影像组学联合临床特征对非小细胞肺癌EGFR突变的预测价值.pdf
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1、本文引文格式:黄必贵,农欣欣,邹清艺,等.影像组学联合临床特征对非小细胞肺癌E G F R突变的预测价值J.右江民族医学院学报,2 0 2 4,4 6(2):1 9 2-1 9 9.【论著与临床报道】影像组学联合临床特征对非小细胞肺癌E G F R突变的预测价值黄必贵1,农欣欣1,邹清艺1,周婷1,吴英宁2(1.右江民族医学院研究生学院,广西 百色 5 3 3 0 0 0;2.右江民族医学院附属医院,广西 百色 5 3 3 0 0 0)摘 要:目的 探讨基于胸部C T影像组学联合临床特征的列线图在非小细胞肺癌(N S C L C)表皮生长因子受体(E G-F R)基因突变中的预测价值。方法 回
2、顾性分析2 1 0例经病理证实为N S C L C患者的术前临床资料及非增强薄层C T图像,将所有N S C L C患者分为E G F R突变组1 4 0例及E G F R野生组7 0例,按82的比例将其随机分配到训练组和验证组,提取C T平扫图像上的肿瘤影像组学特征,应用最小绝对收缩和选择算子(L A S S O)回归分析来筛选特征,同时建立影像组学预测模型,并纳入临床特征(C T影像学特征及患者临床资料)、影像组学标签构建综合预测模型,并基于综合预测模型绘制列线图,实现模型可视化,并进行模型验证。绘制受试者工作特征(R O C)曲线、校准曲线和决策曲线(D C A)用于评估模型预测性能和临
3、床效用。结果 利用影像组学标签预测E G F R突变状态的训练组AU C=0.7 5 6,验证组AU C=0.6 9 6,临床特征模型中训练组AU C=0.8 1 1,验证组AU C=0.6 5 1,将影像组学标签联合临床特征构建综合预测模型后可提高对E G F R突变状态的预测效能,其训练集AU C=0.8 4 7,验证集AU C=0.7 4 0。结论 与单独的临床特征或影像组学标签相比,联合影像组学标签和临床特征构建的综合模型对预测N S C L CE G F R基因突变方面具有更好的预测效能,有助于指导临床治疗策略。关键词:影像组学;癌,非小细胞肺;表皮生长因子受体;基因突变中图分类号:
4、R 7 3 0.2 6 文献标识码:A 文章编号:1 0 0 1-5 8 1 7(2 0 2 4)0 2-0 1 9 2-0 8d o i:1 0.3 9 6 9/j.i s s n.1 0 0 1-5 8 1 7.2 0 2 4.0 2.0 0 8P r e d i c t i v ev a l u eo f i m a g i n gc o m b i n e dw i t hc l i n i c a l f e a t u r e sf o rE G F Rm u t a t i o n i nn o n-s m a l l c e l l l u n gc a n c e rH u
5、a n gB i g u i1,N o n gX i n x i n1,Z o uQ i n g y i1,Z h o uT i n g1,WuY i n g n i n g2(1.G r a d u a t eS c h o o l,Y o u j i a n gM e d i c a lU n i v e r s i t yf o rN a t i o n a l i t i e s,B a i s e5 3 3 0 0 0,G u a n g x i,C h i n a;2.T h eA f f i l i a t e dH o s p i t a l o fY o u j i a n
6、gM e d i c a lU n i v e r s i t yf o rN a t i o n a l i t i e s,B a i s e5 3 3 0 0 0,G u a n g x i,C h i n a)A b s t r a c t:O b j e c t i v e T o i n v e s t i g a t e t h ep r e d i c t i v ev a l u eo f c h e s tC Ti m a g i n gc o m b i n e dw i t hc l i n i c a l f e a-t u r e s i ne p i d e r
7、m a lg r o w t hf a c t o rr e c e p t o r(E G F R)g e n em u t a t i o ni nn o n-s m a l lc e l l l u n gc a n c e r(N S C L C).M e t h o d s P r e o p e r a t i v ec l i n i c a ld a t aa n du n e n h a n c e dt h i n-s l i c eC Ti m a g e so f2 1 0p a t i e n t sw i t hp a t h o l o g i c a l l y
8、p r o v e nN S C L Cw e r e r e t r o s p e c t i v e l ya n a l y z e d.A l lN S C L Cp a t i e n t sw e r ed i v i d e d i n t oE G F Rm u t a n tg r o u p(1 4 0c a s e s)a n dE G F Rw i l dg r o u p(7 0c a s e s),r a n d o m l ya s s i g n e dt ot r a i n i n gg r o u pa n dv a l i d a t i o ng r
9、 o u p(i na82r a t i o),a n dt u m o r i m a g i n g f e a t u r e s o nC Tp l a i ns c a n i m a g e sw e r e e x t r a c t e d.M i n i m u ma b s o l u t e c o n t r a c t i o na n ds e l e c t i o no p e r a t o r(L A S S O)r e g r e s s i o na n a l y s i sw a su s e dt os c r e e nf e a t u r e
10、 s,a n da ni m a g i n go m i c sp r e d i c t i o nm o d e lw a se s t a b l i s h e d.C l i n i c a l f e a t u r e s(C Ti m a g i n gf e a t u r e sa n dp a t i e n t c l i n i c a l d a t a)a n d i m a g i n go m i c s l a-291第4 6卷 第2期 右江民族医学院学报 V o l.4 6N o.22 0 2 4年4月 J o u r n a l o fY o u j
