MEGA使用说明指导书专业资料.doc
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1、MEGA软件构建系统发育树摘要 :以白色念珠菌属下面十个种18s RNA 为例,构建系统发育树来阐明MEGA软件用法。1背景简介1.1 MEGA(分子进化遗传分析)MEGA 全称是Molecular Evolutionary Genetics Analysis。MEGA is an integrated tool for automatic and manual sequence alignment,inferring phylogenetic trees,mining web-based databases,estimating rates of molecular evolution,an
2、d testing evolutionary hypotheses. MEGA 可用于序列比对、进化树推断、预计分子进化速度、验证进化假说等。MEGA 还可以通过网络(NCBI)进行序列比对和数据搜索。 最新版本:MEGA 5.1 Beta (软件开发者建议其成果不用于刊登文章) 建议下载版本:MEGA 5.05 for Windows and Mac OS。 MEGA 5 has been tested on the following Microsoft Windows operating systems:Windows 95/98,NT,XP,Vista,version 7,Linux
3、and Mac OS 1. MEGA 5.05 可免费下载,只需输入名字及有效邮箱,下载链接会发送至邮箱,点击可下载。1.2 系统发育树定义系统发育树(英文:Phylogenetic tree)又称为演化树(evolutionary tree),是表白被以为具备共同祖先各物种间演化关系树。是一种亲缘分支分类办法(cladogram)。在树中,每个节点代表其各分支近来共同祖先,而节点间线段长度相应演化距离(如预计演化时间)1.3 系统发育树分类 依照有根和无根来区别:树可分为有根树和无根树两类。有根树是具备方向树, 依照系统发生树可推断出物种来源包括唯一节点,将其作为树中所有物种近来共同祖先。最
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