地质环境中生物标志物 GDGTs 分析技术研究进展.pdf
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1、战楠,孙青,李琪,等.地质环境中生物标志物 GDGTs 分析技术研究进展J.岩矿测试,2024,43(1):3046.DOI:10.15898/j.ykcs.202306100077.ZHANNan,SUNQing,LIQi,etal.ResearchProgressinAnalyticalMethodsofBiomarkerGDGTsinGeologicalEnvironmentsJ.RockandMineralAnalysis,2024,43(1):3046.DOI:10.15898/j.ykcs.202306100077.地质环境中生物标志物 GDGTs 分析技术研究进展战楠1,2,孙青
2、1*,李琪3,谢曼曼1,尚文郁1,郝瑞霞2(1.国家地质实验测试中心,自然资源部生态地球化学重点实验室,北京100037;2.北京大学地球与空间科学学院,北京100871;3.中国科学院地质与地球物理研究所,北京100029)摘要:甘油二烷基甘油四醚脂(GDGTs)是一类来自于微生物细胞膜脂的新兴生物标志物,广泛存在于海洋、湖泊、土壤、泥炭等环境。在活体细胞中,GDGTs 通常以完整极性膜脂(IPL-GDGTs)的形式存在,而在地质环境中主要以脱去极性头基的核心脂(CL-GDGTs)的形式存在。CL-GDGTs 结构稳定、不易降解,并且对环境变化响应敏感,因此被认为是重建古气候-古环境变化的有
3、力工具。GDGTs 结构复杂、种类多样,在环境中的含量通常较低且常与其他化合物共存,因此分析难度较高,现有技术和方法在其分离、纯化、定量等方面仍然面临挑战。本文总结了近年来 GDGTs 在分析技术方面的研究进展,概述了 GDGTs 的分类与结构,对环境中 IPL-GDGTs 和 CL-GDGTs 的分离、纯化等方法进行总结和比较,其中 CL-GDGTs 可选择多种提取方法,而极性较强、热稳定性较差的 IPL-GDGTs 应尽量选取 Bligh-Dyer 提取法。普通的分离、纯化通常采用柱层析法,而涉及 GDGTs 单体分离时,一般采用制备液相色谱法。液相色谱-质谱、核磁共振波谱、气相色谱-同位
4、素比值质谱是 GDGTs 含量测定、结构鉴定、同位素分析的主要分析手段。本文评述了现有方法的特点和不足,并在此基础上,提出了 GDGTs 分析技术的发展方向,以期为地质环境中 GDGTs的分析研究提供启示和参考。关键词:甘油二烷基甘油四醚脂(GDGTs);提取;分离纯化;含量分析;结构鉴定;同位素分析要点:(1)GDGTs 是来自微生物细胞膜脂的一类新兴的生物标志物,是当前古气候-古环境重建研究的良好载体和有力工具,在地质环境中广泛分布。(2)GDGTs 的结构复杂、种类多样,分析难度较高,现有分析技术在其分离、纯化、准确定量等方面仍面临挑战。(3)GDGTs 的分析研究重点需要关注方法标准化
5、、分析效率、新组分识别及同位素分析等方面。中图分类号:O657文献标识码:A生物标志物,是从生物体中演化而来的一系列有机分子,其含量、分布特征及同位素组成能够反映地质历史时期的气候和环境变化1-2。甘油二烷基甘 油 四 醚 脂(Glycerol dialkyl glyceryl tetraethers,简称 GDGTs)是古菌或细菌细胞膜的骨架成分,也是二十世纪末发展起来的一类新兴的生物标志物3。GDGTs 在 自 然 界 广 泛 分 布,包 括 海 洋 4-6、湖泊7-10、河流11、热泉12-13、土壤14-17、泥炭18-22等环境。GDGTs 的组成对外界环境变化响应敏感,并且其核心脂
