2016年全球二代基因测序行业投研报告.pdf
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1、 全球二代基因测序行业 投研报告 2016年 2 基因测序行业概况 1 基因测序行业投资数据分析 2 基因测序行业发展趋势及投资机会 3 3 基因测序的定义 基因、染色体及基因测序的定义 【基因】基因是指能够产生有功能蛋白质或是RNA产物的DNA片段,其中的核苷酸排列顺序决定了基因的功能。基因通常呈线性排列在作为遗传物质的长链DNA上,随着繁殖传递给后代。【染色体】染色体是细胞核内由长链DNA和核蛋白组成的结构,是基因的主要载体,在显微镜下呈丝状或棒状。正常人体细胞中的染色体数目是23对,包括22对是常染色体和1对性染色体。性染色体有X染色体和Y染色体两种,女性是一对相同的X染色体(XX),男
2、性则是一条X染色体和一条Y染色体(XY)。【基因测序】基因测序是指通过测序设备对DNA分子的碱基排列顺序进行的测定,即测定和解读DNA分子中腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)和鸟嘌呤(G)四种碱基的排列顺序。1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 X Y 基因 染色体 人体23对染色体 4 基因测序行业发展环境分析 政策环境:政策利好,临床级产品监管逐步规范化(1/2)来源:国家卫生和计划生育委员会,国家食品和药品监督管理总局。2016年3月,科技部发布关于发布国家重点研发计划精准医学研究等重点专项2016年度项
3、目申报指南的通知,将“精准医学研究”列为2016年优先启动的重点专项之一。政府鼓励和支持以基因测序为基础的精准医疗,行业迎来政策红利。政府在鼓励行业发展的同时,也逐步加强临床级基因测序产品的监管。2014年,卫计委和食品药品监管总局加强基因测序行业监管,规定基因检测仪器、诊断试剂和相关医用软件等产品,需经CFDA审批注册,并经卫计委批准技术准入方可临床应用。此后分别批准了华大基因、达安基因和贝瑞和康等企业的基因测序诊断NIPT产品,无创产检和肿瘤测序等临床级别的基因测序产品和服务逐步走向规范化。年份 法律法规 具体规定 2014.1 食品药品监管总局办公厅关于基因分析仪等3个产品分类界定的通知
4、 基因分析仪作为类医疗器械管理,测序反应通用试剂盒(测序法)作为类医疗器械管理 2014.2 关于加强临床使用基因测序相关产品和技术管理的通知 检测仪器、诊断试剂和相关医用软件等产品,需经CFDA审批注册,并经卫计委批准技术准入方可应用 2014.3 关于开展高通量基因测序技术临床应用试点单位申报工作的通知 已经开展高通量基因测序技术,且符合申报规定条件的医疗机构可以申请试点 2014.6 第二代基因测序诊断产品批准上市 CFDA首次批准华大基因二代基因测序诊断NIPT产品上市 2014.11 第二代基因测序诊断产品批准上市 CFDA批准达安基因二代基因测序诊断NIPT产品上市 2014.12
5、 开展高通量基因测序技术临床应用试点工作的通知 确定北广两地第一批高通量测序技术临床应用试点单位,开展遗传病诊断、产前筛查与诊断、植入前胚胎遗传学诊断试点工作 2015.1 关于产前诊断机构开展高通量基因测序产前筛查与诊断临床应用试点工作的通知 审批通过了108家医疗机构开展高通量基因测序产前筛查与诊断(NIPT)临床试点 5 基因测序行业发展环境分析 政策环境:政策利好,临床级产品监管逐步规范化(2/2)来源:国家卫生和计划生育委员会,国家食品和药品监督管理总局。年份 法律法规 具体规定 2015.1 关于辅助生殖机构开展高通量基因测序植入前胚胎遗传学诊断临床应用试点工作的通知 审批通过了1
6、3家医疗机构开展高通量基因测序植入前胚胎遗传学诊断临(PGD)床应用试点 2015.3 第二代基因测序诊断产品批准上市 CFDA批准贝瑞和康二代基因测序诊断NIPT产品上市 2015.4 关于肿瘤诊断与治疗专业高通量基因测序技术临床应用试点工作的通知发布了第一批肿瘤诊断与治疗项目高通量基因测序技术临床试点单位名单 2015.6 国家发展改革委关于实施新兴产业重大工程包的通知 重点发展基因检测等新型医疗技术,并将在3年时间内建设30个基因检测技术应用示范中心,快速推进基因检测临床应用以及基因检测仪器试剂的国产化 2015.7 药物代谢酶和药物作用靶点基因检测技术指南(试行)肿瘤个体化治疗检测技术
