华东理工大学过程分子生物学3.pptx
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1、过程分子生物学5 2 3 4 1 6 基因的表达与调控基因的表达与调控细胞通讯的分子机制细胞通讯的分子机制免疫多样性的分子识别免疫多样性的分子识别胚胎发育的基因表达谱胚胎发育的基因表达谱肿瘤发生的分子机制肿瘤发生的分子机制基因组学与系统生物学基因组学与系统生物学免疫多样性的分子识别E B C D A F 人体的免疫识别及应答系统人体的免疫识别及应答系统免疫球蛋白基因的顺序组织免疫球蛋白基因的顺序组织抗体多样性的分子机制抗体多样性的分子机制免疫球蛋白类型开关的启动免疫球蛋白类型开关的启动T T 淋巴细胞受体的结构与功能淋巴细胞受体的结构与功能大型组织相容性蛋白的结构与功能大型组织相容性蛋白的结构
2、与功能3A3A 人体的免疫识别及应答系统人体的免疫识别及应答系统 对于对于单细胞生物单细胞生物而言,区分自身和环境是不困难的,胞内物而言,区分自身和环境是不困难的,胞内物质就是自身的,而胞外物质都是非自身的。但对于质就是自身的,而胞外物质都是非自身的。但对于多细胞生物多细胞生物来来说,区分自身与非自身就要依靠分子识别系统。人体由说,区分自身与非自身就要依靠分子识别系统。人体由三百多种三百多种不同型态和性质的细胞构成,这些细胞的结构、功能、作用方式不同型态和性质的细胞构成,这些细胞的结构、功能、作用方式均有其特殊性,因此人体需要由免疫系统实现下列三种功能:均有其特殊性,因此人体需要由免疫系统实现
3、下列三种功能:a 免疫系统的功能3A3A 人体的免疫识别及应答系统人体的免疫识别及应答系统自身细胞或物质的识别功能自身细胞或物质的识别功能 a 免疫系统的功能一种机制去识别自身的细胞一种机制去识别自身的细胞 非自身细胞或物质的识别功能非自身细胞或物质的识别功能 一种机制去识别非自身的入侵者一种机制去识别非自身的入侵者 抵御消灭入侵者的功能抵御消灭入侵者的功能 一种机制去抵御消灭入侵者,并修复由其所造成的机体损伤一种机制去抵御消灭入侵者,并修复由其所造成的机体损伤3A3A 人体的免疫识别及应答系统人体的免疫识别及应答系统 人体的免疫系统由人体的免疫系统由B B淋巴细胞淋巴细胞、T T淋巴细胞淋巴
4、细胞、吞噬细吞噬细胞胞构成。就免疫过程的性质而言,人体免疫系统包括两构成。就免疫过程的性质而言,人体免疫系统包括两b 免疫系统的组成大部分:即大部分:即体液免疫系统体液免疫系统和和细胞介导的免疫系统细胞介导的免疫系统。体液免疫系统体液免疫系统体液免疫系统由体液免疫系统由抗体分泌抗体分泌所介导,依所介导,依赖于赖于B B淋巴细胞淋巴细胞。B B淋巴细胞合成抗淋巴细胞合成抗体(免疫球蛋白),抗体与抗原特异体(免疫球蛋白),抗体与抗原特异性结合(性结合(免疫识别免疫识别),然后通过下列),然后通过下列两种途径消灭抗原:两种途径消灭抗原:巨噬细胞的吞噬作用巨噬细胞的吞噬作用 补体系统的降解作用补体系统
5、的降解作用 抗原抗体复合物为巨噬细胞吞噬和抗原抗体复合物为巨噬细胞吞噬和降解降解 体液免疫系统体液免疫系统 补体的性质补体的性质 补体是一种能与抗体功能互补的补体是一种能与抗体功能互补的成分,由成分,由2020种左右的种左右的蛋白酶蛋白酶组成。它组成。它们识别抗体抗原复合物并降解之,们识别抗体抗原复合物并降解之,同时也能促进巨噬细胞及其吞噬物的同时也能促进巨噬细胞及其吞噬物的降解。降解。此外,此外,B B淋巴细胞合成抗体需要淋巴细胞合成抗体需要T T淋巴细胞提供信号(淋巴细胞提供信号(细胞通讯细胞通讯),),这种这种T T淋巴细胞称辅助淋巴细胞称辅助T T淋巴细胞。淋巴细胞。细胞介导的免疫系统
