FlowJo软件的简单介绍和基本应用.doc
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1、FlowJo软件的简单介绍和基本应用FlowJo是九十年代美国斯坦福大学Leonard Herzenberg(FACS机器的发明者)实验室研发的一款流式数据分析软件。这款分析软件功能强大,操作简单,易学易用,可在Windows或者Mac系统下安装使用。它简单直观的操作平台,已被领域内的科学家、实验室广泛使用。同时,他也是各期刊杂志引用最多的流式数据分析软件。一、 FlowJo电脑配置及安装环境PC: 操作系统:Vista、Windows7内存:512MB RAM及以上MAC: 操作系统:OSX 10.3 或更高版本内存:512MB RAM及以上安装环境:避免阳光直射,水平放置,远离水源、热源二
2、、 FlowJo基本功能介绍1.阶梯式设门:将细胞群之间的逻辑关系用简单、递进的阶梯式去呈现,一改传统复杂的逻辑门设置。并可以自定义细胞群名称,进而直观的显示细胞群统计值,让分析结果一目了然。如图 2.多种图像显示方法及显示类型:显示方法:它可以呈现为一维的直方图,二维图及三维立体图。如图一维图 二维图 三维图显示类型:除了传统使用的散点图外,还有密度图,等高图,伪色图,斑马图等。如图 3.多种设门工具:设门是流式数据分析中界定细胞目标群的必要手段,不管检测的目标细胞群是规则分布还是不规则分布的,是小概率事件还是集体事件,都可以很方便的界定各种细胞群。如图 蜘蛛门 四分门 矩形门、椭圆门、自动
3、门 4.多种分析平台及工具:特殊的分析平台:细胞周期,细胞增殖,钙离子流量,反向设门等。独特的分析工具:门的批处理,样品的荧光补偿。5.灵活方便的数据导出:无论是图形数据还是表格数据都可以用Ofice软件、Powerpoint或直接打印,输出的表格数据可保存为HTML,SQL等格式。三、 FlowJo的基本应用:1.单标样本的分析方法:双击桌面Flowjo软件图标,进入软件工作台。软件工作台由菜单栏、工具栏、组空间和样本空间组成(见图1)。将要分析的数据组拖至组空间中,单击选中分析组(3 color comp),此时在样本空间里便会显示分析组里的所有样本。然后双击样本空间中的样品(Cy5PE.
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