基于网络药理学与分子对接探讨“萆薢-菟丝子” 药对治疗慢性前列腺炎的分子机制.pdf
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1、云南民族大学学报(自然科学版),():收稿日期:基金项目:江苏省常州市卫生系统拔尖人才项目()作者简介:蒋秋子(),女,硕士研究生 主要从事中医药治疗男科疾病相关研究通信作者:卞廷松(),男,博士,主任中医师,硕士生导师 主要从事中医男科疾病的相关研究基于网络药理学与分子对接探讨“萆 菟丝子”药对治疗慢性前列腺炎的分子机制蒋秋子,葛友涛,韩晨亮,王泽,胡见鑫,卞廷松(南京中医药大学 研究生院,江苏 南京 ;南京中医药大学附属常州市中医医院 男科,江苏 常州 )摘要:应用网络药理学与分子对接揭示“萆 菟丝子”药对治疗慢性前列腺炎的分子机制,为其临床应用提供新的理论依据及研究思路 从中药系统药理学
2、数据库与分析平台()获得“萆 菟丝子”药对主要活性成分,利用 数据库以及 平台数据库获取主要活性成分的药物靶点,由 数据库、人类孟德尔遗传数据库()、数据库中获得慢性前列腺炎疾病相关靶点,与先前获得的药物靶点进行交集,获得共有靶点利用 在线数据库对共有靶点进行基因本体(,)和京都基因与基因组百科全书()富集分析;应用 在线数据库构建共有靶点蛋白互作网络()分析;最后通过 对靶点蛋白与关键化合物进行分子对接评价 共筛选出 个“萆 菟丝子”主要活性成分,包括 薯蓣皂素、芝麻素、柱头甾醇、异鼠李素、谷甾醇等;药物靶点 个,与疾病靶点取交集得到 个共有靶点,其中核心靶点有 、等 主要富集共 个条目,主
3、要为癌症通路、信号通路、信号通路、化学致癌 受体激活、细胞分化等 分子对接结果显示 与 槲皮素、及 与 谷甾醇、与 柱头甾醇结合度最高 由此可知,“萆 菟丝子”药对能够多成分、多靶点、多通路协同调控治疗慢性前列腺炎,且可能具有抑制前列腺炎向前列腺癌进展的潜在作用,为临床进一步研究提供了新的思路关键词:“萆 菟丝子”;慢性前列腺炎;中医药;网络药理学;分子对接中图分类号:文献标志码:文章编号:()慢性前列腺炎(,)是泌尿男科常见疾病,症状主要包括盆腔疼痛症状、下尿路症状、精神心理症状以及性功能障碍症状 本病病程迁延且易反复发作,严重影响患者身心健康,已被美国国立卫生研究院列为影响患者生活质量最严
4、重的慢性疾病之一 由于前列腺自身独特组织结构、炎性刺激及耐药性等问题 ,西药治疗方法效果有限 ,一些物理疗法如磁疗、热疗等也存在较多不足 中医药具有多靶点特点,对于慢性前列腺炎的治疗具有一定优势 相关文献表明,中药治疗慢性前列腺炎的有效率高达 以上,最高能够达到 徐教授认为本病基本病机为本虚标实,肾虚为本,湿热为标,并根据临床最多见的肾虚湿热证型拟制了“萆 菟丝子”核心药对 萆为化湿要药,前列腺疾患常湿浊黏腻不清,非萆不解 然慢性前列腺炎病程迁延,利湿有伤阴之忧,扶正有恋邪之弊,故加菟丝子以相须为用,补肾泄浊,消补兼施,临床疗效显著 但其作用机制目前尚未完全清楚 本研究拟应用网络药理学与分子对
