第二章蛋白质结构与功能.ppt
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1、蛋白质的结构与功能第第 二二 章章Structure and Function of Protein1.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能第二章第二章 蛋白蛋白质结质结构与功能构与功能第一第一节节 蛋白蛋白质质的分子的分子组组成成第二第二节节 蛋白蛋白质质的分子的分子结结构构第三第三节节 蛋白蛋白质结质结构与功能的关系构与功能的关系第四第四节节 蛋白蛋白质质的理化性的理化性质质及其分离及其分离纯纯化化2.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能概述概述n蛋白蛋白质质(protein)是生命的物)是生命的物质质基基础础。n蛋白蛋白质质是由是由DNA编
2、码编码的氨基酸的氨基酸组组成的。成的。3.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能蛋白质的重要性:n1.含量大:占人体固体成分的45%n2.分布广:遍及全身各组织细胞。n3.种类多:人体内有10万余种。自然界有100万之多。n4.功能繁(复)杂:每种蛋白质都有其特异功能。蛋白蛋白质质是生命的物是生命的物质质基基础础,一切生命,一切生命现现象象都离不开蛋白都离不开蛋白质质。4蛋白质的分子组成第第 一一 节节5.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能组成蛋白质的元素主要有主要有C C、H H、O O、N N和和S S。有些蛋白有些蛋白质质含有少量磷或金属元
3、含有少量磷或金属元素素铁铁、铜铜、锌锌、锰锰、钴钴、钼钼,个,个别别蛋蛋白白质还质还含有碘含有碘 。6.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能 各种蛋白各种蛋白质质的含氮量很接近,平均的含氮量很接近,平均为为1616。测测定定生生物物样样品品中中的的含含氮氮量量,就就可可以以根据以下公式推算出蛋白根据以下公式推算出蛋白质质的大致含量:的大致含量:100克克样样品中蛋白品中蛋白质质的含量的含量(g%)=每克每克样样品含氮克数品含氮克数 6.251001/16%7.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能一、氨基酸(amino acid)存在自然界中的氨基
4、酸有300余种,但组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种,除甘氨酸外,均属 L-氨基酸氨基酸。氨基酸是蛋白氨基酸是蛋白质质的基本的基本组组成成单单位位。8.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能(一)氨基酸的一般(一)氨基酸的一般结结构构 中心一个中心一个 碳原子碳原子-C 连连接一个氨基基接一个氨基基团团-NH2 一个一个羧羧基基基基团团-COOH 一个一个氢氢原子原子-H 一个不同的一个不同的R基基团团-侧链侧链 NH2HRCOOHC9.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能L-氨基酸和氨基酸和D-氨基酸氨基酸 蛋白蛋白质质中只存在中只存在L-氨基酸氨
5、基酸10.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能1.非极性疏水性氨基酸非极性疏水性氨基酸2.极性中性氨基酸极性中性氨基酸3.酸性氨基酸酸性氨基酸4.碱性氨基酸碱性氨基酸(二)氨基酸的分(二)氨基酸的分类类11.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能表2-1 氨基酸的分氨基酸的分类类中文名英文名缩写pKapI三字符一字符pK1(-COOH)pK2(-NH3+)pKR(R基)非极性疏水性氨基酸非极性疏水性氨基酸甘氨酸glycine Gly G2.349.605.97丙氨酸丙氨酸alanine Ala A2.349.696.01脯氨酸脯氨酸prolineP
6、ro P1.9910.966.48缬缬氨酸氨酸valineVal V2.329.625.97亮氨酸亮氨酸leucineLeu L2.369.605.98异亮氨酸异亮氨酸isoleucineIle I2.369.686.02蛋氨酸蛋氨酸methionineMet M2.289.215.74苯丙氨酸苯丙氨酸phenylalaninePhe F1.839.135.48极性中性氨基酸极性中性氨基酸酪氨酸酪氨酸tyrosineTyr Y2.209.1110.075.66色氨酸色氨酸tryptophanTrp W2.389.395.89丝丝氨酸氨酸serineSer S2.219.155.68苏苏氨酸氨酸