6、结构稳定、不易降解,能够收稿日期:20230610;修回日期:20230726;接受日期:20230805基金项目:中国地质科学院基本科研业务费项目(CSJ-2022-05)第一作者:战楠,博士研究生,助理研究员,从事环境分析化学、有机地球化学研究。E-mail:。通信作者:孙青,博士,研究员,从事有机地球化学、全球气候变化、稳定同位素研究。E-mail:。2024年1月岩矿测试Vol.43,No.1January2024ROCKANDMINERALANALYSIS304630长期保存在沉积环境中,因此被认为是古气候重建研究的良好载体和有力工具23-28。目前,GDGTs 已被应用于重建早白垩
7、纪以来的气候环境演变历史29-30。例如,Chu 等31利用湖光岩湖泊沉积物中 GDGTs 重建了末次冰消期以来中国热带地区温度变化,该结果与格陵兰冰芯记录的温度变化趋势大致相同,证实高纬度冰盖与热带陆地之间存在耦合作用;Bai 等32利用土壤中GDGTs 指标重建了青藏高原南部古海拔变化历史,为揭示印度板块与欧亚大陆板块的碰撞过程和机制提供了新线索。大量研究表明 GDGTs 在古气候重建中发挥了重要作用,而进行古气候重建的前提是准确分析 GDGTs29-32。然而,GDGTs 分子结构复杂,其同系物、异构体理化性质相似,并且环境中GDGTs 的含量较低(通常在 ng/g 水平),又常与其他有
8、机化合物共存,因此分析难度较高,现有技术在其分离、纯化、准确定量等方面仍面临挑战1,3。本文在前人研究基础上,概述了 GDGTs 的结构与分类,总结并比较了地质环境样品中 GDGTs 的提取、分离、纯化等前处理方法,评述了液相色谱-质谱、核磁共振波谱、气相色谱-同位素比值质谱等技术在含量分析、结构鉴定、同位素分析方面的研究进展,同时提出未来 GDGTs 分析技术的发展方向。1GDGTs 的结构与分类环 境 中的 GDGTs 种 类 多 样,通 常 所 说 的GDGTs 是 指 微 生 物 的 核 心 脂(Core Lipids,CL-GDGTs),其基本结构包括两个烷基长链和两个甘油分子,烷基
9、长链末端通过醚键与甘油基团结合形成闭合环状大分子33-34。在活体细胞中,CL-GDGTs两端的甘油基团上带有由磷酸盐、醣基或葡萄糖醛酸等组成的极性头基,以完整极性膜类脂(IntactPolarLipids,IPL-GDGTs)的形式存在(图 1),但随着细胞的死亡降解,IPL-GDGTs 会丢失极性头基而转化成 CL-GDGTs16,18,35。目前,研究较多的 CL-GDGTs 主要包括两大类:类 异 戊 二烯 GDGTs(Isopernoidal GDGTs,简 称isoGDGTs)和支链 GDGTs(BranchedGDGTs,简称brGDGTs)。两者的结构既有相似性,又有明显差异(
10、图 1)。相同点在于:两者均是由 2 条长链烷基和2 个甘油分子形成的四醚类环状化合物,并且烷基侧链上均含有一定数量的甲基和五元环或六元环。不同点在于:两者结构中甘油的立体构型不同,isoGDGTs 为甘油-1-磷酸(G-1-P)构型,而 brGDGTs为甘油-3-磷酸(G-3-P)构型;两者烷基侧链的骨架不同,isoGDGTs 的烷基侧链含有 40 个碳原子且为类异戊二烯结构12,而 brGDGTs 的侧链仅由 28个碳原子组成且为支链烷烃结构6(图 1)。isoGDGTs 主要包括 GDGT-0 到 GDGT-8(数字代表其结构中包含的环戊烷数量)、泉古菌醇(Crenarchaeol,简
