神经胶质瘤U251细胞中TRIM21和TRIM8之间相互作用研究.pdf
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1、医学分子生物学杂志,2024,21(3):187-195 J Med Mol Biol,2024,21(3):187-195DOI:10.3870/j.issn.1672-8009.2024.03.001论 著:并列第一作者资助项目:国家自然科学基金(No.3120566,No.31370794)通讯作者:高波(电话:010-66931301,E-mail:),邵宁生(电话:010-66932311,E-mail:)These authors contributed equally to this work:WANG Lin,LIU XuemeiThis work was supported
2、by grants from the National Natural Science Foundation of China(No.3120566,No.31370794)Corresponding author:GAO Bo(Tel:86-10-66931301,E-mail:gb5029 ),SHAO Ningsheng(Tel:86-10-66932311,E-mail:sha-oningsheng )神经胶质瘤 U251 细胞中 TRIM21 和 TRIM8 之间相互作用研究王琳,刘雪梅,李慧,黄皑雪,赵越超,肖参,高波,邵宁生军事科学院军事医学研究院军事认知与脑科学研究所 北京市,
3、100850【摘要】目的 探讨 TRIM21 和 TRIM8 在神经胶质瘤 U251 细胞中的相互作用机制及其生物学效应。方法 在 U251 细胞中分别过表达和敲低 TRIM21 或 TRIM8,通过蛋白质印迹和 RT-PCR 法检测两者的蛋白和mRNA 表达水平。利用免疫荧光实验分析 TRIM21 和 TRIM8 的亚细胞定位。通过免疫共沉淀实验验证TRIM21 和 TRIM8 之间的相互作用。应用胞内泛素化实验检测 TRIM21 和 TRIM8 的泛素化修饰。蛋白酶体抑制剂 MG-132 用于抑制蛋白酶体活性。利用流式细胞术检测 U251 细胞凋亡。结果在 U251 细胞中,TRIM21
4、负向调控 TRIM8 蛋白水平,反之,TRIM8 也可以负向调控 TRIM21 蛋白水平,并且都能抑制细胞凋亡。机制研究显示,U251 细胞中 TRIM21 和 TRIM8 之间存在相互结合,两者相互调控是通过催化泛素化介导的泛素-蛋白酶体依赖性降解途径实现的。结论 U251 细胞中 TRIM21 与 TRIM8 可以通过泛素化修饰促进泛素-蛋白酶体依赖性的蛋白质降解相互负向调控,提示体内细胞正常生长分化需要 TRIM21-TRIM8 之间蛋白质水平的相对稳态,也即可能存在 E3 泛素连接酶蛋白稳态,稳态失衡可能与肿瘤的发生发展密切相关。【关键词】TRIM21;TRIM8;相互调控;泛素化;E
5、3 稳态;胶质瘤【中图分类号】Q51,R753Study of Mutual Regulation between TRIM21 and TRIM8 in GliomaU251 CellsWANG Lin,LIU Xuemei,LI Hui,HUANG Aixue,ZHAO Yuechao,XIAO Can,GAO Bo,SHAO NingshengInstitute of Military Cognition and Brain Sciences,Academy of Military Medical Sciences,Academyof Military Sciences,Beijing,
6、100850,China【Abstract】ObjectiveTo explore the mutual regulation between TRIM21 and TRIM8 in gliomaU251 cells.Methods TRIM21 and TRIM8 were overexpressed or knocked down respectively in U251cells,and their protein and mRNA expression levels were detected by Western blotting and RT-PCR re-spectively.I
