基因工程的工具酶.doc
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1、基因工程的工具酶(完整资料)(可以直接使用,可编辑 优秀版资料,欢迎下载)基因工程的工具酶n 限制性核酸内切酶n DNA连接酶n N聚合酶n 碱性磷酸酶n 末端脱氧核苷酸转移酶限制性核酸内切酶是一类能识别双链DNA分子特异性核酸序列的DA水解酶。是体外剪切基因片段的重要工具限制性核酸内切酶不仅是DN重组中重要的工具,而且还可以用于基因组酶切图谱的鉴定防御机制: n 任何物种都有排除异物、保护自身的防御机制n 人:免疫系统n 细菌:限制与修饰系统寄主控制的限制与修饰现象限制与修饰系统是细胞的一种防卫手段,各种细菌都能合成一种或几种能够切割DA双链的核酸内切酶,它们以此来限制外源DNA存在于自身细
2、胞内,但合成这种酶的细胞自身的DNA不受影响,因为这种细胞还合成了一种修饰酶,对自身的DN进行了修饰,限制性酶对修饰过的DN不能起作用。这种现象被称为寄主控制的限制与修饰现象。限制酶 (rstrction enzym)修饰酶 (mdying enme)核酸酶切位点:既可以在,5磷酸二酯键的3酯键处(A),也可以在5酯键处(B)切断磷酸二酯键1) 核酸限制性内切酶的类型2) 核酸限制性内切酶的基本特性3) 同裂酶和同尾酶4) 核酸限制性内切酶的命名法5) 影响核酸限制性内切酶活性的因素限制性核酸内切酶的类型及特性按照限制酶的组成、与修饰酶活性的关系以及切断核酸的情况不同,分为三类:型型*型第一类
3、(型)限制性内切酶: 能识别专一的核苷酸顺序 并在识别点附近的一些核苷酸上切割DNA分子中的双链 但是切割的核苷酸顺序没有专一性,是随机的 这类限制性内切酶在A重组技术或基因工程中用处不大,无法用于分析DA结构或克隆基因 如:EcoB、coK等第二类(II型)限制性内切酶: 能识别专一的核苷酸顺序(回文对称顺序) 并在该顺序内的固定位置上切割双链 是DNA重组技术中最常用的工具酶之一 这种酶识别的专一核苷酸顺序最常见的是4个或6个核苷酸,少数也有识别个核苷酸以及7个、8个、个、10个和11个核苷酸的回文对称顺序:有一个中心对称轴,从这个轴朝二个方向“读”都完全相同n 切割后形成具有粘性末端(c
4、ohsi end)的NA片段n 切割后形成具有平末端(blnt end)的DNA片段限制酶在识别序列的对称轴上切割,形成的DNA片段没有突出的单链第三类(II型)限制性内切酶也有专一的识别顺序,但不是对称的回文顺序,在识别顺序旁边几个核苷酸对的固定位置上切割双链。但这几个核苷酸对不是特异性的。这种限制性内切酶切割后产生的一定长度DNA片段,具有各种单链末端,因此不能应用于基因克隆同裂酶和同尾酶n 同裂酶(同切酶或异源同工酶):两种限制性内切酶的识别核苷酸顺序和切割位置都相同,有时其差别只在于当识别顺序中有甲基化的核苷酸时,一种限制性内切酶可以切割,另一种则不能。例如: Hpa和sp的识别顺序都
5、是CG如果其中有5甲基胞嘧啶,则只有Ha能够切割n 同尾酶: 有时两种酶切割序列不完全相同,但却能产生相同的粘性末端,这类酶被称为同尾酶可以通过NA连接酶将这类末端连接起来,但原来的酶切位点将被破坏,有时可能会产生一个新的酶切位点 如:Xba1、Nhe1以及pe1切割的DA序列不同,但均给出相同的“A”粘性末端。这些粘性末端连接后,以上的酶将不能再切割,但却产生了一个新的4核苷酸的酶切位点,即Bf1的酶切位点限制性核酸内切酶的命名法n 取微生物属名的第一个字母和种名的头两个字母组成三个斜体字母加以表示,遇有株名,再加在后面.如果同一菌株先后发现几个不同的酶,则用罗马数字加以表示n o I E:
6、 表示大肠杆菌属名第一个字母 c:表示种名头两个字母 R: 表示菌株名 I: 表示该菌中第一个被分离出来的酶影响核酸限制性内切酶活性的因素n 反应的温度n DN的纯度n 溶液中离子浓度及种类n 缓冲液的pH值n 酶切时间n DNA的分子结构限制性内切酶在保温过程中的活性变化(图解)反应体系n 1 ffern Dn 酶n H2O注意酶的浓度:并不是加得越多越好!根据NA的量选取合适的酶量1个酶单位:以20反应体系中反应1小时,使1 g A完全消化所需要的酶量NA末端长度对限制酶切割的影响n 限制酶切割DN时对识别序列两端的非识别序列有长度的要求,也就是说,在识别序列两端必须有一定数量的核苷酸,否