5、接揭示“萆 菟丝子”药对治疗慢性前列腺炎的潜在分子机制,以期为其临床应用提供新的理论依据和研究方向 材料和方法 “萆 菟丝子”活性成分筛选应用中药系统药理学数据库与分析平台(,:),以“萆”、“菟丝子”为检索词查找药物化学成分,并以口服生物利用度(,)且类药性(,)的标准进行筛选,得到萆和菟丝子的主要活性成分 “萆 菟丝子”活性成分靶点预测通过 数据库(:)得到药物活性成分的 ,将其代入 平台(:)进行药物靶点的预测 获取慢性前列腺炎相关靶点利用 数 据 库(:)、人 类 孟 德 尔 遗 传 数 据 库(,:)、数据库(:),以“”为检索词,获取慢性前列腺炎相关靶点 在 数据库获得相关靶点后以
6、 为筛选条件进一步筛选靶点 将 个数据库所获得靶点取并集得到总靶点 利用在线工具 (:)取“萆 菟丝子”活性成分靶点与慢性前列腺炎靶点的交集,获得共同靶点,然后使用 软件进行“中药 活性成分 靶点 疾病”网络构建并进行拓扑分析筛选出“萆 菟丝子”药对作用于慢性前列腺炎的关键化合物 共同靶点的 、分析利用 在线数据库(:)对共有靶点进行基因本体(,)和京都基因与基因组百科全书()富集分析,以 为有统计学意义 分析主要包括生物学过程(,)、细胞组分(,)、分子功能(,)共同靶点蛋白蛋白互作()分析应用 在线数据库(:)进行共有靶点蛋白互作网络()分析,以最小相互作用分值 分作为阈值 通过 语言软件
7、筛选出 中关键靶蛋白 分子对接通过 数据库(:)获得 中度值靠前的关键靶点蛋白的结构,再由 平台下载“萆 菟丝子”药对关键化合物的结构,采用 对靶点蛋白与关键化合物进行分子对接,根据得到的 值评价靶点蛋白与关键化合物的结合情况 结果 “萆 菟丝子”主要活性成分筛选萆分为粉萆与绵萆 种 利用 数据库共获得萆 个活性成分、菟丝子 个活性成分,以 ,为筛选条件,筛选后共获得 个有效活性成分,其中萆 个、菟丝子 个,其成分为 、薯蓣皂素、芝麻素、柱头甾醇、异鼠李素、谷甾醇等(见表 )表 “萆 菟丝子”主要活性成分药名 主要活性成分标记 萆 薯蓣皂素 菟丝子 芝麻素 柱头甾醇 异鼠李素 谷甾醇 云南民族
8、大学学报(自然科学版)第 卷续表 药名 主要活性成分标记 菟丝子 山柰酚 菜油甾 烯 醇 异黄酮 苦参碱 槐醇 胆固醇 槲皮素 “萆 菟丝子”活性成分作用于慢性前列腺炎的靶点筛选将 个有效成分使用通过 数据库得到药物活性成分的 ,将其代入 平台进行药物靶点预测,一共获得 个主要靶点,其中萆 个,菟丝子 个,去除重复后筛选到 个主要靶点 由 、个数据库分别获得 个、个、个慢性前列腺炎相关靶点,去除重复后共 个 应用 在线软件取二者交集,共获得 个共有靶点(见图)应用 软件制作“中药 活性成分 靶点 疾病”网络图(见图)并进行拓扑分析得出度值前 的化合物为:异鼠李素(度值 )、槲皮素(度值 )、山
9、柰酚(度值 )、薯蓣皂素(度值 )、柱头甾醇(度值 )、谷甾醇(度值 ),这些可能是在慢性前列腺炎的治疗中发挥重要作用的关键化合物图 “萆 菟丝子”主要活性成分靶点与 相关靶点交集图图 “中药 活性成分 靶点 疾病”网络图第 期蒋秋子,葛友涛,韩晨亮,等:基于网络药理学与分子对接探讨“萆 菟丝子”药对治疗慢性前列腺炎的分子机制 共有靶点的 分析、富集分析将“萆 菟丝子”药对治疗慢性前列腺炎的 个共有靶点导入 在线数据库,进行 、富集分析,以 为有统计学意义 富集分析显示生物学过程()共富集到 个条目,主要为对肽基酪氨酸磷酸化、蛋白质自磷酸化、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号通路的调控、对异源刺激的反
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