6、细胞介导的免疫系统细胞介导的免疫细胞介导的免疫是由含有细胞是由含有细胞毒素的毒素的T T淋巴细胞实现的,这类淋巴细胞实现的,这类T T细胞称为细胞称为杀手杀手T T淋巴细胞淋巴细胞。外。外来抗原,尤其是细菌或病毒侵来抗原,尤其是细菌或病毒侵染机体靶细胞后,靶细胞表面染机体靶细胞后,靶细胞表面靶细胞靶细胞杀手杀手TT细胞细胞抗原片段抗原片段MHCMHCTCRTCR TT细胞受体细胞受体上的上的大型组织相容性复合物大型组织相容性复合物(MHCMHC)将细菌或病毒的抗原片段展现在将细菌或病毒的抗原片段展现在细胞外表面,这时杀手细胞外表面,这时杀手T T淋巴细胞表面的淋巴细胞表面的T T细胞受体就能专
7、一性与抗原细胞受体就能专一性与抗原片段或片段或抗原片段抗原片段-MHCMHC复合物复合物结合,进而消灭被侵染的靶细胞及入侵者结合,进而消灭被侵染的靶细胞及入侵者细胞介导的免疫系统细胞介导的免疫系统哺乳动物的每个个体都有其特哺乳动物的每个个体都有其特异性的异性的MHCMHC蛋白谱蛋白谱,因而从一,因而从一个个体向另一个体的组织移植个个体向另一个体的组织移植是困难的,因为供体与受体之是困难的,因为供体与受体之间的间的MHCMHC蛋白谱不同。机体免蛋白谱不同。机体免靶细胞靶细胞杀手杀手TT细胞细胞抗原片段抗原片段MHCMHCTCRTCR TT细胞受体细胞受体疫系统不会进攻自身的性质称为疫系统不会进攻
8、自身的性质称为“免疫耐受性免疫耐受性”,而抗体、,而抗体、T T细胞受体、细胞受体、MHCMHC是多样的(免疫多样性),这就为机体定义识别自身提供了分子是多样的(免疫多样性),这就为机体定义识别自身提供了分子基础。基础。3A3A 人体的免疫识别及应答系统人体的免疫识别及应答系统 机体在接触到抗原后,便会产生对该抗原新一轮入侵的机体在接触到抗原后,便会产生对该抗原新一轮入侵的免疫作用,而在此之前,机体缺乏对抗原的这种特异性杀伤免疫作用,而在此之前,机体缺乏对抗原的这种特异性杀伤作用。换句话说,机体对抗原的杀伤能力是在免疫应答过程作用。换句话说,机体对抗原的杀伤能力是在免疫应答过程c 免疫系统的形
9、成中获得的,这种能力产生的机制遵循中获得的,这种能力产生的机制遵循“克隆选择理论克隆选择理论”。克隆选择理论克隆选择理论未成熟的淋巴细胞池中含未成熟的淋巴细胞池中含有有B B细胞和细胞和T T细胞,每一个细胞,每一个B B细胞和细胞和T T细胞只含有一种细胞只含有一种特异性抗体和受体。在初特异性抗体和受体。在初级免疫应答之后,大量的级免疫应答之后,大量的B B细胞和细胞和T T细胞成熟,它们细胞成熟,它们具有对某一抗原的特异性具有对某一抗原的特异性抗体和受体。抗体和受体。3A3A 人体的免疫识别及应答系统人体的免疫识别及应答系统 哺乳动物的免疫系统不但具有重要的生理功能,同时也哺乳动物的免疫系
10、统不但具有重要的生理功能,同时也d 免疫系统的特征涉及到许多分子生物学的重大理论问题。涉及到许多分子生物学的重大理论问题。免疫识别免疫识别抗体与抗原的特异性分子识别抗体与抗原的特异性分子识别 上述特异性识别通常只涉及到抗原蛋白分子中的上述特异性识别通常只涉及到抗原蛋白分子中的5-65-6个氨基个氨基酸残基。抗体与抗原、受体与配体、酶与底物是生物体内酸残基。抗体与抗原、受体与配体、酶与底物是生物体内蛋白质蛋白质MHCMHC与抗原的特异性分子识别与抗原的特异性分子识别T T细胞受体与抗原细胞受体与抗原MHCMHC复合物的特异性分子识别复合物的特异性分子识别之间分子识别之间分子识别的三大模型。的三大
