酶、辅助因子、除去起始残基和信号肽所需化合物,特异酶、辅助因子、除去起始残基和信号肽所需化合物,水解过程,末端残基修饰,磷酸、甲基、羧基、碳水化合物或辅水解过程,末端残基修饰,磷酸、甲基、羧基、碳水化合物或辅基结合到蛋白质上基结合到蛋白质上阶段阶段必需化合物必需化合物第第23页页第第23页页目目 录录蛋白质合成过程蛋白质合成过程Protein Synthesis Process 第二节第二节第第24页页第第24页页目目 录录l氨基酸活化氨基酸活化l肽链合成起始肽链合成起始(initiation)l肽链延长肽链延长(elongation)l肽链合成
17、终止肽链合成终止(termination)及释放及释放整个翻译过程可分为整个翻译过程可分为4 4个阶段个阶段 :翻翻译译过过程程从从开开放放阅阅读读框框架架5-AUG开开始始向向3 阅阅读读,按按mRNA上上三三联联体体密密码码顺顺序序指指导导蛋蛋白白质质从从N端向端向C端合成,直至终止密码。端合成,直至终止密码。第第25页页第第25页页目目 录录氨基酸氨基酸+tRNA氨基酰氨基酰-tRNAATP AMPPPi氨基酰氨基酰-tRNA合成酶合成酶(一)氨基酰(一)氨基酰-tRNA合成酶催化氨基酸合成酶催化氨基酸与与tRNA连接连接一、氨基酸活化成氨基酰一、氨基酸活化成氨基酰-tRNA氨基酰氨基酰
18、-tRNA合成酶合成酶(aminoacyl-tRNA synthetase)第第26页页第第26页页目目 录录第一步反应第一步反应:氨基酸氨基酸 ATP-E 氨基酰氨基酰-AMP-E PPi 目目 录录第第27页页第第27页页目目 录录第二步反应第二步反应:氨基酰氨基酰-AMP-E tRNA 氨基酰氨基酰-tRNA AMP E目目 录录(型)型)第第28页页第第28页页目目 录录l氨基酰氨基酰-tRNA合成酶对底物氨基酸和合成酶对底物氨基酸和tRNA都都有高度特异性。有高度特异性。l氨基酰氨基酰-tRNA合成酶含有合成酶含有校正活性校正活性(editing activity),即酯酶活性,即酯
19、酶活性 。l氨基酰氨基酰-tRNA表示办法:表示办法:Ser-tRNASerMet-tRNAMet(二)氨基酰(二)氨基酰-tRNA合成酶含有校读作用合成酶含有校读作用第第29页页第第29页页目目 录录二、起始阶段形成翻译起始复合物二、起始阶段形成翻译起始复合物指指在在起起始始因因子子作作用用下下,mRNA和和起起始始氨氨基基酰酰-tRNA分分别别与与核核糖糖体体结结合合而而形形成成翻翻译译起起始始复复 合合 物物(translational initiation complex)。第第30页页第第30页页目目 录录l原核生物中有原核生物中有3种种起始因子起始因子(initiation fac
20、tor,IF):IF-1、IF-2、IF-3l真核生物起始因子被称作真核生物起始因子被称作eIF(eukaryotic initiation factor)eIF-1、-2、-3、-4、-5和和-6 第第31页页第第31页页目目 录录翻译起始因子翻译起始因子真核起始因子真核起始因子功效功效eIF-1 多功效因子,参与多个翻译环节多功效因子,参与多个翻译环节eIF-2 增进起始增进起始Met-tRNAMet与核糖体与核糖体40S小亚基结合小亚基结合eIF-2B 又称鸟苷酸互换因子,将又称鸟苷酸互换因子,将eIF-2上上GDP互换成互换成GTP eIF-3 首先与首先与40S小亚基结合因子,并能加