11、称 Cren)及 其 立 体 异 构 体(Crenarchaeol regioisomer,简称 Cren)(图 1)12。isoGDGTs 的 母 源 微 生 物 是 古 菌,包 括 泉 古 菌(Crenarchaeota)、奇古菌(Thaumarchaea)、广古门菌(Euryarchaeota)等36-37。其中,泉古菌主要合成含有 04 个环戊烷的 GDGTs 和 Cren,氨氧化古菌主要合成 Cren 及 Cren,而含有 4 个环戊烷以上的isoGDGTs(GDGT-5 至 GDGT-8)仅在热泉和嗜热菌的培养液中发现38。brGDGTs 含有、和三个系列,每个系列之间相差一个 C
12、H2。目前已发现和系列烷基侧链上的甲基可以在 C5、C6、C7位置变动,分别形成5-甲基、6-甲基和 7-甲基等位置异构体8,39-41。在立体结构方面,brGDGTs 的甘油构型只有一种反平行结构42,这与 Cren 及 Cren存在平行和反平行2 种构型不同43,并且其烷基侧链上的多个手性碳原子的立体构型也是固定的44。目前,brGDGTs的生物来源还不十分明确,但其甲基支链结构和甘油立体化学特征指示它们由细菌合成8,其稳定碳、氢同位素表明其来自兼性异养细菌21,45。培养实验也证实酸杆菌可以合成 brGDGTs 个别组分(如a、c)46-47。最新研究表明,除了酸杆菌外,变形菌、消化螺旋
13、菌、拟杆菌、放线菌和疣菌也可能是brGDGTs 的潜在母源25-27,48。2地质环境样品中GDGTs 的提取方法与纯化技术2.1GDGTs 的提取方法地质环境样品中 GDGTs 的提取方法主要包括Bligh-Dyer 法(简称 BD 法)12,35,49-50、超声萃取法14,32,51-52、索氏抽提法53-56、加速溶剂萃取法(ASE)31,57-59和微波辅助提取法(MAE)21,59-60等(表 1)。BD 法最早被应用于提取真核生物和细菌中的细胞膜脂,以氯仿-甲醇(21,V/V)为提取液,后经不断改良,如增加萃取液中甲醇的比例,加入少量的酸(如盐酸、三氯乙酸、磷酸盐缓冲液),使其对
14、脂类物第1期战楠,等:地质环境中生物标志物 GDGTs 分析技术研究进展第43卷31OOOOOHHOHOHOHOHOHOHOHOHOHOIam/z 1022Ibm/z 1020Icm/z 1018OOOOOHOOOOOHIIam/z 1036IIbm/z 1034IIcm/z 1032OOOOOHOOOOOHOOOOOH5IIa6m/z 1036IIb6m/z 1034IIc6m/z 1032OOOOOHOOOOOHOOOOOH666IIIam/z 1050IIIbm/z 1048IIIcm/z 1046OOOOOHHOOOOOOHHOOOOOOHHO555OOOOOHHO5555IIIa6m
15、/z 1050IIIb6m/z 1048IIIc6m/z 1046OOOOOHHO66OOOOOHHOOOOOOHHOOOOOOHHO66666IIa7m/z 1036OOOOOH756IIIa7m/z 1050OOOOOHHO77OOOOOHHO77支链 GDGTs类异戊二烯 GDGTsOOHOGDGT-0m/z 1302GDGT-1m/z 1300GDGT-2m/z 1298GDGT-3m/z 1296OOOOOHHOOHOOOOOHOHOOOOOHOHOOOOHOGDGT-4m/z 1294OHOOOOHOGDGT-5m/z 1292OHOOOOHOOOHOGDGT-6m/z 1290G
