微生物生理PPT.pptx
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1、第四章 微生物生理主要内容:生物的酶 微生物的营养 微生物的能量代谢 微生物的合成代谢 酶是一类由活性细胞产生的具有催化作用和高度专一性的特殊蛋白质。简单说,酶是一类由活性细胞产生的生物催化剂。辅基 全酶=酶蛋白+辅助因子 辅酶一、酶的概念一、酶的概念第一节第一节 酶酶 (EnzymeEnzyme)第一节 酶(续)二、酶的催化特性 1酶积极参与生物化学反应,加速反应速度,但不能改变反应平衡点,在反应前后无变化;2酶的催化作用具有专一性;一种酶只能作用于一种物质或一类物质,或者说只能催化一种或一类化学反应;3酶的催化作用条件温和;在常温、常压和近中性的水溶液中进行(生物体内环境);4酶对环境条件
2、极为敏感;高温、强酸、强碱、重金属离子等会能使酶丧失活性;由于酶是蛋白质,容易失活;5酶具有极高的催化效率;如过氧化氢酶的催化效率比铁离子Fe3+(一般催化剂)要高1010倍。第一节 酶(续)三、酶的组成 酶的组成有两类:(1)单成分酶:只有蛋白质;(2)全酶:由蛋白质和非蛋 白成分组成。非蛋白成分可以是:有机物、金属离子、有机物和金属离子。通常把它分为辅酶和辅基,与酶蛋白结合得牢的,称为辅基基,与酶蛋白结合得不牢的,称为辅酶。第一节 酶(续)常见的辅酶和辅基有:辅酶A(CoA或CoASH)、NAD(辅酶I)和NADP(辅酶II)、FMN(黄素单核苷酸)和 FAD(黄素腺嘌呤二核苷酸)、辅酶Q
3、(CoQ)、磷酸腺苷及其他核苷酸类(包括AMP、ADP、ATP、GTP、UTP、CTP等)。专性厌氧菌特有的辅酶:辅酶M、F420(辅酶420)、F430(辅酶430)等。第一节 酶(续)四、酶的活性中心 酶的的活活性性中中心心:酶蛋白分子中与底物结合,并起催化作用的小部分氨基酸微区。组成酶的活性中心,可以是蛋白质多肽链上不同位置的氨基酸区域。活性中心可分为结合部位和催化部位。只有酶蛋白保持一定的空间构型,酶的活性中心才能存在。如果酶蛋白发生变性,构成酶活性中心的基团互相分开,酶与底物将无法形成结合,酶促反应也就无法进行。第一节 酶(续)在酶(双成分酶)的非蛋白成分上,具有催化功能的那一部分,
4、称为活性基活性基,它决定着催化反应的性质,担负着传递电子、原子或化学基团的功能。单独的酶蛋白没有酶活性或活性很低,只有与活性基结合,才显示出酶的高度专一性和强大催化效率。酶与底物结合的机理第一节 酶(续)五、酶的分类与命名 根据不同的标准,有不同的分法:1按照酶所催化的化学反应类型,可分为6大类,这也是国际上的标准分法,由此进行编号:(因此其顺序也是很重要的)(注意:教材的顺序是错误的)(1)氧化还原酶类(氧化还原反应)AH2+BA+BH2 还可进一步分为氧化酶和脱氢酶。(2)转移酶类(底物的基团转移到另一有机物上)A-R+BA+B-R R可以是氨基、醛基、酮基、磷酸基等。第一节 酶(续)(3
5、)水解酶类(大分子有机物水解)A-B+HOHAOH+BH(4)裂解酶类(有机物裂解成小分子物质)ABA+B(5)异构酶类(同分异构体之间的转化)AA(6)合成酶类(底物的合成反应,需要能量)A+B+nATPAB+nADP+nPi 第一节 酶(续)根据催化反应的性质将酶分为六大类,在每一大类中又可分为若干亚类和亚亚类,并采取四位编号的系统。每种酶都有一个四位数字的号码,每个酶用4个用圆点隔 开 的 数 字 编 号,编 号 前 冠 以 EC(Enzyme Commission),其中第一位数代表大类;第二、三位数分别代表亚类和亚亚类,由前三位数就可确定反应的性质;第四位数则是酶在该亚亚类中的顺序。
