医学院校公共科研平台质谱管理工作探讨_汪生.pdf
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1、第 51 卷第 3 期2023 年 2 月广 州 化 工Guangzhou Chemical IndustryVol.51 No.3Mar.2023医学院校公共科研平台质谱管理工作探讨汪 生1,陈冠军1,冯 蕊2,3(1 安徽医科大学科研实验中心,安徽 合肥 230032;2 安徽医科大学药学院,安徽 合肥 230032;3 炎症免疫性疾病安徽省实验室,安徽 合肥 230032)摘 要:在医学类高校公共科研平台,利用质谱仪开展科学研究的需求日益增多。同时以质谱仪为主的代谢组学和蛋白质组学平台建设,在近几年发展迅速。但在质谱平台的建设、管理和运行方面却存在很多的管理短板和难点。文章对质谱仪的基本
2、理论、实验的一般流程、日常故障类型和解决思路、质谱平台的建设、维护和管理等方面进行了总结,给读者在质谱平台的建设和管理提供一定的参考和建议。关键词:医学类高校;公共科研平台;质谱平台;平台建设;维护和管理中图分类号:R917 文献标志码:A文章编号:1001-9677(2023)03-0290-04 基金项目:安徽医科大学校基金(2021xkj013)。第一作者:汪生(1992-),男,硕士,实验师,主要从事质谱相关研究和实验室管理工作。通讯作者:冯蕊(1990-),女,硕士,助理实验师,主要从事实验室管理工作。Exploration on Management of Mass Spectro
3、metry in Public ScientificResearch Platform of Medical UniversityWANG Sheng1,CHEN Guan-jun1,FENG Rui2,3(1 Center for Scientific Research of Anhui Medical University,Anhui Hefei 230032;2 School of Pharmacy,Anhui Medical University,Anhui Hefei 230032;3 Inflammation and Immune Mediated Disease Laborato
4、ry of Anhui Province,Anhui Hefei 230032,China)Abstract:In the public scientific research platform of medical university,the mass spectrometer(MS)gets moreimportant role in daily scientific research.In recent years,the construction of metabolomics and proteomics platform basedon MS has developed rapi
5、dly.However,there are some management shortcomings and difficulties in the construction,management and operation of MS platform.The basic theory,procedures of carry out the experiment,types and solutionsof common faults,experiences on the construction,maintenance and management of MS platform were s
6、ummarized.Somereference and suggestions were provided for scholars to carry out work on construction and management of massspectrometry platform in colleges and universities.Key words:medical university;public scientific research platform;mass spectrometry;platform construction;maintenance and manag
7、ement质谱方法最早于1913 年由 J.J.Thomson 确定,英国实验物理学家阿斯顿因发明质谱仪分离同位素而获得 1922 年诺贝尔化学奖1。1953 年 W.Paul 提出四极杆质量分析器和离子阱质量分析器,四极杆质量分析器已成为当前最普及的质量分析器2-3。从 1942 年第一台单聚焦质谱仪商品化到现在已经约80 年,昂贵的质谱仪已经从圣殿走向大众化实验室。我国近5 年年均质谱仪进口数量超 1 万台,其中 2020 年我国质谱仪进口数量约为1.4 万台,2020 年我国质谱仪市场规模达到 142 亿元,质谱仪的市场需求逐年递增,当前市场和前景广阔4。当前的新冠肺炎疫情爆发,国家更加