7、mmunofluorescence experiment was used to analyze the subcellular localization of TRIM21and TRIM8.The interaction between TRIM21 and TRIM8 was verified by immunoprecipitation experi-ment.The ubiquitination modification of TRIM21 or TRIM8 was analyzed by intracellular ubiquitinationexperiment.Protease
8、 inhibitor MG-132 was used to inhibit protease activity.U251 cell apoptosis was de-tected by flow cytometry assay.Results TRIM21 and TRIM8 could negatively regulate each other on theprotein level in U251 cells which resulted in cell apoptosis inhibition.Mechanism study showed that therewas an intera
9、ction between TRIM21 and TRIM8 in U251 cells,that interaction furtherly activated ubiq-uitin-proteasome-dependent degradation pathway through ubiquitination.Conclusion Negatively mutualregulation between TRIM21 and TRIM8 is achieved through ubiquitination modification,following ubiq-uitin-proteasome
10、-dependent degradation.Our results suggested that it is important to maintain a balancebetween TRIM21 and TRIM8 on protein level,that is,three might exist an E3 ubiquitin ligase proteinhomeostasis.The homeostasis disorder will be highly related to the tumorigenesis.【Key words】TRIM21;TRIM8;mutual reg
11、ulation;ubiquitination;E3 homeostasis;glioma 神经胶质瘤是颅内肿瘤中最常见的原发性恶性肿瘤,生长迅速,侵袭性强,患者的预后差。神经胶质瘤的基础研究及其治疗手段的探索一直是国内外学者研究的热点和难点问题。含有 3 部分基序(tripartite motif,TRIM)蛋白家族成员的特征是具有 3 元结构域结构,包括 N 端的 1 个 RING 锌指结构域、1 个或 2 个 B-box 结构域和 1 个卷曲螺旋结构域,以及可变的 C 端结构域。RING 结构域赋予E3 泛素连接酶活性,可变 C 端区域介导底物识别1,使 TRIM 蛋白能够泛素化底物。许多
12、 TRIM家族 蛋 白 是 癌 症 发 生 发 展 的 重 要 调 节 因 子。TRIM21 和 TRIM8 在不同类型肿瘤中作用报道不一,参与调节肿瘤细胞的增殖、凋亡、侵袭和转移等过程。有研究表明,TRIM21 的表达水平在脑胶质瘤组织中上调,通过调节细胞增殖、迁移和衰老促进肿瘤进展。TRIM8 在脑胶质瘤中下调参与细胞增殖并与患者生存有关。本实验室前期研究发现TRIM21-TRIM8 在肺细胞和肾细胞中存在相互调控并且共同影响细胞的干性,与非小细胞肺癌和肾细胞癌发生密切相关6,但是 TRIM21-TRIM8 之间的调控影响肿瘤的发生是否具有普遍性尚不清楚。本文选择神经胶质瘤 U251 细胞
13、作为研究重点,进一步探讨 TRIM21-TRIM8 在神经胶质瘤细胞中的相互作用机制及其对细胞凋亡的影响,为阐明脑胶质瘤发生发展机制提供一定的理论依据。1 材料和方法1.1 细胞与细胞培养人神经胶质瘤细胞株 U251 购自武汉普诺赛生命科技有限公司,在 5%CO2,37 恒温培养箱(Thermo)中用含有 10%胎牛血清(Gibco)的MEM/EBSS 培养基(Hyclone)进行培养,待细胞密度达到 85%汇合度处于对数生长期后进行常规传代、冻存及后续实验,每 2 3 天换液。1.2 细胞转染使用 Lipofectamine 3000(Invitrogen)并按照其说明转染质粒,使用 Lip