11、模型。细胞通讯细胞通讯 B B淋巴细胞合成抗体需要辅助淋巴细胞合成抗体需要辅助T T细胞提供信号;杀手细胞提供信号;杀手T T细胞在细胞在与抗原与抗原MHCMHC复合物结合后,将信号转导入细胞内,激活一系列复合物结合后,将信号转导入细胞内,激活一系列参与免疫应答的组分。这些都是细胞通讯的基本原理,但这种信参与免疫应答的组分。这些都是细胞通讯的基本原理,但这种信号转导又与细胞因子和生长因子的信号转导通路有所不同。号转导又与细胞因子和生长因子的信号转导通路有所不同。免疫多样性免疫多样性 免疫多样性,包括抗体、免疫多样性,包括抗体、T T细胞受体、细胞受体、MHCMHC的多样性发生机的多样性发生机制
12、,是免疫分子生物学的基本内容,也是生命科学的重要理论命制,是免疫分子生物学的基本内容,也是生命科学的重要理论命题题。一个哺乳类动物的机体可以产生数百万甚至一个哺乳类动物的机体可以产生数百万甚至数亿种数亿种不同的抗不同的抗体,它们对应着同等数量的抗原。自然界中存在着的所有细菌、体,它们对应着同等数量的抗原。自然界中存在着的所有细菌、病毒、生物大分子在机体内均有对应的抗体和病毒、生物大分子在机体内均有对应的抗体和T T细胞受体,甚至细胞受体,甚至就连自然界内尚未出现的抗原分子(如病毒),机体内已存在着就连自然界内尚未出现的抗原分子(如病毒),机体内已存在着相应的抗体。那么机体是怎样产生数量如此庞大
13、的抗体呢?人体相应的抗体。那么机体是怎样产生数量如此庞大的抗体呢?人体内总共只有几万个基因,如何能为数亿种抗体蛋白编码呢?内总共只有几万个基因,如何能为数亿种抗体蛋白编码呢?3B3B 免疫球蛋白基因的顺序组织免疫球蛋白基因的顺序组织 高等哺乳类动物的免疫球蛋白(高等哺乳类动物的免疫球蛋白(IgIg)由两条重链由两条重链(HH,35KD35KD)和两条轻链(和两条轻链(L L,17KD17KD)通过通过四对二硫键四对二硫键连接而成。连接而成。a 抗体分子的基本结构 重链有五种类别:重链有五种类别:m m m m,d d d d,g g g g,e e e e,a a a a,分别构成:分别构成:
14、IgMIgM、IgDIgD、IgGIgG IgAIgA、IgEIgE,它们通常具有不同的生物学功能。它们通常具有不同的生物学功能。轻链有两种类别:轻链有两种类别:k k k k,l ll l。人类的抗体中,人类的抗体中,60%60%是是k k链;链;40%40%为为l ll l链。链。抗体的分子结构抗体的分子结构NNNNCCCCV VLLJ JCCLLV VLLJ JCCLLV VHHDJDJCCH1H1CCH2H2CCH3H3CCH2H2CCH3H3铰链区(铰链区(HingeHinge)效应功能区(五类抗体的功能类别决定区)效应功能区(五类抗体的功能类别决定区)抗原结合区抗原结合区3B3B
15、免疫球蛋白基因的顺序组织免疫球蛋白基因的顺序组织人体免疫球蛋白的编码基因包括下列三大家族:人体免疫球蛋白的编码基因包括下列三大家族:b 抗体分子的编码基因轻链轻链 l l l l 家族家族轻链轻链 k k k k 家族家族重链家族重链家族少于少于300300个不同的个不同的V V基因和大于基因和大于6 6个不同的个不同的CC基因基因 少于少于300300个不同的个不同的V V基因以及唯一的基因以及唯一的1 1个个CC基因基因 大约大约300300个不同的个不同的V V基因以及基因以及9 9个不同的个不同的CC基因基因包括包括 m m m m、d d d d、g g g g、a a a a、e