16、DGT-7m/z 1288GDGT-8m/z 1286OHOOOOHOOHOOOOHOOHOOOOHOOOHOOOOH55完整极性膜类脂 GDGTs单葡萄糖头基 IPL-GDGTMonoglycosylGDGTOHOHOOHGDGTHO磷酸葡萄糖头基 IPL-GDGTPhosphohexoseGDGTOHOHOOHO PHOGDGTO糖醛酸头基 IPL-GDGTGlycuronicacidGDGTOHOHOOHGDGTHOO磷酸甘油头基 IPL-GDGTPhosphatidylglycerolGDGTHOOPGDGTOHOOH双葡萄糖头基 IPL-GDGTDiglycosylGDGTOHOHO
17、OHOHOOOHHOGDGTHO胆碱磷酸头基 IPL-GDGTPhosphocholineGDGTNOPGDGTOOHOHCrenm/z 1292Crenm/z 1292图1环境中常见的支链 GDGTs、类异戊二烯 GDGTs 和完整极性膜类脂 GDGTs 的分子结构图Fig.1MolecularstructuresofbrGDGTs,isoGDGTsandIPL-GDGTsintheenvironment.第1期岩矿测试http:/2024年32质的提取率可达 90%以上3,59,61。超声波萃取法通常采用甲醇、甲醇-二氯甲烷(11,V/V)、二氯甲烷等为提取液,超声萃取 23 次以保证提取
18、效率52,59。索氏抽提法通常采用二氯甲烷-甲醇混合溶剂为萃取液,加热回流提取 2472h,其萃取效率较高,但溶剂消耗量大且耗时、费力53-56。ASE 法是目前 CL-GDGTs 的主流提取方法,通常以二氯甲烷-甲醇为提取溶剂,在温度 100120、压力12001500psi 条件下,静态萃取 510min,循环萃取 23 次57-59。2020 年 Auderset 等62提出一种 ASE 分步提取法,通过不同极性溶剂萃取,从土壤和沉积物中依次分离出正构烷烃、长链烯酮及GDGTs 三种组分。MAE 法是一种利用微波加热技术对固体样品提取的方法,通常以二氯甲烷-甲醇为提取溶剂,在一定温度、压
19、力和微波辐射下,萃取1020min,该法操作简单、快速高效、节省溶剂、选择性好,但由于微波反应器的普及程度不高,所以目前应用还较少28,59-60。不 同 方 法对 GDGTs 的 提 取 效 率 不 尽 相同50-51,63-64。Schouten 等51比较了超声萃取、索氏抽提和 ASE 萃取三种方法对 isoGDGTs 的提取效率,发现三种方法得到的古气候指标(TEX86)值在1 误差范围内基本一致。Huguet 等59比较了BD 法、超声法、索氏抽提法、ASE、MAE 等多种提取方法,认为索氏提取法对于 IPL-GDGTs 的提取效果最佳,优于常用的 BD 法。随后,Lengger 等
20、63比较了BD 法、索氏抽提法和ASE 法,发现三种提取方法对CL-GDGTs 的提取效率基本一致且良好,但对IPL-GDGTs 的提取效率则呈现:ASE 法索氏抽提法BD 法,其原因可能是较高的温度(ASE 法100,索氏抽提法 65)导致部分 IPL-GDGTs 降解,而常温下进行的 BD 法更好地保护了 IPL-GDGTs 的极性头基。王欢业等50对比了 BD 法和超声萃取法的提取效率,指出 BD 法对于 IPL-GDGTs 的提取效果更好,而超声萃取法对于 CL-GDGTs 的提取效率更高,但两种方法得到的古气候指标(TEX86、MBT、CBT)数值一致,说明不同提取方法并不影响古气候