14、ofectamine RNAiMAX(Invitrogen)并按照其说明转染 siRNA。TRIM21 和TRIM8 质粒均购自于北京义翘神州科技股份有限公司。TRIM21 表达敲低 siRNA 由苏州贝信生物技术有限公司合成,TRIM21 敲低靶序列:#1 是 5-GAGAAGTTGGAAGTGGAAATTGCAA-3;#2 是 5-GCGCTTTCTGCTCAAGAAT-3;#3 是 5-AAGTGG-AAATTGCAATAAA-3。TRIM8 表达敲低 siRNA 由广州锐博生物科技有限公司合成,TRIM8 敲低靶序列:#1 是 5-CCGCAAGATTCTCGTCTGT-3;#2是 5
15、-GTGGACAACTGTTACTGTT-3;#3 是 5-TGA-ACGAAGTGGCCAAGAA-3。1.3 蛋白质提取细胞转染 48 h 后收取总蛋白。弃去原有培养基,PBS 清洗 2 遍。加入适量含有蛋白酶抑制剂Cocktail(Selleck)的冷裂解缓冲液(pH 7.5,50mmol/L Tris-HCl,150 mmol/L NaCl,5 mmol/LEDTA-2 Na,5 mmol/L 脱氧胆酸,1%TritonX-100)在冰上裂解细胞 30 min。在 4 下以 13 000r/min 离心 15 min,将上清液转移到另一个新 EP管中。1.4 蛋白质印迹(Western
16、 blotting)使用 BCA 试剂盒(康为世纪)对细胞总蛋白浓度进行定量,加入 5 蕈上样缓冲液,98 水浴加热10 min。进行 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳分离 30 50 g/泳道的蛋白质,通过 eBlotTML1 快速湿转仪(金斯瑞)转膜,在室温下用含有 5%脱脂奶粉的0.1%TBS-T 封闭 1 h 后,条带置于相应的一抗中,于水平摇床 4 孵育过夜。次日用 0.1%TBS-T 洗涤 3 次,每次 10 min 后,将条带与相应二抗在室温下孵育 40 min,再次洗涤3 次,每次10 min。配置 ECL 显影液(Thermo)显影,化学发光成像系统(Clinx ChemiScop
17、e2850)扫描条带并储存分析。抗体信息如下:-actin(Abclonal,1 50 000),TRIM21(Proteintech,12 000),TRIM8(Proteintech,12 000),Ubiquitin(Proteintech,12 000)。1.5实时荧光定量 PCR(real time quantitative PCR,RT-PCR)使用 TRIzol 试剂(Life Technologies)提取细胞总 RNA。使用 ReverTra-Ace qPCR RT 试剂盒(TOYOBO)进行逆转录后,将得到的 cDNA 样品进行 RT-PCR。-actin 作为内参比较细胞
18、中目的基因的 表 达。TRIM21 引 物:正 向 为 5-CAGCAG-CACGCTTGACAATGATG-3,反 向 为 5-GATGCT-CACAGGCTCCACGAAG-3;TRIM8 引物:正向为5-CGTGGAGATCCGAAGGAATGA-3,反 向 为 5-CAGGCGCTTGTCTGACTCG-3;-actin 引物:正向为 5-CATGTACGTTGCTATCCAGGC-3,反向为 5-CTCCTTAATGTCACGCACGAT-3。881王琳,等.神经胶质瘤 U251 细胞中 TRIM21 和 TRIM8 之间相互作用研究1.6 免疫共沉淀用适量含有蛋白酶抑制剂 Cock
19、tail 的冷裂解缓冲液(pH 7.5,50 mmol/L Tris-HCl,150 mmol/LNaCl,1%TritonX-100)在冰上裂解细胞 30 min。在 4 下以 13 000 r/min 离心 15 min 后,取 1/10上清留作 input,其余与 TRIM21 或 TRIM8 抗体以及对应种属的对照 IgG 抗体混合,4 旋转孵育3 h后,加入适量 Protein A/G 磁珠(Bimake),4 旋转孵育过夜。次日用冷裂解缓冲液洗涤磁珠 4 次,每次 10 min。弃去洗涤液,加入 2 蕈上样缓冲液,98 水浴加热 10 min。取上清进行免疫印迹检测目的蛋白质。抗体