6、例如,L-乳酸:NAD氧化还原酶(乳酸脱氢酶)的四位编号是EC1.1.1.27。其中第一的1是指氧化还原酶大类;第二位的1是指该酶作用于底物的CHOH 基,使之脱氢;第三位的1表明受氢体是NAD+,第四位的27是这个酶的序号。第一节 酶(续)2按酶作用的部位,可分为:胞外酶、胞内酶和表面酶。3按酶作用的底物的不同,可把酶分为淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、纤维素酶、核糖核苷酶等。(属于习惯性的分类法)4按照酶在生物体内存在的状况,可分成固有酶和诱导酶:固有酶,也称为组成酶(constitutive enzyme),无论培养基中有无它们的底物,这种酶都能形成。诱导酶,也称为适应酶(adaptive em
7、zyme),只有在培养基中存在其底物时才能形成。如在E.coli中的利用乳糖的酶就是适应酶。第一节 酶(续)诱导酶的意义:诱导酶的产生,是一个十分复杂的过程,与外界物质(底物)的存在有关,也与生物体内基因的调控有关。这种适应现象对生物来说是一种节约,在环境工程领域具有其意义。因为在环境保护领域,经常会遇到一些在自然界不常见的物质,微生物的适应能力,使对这些物质的降解成为可能。第一节 酶(续)七、酶的活性和影响酶活力的因素 一般都是根据酶的催化效果来测定酶的含量,也就是测定酶所催化的反应速度 反应速度-单位时间内底物的消失量或产物的生成量。衡量酶的数量指标:酶活力-在温度25、最适pH、最适的缓
8、冲溶液和最佳底物浓度等诸条件下,每分钟能使1微摩尔的底物转化的酶量为一个酶活力单位(IU或U)。比活力-在固定条件下,每毫克酶蛋白或每毫升酶液所具有的酶活力。第一节 酶(续)酶反应机理(反应动力学)中间产物学说 Michaelis&Menten提出的中间反应学说:k1 k3 E+S ES E+P k2 米氏公式:由上述中间反应,根据质量作用定律,导出酶促反应速度方程式:(米-门公式):V=VmaxS/(Km+S)Km=(k2+k3)/k1第一节 酶(续)米氏常数Km的含义:(1)当V=Vmax/2时,Km=S,故它是反应速度为最大反应速度一半时的底物浓度;(2)Km=(k2+k3)/k1,表示
9、酶与底物的反应完全程度,Km越小,表明酶与底物的反应越趋于完全,Km越大,表明酶与底物的反应越不完全。对米氏公式作图,可以看到下述关系:第一节 酶(续)米氏常数的求法:Lineweaver-Burk图解法 1/V=1/Vmax+(Km/Vmax)(1/S)第一节 酶(续)1酶浓度对酶促反应的影响 酶促反应速度与酶分子浓度成正比。当底物分子浓度足够时,酶分子越多,底物转化的速度越快。第一节 酶(续)2底物浓度对酶促反应的影响 在生化反应中,若酶的浓度为定值,底物的起始浓度较低时,酶促反应速度与底物浓度成正比,即随底物浓度的增加而增加。当所有的酶与底物结合生成ES后,即使再增加底物浓度,中间产物浓
10、度ES也不会增加,酶促反应速度也不增加 在底物浓度相同的条件下,酶促反应速度与酶的初始浓度成正比。酶的初始浓度大,其酶促反应速度就大。第一节 酶(续)3温度对酶促反应的影响 各种酶在最适温度范围内,酶活性最强,酶促反应速度最大。在适宜的温度范围内,温度每升高10,酶促反应速度可相应提高1-2倍。用温度系数Q10来表示温度对酶促反应的影响。Q10表示温度每升高10,酶促反应速度随之相应提高的因数。酶促反应的Q10通常在1.4-2.0之间,小于无机催化反应和一般化学反应的Q10。Q10=在(T+10)时的反应速度/在T时的反应速度第一节 酶(续)但并不是温度越高越好,有一个适应的范围,一般微生物的
