药物研发过程全解.doc
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1、(完整版)史上最全药物研发过程全解史上最全药物研发过程全解我们身边常用的药物多少岁了?青霉素:1941年,76岁;病毒灵:1960年,57岁,而最常备的感冒药阿司匹林于1898年上市,至今已有119年的历史了。这些老牌药物在科技发展如此迅速的今天,为何依然活跃于每个人的生活中?药物研发之路有多难,看一看就知道了。(此处,小编回想到无数个泡在实验室的日日夜夜,已经哭晕在厕所)一、结构筛选结构筛选是新药研发过程中至关重要的一项,决定着项目的生死存亡。1.药物靶点的确认这个是所有工作的开始.只有确定了靶点,后续所有的工作才有展开的依据.确定靶标和靶标分析需要基于治疗的疾病,做大量的文献调研和生物信息
2、分析,从基因序列到晶体结构,从基因组学到蛋白质组学。这一阶段整理的信息特别重要,将直接影响和指导新药研发的全流程。陶素生化可提供涵盖大部分已知通路和靶点的筛选工具库,助力药物靶点的确认,最受客户欢迎的工具筛选库包括激酶库,GPCR库等,通过这些工具小分子的对靶点活性和功能筛选,鉴定,可以大大加快靶点确认工作的进程。当科学家发现某个家族或某类蛋白中的一个/几个蛋白对其感兴趣的生物现象的发生起了非常重要的作用,他们会用各类相关的小分子抑制剂,逐个打断其中的蛋白,观察是哪个蛋白的打断对该生物现象的发生有明显的影响,从而确认其所感兴趣的哪个/些蛋白。例如:科学家发现Rheb通过X蛋白调控自噬的发生。同
3、时,通过研究发现蛋白是一个激酶.此时,科学家便可以用激酶的库进行筛选。通过筛选便可以简单确定X蛋白是哪个/类激酶.后续,通过RNA干扰等基因水平的技术进一步确认X蛋白的作用等。2.Hit的发现与获得发现苗头化合物(hit),hit是指对待特定靶标或作用环节具有初步活性的化合物.发现hit的主要途径包括随机筛选的方法和理性设计的方法,理性设计的方法主要基于受体或配体结构和机制的分子设计。人工进行分子设计是一项复杂艰难,费时又烧钱的庞大工程。药物研发工作者很多时候采用虚拟筛选的方式获得hit。进行计算机虚拟筛选,有两种方式可以选择。第一种,基于受体的虚拟筛选从靶蛋白的三维结构出发,研究靶蛋白结合位
4、点的特征性质以及它与小分子化合物之间的相互作用模式,根据与结合能相关的亲合性打分函数对蛋白和小分子化合物的结合能力进行评价,最终从大量的化合物分子中挑选出结合模式比较合理的、预测得分较高的化合物,用于后续的生物活性测试。第二种,基于配体的虚拟筛选一般是利用已知活性的小分子化合物,根据化合物的形状相似性或药效团模型在化合物数据库中搜索能够与它匹配的化学分子结构.最后对这些挑选出来的化合物进行实验筛选研究。下图,为陶素计算机筛选的两大方向,一类是基于分子结构的筛选,陶素可以使用计算机筛选帮助其客户从500万个化合物中筛选出目标分子,另一类是使用基于配体的方式进行筛选.对于不从事计算机虚拟筛选的实验
5、室,陶素生化也精选了骨架化合物库,最大限度的降低筛选工作的成本和精度, 从500万个类药小分子中去除了99%以上的相似结构的化合物,仅通过4131个极具代表性的化合物就可以筛选到最全的母核结构,最大程度上保证了化合物库的多样性。在先导化合物的发现和优化过程中,起到了极为重要的作用,保证实验的高效性与准确性,作为 Hit 发现的筛选库具有独一无二的优势:多样性好,千里挑一4131多样性骨架库,每个骨架只对应一个化合物;纯度高具有较高的纯度(不低于90),随货附带HNMR/LCMS谱图符合药物筛选的纯度要求,利于后期优化;产品新颖度高 产品新颖度高,在筛选中先人一步,同样的筛选模型,筛出不一样的分
6、子类药性小分子在分子量、亲疏水常数等方面符合药物的类似性,适合于在高通量筛选平台建立初期的基础化合物库购置,为后期在多靶点、多通路上的类药筛选和前沿研究奠定化合物基础。同样,作为最专业的药物筛选平台,陶素也支持不同骨架小分子的定制库,如果陶素的客户有感兴趣的骨架,陶素就能为其提供全球范围内最全的相关骨架小分子。3。候选药物的获得在hit的基础上,我们通过ADMET预测分析,类药五原则,结合靶标分析阶段的文献调研和生物信息学分析所获得的信息以及生物活性验证等等,除掉大部分研发风险高的hit,获得先导化合物(lead)。先导化合物,意为通过各种途径和手段得到的具有某种生物活性和化学结构的化合物,用
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