20、信息如下:TRIM21(Proteintech,1200),TRIM8(Proteintech,1 200)和兔 IgG(Proteintech,1200)。1.7 免疫荧光为了检测 TRIM21 和 TRIM8 的亚细胞定位,将生长在爬片上的细胞在-20 下用甲醇固定 30min 后,在室温下用含有1%BSA 的0.1%TBS-T封闭 1 h。将细胞爬片与 TRIM21 和 TRIM8 抗体在4 下共同孵育过夜。次日用 0.1%TBS-T 洗涤 3次,每次10 min 后,将爬片与 Alexa Fluor 488 标记和 Alexa Fluor 594 标记的二抗在室温下共同孵育1 h,再次
21、洗涤 3 次,每次 10 min。用 DAPI(So-larbio)对细胞核进行染色,0.1%TBS-T 洗涤后,封片。用蔡司 LSM880 激光共聚焦显微镜拍摄免疫荧光图像并储存分析。抗 体 信 息 如 下:TRIM21(Proteintech,1200),TRIM8(Proteintech,1200),Alexa Fluor488 标记二抗(ZSGB-Bio,1 200)和 Alexa Fluor594 标记二抗(ZSGB-Bio,1200)。1.8 胞内泛素化分析用适量含有蛋白酶抑制剂 Cocktail 的冷裂解缓冲液(pH 7.5,50 mmol/L Tris-HCl,150 mmol
22、/LNaCl,5 mmol/L EDTA-2Na,5 mmol/L 脱氧胆酸钠,1%TritonX-100,0.2%SDS)在冰上裂解细胞 30 min。在 4 下以 13 000 r/min 离心 15 min后,取 1/10 上清留作 input,其余与对照 IgG 抗体混合,4 旋转结合1 h 后加入适量 Protein A/G 磁珠,4 旋转结合 2 h。弃去磁珠,上清液与TRIM21 或 TRIM8 抗体混合,4 旋转孵育 3 h 后,加入适量 Protein A/G 磁珠,4 旋转孵育过夜。次日用冷清洗液(pH 7.5,50 mmol/L Tris-HCl,150 mmol/L N
23、aCl,1%TritonX-100)洗涤磁珠 4次,每次 10 min。弃去洗涤液,加入 2 蕈上样缓冲液,98 水浴加热 10 min。取上清进行免疫印迹检测目的蛋白质。1.9 流式细胞仪检测细胞凋亡U251 细胞转染质粒或 siRNAs 24 h 后,按照细胞凋亡检测试剂盒(DOJINDO)说明书进行流式细胞术实验。用凋亡标记物 Annexin V/PI 对单细胞悬液进行染色,并通过流式细胞仪(ACEA Bio-sciences)进行分析。Annexin V 单阳性细胞为早期凋亡细胞。PI/Annexin V 双阳性细胞为晚期凋亡细胞。凋亡细胞包括两种类型的染色细胞。1.10 统计学分析所
24、有实验均重复 3 次以上,使用 GraphPad 8软件进行统计分析。两组比较采用独立样本非配对t 检验。多组间比较采用 One-way ANOVA 或 Two-way ANOVA 分析。数据采用平均数 标准差表示。P0.05 认为差异具有统计学意义。使用 Image J分析免疫印迹的条带图像。2 结 果2.1 U251 细胞中 TRIM21 在蛋白水平上负调节 TRIM8 表达在 U251 细胞中过表达 TRIM21(pL-TRIM21)后,通过蛋白质印迹检测 TRIM8 的蛋白水平,结果显示,过表达 TRIM21 显著降低了内源性 TRIM8蛋白水平(图 1A、B)。随后,转染 TRIM2
25、1-siR-NAs(siTRIM21s)进 U251 细胞,蛋白质印迹检测结果显示,3 条 siTRIM21s 敲低 TRIM21 表达后内源性 TRIM8 蛋白水平都显著提高(图 1C、D),选取 siTRIM21#1 进行后续实验。我们还通过 RT-PCR实验检测发现,过表达或敲低 TRIM21 都没有改变TRIM8 的 mRNA 水平(图 1E、F)。以上结果表明,TRIM21 只在蛋白水平上负向调控 TRIM8。2.2 U251 细胞中 TRIM8 在蛋白质水平上负调节 TRIM21表达 为了探究 TRIM8 的变化对 TRIM21 的表达是否有影响,我们将 TRIM8 的质粒(pL-
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