11、温度最适范围在2560。温度的影响存在三基点:最高、最适、最低。温度过高会破坏酶蛋白,造成变性;(约60)温度过低会使酶作用降低或停止,但可以恢复。(约4)不同微生物的温度适应范围不同。第一节 酶(续)4pH对酶促反应的影响 同样存在三基点:最高、最适、最低。酶在最适pH范围内表现出活性,大于或小于最适pH,都会降低酶活性。pH对酶活力的影响主要表现在两个方面:(1)改变底物分子和酶分子的带电状态,从而影响酶和底物的结合;(2)过高、过低的pH都会影响酶的稳定性,进而使酶遭到不可逆的破坏。第一节 酶(续)5激活剂对酶促反应的影响 能激活酶的物质称为酶的激活剂。激活剂种类很多,有无机阳离子、无机
12、阴离子、有机化合物等。许多酶只有当某一种适当的激活剂存在时,才表现出催化活性或强化其催化活性,这称为对酶的激活作用。例如,金属离子的激活作用起了某种搭桥作用,它先与酶结合,再与底物结合,形成酶-金属-底物的复合物。而有些酶被合成后呈现无活性状态,这种酶称为酶原。它必须经过适当的激活剂激活后才具有活性。如胰蛋白酶刚合成时,没有活性,为胰蛋白酶原,需经肠激酶激活后才具有活性。又如酵母磷酸葡萄糖变位酶,需1310-3M的 Mg2+进行激活,其活性可以增加6.6倍。第一节 酶(续)6抑制剂对酶促反应的影响 能减弱、抑制甚至破坏酶活性的物质称为酶的抑制剂。抑制剂可降低酶促反应速度。酶的抑制剂有重金属离子
13、、一氧化碳、硫化氢、氰氢酸、氟化物、碘化乙酸、生物碱、染料、对-氯汞苯甲酸、二异丙基氟磷酸、乙二胺四乙酸、表面活性剂等。第一节 酶(续)对酶促反应的抑制可分竞争性抑制和非竞争性抑制。与底物结构类似的物质争先与酶的活性中心结合,从而降低酶促反应速度,这种作用称为竞争争性性抑抑制制。竞争性抑制是可逆性抑制,通过增加底物浓度最终可解除抑制,恢复酶的活性。与底物的结构类似的物质称为竞争性抑制剂。抑制剂与酶活性中心以外的位点结合后,底物仍可与酶活性中心结合,但酶不显示活性,这种作用称为非非竞争争性性抑抑制制。非竞争性抑制是不可逆的,增加底物浓度并不能解除对酶活性的抑制。与酶活性中心以外的位点结合的抑制剂
14、,称为非竞争性抑制剂。有的物质既可作一种酶的抑制剂,又可作另一种酶的激活剂。第二节 微生物的营养 新陈代谢过程:微生物从外界不断地摄取营养物质,经过一系列的生物化学反应,转变成细胞的组分,同时产生废物并排泄到体外,这个过程称为新新陈代代谢(代谢)。新陈代谢包括同化作用(物质合成,吸收能量)和异化作用(物质分解,释放能量)。两者是相辅相成的:异化作用为同化作用提供物质基础和能量。同化作用为异化作用提供基质。了解微生物的营养及其所需营养物的种类和数量,首先要了解微生物的化学组成、元素组成和生理特性。一、微生物的化学组成 化学(物质)组成:微生物体内,70-90%为水分,10-30%为干物质。水:各
15、类微生物细胞内均含有大量的水分,如细菌为75-85%、酵母菌为70-85%、霉菌为85-90%,芽孢的水分最少,仅40%,这与它的生理功能有关(抵抗不良环境)。水是生命活动不可缺少的重要物质,它是多种物质的良好溶剂,各种生理活动都离不开水。营养物质:营养物质:满足机体生长、繁殖和生理活动的物质满足机体生长、繁殖和生理活动的物质 营养:营养:获取和利用营养物质的过程。获取和利用营养物质的过程。元素组成:(1)C、H、O、N:为所有生物体的有机元素。在生物体内大量存在,占90-97%,是组成有机体的主要元素。除此之外的元素为矿质元素,又可分为:(2)大量元素:包括P、S、K、Na、Ca、Mg、Cl