7、threonineThr T2.119.625.87半胱氨酸半胱氨酸cysteineCys C1.9610.288.185.07天冬天冬酰酰胺胺asparagineAsn N2.028.805.41谷氨谷氨酰酰胺胺glutamineGln Q2.179.135.65带带正正电电的碱性氨基酸的碱性氨基酸赖赖氨酸氨酸lysineLys K2.188.9510.539.74组组氨酸氨酸histidineHis H1.829.176.007.59精氨酸精氨酸arginineArg R2.179.0412.4810.76带负电带负电的酸性氨基酸的酸性氨基酸天冬氨酸天冬氨酸aspartic acidAsp
8、 D1.889.603.652.77谷氨酸谷氨酸glutamic acidGlu E2.199.674.253.2212.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能1.非极性疏水性氨基酸非极性疏水性氨基酸 13.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能2.极性中性氨基酸极性中性氨基酸 14.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能3.带带正正电电荷的碱性氨基酸荷的碱性氨基酸 15.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能4.带负电带负电荷的酸性氨基酸荷的酸性氨基酸 16.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白
9、质的结构与功能+胱氨酸胱氨酸二硫二硫键键-HH二硫二硫键键的形成的形成17.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能记忆口诀u甘、丙、缬、亮、异,三、四碳烃基。u丙、丁羟丝、苏。(半)胱、蛋含有硫。u酸有天冬、谷;碱有精、赖、组。u苯、酪、色、脯环;中性天、谷胺。18.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能n1.组成蛋白质的编码氨基酸只有20种。n2.除G外,其他编码氨基酸均为L-型。n3.P为环状亚氨基酸。n4.含羟基氨基酸有:S、T、Y。n5.含硫氨基酸有:C、M。n6.芳香族氨基酸有:F、Y、W。n7.支链氨基酸有:V、L、I。n8.酸性氨基酸有
10、:D、E。n9.碱性氨基酸有:R、K、H。要点要点:19目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能(三)氨基酸的理化性(三)氨基酸的理化性质质1.两性解离及等两性解离及等电电点点氨基酸是两性氨基酸是两性电电解解质质,其解离程度取决,其解离程度取决于所于所处处溶液的酸碱度。溶液的酸碱度。20.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能在在某某一一pH的的溶溶液液中中,氨氨基基酸酸解解离离成成阳阳离离子子和和阴阴离离子子的的趋趋势势及及程程度度相相等等,成成为为兼兼性性离离子子,呈呈电电中中性性。此此时时溶溶液液的的pH值值称称为该为该氨基酸的氨基酸的等等电电点
11、点。等等电电点点(isoelectric point,pI)21.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能pH=pI+OH-pHpI+H+OH-+H+pHpI兼性离子兼性离子 阳离子阳离子阴离子阴离子22.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能2.紫外吸收紫外吸收 色氨酸、酪氨酸的色氨酸、酪氨酸的最大吸收峰在最大吸收峰在 280 nm 附近。附近。大大多多数数蛋蛋白白质质含含有有这这两两种种氨氨基基酸酸残残基基,所所以以 测测 定定 蛋蛋 白白 质质 溶溶 液液280nm的的光光吸吸收收值值是是分分析析溶溶液液中中蛋蛋白白质质含含量量的的快速快速简简便
12、的方法。便的方法。芳香族氨基酸的紫外吸收芳香族氨基酸的紫外吸收23.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能3.茚茚三三酮酮反反应应 氨氨基基酸酸与与茚茚三三酮酮水水合合物物共共热热,可可生生成成蓝蓝紫紫色色化化合合物物,其其最最大大吸吸收收峰峰在在570nm处处。由由于于此此吸吸收收峰峰值值与与氨氨基基酸酸的的含含量量存存在在正正比比关系,因此可作关系,因此可作为为氨基酸定量分析方法。氨基酸定量分析方法。24.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能二、肽*肽肽键键(peptide bond)是是由由一一个个氨氨基基酸酸的的-羧羧基基与与另另一一个个氨
13、氨基基酸酸的的-氨氨基基脱脱水水缩缩合而形成的化学合而形成的化学键键。(一)(一)肽肽(peptide)氨基酸通氨基酸通过过肽键肽键缩缩合而成的化合物称合而成的化合物称为为肽肽。25.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能+-HOH甘氨甘氨酰酰甘氨酸甘氨酸肽键26.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能两分子氨基酸两分子氨基酸缩缩合形成合形成二二肽肽,三分子氨,三分子氨基酸基酸缩缩合合则则形成形成三三肽肽由十个以内由十个以内氨基酸氨基酸相相连连而而成成的的肽肽称称为为寡寡肽肽(oligopeptide),由更多的氨基酸相由更多的氨基酸相连连形成的形成