11、i a n gM e d i c a lU n i v e r s i t yf o rN a t i o n a l i t i e s A p r.2 0 2 4基金项目:广西研究生教育创新计划项目(Y C SW 2 0 2 3 5 0 3)第一作者:黄必贵,在读硕士研究生,研究方向:放射影像学,E-m a i l:8 4 2 5 9 7 4 3 1q q.c o m 通讯作者:吴英宁,博士,副主任医师,硕士研究生导师,研究方向:影像诊断与介入治疗,E-m a i l:y b 2 0 0 2 0 1 0 61 6 3.c o mb e l sw e r e i n c l u d e d
12、t oc o n s t r u c t a c o m p r e h e n s i v ep r e d i c t i o nm o d e l.B a s e do n t h e c o m p r e h e n s i v ep r e d i c t i o nm o d-e l,an o m o g r a mw a sd r a w n t o r e a l i z em o d e l v i s u a l i z a t i o na n dm o d e l v a l i d a t i o n.R e c e i v e r o p e r a t i n
13、gc h a r a c t e r i s t i c(R O C)c u r v e s,c a l i b r a t i o nc u r v e s,a n dd e c i s i o nc u r v e s(D C A)w e r ep l o t t e dt oe v a l u a t e t h em o d e lsp r e d i c t i v ep e r f o r m a n c ea n dc l i n i c a lu t i l i t y.R e s u l t s T h eAU Co f t h et r a i n i n gg r o u
14、 pw a s0.7 5 6;t h a to f t h ev e r i f i c a t i o ng r o u pw a s0.6 9 6;t h a to f t h ec l i n i c a l f e a t u r em o d e lw a s0.8 1 1;a n dt h a to f t h ev e r i f i c a t i o ng r o u pw a s0.6 5 1.T h e i n t e g r a t e dp r e d i c t i o nm o d e l c o m b i n e dw i t h t h e i m a g
15、i n g l a b e l c o u l d i m p r o v e t h ep r e d i c t i o ne f f i c i e n c yo fE G-F Rm u t a t i o ns t a t u s,w i t ht h e t r a i n i n gs e tAU C=0.8 4 7a n dt h ev e r i f i c a t i o ns e tAU C=0.7 4 0.C o n c l u s i o n C o m p a r e dw i t hc l i n i c a l f e a t u r e so r i m a g
16、 i n gt a g sa l o n e,t h e i n t e g r a t e dm o d e l c o n s t r u c t e db yc o m b i n i n g i m a g i n gt a g sa n dc l i n i c a lf e a t u r e sh a sb e t t e rp r e d i c t i v ee f f i c a c yi np r e d i c t i n gN S C L CE G F Rg e n em u t a t i o n,w h i c hi sh e l p f u l t og u i
17、 d ec l i n i c a l t r e a t m e n t s t r a t e g y.K e yw o r d s:i m a g o m i c s;n o n-s m a l l c e l l l u n gc a n c e r;e p i d e r m a l g r o w t hf a c t o r r e c e p t o r;g e n em u t a t i o n 肺癌是全世界癌症相关死亡的主要原因之一1,其中 非 小 细 胞 肺 癌(n o n-s m a l lc e l ll u n gc a n c e r,N S C L C)约占肺
18、癌所有病理类型的8 5%2。肺癌的发生、发展与基因组改变密切相关,表皮生长因子受体(e p i d e r m a l g r o w t hf a c t o r r e c e p t o r,E G F R)是N S C L C患者最常见的突变驱动基因。有研究表明3,表皮生长因 子 受 体 酪 氨 酸 激 酶 抑 制 剂(E G F R-T K I)是N S C L CE G F R突变患者的一线治疗方法,E G F R-T K I可以改善N S C L CE G F R突变患者的生存预后。因此,根据N S C L CE G F R突变状态制定具体的诊疗计划对于改善患者预后至关重要。目前
19、,组织活检仍然是确定E G F R基因突变的金标准,但其耗时、昂贵、不适合重复检测,并且组织样本的采集具有侵入性,存在一定的主观性和采样误差,当有些患者没有手术或穿刺活检的倾向时,无法评估其表达水平。C T作为肺癌筛查和诊断的常规手段,具有非侵入性和可重复性的优势。影像组学通过高通量提取C T图像中的定量特征,挖掘出更多的生物学信息,全面评估肿瘤内部异质性,具有反映相关肿瘤基因表型的潜力。本研究旨在探讨影像组学结合临床特征构建的综合模型在预测N S C L CE G F R突变患者中的应用价值,为临床提供一种无创、操作简便的检测技术,从而辅助临床进行决策,实施精准医疗。1 资料与方法1.1 一
20、般资料 回顾性搜集2 0 1 9年9月至2 0 2 3年8月于右江民族医学院附属医院经手术或穿刺活检病理证实为N S C L C患者3 0 0例。纳入标准:术前接受胸部非增强薄层C T检查;具有完整的临床资料;经组织病理学证实为N S C L C,并可获得完整的E G-F R基因检测信息。排除标准为:经组织病理学证实的N S C L C;临床资料不完整;由于严重的呼吸运动伪影,图像质量不符合要求。经过上述纳入排除标准,最终纳入2 1 0例患者,1 4 0例E G F R突变阳性患者和7 0例E G F R突变阴性患者,男1 3 3例,女7 7例,平均年龄(6 0.3 01 0.7 0)岁。1.