16、等。它们与细胞结构,物质组成,能量转移,原生质胶体状的维持等有关。(3)微量元素:包括Fe、Cu、Mn、B、Mo、Co、Si等,含量极微,但却是不可缺少的,具有一些特殊的功能,如酶的激活等。当然,微生物的化学组成并不是绝对不变的,它往往会由于菌龄的不同和培养条件的改变而发生变化。干物质:其中有机物占干重的90-97%,无机物占3-10%;有机物主要是蛋白质、糖类(碳水化合物)、核酸、脂类等,无机物则是各类元素。根据微生物有机元素组成分析数据,可得到化学组成实验式。如霉菌是C12H18O7N,它不是分子式,只是用来说明组成有机体的各种元素之间的比例关系,可供在培养微生物时作为提供营养的参考。从实
17、验所得数据可以求出化学组成实验式:重量百分比摩尔百分比以氮为1,求出相对比值四舍五入,最后得到化学组成实验式二、微生物的营养物及营养类型 从微生物的化学组成中,我们可以看到:微生物首先需要大量的水分;需要较多地供给构成有机物碳架和含氮物质的碳元素和氮元素;另外,还需要一些含P、Mg、K、Ca、Na、S等的盐类,及微量的Fe、Cu、Zn、Mn等元素。因此,除了某些特殊要求的微生物外,培养一般微生物必须提供上述这些营养物质,微生物才能正常地生长繁殖。水水微微生生物物营营养养物物质质碳素化合物碳素化合物氮素化合物氮素化合物矿质元素矿质元素生长因子生长因子(一)微生物需要的营养物质能源能源 1.水 水
18、是微生物机体的组成部分,同时又是微生物代谢过程中必不可少的。它的作用体现在两方面,一是有助于营养物质的吸收利用(先溶解于水);二是保证各种生化反应的进行(须在水溶液中进行)。2.碳源和能源(source of carbon)凡能供给微生物碳素营养的物质,称为碳源。碳源的主要作用:是构成微生物细胞的含碳物质(碳架)和供给微生物生长、繁殖及运动所需要的能量。充当碳源的物质,往往同时又是能量的提供者(自然界中含碳的有机物,一般都含有较高的能量,在被分解时能释放出来,为微生物所利用)。从简单的无机碳化合物到复杂的有机含碳化合物,都可作为碳源。例如,糖类、脂肪、氨基酸、蛋白质、脂肪酸、丙酮酸、柠檬酸、淀
19、粉、纤维素、半纤维素、果胶、木质素,醇类、醛类、烷烃类、芳香族化合物(如酚、萘、菲及蒽等)、氰化物(如氰化钾、氰氢酸和丙烯腈),各种低浓度的染料等。少数微生物还能以CO2或CO32-中的碳素为唯一的或主要/的碳源。微生物细胞中的碳素含量相当高,占干物质质量的50%左右。可见,微生物对碳素的需求量最大。种类种类 碳源物质碳源物质备注备注糖糖葡萄糖、果糖、麦芽糖、蔗糖、淀粉、葡萄糖、果糖、麦芽糖、蔗糖、淀粉、半乳糖、乳糖、甘露糖、纤维二糖、纤半乳糖、乳糖、甘露糖、纤维二糖、纤维素、半纤维素、甲壳素、木质素等维素、半纤维素、甲壳素、木质素等 单糖优于双糖,己糖优于戊糖,淀粉优单糖优于双糖,己糖优于戊
20、糖,淀粉优于纤维素,纯多糖优于杂多糖。于纤维素,纯多糖优于杂多糖。有机酸有机酸糖酸、乳酸、柠檬酸、延胡索酸、低级糖酸、乳酸、柠檬酸、延胡索酸、低级脂肪酸、高级脂肪酸、氨基酸等脂肪酸、高级脂肪酸、氨基酸等与糖类比效果较差,有机酸较难进入细与糖类比效果较差,有机酸较难进入细胞,进入细胞后会导致胞,进入细胞后会导致pHpH下降。当环境下降。当环境中缺乏碳源物质时,氨基酸可被微生物中缺乏碳源物质时,氨基酸可被微生物作为碳源利用。作为碳源利用。醇醇乙醇乙醇在低浓度条件下被某些酵母菌和醋酸菌在低浓度条件下被某些酵母菌和醋酸菌利用。利用。脂脂脂肪、磷脂脂肪、磷脂主要利用脂肪,在特定条件下将磷脂分主要利用脂肪