7、则很难发挥切割活性n 限制性内切酶的Stativiy是指当酶的反应条件改变时,其在识别序列以外的位点进行切割修饰酶甲基化酶又称甲基转移酶(mthtrnsferase)在真核和原核生物中存在大量的甲基化酶实验室里大部分大肠杆菌菌株含有3个位点特异的甲基化酶:n D甲基化酶,由dam基因编码,将S腺苷甲硫氨酸的甲基基团转移到ATC中A的N6位置上n Dc甲基化酶,由m基因编码,以前称Me甲基化酶,在位置修饰CCGG和CT的胞嘧啶(C)残基, 位点2565bp出现一次n EcoK I甲基化酶,识别AAC()6GTGC和GCAC(N)T序列中的A的N6位置,位点少,约8 b出现一次n ss 甲基化酶从
8、某种Da 或Dcm 的菌株中分离的DN可能抗从自身分离的限制性内切酶的切割 例如: Mbo I 和Sau 3A识别序列ATC 从Dam+大肠杆菌中分离到的DNA完全不受bo 的切割, 但是不抗Sau3AI来自原核生物螺原体(pirlamasp.),可使CG序列中的在C位置上甲基化Ss I甲基化的NA受。coli中crA, mcrBC和mrr系统的限制许多酶对此甲基化酶敏感,如:A II, Cl I, Xho I, Sl如果将外源DA引入一个大肠杆菌的宿主,它可能会受宿主细胞中的限制系统的袭击因此, 消除大肠杆菌重组分子宿主菌株中的限制系统具有重要意义(大肠杆菌的所有限制系统都集中在一个长约14
9、 kb的迁移控制区内)某些菌株在这些基因中的某个上携带突变如: H5菌株在sd基因内有突变,因此是Eco I内切酶缺陷型的普遍应用的菌株B1是整个迁移控制区都缺失,因此缺乏所有的限制活性DNA连接酶:在体外将目的基因和载体共价连接构成重组DNA分子4 DNA连接酶大肠杆菌NA连接酶反应体系n 5 uffer (10 X Buffer )n Veorn DA Fragmen T4 NA igasen O连接反应的温度n 平末端 1 4-6horn 粘性末端 1 3 hor 4 6ourDA聚合酶不同种类的DA聚合酶在DNA的复制和修复中起到重要的作用n 大肠杆菌DA聚合酶In Kleno大片段n
10、 耐热 DNA聚合酶大肠杆菌DNA聚合酶的酶活性: 1) 3DA聚合酶活性 2) 53DNA外切酶活性( 5端降解) 3) 3 DNA外切酶活性(纠错)Kleow 大片段:大肠杆菌A聚合酶I 经蛋白酶处理后产生的大片段活性: )53 DN聚合酶活性 2)3 DN外切酶活性(纠错)耐热 DNA聚合酶来自于嗜高温的细菌,主要用于PCR反应如:TaqNA聚合酶 Vnt DNA聚合酶 PDNA聚合酶 woDNA聚合酶 th DNA聚合酶碱性磷酸酶n 去除5磷酸基团n 底物: DN、R、脱氧核糖核苷三磷酸n 应用: 。 端标记之前的处理. 处理克隆载体防止载体自连c.外源NA片段的末端处理防止片段间的连
11、接目前常用的有两种:细菌碱性磷酸酶(BAP),耐高温,不易失活,要终止和灭活它很困难小牛肠道碱性磷酸酶(CIP),可在加热45mi灭活,活性高,因此更为常用末端脱氧核苷酸转移酶(TT)n 从小牛胸腺中分离纯化出来的特点:(1)不需要N模板 (2) 沿着5方向将脱氧核苷酸加到DNA链的羟基末端n 应用:()催化DNA的3末端添加同聚物 (2)D的3末端标记琼脂糖酶(arase)n 是一种琼脂糖水解酶n 可以将琼脂糖亚单位水解为新琼脂寡糖n 用于从低熔点琼脂糖中分离纯化大片段DNA或RNA片段n 对热稳定,反应时不需要缓冲液13 基因工程的应用基因工程自0世纪0年代兴起后,在短短的30年间,得到了