16、e e e 基因基因 3B3B 免疫球蛋白基因的顺序组织免疫球蛋白基因的顺序组织 在在这这里里,基基因因的的概概念念是是编编码码免免疫疫球球蛋蛋白白多多肽肽链链的的一一个个特特定定区区域域的的DNADNA序序列列。在在非非抗抗体体合合成成细细胞胞中中,V V基基因因和和CC基基因因不不在在同同一一条条染染色色体上。体上。b 抗体分子的编码基因 三三个个家家族族的的划划分分是是因因为为每每个个家家族族的的各各个个基基因因均均有有自自己己的的顺顺序序组组织织模模式式及及表表达达模模式式,家家族族不不同同,基基因因的的顺顺序序组组织织及及表表达达调调控控模模式式也也不同。不同。3B3B 免疫球蛋白基
17、因的顺序组织免疫球蛋白基因的顺序组织 高高等等哺哺乳乳类类动动物物免免疫疫球球蛋蛋白白基基因因的的排排列列顺顺序序在在胚胚胎胎细细胞胞和和B B淋淋巴巴细细胞胞中中是是不不同同的的,胚胚胎胎细细胞胞中中的的相相应应基基因因并并不不能表达。胚胎细胞中免疫球蛋白的基因顺序组织如下:能表达。胚胎细胞中免疫球蛋白的基因顺序组织如下:c 抗体基因家族的顺序组织l l l l 基因家族在胚胎细胞中的顺序组织基因家族在胚胎细胞中的顺序组织1000 kb1000 kb少于少于300300个个V Vl ll l基因基因间隔区间隔区大于大于6 6个个J Jl ll l CCl ll l基因基因信号肽编码区信号肽编
18、码区可变区编码区可变区编码区J J 区编码区区编码区不变区编码区不变区编码区(-19 -4-19 -4)(-3 97-3 97)(98 11098 110)(111 111 CC)k k k k 基因家族在胚胎细胞中的顺序组织基因家族在胚胎细胞中的顺序组织少于少于300300个个V Vkk基因基因间隔区间隔区5 5个个J Jkk和和1 1个个CCkk基因基因信号肽编码区信号肽编码区可变区编码区可变区编码区J J 区编码区区编码区不变区编码区不变区编码区5 5个个J Jkk片段分布在片段分布在500-700 500-700 bpbp的区域内,内含子结构长的区域内,内含子结构长为为2-3 2-3
19、kbkb增强子增强子H H 重链重链基因家族在胚胎细胞中的顺序组织基因家族在胚胎细胞中的顺序组织300 kb300 kb300300个个VVHH信号肽编码区信号肽编码区可变区编码区可变区编码区 人人的的免免疫疫球球蛋蛋白白HH重重链链基基因因家家族族不不像像轻轻链链家家族族那那样样分分隔隔成成分分离离的的两两部部分分,而而是是所所有有基基因因全全部部组组成成一一个个巨巨大大的的基基因因簇簇结结构构。其其中中,DD区区由由2-132-13个氨基酸组成。个氨基酸组成。2020个个DD66个个JJm d gm d g3 3 gg11ye ye aa1 1 yg yg gg2 2 gg4 4 e ae
20、 a22CCH1H1铰链区铰链区CCH2H2CCH3H33C3C 抗体多样性的分子机制抗体多样性的分子机制 人体的人体的B B淋巴细胞可同时产生至少数百万种不同的抗体,每种抗体淋巴细胞可同时产生至少数百万种不同的抗体,每种抗体分子的氨基酸序列均不同。根据传统理论,人体至少应有几百万个免疫分子的氨基酸序列均不同。根据传统理论,人体至少应有几百万个免疫球蛋白基因为其编码,但事实上人体染色体中的基因总数只有球蛋白基因为其编码,但事实上人体染色体中的基因总数只有3-43-4万个万个这显然是一个理论上的难题。这显然是一个理论上的难题。19651965年年,DreyerDreyer和和BenettBene