21、,在特定条件下将磷脂分解为甘油和脂肪酸而加以利用。解为甘油和脂肪酸而加以利用。烃烃天然气、石油、石油馏分、石蜡油等天然气、石油、石油馏分、石蜡油等利用烃的微生物细胞表面有一种由糖脂利用烃的微生物细胞表面有一种由糖脂组成的特殊吸收系统,可将难溶的烃充组成的特殊吸收系统,可将难溶的烃充分乳化后吸收利用。分乳化后吸收利用。COCO2 2COCO2 2为自养微生物所利用。为自养微生物所利用。碳酸盐碳酸盐NaHCONaHCO3 3、CaCOCaCO3 3、白垩等、白垩等为自养微生物所利用。为自养微生物所利用。其他其他芳香族化合物、氰化物芳香族化合物、氰化物 蛋白质、核酸等蛋白质、核酸等利用这些物质的微生
22、物在环境保护方面利用这些物质的微生物在环境保护方面有重要作用。有重要作用。当环境中缺乏碳源物质时,可被微生物当环境中缺乏碳源物质时,可被微生物作为碳源而降解利用。作为碳源而降解利用。3、氮源、氮源(source of nitrogen)|凡是可以被微生物用来构成细胞物质的或代凡是可以被微生物用来构成细胞物质的或代谢产物中氮素来源的营养物质通称为谢产物中氮素来源的营养物质通称为氮源氮源物物质。氮源的作用是提供微生物合成蛋白质的质。氮源的作用是提供微生物合成蛋白质的原料(一般不充当能源)。原料(一般不充当能源)。|能被微生物所利用的氮源物质有蛋白质及其能被微生物所利用的氮源物质有蛋白质及其各类降解
23、产物、铵盐、硝酸盐、亚硝酸盐、各类降解产物、铵盐、硝酸盐、亚硝酸盐、分子态氮、嘌呤、嘧啶、脲、酰胺、氰化物。分子态氮、嘌呤、嘧啶、脲、酰胺、氰化物。种类种类 氮源物质氮源物质 备注备注 蛋白质蛋白质类类 蛋白质及其不蛋白质及其不同程度降解产同程度降解产物物(胨、肽、氨胨、肽、氨基酸等基酸等)大分子蛋白质难进入细胞,一些真菌和少数细菌大分子蛋白质难进入细胞,一些真菌和少数细菌能分泌胞外蛋白酶,将大分子蛋白质降解利用,能分泌胞外蛋白酶,将大分子蛋白质降解利用,而多数细菌只能利用相对分子质量较小其降解产而多数细菌只能利用相对分子质量较小其降解产物物 氨及铵氨及铵盐盐 NH3、(NH4)2SO4等等
24、容易被微生物吸收利用容易被微生物吸收利用 硝酸盐硝酸盐 KNO3等等 容易被微生物吸收利用容易被微生物吸收利用 分子氮分子氮 N2 固氮微生物可利用,但当环境中有化合态氮源时,固氮微生物可利用,但当环境中有化合态氮源时,固氮微生物就失去固氮能力固氮微生物就失去固氮能力 其他其他 嘌呤、嘧啶、嘌呤、嘧啶、脲、胺、酰胺、脲、胺、酰胺、氰化物氰化物 大肠杆菌不能以嘧啶作为唯一氮源,在氮限量的大肠杆菌不能以嘧啶作为唯一氮源,在氮限量的葡萄糖培养基上生长时,可通过诱导作用先合成葡萄糖培养基上生长时,可通过诱导作用先合成分解嘧啶的酶,然后再分解并利用嘧啶可不同程分解嘧啶的酶,然后再分解并利用嘧啶可不同程度
25、地被微生物作为氮源加以利用度地被微生物作为氮源加以利用 根据对氮源要求的不同,将微生物分为根据对氮源要求的不同,将微生物分为4类:类:(1)固氮微生物 这类微生物能利用空气中的氮分子(N2)合成自身的氨基酸和蛋白质。如固氮菌、根瘤菌和固氮蓝藻。(2)利用无机氮作为氮源的微生物 能利用氨(NH3)、铵盐(NH4+)、亚硝酸盐(NO2-)、硝酸盐(NO3-)的微生物有亚硝化细菌、硝化细菌、大肠杆菌、产气杆菌、枯草杆菌、铜绿色假单胞菌、放线菌、霉菌、酵母菌及藻类等。(3)需要某种氨基酸作为氮源的微生物 这类微生物叫氨基酸异养微生物。如乳酸细菌、丙酸细菌等。它们不能利用简单的无机氮化物合成蛋白质,而必
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