14、的肽肽称称多多肽肽(polypeptide)。27.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能多多肽肽链链(polypeptide chain)是是指指许许多多氨氨基基酸之酸之间间以以肽键连肽键连接而成的一种接而成的一种结结构。构。肽链肽链中的氨基酸分子因中的氨基酸分子因为为脱水脱水缩缩合而基合而基团团不全,被称不全,被称为为氨基酸残基氨基酸残基(residue)。28.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能氨基末端(氨基末端(N末端):多末端):多肽链肽链中有中有自由氨基自由氨基的一端的一端羧羧基末端(基末端(C末端):多末端):多肽链肽链中有中有自由
15、自由羧羧基基的一端的一端多多肽链肽链有两端有两端丝丝氨氨酰酰-甘氨甘氨酰酰-酪氨酪氨酰酰-丙氨丙氨酰酰-亮氨酸亮氨酸 (ser-gly-tyr-ala-leu)(ser-gly-tyr-ala-leu)29.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能先写骨架先写骨架NCC,再写再写氨氨羧羧两末端;两末端;然后配平然后配平酰酰胺胺键键,最后才是最后才是侧链侧链上。上。30.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能肽单元(peptide unit)参参与与肽肽键键的的6个个原原子子C 1、C、O、N、H、C 2位位于于同同一一平平面面,C 1和和C 2在在平平
16、面面上上所所处处的的位位置置为为反反式式(trans)构构型型,此此同同一一平平面面上上的的6个个原原子子构构成成了了所所谓谓的的肽单肽单元元。31.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能肽键(C-N)具有部分双键的性质32.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能绝绝大多数大多数肽单肽单元中元中C1和和C2在平面所在平面所处处的位置的位置为为反反式(式(trans),即在,即在连连接它接它们们的的肽键肽键的相反方向。的相反方向。顺式(cis)肽单元和 反式(trans)肽单元 33.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能(二)天
17、然存在的活性肽 1.谷胱甘肽(glutathione,GSH)34.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能GSH过过氧氧化物化物酶酶H2O2 2GSH 2H2O GSSG GSH还还原原酶酶NADPH+H+NADP+35.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能 体内体内许许多激素属寡多激素属寡肽肽或多或多肽肽 神神经肽经肽(neuropeptide)2.2.多多肽类肽类激素及神激素及神经肽经肽36.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能3.3.抗生素抗生素肽肽 抗生素肽是一类能抑制或杀死细菌的多肽。如短杆菌肽A、短杆菌素S、缬氨
18、霉素(valinomycin)和博来霉素(blemycin)等。37.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能38.蛋白质的分子结构 第第 二二 节节39.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能蛋白蛋白质质的的结结构构层层次次40.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能第二第二节节 蛋白蛋白质质的分子的分子结结构构 一级结构(基本结构)高级结构(空间构象)二级结构三级结构四级结构-螺旋-折叠-转角不规则卷曲分子结构41.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能定定义义蛋白蛋白质质的一的一级结级结构指多构指多肽链
19、肽链中氨基酸的数目中氨基酸的数目及排列及排列顺顺序,包括二硫序,包括二硫键键的数目和位置。的数目和位置。一、蛋白一、蛋白质质的一的一级结级结构构(primary structure)主要的化学主要的化学键键肽键肽键,有些蛋白,有些蛋白质还质还包括二硫包括二硫键键。42.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能一一级结级结构是蛋白构是蛋白质质空空间间构象和特异生物学构象和特异生物学功能的基功能的基础础。目目 录录牛胰岛素的一级结构 43.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能二、蛋白二、蛋白质质的二的二级结级结构构(secondary structure