21、指标的计算。之后,Yang 等64也证实对于含有极性头基的 OH-GDGTs,使用 BD 法比超声萃取法的提取效率更高。综上可知,CL-GDGTs 的提取可以选择多种方法,而对于极性较强、热稳定性较差的IPL-GDGTs,应尽量选取 BD 法。2.2GDGTs 的分离与纯化方法在得到总脂类提取物后,需要从中进一步分离、纯化 GDGTs,这个过程通常采用柱层析法51,59-61,少数情况下采用制备液相色谱法40,65-66。前者适合常规的含量分析,后者或两者联用适合 GDGTs 的结构鉴定和同位素分析。柱层析法通常采用硅胶、氧化铝(Al2O3)等吸附剂作为固定相填料51,59-61。Al2O3作
22、为固定相时,通常以正己烷-二氯甲烷、甲醇-二氯甲烷为淋洗液31,51,57。硅胶作为固定相时,通常以正己烷-乙酸乙酯、二氯甲烷-乙酸乙酯等为洗脱液58,66。收集到的洗脱液通常包括非极性和极性两部分,其中 GDGTs 存在于极性组分,将其用氮表1地质环境样品中 GDGTs 的不同提取、分离、纯化方法Table1Differentextraction,separationandpurificationmethodsofGDGTsingeologicalenvironmentsamples.样品类型提取方法及提取剂分离及净化方法参考文献土壤BD 法,甲醇-二氯甲烷-磷酸缓冲液硅胶柱,正己烷/乙酸乙
23、酯、乙酸乙酯、甲醇Pitcher 等(2009)土壤超声萃取法,甲醇、甲醇-二氯甲烷硅胶柱,正己烷/二氯甲烷、二氯甲烷/甲醇Bai 等(2017)土壤、湖泊沉积物BD 法,甲醇-二氯甲烷-磷酸缓冲液硅胶柱,正己烷/乙酸乙酯、甲醇Buckles 等(2014)土壤、湖泊沉积物索氏抽提法,甲醇-二氯甲烷Al2O3柱,正己烷/二氯甲烷、二氯甲烷/甲醇Hu 等(2016)黄土ASE,二氯甲烷-甲醇硅胶柱,二氯甲烷/乙酸乙酯Lu 等(2016)泥炭超声萃取法,二氯甲烷、二氯甲烷/甲醇硅胶柱,正己烷/甲醇Zheng 等(2018)泥炭MAE,二氯甲烷-甲醇硅胶柱,二氯甲烷/甲醇Naafs 等(2017)海
24、洋沉积物索氏抽提法,甲醇-二氯甲烷Al2O3柱,正己烷/二氯甲烷、二氯甲烷/甲醇Liao 等(2020)海洋沉积物BD 法,甲醇-二氯甲烷-磷酸缓冲液硅胶柱,正己烷/乙酸乙酯制备 HPLC,正己烷/异丙醇Zhu 等(2013)湖泊沉积物ASE 法,二氯甲烷-甲醇Al2O3柱,二氯甲烷、二氯甲烷/甲醇Chu 等(2017)湖泊沉积物ASE 法,二氯甲烷-甲醇Al2O3柱,正己烷/二氯甲烷、二氯甲烷/甲醇Li 等(2023)湖泊沉积物ASE 法,二氯甲烷-甲醇Al2O3柱,二氯甲烷、二氯甲烷/甲醇制备 HPLC,正己烷/异丙醇Weber 等(2015海洋、湖泊沉积物MAE 法,二氯甲烷-甲醇Al2
25、O3柱,正己烷/二氯甲烷、二氯甲烷/甲醇Escala 等(2009)湖泊水体悬浮颗粒物BD 法,甲醇-二氯甲烷-磷酸缓冲液Al2O3柱,正己烷/二氯甲烷、二氯甲烷/甲醇Kumar 等(2019)第1期战楠,等:地质环境中生物标志物 GDGTs 分析技术研究进展第43卷33气吹干,溶解于合适的溶剂,过滤后即可上机分析3,40。柱层析色谱法的操作性强、分离效果好,但操作繁琐、溶剂消耗量大、容易产生误差。Sanchi等67提出一种采用固相萃取装置进行自动分离、净化的方法,使操作更简单、误差更小、重现性更高。对于 IPL-GDGTs,其含有的某些极性头基在硅胶柱净化、无水硫酸钠干燥、受热等过程中极易脱
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