21、2 C T检查方法 采用2 5 6排R e v o l u t i o n螺旋C T扫描仪进行胸部非增强C T扫描,扫描参数:管电压1 2 0k V,管电流自动控制,螺距0.9 9 2mm,准直1 2 8mm0.6mm,探测器宽度8 0mm,层间距5mm,层厚5mm,重建层厚1mm。1.3 C T影像学特征的主观评价 由两名经验丰富的放射科诊断医师针对C T影像学特征进行定义,取得一致性意见,并记录结果。纳入的C T影像学特征主要包括肿瘤大小、分叶征、毛刺征、磨玻璃成分、胸膜牵拉征、空气支气管征、纵膈淋巴结肿大(1 0mm)、胸腔积液。将纳入的C T影像学特征与患者临床基线数据(性别、年龄、吸
22、烟状况、C E A、C A 1 5 3、组织学类型)通过单因素和多因素二元L o g i s t i c回归分析筛选出独立的预测因子,构建预测E G F R突变状态的临床特征模型。1.4 图像勾画、特征提取及筛选 存储D I C OM格式图像,以双线性内插法进行重采样处理,重采样体素为1mm1mm1mm,将图像标准化,随后以n i i格式保存并导入I T K-S NA P(h t t p:/www.i t k s n a p.o r g,V e r s i o n4.0.1)软件,由1名具有3年工作经验的放射科诊断医师对肿瘤边界进行逐层手动勾画出感兴趣区(r e g i o no f i n
23、t e r e s t,R O I),并由另1名具有5年工作经验的放射科诊断医师审核,然后使用开源软件包P y r a d i o m i c s提取影像组学特征,每个患者总共提取1 0 7个特征,其中包括1 8个一阶统计特征(F i r s tO r-d e r)、2 4个灰度共生矩阵(G L CM)特征、1 4个灰度依赖矩阵(G L DM)特征、1 6个灰度游程矩阵(G L R LM)特征、1 6个灰度大小区域矩阵(G L S ZM)特征、5个邻近灰度差值矩阵(NG T DM)和1 4个形态基础特征,对所有影像组学特征进行Z-s c o r e归一化处理,利用两独立样本M a n n-Wh
24、 i t n e yU检验(符合非正态分布)或t检验(符合正态分布)筛选出预测E G F R突变的特征,将保留的特征进一步采用最小绝对收缩与选择算3912 0 2 4年 右江民族医学院学报 第2期子(L A S S O)回归及1 0倍交叉验证法,并选择一个使得模型误差最小的最佳惩罚系数,最终筛选最优的影像组学特征,并根据各个特征的权重系数计算出影像组学评分,将其作为影像组学标签,分别使用6种机器学习模型构建影像组学模型,包括K紧邻(KNN)、支持向量机(S VM)、决策树(D e c i s i o nT r e e)、随机森林(R a n d o mF o r e s t s)、X G B
25、o o s t及L i g h t G BM,最后筛选出预测效能最佳的影像组学模型。1.5 综合预测模型的构建与验证 利用筛选出的临床独立预测因子构建的临床特征模型,将临床特征与r a d-s c o r e相结合构建预测E G F R突变状态的综合模型,并制作综合模型的列线图,通过列线图来实现对N S C L CE G F R基因突变的个体化预测。通过绘制受试者工作特征(R O C)曲线,并计算各个模型R O C曲线下面积(AU C)、准确性、敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值等来评价各个模型对N S C L CE G F R基因突变状态的预测价值。绘制决策曲线来评估列线图的临床实用价值
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- 影像 学联 临床 特征 细胞 肺癌 EGFR 突变 预测 价值
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