21、速后续环节小亚基结合因子,并能加速后续环节eIF-4A 含有含有RNA解旋酶活性,能解除解旋酶活性,能解除mRNA 5端发夹结构,端发夹结构,使其与使其与40S小亚基结合。是小亚基结合。是eIF-4F 构成成份构成成份eIF-4B 与与mRNA结合,对结合,对mRNA进行扫描并定位第一个进行扫描并定位第一个AUGeIF-4E 结合结合mRNA帽子结构,是帽子结构,是eIF4F构成成份构成成份eIF-4G 一个接头蛋白,能与一个接头蛋白,能与eIF-4E、eIF-3和和poly A结合蛋白结合将结合蛋白结合将40 S小亚基富集至小亚基富集至mRNA,而刺激翻译。是,而刺激翻译。是eIF4F构成构
22、成成份成份eIF-5 增进上述起始因子从增进上述起始因子从40S小亚基脱落,以便小亚基脱落,以便40S小亚基与小亚基与60S大亚基结合形成大亚基结合形成80S起始复合物起始复合物eIF-6 增进无活性增进无活性80S核糖体解聚生成核糖体解聚生成40S小亚基和小亚基和60S大亚基大亚基原核起始因子原核起始因子功效功效IF-1 预防预防tRNA过早地结合到过早地结合到A位位IF-2 增进增进fMet-tRNAfMet结合到结合到30S小亚基小亚基IF-3 结合结合30S小亚基,预防它过早地与小亚基,预防它过早地与50S大亚基结合,并提升大亚基结合,并提升P 位对位对fMet-tRNAfMet特异性
23、特异性真核起始因子真核起始因子功效功效eIF-1 多功效因子,参与多个翻译环节多功效因子,参与多个翻译环节eIF-2 增进起始增进起始Met-tRNAMet与核糖体与核糖体40S小亚基结合小亚基结合eIF-2B 又称鸟苷酸互换因子,将又称鸟苷酸互换因子,将eIF-2上上GDPGTP eIF-3 首先与首先与40S小亚基结合因子,并能加速后续环节小亚基结合因子,并能加速后续环节eIF-4A 含有含有RNA解旋酶活性,能解除解旋酶活性,能解除mRNA 5端发夹结构,端发夹结构,使其与使其与40S小亚基结合。是小亚基结合。是构成成份构成成份eIF-4B 与与mRNA结合,对结合,对mRNA进行扫描并
24、定位第一个进行扫描并定位第一个AUGeIF-4E 结合结合mRNA帽子结构,是帽子结构,是构成成份构成成份eIF-4G 一个接头蛋白,能与一个接头蛋白,能与、eIF-3和和poly A结合蛋白结合将结合蛋白结合将40 S小亚基富集至小亚基富集至mRNA,而刺激翻译。是,而刺激翻译。是eIF4F构成构成成份成份eIF-5 增进上述起始因子从增进上述起始因子从40S小亚基脱落,以便小亚基脱落,以便40S小亚基与小亚基与60S大亚基结合形成大亚基结合形成80S起始复合物起始复合物eIF-6 增进无活性增进无活性80S核糖体解聚生成核糖体解聚生成40S小亚基和小亚基和60S大亚基大亚基原核起始因子原核
25、起始因子功效功效IF-1 预防预防tRNA过早地结合到过早地结合到A位位IF-2 增进增进fMet-tRNAfMet结合到结合到30S小亚基小亚基IF-3 结合结合30S小亚基,预防它过早地与小亚基,预防它过早地与50S大亚基结合,并提升大亚基结合,并提升P 位对位对fMet-tRNAfMet特异性特异性第第32页页第第32页页目目 录录(一)(一)原核生物在起始因子参与下组装翻译起原核生物在起始因子参与下组装翻译起始复合物始复合物 1 1原核生物翻译起始形成原核生物翻译起始形成70S70S起始复合物起始复合物lIF-1、IF-3结合解聚核糖体结合解聚核糖体30S小亚基小亚基;lmRNA结合核
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