12、飞速的发展,目前已成为生物科学的核心技术.基因工程在实际应用领域农牧业、工业、环境、能源和医药卫生等方面,也展示出美好的前景.植物基因工程硕果累累植物基因工程在农业中的应用发展迅速.从19960年,在短短的5年中,全世界转基因作物的种植面积就增长了3倍。以转基因植物研究、开发和应用为标志的农业技术革命,已经在一些国家展开。0年,就世界范围来看,转基因植物种植面积首次突破5x106hm。其中,转基因大豆、棉花、油菜、玉米已进入大规模商业化应用阶段,这四种转基因作物种植面积占相关作物种植面积的比例已达到:大豆63,玉米1,棉花1%,油菜%。我国转基因作物的种植面积也迅速增长,目前已位居世界第四(图
13、1 16). 植物基因工程技术主要用于提高农作物的抗逆能力(如抗除草剂、抗虫、抗病、抗干旱和抗盐碱等),以及改良农作物的品质和利用植物生产药物等方面。抗虫转基因植物全世界每年因虫害造成农作物的损失约占总产量的1%,达数千亿美元。对农业害虫的防治,大多是依靠化学农药.大量使用化学农药不仅造成了严重的环境污染,损害了人类健康,而且大大增加了生产成本.因此,从某些生物中分离出具有杀虫活性的基因,将其导入作物中,使其具有抗虫性,已成为防治作物虫害的发展趋势.目前,已问世的转基因抗虫植物主要有水稻(图11)、棉、玉米、马铃薯、番茄、大豆、蚕豆、烟草、苹果、核桃、杨、菊花和白花三叶草等。用于杀虫的基因主要
14、是Bt毒蛋白基因、蛋白酶抑制剂基因、淀粉酶抑制剂基因、植物凝集素基因等.例如,我国转基因抗虫棉就是转入t毒蛋白基因培育出来的,它对棉铃虫具有较强的抗性。近几年来,我国拥有自主知识产权的转基因抗虫棉的研究和应用,取得了突飞猛进的发展,从1998年占据市场份额的10%,已经提高到200年的6。4%,居主导地位。仅002年我国抗虫棉的栽培面积已达9x 0m2,增加收益约2亿元人民币。生物技术资料卡可用于转基因植物的抗虫基因Bt毒蛋白基因是从苏云金芽孢杆菌中分离出来的抗虫基因。当害虫食用含有转基因的植物时,t基因编码的蛋白质会进入害虫的肠道,在消化酶的作用下.蛋白质能够降解成相对分子质量比较小的、有毒
15、的多肽。多肽结合在肠上皮细胞的特异性受体上,会导致细胞膜穿孔,细胞肿胀裂解,最后造成害虫死亡。由于Bt毒蛋白对哺乳动物无毒害作用,因而广泛用于抗虫转基因植物.蛋白酶抑制剂基因广泛存在于植物中,它产生的抑制剂可与害虫消化道中的蛋白酶结合形成复合物,从而阻断或降低蛋白酶的活性,使昆虫不能正常消化食物中的蛋白质.这种复合物还能剌激昆虫分泌过量的消化酶,引起害虫的厌食反应。淀粉酶抑制剂基因产生的淀粉酶抑制剂可以抑制昆虫消化道中的淀粉酶活性,使害虫不能消化所摄取的淀粉,从而阻断害虫的能量来源。植物凝集素基因控制植物合成一种糖蛋白,这种糖蛋白可与昆虫肠道黏膜上的某种物质结合,从而影响害虫对营养物质的吸收和
16、利用。抗病转基因植物植物像人一样也会生病。引起植物生病的微生物称为病原微生物,主要有病毒、真菌和细菌等。例如,许多栽培作物由于自身缺少抗病毒的基因,因此,用常规育种的方法很难培育出抗病毒的新品种,而基因工程技术,为培育抗病毒植物品种开辟了新的途径。目前,人们已获得抗烟草花叶病毒的转基因烟草和抗病毒的转基因小麦(图1-)、甜椒(图119)、番茄等多种作物。抗病转基因植物所采用的基因,使用最多的是病毒外壳蛋白(coat roein,CP)基因和病毒的复制酶基因;抗真菌转基因植物中可使用的基因有几丁质酶基因和抗毒素合成基因。抗逆转基因植物环境条件对农作物的生产会造成很大影响。例如,盐碱、干旱、低温、
17、涝害等不利的环境条件,是造成低产、减产的常见因素。目前,全球的盐碱和干旱地区分别占陆地面积的1/3,还有许多地区属于高寒地区。这些不利的环境条件也会对农业生产造成影响。由于盐碱和干旱对农作物的危害与细胞内渗透压调节有关,目前科学家们正在利用一些可以调节细胞渗透压的基因,来提高农作物的抗盐碱和抗干旱的能力,这在烟草等植物中已获得了比较明显的成果。科学家们还研究开发出了一批耐寒作物,使它们在寒冷的环境条件下,良好地生长。例如,将鱼的抗冻蛋白基因导入烟草和番茄(图1 -20),使烟草和番茄的耐寒能力均有提高。此外,将抗除草剂基因导入大豆、玉米等作物(图 1),喷洒除草剂时,杀死田间杂草而不损伤作物.
