Pubmed分面检索与聚类分析系统.pptx

PubMed分面检索与聚类分析的意义分面检索与聚类分析的意义nPubMed是世界公认的权威生物医学文献数据库，收录文献能反映世界医学的发展现状，对其文献的分面检索与聚类分析能揭示医学研究发展的内在规律与趋势；n帮助研究人员寻找新的研究方向和创新点；n有助于对学者、机构、期刊以及研究领域进行学术评价和评估；n为各级各类的学术评价、大学或研究机构的学术排名、学科竞争力分析等提供补充数据；n其他意义；PubMed分面检索与聚类分析分面检索与聚类分析系统简介系统简介n建立在PubMed基础之上，能检索PubMed全部文献，但同时提供分面检索与聚类分析功能的系统；n完全独立开发的系统，分面检索性能优于gopubmed等国际同类知名系统；n分为基础版（PubMedpro）和专业版（PubMedplus）两个版本。基础版同PubMed一样，免费向全世界开放；专业版可以针对不同用户定制功能；基础版简介基础版简介n网址：Http:/www.PubMn无限制访问，任何人无须注册即可访问基本使用方法基本使用方法n在系统输入框中输入任何检索词或检索式，系统将输入的检索式提交给PubMed,得到与PubMed同样的检索结果并展示；n对于检索结果，系统提供20多个分面或项目对检索结果进行分面检索或聚类分析，并将分析结果进行展示；n分面（项目）包括关键词（短语）、MeSH、期刊、作者、机构、国别、基因等；PubMedpro与与PubMed比较比较nPubMed支持限定检索，自由词自动转换主题词等功能；PubMedpro使用PubMed的内核，两者检索方式与检索结果完全一致；nPubMed没有分面检索功能；PubMedpro具有20余项分面检索或聚类的功能；n国内用户使用PubMedpro检索速度更快PubMedpro与与gopubmed比较比较ngopubmed是德国开发的一个基于PubMed数据库的分面检索系统，可按年代、作者、期刊、国家、城市、主题词等6个分面对PubMed的检索结果进行分面检索；PubMedpro除了分析这6个项目外，还分析机构、部门、基因本体、基因蛋白等多达20个项目；ngopubmed检索结果超过10万条时，仅分析前10万条数据。PubMedpro无论检索结果是多少，均分析全部数据；nPubMedpro分析的最新的文献数据比gopubmed更准确；三个系统检索结果比较三个系统检索结果比较n在三个系统分别搜索1000:2015dp，检索得到的相同。pubmed.gov www.PubM www.gopubmed.orgPubMedpro与与gopubmed分面检索对比分面检索对比n检索早年文献，检索文献小于10万时。以期刊为例对两者分面检索对比，gopubmed与PubMedpro分析的数据一致。n检索最新发表的文献，检索文献小于10万时。两者分面检索对比，gopubmed与PubMedpro分析的数据出现差别。n对聚类结果进行二次检索与核对发现pubmedpro更准确PubMedpro与与gopubmed分面检索对比分面检索对比n文献检索结果超过10万时，PubMedpro分析全部数据，gopubmed仅分析前10万条数据；n两个系统聚类的数据有明显区别，超过10万的检索不能使用gopubmed的聚类数据。PubMedpro与与gopubmed分面检索对比分面检索对比 以下是以下是Pubmedpro提供，而提供，而Gopubmed没有提供的分面检索项目没有提供的分面检索项目n机构、部门、主题词搭配、化学物质、物种、疾病、化学药品、基因本体、基因蛋白、自由词、短语n举例说明这些分面项目的意义PubMedpro独有的分面检索独有的分面检索-机构机构n检索beijingad，按机构分面检索，发现peking university是北京在pubmed中收录文献最多的单位。PubMedpro独有的分面检索独有的分面检索-部门部门n点击peking university对应的数字检索，再按部门分面检索，可以分析哪些部门发表文献较多PubMedpro独有的分面检索独有的分面检索-组配主题词组配主题词n对组配主题词进行分面检索可以查看北京大学的哪些研究课题处在前列n主、副主题词组配可对主题词的概念进行限定或复分，使主题词具有更高的专指性。PubMedpro独有的分面检索独有的分面检索-物种物种n检索SARS并按物种分面检索，发现sars与Paguma Larvata(果子狸)有某种联系。PubMedpro独有的分面检索独有的分面检索-基因本体基因本体n按基因本体分面检索，发现breast cancer文献讨论细胞生长周期，细胞凋亡的文献较多；PubMedpro独有的分面检索独有的分面检索-基因蛋白基因蛋白n检索breast cancer并按基因蛋白分面检索，发现BRCA2，BRCA1是乳腺癌的易感基因；PubMedpro独有的分面检索独有的分面检索-药品药品n检索lung cancer并按药品分面检索，可得到多个肺癌靶向药品Erlotinib hydrochloride、celecoxib、Gefitinib等；PubMedpro独有的分面检索独有的分面检索-疾病疾病n检索lung cancer并按疾病分面检索，可得到各种类型肺癌、肺癌各期的文章分布；专业版简介专业版简介n专业版网址：http:/www.PubMn比基础版提供更多功能，更专业的服务n可接受用户要求的定制服务分面语义（概念）检索分面语义（概念）检索n专业版提供分面语义检索，即在分面检索的同时，能将某个概念的同义词、近义词、下位词进行聚类检索，实现语义（概念）检索，提高查全率；n举例：PubMed文献中“jin yin hua”有3篇，“Lonicera japonica”有161篇，“honeysuckle”有92篇，“Flos Lonicerae”有79篇。按中药分面检索，点击“金银花”对应的数字可将文献一次查全。（相反pubmedpro分别聚类，如chinese academy of medical sciences&peking union medical college、peking union medical college 、chinese academy of medical sciences）可提供语义检索的分面可提供语义检索的分面n中国省份、国家（如北京上海）、治疗方法、症状、生物过程、分子功能、细胞成分、疾病、药品（如吉非替尼，易瑞沙）、解剖、基因蛋白、中药和食品等 专业版可揭示概念间的隐含关系专业版可揭示概念间的隐含关系n目前提供主题词之间的隐含关系；n检索肿瘤，揭示出如幽门螺杆菌与胃癌的相关性，帮助用户拓宽研究思路，寻找新的研究方向。专业版可过滤本馆馆藏资源专业版可过滤本馆馆藏资源n可以过滤全部电子资源，印刷本资源；n通过访问各馆数据库网页，我们整理了各馆购买的数据库资源，基本实现国内医学院校的各种资源过滤。专业版可对期刊按不同标准过滤专业版可对期刊按不同标准过滤n期刊影响因子的过滤，数据来源于SCI公布的数据，以最新年限为准。n期刊H指数过滤，数据来源于Scopus公布的数据专业版可对本校或机构的专业版可对本校或机构的PubMed文献进行文献进行全面聚类分析全面聚类分析n通过分面语义检索，可以查全国内机构发表在PubMed的全部文献并详细分析。专业版可对某机构专业版可对某机构SCI文献进行聚类分析文献进行聚类分析n基于同样的工作原理及分面语义检索，专业版系统不仅能够对某机构PubMed文献进行聚类分析，也可对某机构在SCI上收录文献进行聚类分析；谢谢大家！谢谢大家！敬请批评指正！敬请批评指正！