应用HadoopMapReduce框架来支持分类工作中国云计算.ppt
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1、电子工业出版社云计算(第二版)配套课件解放军理工大学 刘鹏 教授主编华东交通大学 刘鹏 制作第第1010章章 云计算研究热点云计算研究热点 云计算(第二版)购买网址:当当网 京东商城姊妹力作实战Hadoop购买网址:当当网 京东商城提提 纲纲 云计算体系结构研究 云计算关键技术研究 编程模型研究 支撑平台研究 应用研究 云安全研究 Cumulus:数据中心科学云-主要为科学计算应用程序提供虚拟机、虚拟应用程序和虚拟计算平台 -Cumulus前端节点是Globus虚拟工作空间服务的再实现-OS Farm为云用户提供了两个两个界面界面:用户能输入虚拟机镜像构建参数的Web界面和能通过wget访问的
2、HTTP服务-两种访问方式两种访问方式:一种是Globus虚拟工作空间服务客户端,另一种是通过网格计算工作台或网格门户 CARMEN:e-Science云计算-该项目供神经学家共享、整合、分析数据-体系结构 -用户,通过Web浏览器和富客户端访问CARMEN系统 -领域内的特定服务 -e-Science核心云服务(工作流、数据管理、服务管理、元数据管理和安全组件)-核心云服务(基本的存储和处理)RESERVOIR:云服务融合平台-IBM与SAP、Sun Microsystems及其他若干欧洲科研机构联合开展一项名为RESERVOIR的云计算计划,欧盟投资经费为1700万欧元。该项目旨在建立一种
3、“基于服务的网络经济模式”-RESERVOIR研究了当前无法实现的商业服务对系统性能的需求。RESERVOIR在公开标准基础上建立一个具有可扩展性、灵活性、可靠性的框架以提供云计算服务 TPlatform:Hadoop的变种-体系结构 -PC集群层 -云计算平台基础设施层 -数据处理应用层-最大特点把大小不变的GFS固定文件块变为大小可变的TFS文件块,改进使得数据的分发和读取有更好的性能 P2P环境的MapReduce-P2P-MapReduce体系结构体系结构包含三个基本角色:用户(User)、主节点(Master)和从节点(Slave)。主节点和从节点形成了两个逻辑上的P2P网络M-ne
4、t和S-net-主节点失效时的作业提交和节点失效管理流程管理流程,从中可以看出P2P-MapReduce的工作过程 Yahoo云计算平台-应用需求应用需求(1)在相同的硬件和软件基础设施上支持各种不同类型的应用程序(2)需要根据用户的需求动态的提供计算资源(3)需要很高的安全保证(4)云中的系统必须易于操作(5)提供简单易用的API接口(6)采用资源调度和负载均衡技术,快速高效地为用户提供服务-平台包括三层服务三层服务,分别是基于内容的边缘服务、消息服务和核心服务 微软的Dryad框架-主要用来构建支持有向无环图有向无环图(Directed Acycline Graph,DAG)类型数据流的并
5、行程序,根据程序的要求进行任务调度,自动在各个节点上完成任务-Dryad的执行过程可以看做二维管道流的处理过程 -二维Dryad管道模型定义了一系列操作,包括建立新的节点、在节点之间加入边、合并两个图或是对任务的输入和输出进行处理等 Neptune框架-基础结构中间件,通过提供标准系统的构建来保证可扩展性和有效性,同时减少服务结构的灵活性-优点优点 -信息独立和用户独立,通过一个包含RPC-like访问方式的服务访问接口来压缩应用级别的网络服务。通过服务访问一个模块,可以在数据分区上实现独占 提提 纲纲 云计算体系结构研究 云计算关键技术研究 编程模型研究 支撑平台研究 应用研究 云安全研究
6、语义分析应用对大规模的对大规模的RDFRDF三元组进行语义推理和查询的速度之慢已深三元组进行语义推理和查询的速度之慢已深受广大研究者关注受广大研究者关注 解决方案-应用Google的MapReduceMapReduce框架框架来实现大规模分布式查询和推理,将RDF图分解成能够被计算节点处理的小单位-RDFRDF分子法分子法提供一个处于RDF图和三元组之间的中间化的粒度方法,由于RDF分子的自身缺陷,使得其性能受到限制,提出了将RDF进行扩展的方法,包括层次扩展和顺序扩展,以克服其缺陷生物学应用 HadoopHadoop实现了两个算法来研究解决生物信息计算的问题:一实现了两个算法来研究解决生物信
7、息计算的问题:一个是基本的局部相似性基本查询工具(个是基本的局部相似性基本查询工具(Basic Local Basic Local Alignment Search ToolAlignment Search Tool,BLASTBLAST);另一个是基因集合增强);另一个是基因集合增强分析(分析(Gene Set Enrichment AnalysisGene Set Enrichment Analysis,GSEAGSEA)-BLASTBLAST:一个用来比对生物序列的一级结构的算法:一个用来比对生物序列的一级结构的算法-GSEA:DNA微点阵数据分析工具,用来检测在显性环境中,整个基因序列
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