7、指南(试行)印发药物代谢酶和药物作用靶点基因检测技术指南;印发肿瘤个体化治疗检测技术指南 2015.10 中共中央关于制定国民经济和社会发展第十三个五年规划的建议 将“健康中国”写入纲领性文件,未来5年健康产业将会获得重点扶持 2016.3 科技部关于发布国家重点研发计划精准医学研究等重点专项2016年度项目申报指南的通知“精准医学研究”列为2016年优先启动的重点专项之一,并正式进入实施阶段 6 基因测序行业发展环境分析 经济环境:医疗支出呈增长趋势,提升行业机会 注释:人均医疗卫生支出为公共和与私营卫生支出之和与总人口的比率。涵盖医疗卫生服务(预防和治疗)、计划生育、营养项目、紧急医疗救助
8、,但是不包括饮用水和卫生设施提供。数据按现价美元计。来源:人均医疗支出和人均GDP数据均来自世界银行数据库。世界银行数据显示,除中低收入国家外,其余各类收入类型国家人均医疗支出占人均GDP的比重均呈现逐年上升趋势。医疗保健人均支出占比的提高,一方面来自医疗费用的上涨,另一方面则来自人们对于健康的重视程度的提高。艾瑞分析认为,随着人均收入的增长,人们越来越重视自己的健康状况,因而人均医疗支出占比也呈现逐步上升的趋势。人们健康意识的提高,将有利于提高用户或病患对于基因测序产品和服务的接受度和付费意愿。9.3%9.9%10.9%11.9%11.9%4.9%5.4%5.6%5.9%6.0%4.7%5.
9、1%5.3%5.4%5.6%2.3%2.1%2.3%2.1%2.0%4.6%4.8%5.4%6.1%6.1%0%5%10%15%199520002005201020131995-2013年各收入类型国家人均医疗支出占人均GDP比重 高收入国家(%)中高等收入国家(%)中等收入国家(%)中低收入国家(%)低收入国家(%)7 基因测序行业发展环境分析 社会环境:复杂疾病死亡率高,催生精准医疗需求 来源:1)2014年中国统计年鉴;2)WIN Symposium。卫生统计年鉴数据显示,2013年城市居民主要疾病死亡率前三分别为恶性肿瘤、心脏病和冠心病,这组数据表明肿瘤等复杂疾病在我国具有较高的死亡率
10、。而传统治疗方案在治疗肿瘤等复杂疾病时,治疗效果不佳。数据显示,传统治疗方案在肿瘤治疗上的用药无效率高达75%,在老年痴呆症治疗上的用药无效率为70%,在糖尿病治疗上的用药无效率为43%。艾瑞分析认为,传统医学在治疗复杂疾病时的效果并不佳,同时人们也逐渐意识到大多数复杂疾病是自身基因同外界环境和个人生活习惯等因素共同作用的结果,迫切需求在治疗上的个性化。11.6 15.1 15.1 39.0 39.5 52.4 53.0 100.9 133.8 159.7 050100150200高血压心脏病 糖尿病 肺炎 损伤和中毒 脑梗死 脑出血 慢性下呼吸道疾病 冠心病 心脏病 恶性肿瘤 死亡率(十万分
11、之)2013年中国居民疾病死亡率Top10 38%40%40%43%48%50%52%70%75%0%20%40%60%80%100%抑郁症 心律失常 哮喘 糖尿病 偏头疼 关节炎 骨质疏松症 老年痴呆症 肿瘤 传统医疗在复杂疾病治疗上的用药无效率 药物平均无效率(%)8 基因测序行业发展环境分析 技术环境:基因测序技术更新迭代速度加快 来源:根据公开资料整理而得。从1986年第一台商用基因测序设备出现,到第二代测序设备出现,中间间隔19年;而第二代设备到第三代设备只用了5年,基因测序设备更新迭代的速度正在加快。目前二代测序设备在通量、准确度上都有了较大的提高,同时测序成本也随之大幅度下降,已
12、成为商用测序的主流;三代测序设备在DNA 序列片段读长上优于二代设备,但在准确度上较二代设备差,未来随着技术的改善,三代测序设备也将更为稳定和成熟。桑格和考尔森发明第一代测序技术链终止法 技术基础 1953 1975 1977 1983 1986 1995 2005 2006 2007 2008 2010 2011 2012 沃森和克里克提出DNA双螺旋结构 技术基础 桑格完成噬菌体X174基因组测序,为第一个基因测序 技术基础 穆利斯发明复制DNA片段的“聚合酶链式反应”,即PCR 技术基础 ABI公司推出第一台商用基因测序仪Prism370A 第一代测序技术 ABI推出第一台毛细管电泳测序