21、tt提出了基因重排假说,以解释抗体多样性提出了基因重排假说,以解释抗体多样性的分子机制:抗体的不变区是由单基因编码的,而可变区则由数千个基的分子机制:抗体的不变区是由单基因编码的,而可变区则由数千个基因编码,机体通过因编码,机体通过体内基因重排体内基因重排或重组方式实现抗体分子的多样性。可或重组方式实现抗体分子的多样性。可是当时这个假说并没有为他人所接受,因为那时人们相信基因是不会重是当时这个假说并没有为他人所接受,因为那时人们相信基因是不会重组的,直到十年后,组的,直到十年后,DNADNA体外重组实验成功后,这个假说才被承认。体外重组实验成功后,这个假说才被承认。3C3C 抗体多样性的分子机
22、制抗体多样性的分子机制 19761976年,年,Susumu TonegawaSusumu Tonegawa设计了一个著名的实验,证明抗体基设计了一个著名的实验,证明抗体基因在骨髓干细胞(淋巴细胞的前身)中发生了重排。实验设计如下:从因在骨髓干细胞(淋巴细胞的前身)中发生了重排。实验设计如下:从胚胎细胞和骨髓干细胞中分别制备全染色体胚胎细胞和骨髓干细胞中分别制备全染色体DNADNA,用用BamHIBamHI消化后,凝消化后,凝胶电泳分离,然后用胶电泳分离,然后用 I I125 125 标记的抗体标记的抗体mRNAmRNA(包含包含V V和和C C两部分)杂交两两部分)杂交两种来源的种来源的DN
23、ADNA片段,结果发现在胚胎细胞片段,结果发现在胚胎细胞DNADNA片段中有两条不同大小的片段中有两条不同大小的BamHIBamHI片段呈阳性;而在骨髓干细胞片段呈阳性;而在骨髓干细胞DNADNA片段中,只有一条带呈杂交阳片段中,只有一条带呈杂交阳性。这表明,在骨髓干细胞中的抗体基因顺序组织不同于胚胎细胞,也性。这表明,在骨髓干细胞中的抗体基因顺序组织不同于胚胎细胞,也就是说,骨髓干细胞中的抗体基因发生了改变,因为骨髓干细胞也是就是说,骨髓干细胞中的抗体基因发生了改变,因为骨髓干细胞也是从胚胎细胞分化而来的。从胚胎细胞分化而来的。3C3C 抗体多样性的分子机制抗体多样性的分子机制 后来,当抗体
24、基因逐一被克隆后,后来,当抗体基因逐一被克隆后,DNADNA顺序组织的分析结果证实顺序组织的分析结果证实了在胚胎细胞和其它非抗体生成体细胞中,构成抗体的各基因(尤其了在胚胎细胞和其它非抗体生成体细胞中,构成抗体的各基因(尤其是是V V基因和基因和C C基因)是分离的,它们不能表达任何有功能的抗体蛋白。基因)是分离的,它们不能表达任何有功能的抗体蛋白。而在而在B B淋巴细胞中,各抗体基因元件重组在一起,轻链为淋巴细胞中,各抗体基因元件重组在一起,轻链为V-JCV-JC,重链重链为为V-DJ-CV-DJ-C,它们作为一个转录单位,转录出它们作为一个转录单位,转录出mRNAmRNA前体,经剪切后,前
25、体,经剪切后,翻译出抗体蛋白。那么,抗体基因的重排是怎样进行的呢?翻译出抗体蛋白。那么,抗体基因的重排是怎样进行的呢?3C3C 抗体多样性的分子机制抗体多样性的分子机制小鼠的小鼠的k k k k轻链基因和重链基因随机重排研究得最为详细,以此为例:轻链基因和重链基因随机重排研究得最为详细,以此为例:a 体细胞抗体基因重排的分子机制抗体基因的随机组合抗体基因的随机组合 小鼠小鼠k k k k轻链基因的重排与表达轻链基因的重排与表达小鼠小鼠k k k k轻链基因定位于第轻链基因定位于第6 6号染色体上。号染色体上。V Vk k基因和基因和J Jk k片段的选择是随机的片段的选择是随机的抗体基因的随机
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