8、重视医学平台的建设,我国医学院校将会得到更大的发展。高校科研实验室是教研人员开展科学研究和实验教学的重要场所,学校院所的公共科研平台在社会科研服务中发挥着重要的科研支撑作用5-6。其中以质谱仪为核心仪器的代谢组学、蛋白质组学和化合物靶标定量分析的科研需求日益增多。高校的科研公共平台在培训教学、科研服务、安全管理等方面承担着重要的角色。文章通过介绍质谱仪的工作原理、常见质谱质量分析器的特点、炎症免疫性疾病安徽省实验室公共平台(简称“平台”)质谱仪的配置和应用、质谱仪的一般使用流程、质谱管理工作中常见故障和解决方法、质谱平台建设和管理建议 6 个方面进行介绍和讨论,总结出质谱实验技术流程和质谱平台
9、建设管理经验,给相关实验室在质谱平台的建设方面提供参考。1 质谱仪的工作原理当前的质谱仪一般同色谱仪联用,常见的有液相色谱-质谱联用仪(Liquid Chromatography Mass Spectrometry,LC-MS)和气相色谱-质谱联用仪(Gas Chromatography Mass Spectrometry,第 51 卷第 3 期汪生,等:医学院校公共科研平台质谱管理工作探讨291 GC-MS)。仪器主要由 7 个方面组成,分别是样品导入系统、离子源、真空系统、质量分析器、供气系统、检测器和数据处理系统7-8。样品导入系统是液相或气相部分,主要用于物质的色谱分离,提高检出效率和
10、定量的准确性。离子源是化合物离子化的部分,最常见的离子源有电喷雾离子源、大气压化学离子源、基质辅助激光解析电离源、化学离子源和电子轰击离子源等。物质必须变成带电荷的离子态,才能被质谱仪检测。真空系统一般由外部的机械泵和内部的分子涡轮泵产生,还包括真空传递系统,离子在高真空的条件下才能“存活”。质量分析器是质谱仪的核心部件,详细介绍见“2”部分,具有离子筛选、碰撞碎裂和检测的功能。质量分析器的串接,可以实现采集一级、二级和三级质谱。供气系统常见的有空气、氢气、氩气、高纯氮气、高纯氦气、甲烷气等。气体在不同的质谱仪中发挥不同的作用,例如作为载气、雾化气和碰撞气等,还可以发挥离子保护、离子聚焦、还原
11、和淬灭的作用等。检测器作用是将检测的电子信号放大后经过一定的算法,转化成电信号,以最终的光谱和质谱图形式输出实验结果。数据处理系统包括数据的存储和数据处理软件,主要是指电脑。色谱-质谱联用仪的各部分示意图如图 1 所示。图 1 色谱-质谱联用仪的结构示意图Fig.1 Composition of chromatography-mass spectrometer2 质谱仪常见的质量分析器随着质谱技术的更新换代,联用技术的层叠不穷,质谱仪在生命科学领域的应用越来越广泛。目前市面上常见的质谱质量分析器有 5 种9,分别是四极杆质量分析器、离子阱质量分析器(Trap)、傅里叶变换离子回旋共振(Four
12、ier Transform IonCyclotron Resonance,FT-ICR)、飞行时间质量分析器(Time ofFlight,TOF)和轨道阱质量分析器(Orbitrap)。四极杆质量分析器是最传统、目前技术最成熟、应用最广泛的质量分析器,在 LC-MS 和 GC-MS 均有应用。其中三重四极杆质谱的多反应监测模式是目前定量分析的金标准。离子阱质量分析器的工作原理类似四极杆质量分析器,结构简单,它和四极杆质量分析器都属于低分辨率质量分析器。TOF 检测离子的质核比理论上不受限制,但是在实际应用中受限于漂移管的长度。TOF 属于高分辨率质谱,广泛应用于定性分析。TOF 的质量轴稳定性
13、有待提升,但是仪器的成本相对其他高分辨质谱偏低。FT-ICR 和 Orbitrap 都属于超高分辨率质量分析器10,近年来 Orbitrap 的市场占有率大幅提升。Orbitrap 质量分析器分辨率高(可达 100 万以上)、灵敏度高、仪器稳定性好,同时具备很好的定性和定量功能,已成为当前高分辨质谱的主流,但仪器价格昂贵。3 平台质谱仪的配置和应用 平台目前配备三台质谱仪,分别是 Shimadzu 20AT 超高效液相色谱仪-AB 5500 三重四极杆质谱仪,Dionex Ultimate 3000超高效液相色谱仪-Thermo Fisher Q Exactive plus 高分辨质谱仪和 A
14、gilent 7890B 气相色谱仪-7000D 三重四极杆质谱仪,该配置基本满足常规小分子定量和定性分析。平台利用三台质谱仪,开展线上和线下理论知识和仪器应用培训、线下仪器操作培训以及科学研究项目。平台质谱每年线上培训约300 人次,线下培训仪器操作20 余人,辅助完成科研项目 30 余项,同时协助校内课题组建立抗生素、色氨酸代谢通路和硫离子检测等靶标方法检测服务 10 多项。2021 年度三台质谱的年平均机时为 2100 h;协助发表 SCI 论文 12 篇,在培训人次、课题服务、使用机时和科研成果四个方面均做出满意的业绩。4 质谱仪一般实验流程液相色谱-三重四极杆质谱仪(Liquid C
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