13、仪Prism310 第一代测序技术 454 Life Science 推出基于焦磷酸测序的高通量测序仪Genome Sequencer 20 第二代测序技术 Illumina推出Genome Analyer测序平台 第二代测序技术 ABI推出第二代基因测序设备SOLiD 第二代测序技术 Illumina推出HiSeq系列基因测序设备 第二代测序技术 Helicos推出单分子测序设备Heliscope 第三代测序技术 Life Ion Torrent 推出快速测序设备PGM 第三代测序技术 Pacific Biosciences推出单分子测序设备PacBio RS 第三代测序技术 Oxford
14、Nanopore公开MinIon和GridIO,并启动MinIon试用计划 第三代测序技术 基因测序技术发展历程 9 基因测序行业发展环境分析 技术环境:二、三代测序技术并存,但二代技术仍为主导 基因测序技术历经Sanger双脱氧终止法、边合成边测序法和单分子测序法等三代技术。一代技术在读长和准确率上具有优势,但其通量较小并且成本非常高;二代技术改进了一代技术在通量上的问题,同时大幅度降低了测序成本,但二代技术在读长上较短;三代技术在读长上优于二代技术,但在准确率上较二代技术差,目前还不成熟。现阶段,二代技术同三代技术并存,由于三代技术在准确率上不高,技术有待进一步完善,因而使用范围还比较小;
15、二代技术凭借高通量和较高的准确率拥有较高的使用率,是目前主流的基因测序技术。来源:根据公开资料整理而得。测序 技术 典型测序平台 测序原理 读长 通量 准确率 优点 缺点 一代测序 ABI/LIFE3730 ABI/LIFE3500 Sanger双脱氧终止法,毛细管电泳法 400-900bp 0.2Mb/run 99%读长较长,准确率高 通量小,测序成本较高 二代测序 Illumina HiSeq 边合成边测序法,可逆链终止法 50-150bp(x2)750-1500Gb/run 99%通量高,单位测序成本低 读长较短,样本制备较繁琐 Life Tech SOLiD 连接测序法 50bp 30
16、-50Gb/run 99%Roche 454 焦磷酸测序法 200-600bp 0.45Gb/run 99%三代测序 PacBio RS DNA单分子测序,纳米孔测序 1000-10000bp 0.5-9Gb/run 90%读长较长,样本制备较简单 准确率较低 Oxford Nanopore MinIon 纳米孔测序 平均读长5400bp 30-400bp/秒 90%一、二、三代基因测序技术各项参数对比 10 基因测序行业发展环境分析 技术环境:技术进步带动基因测序成本大幅下降 来源:National Human Genome Research Insititute。艾瑞整理公开数据显示,基因
17、测序成本呈现大幅度下降趋势,2001年平均每兆数据量基因测序成本是5292.4美元,单人类基因组测序成本是9526.3万美元,至2006年新一代测序技术推出,平均每兆数据量基因测序成本下降至581.9美元,单人类基因组测序成本下降至1047.5万美元,此后基因测序成本以超“摩尔定律”的速度不断下降,从单个人类基因组1000万美元下降到 2013年的5000美元;2014年1月Illumina推出HiSeq X Ten 更是将单人类基因组测序成本降至 1000 美元以下。艾瑞分析认为,伴随基因测序技术的更新换代,基因测序的成本不断下降的趋势仍将继续。基因测序成本的进一步下降,将为基因测序技术的广
18、泛使用提供良好的经济基础,也将推动医疗行业的大变革。$3.00$4.00$5.00$6.00$7.00$8.002001-9 2003-10 2005-11 2007-12 2010-12012-22014-32001-2016年基因组测序成本 基因组测序成本(Cost per Genome)$100M$10M$1M$100K$10K$1K -2.00-1.000.001.002.003.004.002001-92004-22006-72008-122011-52013-102001-2016年平均每兆数据量基因测序成本 每兆数据量测序成本(Cost per Mb)$10K$1K$100$10
19、$1$0.1$0.01 11 基因测序行业产业链图谱 国外基因测序产业链图谱 注释:1)产业链图谱中logo位置不分先后,不涉及排名;2)Thermo Fisher Scientific 于2014年2月完成对Life Technologics的收购;3)Epicentre是Illumina的子公司,但其独立运营;4)Roche于2014年12月收购Bina Technologies;5)Hologic于2008年7月收购Third Wave Technologies。测序设备研发制造 基因测序服务 数据服务 上游(设备端)中游(服务端)耗材及试剂生产 科研机构 医院 个人 下游(应用端)生物