18、利用转基因改良植物的品质随着人们生活水平的提高,人们对食品的要求不仅仅是吃饱,而且要富于营养。但是,我们吃的许多食品含有的营养成分并不平衡,例如,豆类食品中,含有蛋氨酸比较少,大米、玉米、小麦则含赖氨酸比较少。这些人体必需的氨基酸缺少后对人的健康不利。科学家将必需氨基酸含量多的蛋白质编码基因,导入植物中,或者改变这些氨基酸合成途径中某种关键酶的活性,以提高氨基酸的含量。例如,我国科学家将富含赖氨酸的蛋白质编码基因导入玉米,获得的转基因玉米中赖氨酸的含量比对照提高30% (图122)。番茄含有丰富的维生素,但不耐储存.我国科学家将控制番茄果实成熟的基因导入番茄,获得转基因延熟番茄,储存时间可延长
19、个月,有的可达80多天。目前,我国农业部已批准这种耐储存番茄进行商品化生产。我国科学家还成功地将与植物花青素代谢有关的基因导入花卉植物矮牵牛中,转基因矮牵牛呈现出自然界没有的颜色变异, 大大提高了花卉的观赏价值(图-23)。异想天开发光树能做路灯吗?自然界有许多生物可以发光,它们发出的光有磷光和荧光两种.大家最熟悉的是萤火虫,在夏天的夜晚,它们那“腾空类星陨,拂树若花生”的美丽荧光,曾引起人们的许多遐想.科学家研究发现,萤火虫发光是发光器中的荧光素,在荧光酶的催化下发出的间歇光。荧光素和荧光酶都是由发光基因“指挥合成的。如果将发光基因导入植物,培育出发光植物是一件十分有趣的事情。目前,科学家已
20、培育出发光的烟草、棉花等.科学家们正计划培育一种发光的夹竹桃,将其种植到高速公路的两旁,白天做行道树,夜晚做路灯照明。到那时,每当夜幕降临,公路两旁的夹竹桃荧光闪闪,树树相连,公路将变成美丽的荧光世界。也许不久的将来,你可以用各种各样的发光植物来装点你的庭院和家居,那是多么漂亮、有趣!动物基因工程前景广阔 动物基因工程是20世纪8年代开始发展起来的,它从诞生那天起,就在动物品种改良、建立生物反应器、器官移植等很多方面显示了广阔的应用前景。 用于提高动物生长速度 动物基因工程技术可以提高动物的生长速率.由于外源生长激素基因的表达可以使转基因动物生长得更快,因此,科学家们将这类基因导入动物体内,以
21、提高动物的生长速率。例如,将外源生长激素基因导入绵羊体内,转基因绵羊的生长速率比一般的绵羊提高3%,体型增大50;将外源生长激素基因导入鲤鱼,9个月后有的转基因鲤鱼比对照重1。kg(图124)。用于改善畜产品的品质动物基因工程技术的另一个重要作用是改善畜产品的品质.例如,有些人食用牛奶后,对牛奶中的乳糖不能完全消化;也有些人食用牛奶后会出现过敏、腹泻、恶心等不适症状。为了解决这一问题,科学家将肠乳糖酶基因导人奶牛基因组,使获得的转基因牛分泌的乳汁中,乳糖的含量大大减低,而其他营养成分不受影响。用转基因动物生产药物最令人兴奋的是利用基因工程技术,还可以使哺乳动物本身变成“批量生产药物的工厂。科学
22、家将药用蛋白基因与乳腺蛋白基因的启动子等调控组件重组在一起,通过显微注射等方法,导入哺乳动物的受精卵中,然后,将受精卵送入母体内,使其生长发育成转基因动物。转基因动物进人泌乳期后,可以通过分泌的乳汁来生产所需要的药品,而称为乳腺生物反应器或乳房生物反应器。目前,科学家已在牛和山羊等动物乳腺生物反应器中表达出了抗凝血酶、血清白蛋白、生长激素和抗胰蛋白酶(图1一25)等重要医药产品。用转基因动物作器官移植的供体动物基因工程技术有可能使建立移植器官工厂的设想成为现实。目前,人体移植器官短缺是一个世界性难题.为此,人们不得不把目光移向寻求可替代的移植器官.由于猪的内脏构造、大小、血管分布与人极为相似,
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