阿尔茨海默症的分级集成分类方法_王如月.pdf
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1、2023.7电脑编程技巧与维护1概述为了更好地了解AD,相关的研究日益增多1,相关组织明确提出加大对AD的关注度。随着神经影像技术的飞速发展,关于AD分类取得了一定的成果2。原始高维医学图像本身带有无用特征的比重较大,严重影响计算机的计算速度,因此直接采用原始数据进行分类的方法计算成本高,不可取。需要进一步降低特征冗余度,或引入多源信息,使其符合当前研究的特征提取与选择的准则。2相关研究近年来的研究利用了该疾病的不同方面,即多种数据形式或多种可用于此任务的特征类型。这些特征通常是互补的,因为它们来自代表相同主题的不同测量。机器学习算法的表现一般取决于数据表示(或特征),因此特征提取成为分类框架
2、中的关键步骤3。在使用多模态数据时,数据不完整的问题仍然是一个难点,且在不同的数据库中不同类型数据的可用度不同。这些研究使用高度可变的训练和测试数据集,混淆了方法之间分类的客观比较4。预处理后的可用特征数量非常大,且许多特征可能与AD引起的病理改变无关。因此,在一定程度上特征提取方法的选择限制了多类分类的通用性及其性能。3分级集成分类核磁共振成像(MRI)能清晰地显示颅内的各种组织,因此选取MRI的数据进行研究。在传统的研究中,需要从MRI图像的感兴趣区域(ROI)中手工提取AD特征,这种方法效果显著,但有很大的局限性。此外,现有的特征提取和分类的方法对AD、正常大脑和轻度认知障碍的分类精度还
3、不够高。因此对自动诊断进行研究,提出一种基于多个切片的预测结果来提升病人分类的准确率的多层次集成框架,如图1所示。基金项目:2021年度广西高校中青年教师科研基础能力提升项目(2021KY0797);2020年度广西高校中青年教师科研基础能力提升项目(2020KY21023);2022年 度 广 西 高 校 中 青 年 教 师 科 研 基 础 能 力 提 升 项 目(2022KY0789)。作者简介:王如月(1993),女,硕士,研究方向为图像处理;曾利,通信作者,硕士;王也,硕士。阿尔茨海默症的分级集成分类方法王如月,曾利*,王也(桂林航天工业学院计算机科学与工程学院,广西 桂林541004
4、)摘要:提出了一种基于多个切片的预测结果来提升病人分类准确率的分级集成框架,对象是阿尔茨海默症(AD)。首先对公开数据集中选取的 AD、轻度认知障碍(MCI)和健康(NC)3 类样本进行数据预处理,得到每类样本的单个个体相对应的数量的切片;其次用 3 种不同的方法对所有切片进行特征提取,得到不同维度及不同结构的图像特征;再次用两种不同的分类方法对切片进行分类,得到单个切片类别的预测标签;最后根据切片的预测结果,预测相对应的病人类别。关键词:阿尔茨海默症;分类;分级集成图1在此提出的分级集成分类框架预先训练好的DNN M特征矩阵M分类器M粗分类结果M细分类结果N输入层预处理后的MRI特征提取层预
5、先训练好的DNN 1特征矩阵1分类器1预先训练好DNN 2特征矩阵2分类器2集成分类层粗分类结果2粗分类结果1将所有粗分类结果进行集成分类细分类结果1细分类结果2将所有细分类结果进行集成分类输出层得到病人的最终分类结果54DOI:10.16184/prg.2023.07.0172023.7电脑编程技巧与维护3.1提出问题在此形式化地讲解了该框架的问题具体如下:输入层,图像输入到集成框架内;特征提取层,将k类病人的一系列图片X=Xi|i=1,.,N处理之后,这里的N为一类病人的切片数量,分别将切片送入l种不同的特征提取器中,得到相应的特征矩阵,即Y=Yi|i=1,.,N,这里的YiRd是第i张切
6、片的d维特征向量;集成分类层,有m种分类器,根据前层操作,这里可以得到M种分类结果。函数M如公式(1)所示:M=klm(1)最终分类层,将上层的分类结果再次进行分类,得到最终的结果。假设n为样本数量;k为类别数量。多类分类的问题实现如公式(2)公式(4)所示:(2)(3)(4)可以得到决策函数f(x),结果判为第i类,如公式(5)所示:(5)结果输出层,根据上述各层进行操作之后,可得到最终的输出结果。3.2特征和分类方法对原始图像的维度进行统一调整。把经过统一调整后的数据送入统计参数映射包(SPM12),完成预处理操作。选择3种特征提取的方法,(HOG算法、VGG-19网络和ALEXNET网络
7、),以及支持向量机(SVM)和极限学习机(ELM)两种分类方法。考虑到计算成本,提出采用预先训练好的DNNs对MRI切片图像集进行特征提取。例如,利用VGG-19网络训练的ImageNet3进行特征提取。在此对VGG-19网络的分类层进行简单的移除,以达到特征提取的目的。这样每个切片都可以用一个D维特征向量xRD来表示。此外,由于并没有针对MRI图像对预先训练好的DNNs网络进行优化,因此将利用来自M种不同DNNs网络的输出作为一个特征集合,并利用该分类框架将它们结合起来。4实验在此使用的实验数据均从公开数据集中获取,即阿尔茨海默神经影像学倡议数据库(ADNI),共155个样本,其中,有50个
8、AD样本、50个NC样本和55个MCI样本。为了保证实验数据样本量足够,从每个样本中选取28张切片,故切片总数量为4 340张,理论上可以满足验证所提出方法的有效性。所有的样本切片经图像预处理之后,运用3种特征提取的方法,得到不同类型的特征,如表1所示。所有实验都是使用Matlab R2017b在带有8GB RAM的Intel i5-3230M 2.60 GHz机器上进行的。在该实验中,为了避免在实验结果的评估中出现偏差,采用十折交叉验证的方法进行实验,每次从所有样本中抽取AD、MCI和NC的训练集数量分别为565,其余样本为训练集。在最终分类层仍然使用SVM/ELM分类器进行分类,同时对la
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