20、学基础研究 农学基础研究 医学基础研究 疾病易感基因筛查 肿瘤诊断及治疗 药物代谢检测 医学基础研究 无创产前检查 肿瘤诊断及治疗 药企 药物基础研究 辅助生育检测 遗传病检测 家系检测 药物临床测试 12 基因测序行业产业链图谱 中国基因测序产业链图谱 注释:产业链图谱中logo位置不分先后,不涉及排名。测序设备研发制造 基因测序服务 上游(设备端)中游(服务端)耗材及试剂生产 国产设备 进口设备 进口耗材及试剂 国产耗材及试剂 数据服务 数据服务 国内企业 国外企业 科研机构 医院 个人 下游(应用端)生物学基础研究 农学基础研究 医学基础研究 疾病易感基因筛查 肿瘤诊断及治疗 药物代谢检
21、测 医学基础研究 无创产前检查 肿瘤诊断及治疗 药企 药物基础研究 辅助生育检测 遗传病检测 家系检测 药物临床测试 13 基因测序行业产业链解析 上游:测序设备由国外垄断,国产设备多方式突围 数据来源:Next Generation Genomics:World Map of High-throughput Sequencers,http:/。艾瑞整理公开数据显示,目前共有7389台基因测序设备,分布在60多个国家中,其中Illumina公司的HiSeq 2000、GA 2x、MiSeq和NextSeq等测序平台占比为83.9%;Thermo Fisher公司的SOLiD、Ion Torre
22、nt和Ion Proton等测序平台占比为9.9%;Roche公司的454平台占比为5.3%。Illumina和Thermo Fisher设备占比超过90%,上游基因测序设备制造已形成垄断。尽管基因测序设备目前仍由国外垄断,但国内企业已经通过各种方式研发和生产基因测序设备。基因测序设备国产化主要有三种方式:1)自主研发方式,如紫鑫药业同中科院合作开发的二代测序设备BIGIS系列产品,华因康开发的基因测序仪HYK-PSTAR-IIA;2)收购国外企业的方式,如华大基因于2013年收购美国Complete Genomics公司,获取CG公司基因测序设备知识产权;3)合作开发的方式,如贝瑞和康和Il
23、lumina合作开发的基因测序仪NextSeq CN500。Illumina 83.9%Thermo Fisher 9.9%Roche 5.2%Pacific Biosciences 0.7%Oxford Nanopore 0.2%其他 0.1%2016年全球主要基因测序设备公司设备销售占比 国产设备突围之路 自主研发 收购国外企业 合作开发 紫鑫药业同中国科学院合作开发第二代高通量测序仪BIGIS系列产品 华康因发布了一款自主研发、获CFDA注册的基因测序仪HYK-PSTAR-IIA Illumina和贝瑞和康双方已经合作开发了适用于中国临床的基因测序仪NextSeq CN500,这款测序仪
24、在中国的贝瑞和康自有医疗设备制造工厂生产,并且只在中国市场进行销售 华大基因(BGI)于2013年收购了美国Complete Genomics 公司(简称“CG”),获取CG公司基因测序的领先技术和基因测序设备知识产权,并将其测序仪更名为BGISEQ 14 基因测序行业产业链解析 上游:新技术不断涌现,但技术还未成熟 来源:投资数据来自CBinsights.。公司 产品及技术介绍 融资情况 Oxford Nanopore Technologies Oxford Nanopore推出MinION测序平台,该平台采用纳米孔测序法,体积小巧,价格便宜。2009年获得1800万美元投资;2010年获得
25、2800万美元B轮投资 2011年获得4100万美元C轮投资;2012年获得5080万美元D轮投资 2013年获得6400万美元E轮投资;2014年获得5900万美元F轮投资 2015年获得1亿美元G轮投资 10X Genomics 10X Genomics2015年正式发售GemCode测序平台,该平台能够与现有的短读取测序仪互补,产生长片段信息(10-100 kb),实现结构变异和单体型等分析。2015年获得5550万美元B轮投资;2016年获得5500万美元C轮投资 Genia Corporation Genia正在研发的测序平台主要采用单分子测序和电子传感器捕获信号的方法。2013年获
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