20、)蛋蛋白白质质分分子子中中某某一一段段肽肽链链的的局局部部空空间间结结构构,即即该该段段肽肽链链主主链链骨骨架架原原子子的的相相对对空空间间位位置置,并并不不涉涉及及氨氨基基酸酸残残基基侧侧链链的的构构象象。定定义义 主要的化学主要的化学键键:氢键氢键 44.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能 蛋白蛋白质质二二级结级结构的主要形式构的主要形式 -螺旋螺旋(-helix)-折叠折叠(-pleated sheet)-转转角角(-turn)无无规规卷曲卷曲(random coil)45.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能(一)(一)-螺旋螺旋目目
21、录录46.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能 -螺旋螺旋 要点要点 呈右手螺旋(棒状)呈右手螺旋(棒状)螺旋一圈含螺旋一圈含3.63.6个氨基酸残个氨基酸残 基,螺距基,螺距 0.54nm 0.54nm。螺旋螺旋稳稳定靠定靠氢键氢键,氢键氢键方向方向 与螺旋与螺旋长轴长轴平行平行 R R侧链对侧链对螺旋的形成和螺旋的形成和稳稳定定 有影响。有影响。47.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能二、二、-折叠折叠 反平行反平行-折叠折叠和平行和平行-折叠折叠48.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能 -折叠折叠 要点要点 呈伸
22、展、呈伸展、锯齿锯齿状状结结构。构。有有顺顺向平行和反向平行两种向平行和反向平行两种 构象。构象。折叠的折叠的稳稳定靠定靠氢键氢键。R R侧链对侧链对折叠形成、折叠形成、稳稳定有定有 影响。影响。49.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能(三)(三)-转转角和无角和无规规卷曲卷曲-转转角角无无规规卷曲是用来卷曲是用来阐阐述没有确定述没有确定规规律性的那部律性的那部分分肽链结肽链结构。构。50.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能(四)(四)超二超二级结级结构(构(模体模体motif)指在多指在多肽链肽链内内顺顺序上相互序上相互邻邻近的二近的二级结
23、级结构常常在空构常常在空间间折叠中靠近,彼折叠中靠近,彼此相互作用,形成此相互作用,形成规则规则的二的二级结级结构构聚集体。聚集体。51.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能钙结钙结合蛋白中合蛋白中结结合合钙钙离子的模体离子的模体 锌锌指指结结构构 52.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能三、蛋白质的三级结构(tertiary structure)疏水疏水键键、离子、离子键键、氢键氢键和和 Van der Waals力等。力等。主要的化学主要的化学键键是次是次级键级键整条整条肽链肽链中全部氨基酸残基的相中全部氨基酸残基的相对对空空间间位置。位置
24、。即即肽链肽链中中所有原子所有原子在三在三维维空空间间的整体排布。的整体排布。(一)(一)定定义义 53.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能目目 录录54.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能纤连纤连蛋白分子的蛋白分子的结结构域构域 (二)(二)结结构域构域大分子蛋白大分子蛋白质质的三的三级结级结构常可分割成一个或构常可分割成一个或数个球状或数个球状或纤维纤维状的区域,折叠得状的区域,折叠得较为紧较为紧密,各密,各行使其功能,称行使其功能,称为为结结构域构域(domain)。55.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能细细
25、胞表面蛋白胞表面蛋白CD4分子分子4个相似个相似结结构域构域 56.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能肌肌红红蛋白蛋白(Mb)血血红红素素铁铁原子原子57.目目 录录第二章第二章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能亚亚基之基之间间的的结结合力主要是合力主要是疏水作用疏水作用,其次,其次是是氢键氢键和离子和离子键键。四、蛋白四、蛋白质质的四的四级结级结构构(quaternary structure)蛋白蛋白质质分子中各分子中各亚亚基的空基的空间间排布及排布及亚亚基接基接触部位的布局和相互作用,称触部位的布局和相互作用,称为为蛋白蛋白质质的四的四级级结结构构。有些蛋白有
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