miR-101-5p通过靶向ATAD2抑制肺鳞癌细胞的侵袭.pdf
《miR-101-5p通过靶向ATAD2抑制肺鳞癌细胞的侵袭.pdf》由会员分享,可在线阅读,更多相关《miR-101-5p通过靶向ATAD2抑制肺鳞癌细胞的侵袭.pdf(9页珍藏版)》请在咨信网上搜索。
1、第 卷第期年月西 安 交 通 大 学 学 报(医 学 版)J o u r n a l o fX ia nJ i a o t o ngU n i v e r s i ty(M e d i c a l S c i e n c e s)V o l N o M a r 本刊网址:h t t p:/y x x b x j t u e d u c n微信公众号:西安交通大学学报医学版基础研究m i R p通过靶向A T A D 抑制肺鳞癌细胞的侵袭刘浩杰,王德才,李树斌(新乡市中心医院/新乡医学院第四临床学院心胸外科,河南新乡 )摘要:目的探讨微小R NA p(m i R p)影响肺鳞癌(l u n gs
2、 q u a m o u s c e l l c a r c i n o m a,L U S C)细胞增殖、侵袭的分子机制.方法从癌症基因组图谱(T h eC a n c e rG e n o m eA t l a s,T C G A)数据库下载肺鳞癌T C GA L U S C的m i R NA成熟体表达数据和总R NA的测序数据,鉴定差异表达基因;分析富集于A TA D 的信号通路.培养L U S C细胞,q R T P C R检测细胞中m i R p和A T A D 的mR NA表达,MT T实验、克隆形成实验和侵袭实验检测m i R p对L U S C细胞增殖和侵袭的影响,流式细胞术检
3、测A T A D 对L U S C细胞周期的影响,W e s t e r nb l o t t i n g检测A T A D 蛋白的表达.双荧光素酶实验验证m i R p能否与A T A D 靶向结合,最后通过L U S C细胞共转染o e A TA D 和m i R p模拟物(m i m i c),检测细胞增殖、克隆、侵袭能力的变化,进一步探究m i R p能否通过A T A D 调节L U S C细胞的生物学功能.结果m i R p在L U S C组织及培养L U S C细胞中显著下调.过表达m i R p的L U S C增殖和侵袭能力显著抑制.其下游调控靶基因A TA D 在L U S
4、C中显著上调,且m i R p和A T A D 表达呈负相关,单基因富集分析(G S E A)结果显示A T A D 显著富集于细胞周期信号通路.双荧光素酶实验结果显示,m i R p靶向结合A T A D,并通过MT T和侵袭实验发现m i R p通过靶向结合A TA D 调控L U S C细胞的增殖和侵袭.结论m i R p在L U S C中低表达,m i R p通过靶向抑制A T A D 降低L U S C细胞的增殖、侵袭.关键词:微小R NA p(m i R p);A T P酶家族AAA域(A T A D);肺鳞癌(L U S C);增殖;侵袭中图分类号:R 文献标志码:AD O I:
5、/j d y x b 收稿日期:修回日期:通信作者:李树斌,主任医师 E m a i l:l i s s b i n c o m网络出版地址:h t t p s:/l i n k c n k i n e t/u r l i d/R ()M i R p i n h i b i t s t h ep r o l i f e r a t i o na n d i n v a s i o no f l u n g s q u a m o u s c e l lc a r c i n o m ac e l l sb y t a r g e t i n gA T A D L I U H a o j i e
6、,WANGD e c a i,L IS h u b i n(D e p a r t m e n to fC a r d i o t h o r a c i cS u r g e r y,T h eF o u r t hC l i n i c a lC o l l e g eo fX i n x i a n gM e d i c a lC o l l e g e;X i n x i a n gC e n t r a lH o s p i t a l,X i n x i a n g ,C h i n a)A B S T R A C T:O b j e c t i v e T oi n v e s
7、t iga t et h em o l e c u l a rm e c h a n i s mo fm i c r o RNA p(m i R p)a f f e c t i ngt h epr o l i f e r a t i o na n di n v a s i o no fl u ngsqu a m o u sc e l lc a r c i n o m a(L U S C)c e l l s M e t h o d sW ed o w n l o a d e dt h em i RNA m a t u r ee xpr e s s i o nd a t aa n dt o t a
8、 lRNAs equ e n c i ngd a t ao fT C GA L U S Cf r o m T C GAd a t a b a s et oi d e n t i fyd i f f e r e n t i a l lye xpr e s s e dge n e s T h e s ign a lpa t h w aye n r i c h e d i nA T AD w a s a n a lyz e d T h emRNAe xpr e s s i o n s o fm i R pa n dA T AD i nt h eL U S Cc e l l sw e r ed e t
9、 e c t e dbyqR T P C R T h ee f f e c t so fm i R po nt h epr o l i f e r a t i o na n d i n v a s i o no fL U S Cc e l l sw e r ed e t e c t e dbyMT Ta s s ay,c l o n i nga s s ay,a n di n v a s i o na s s ay T h ee f f e c t so fA T AD o nt h ec e l l cyc l eo fL U S Cc e l l sw e r ed e t e c t e
10、 dbyf l o wcyt o m e t ry W e s t e r nb l o t t i ngw a su s e dt od e t e c t t h ee xpr e s s i o no fA T AD pr o t e i n D o u b l el u c i f e r a s ee xpe r i m e n tw a su s e dt ov e r i fyw h e t h e rm i R pc o u l db i n dt oA T AD t a rge t F i n a l ly,w ed e t e c t e dt h ec h a nge s
11、i nt h epr o l i f e r a t i o n,c l o n i nga n di n v a s i o na b i l i tyo fL U S Cc e l l sbyc o t r a n s f e c t i o nw i t ho e A T AD a n dm i R pm i m i c,a n df u r t h e re xpl o r e dw h e t h e rm i R pc o u l dr egu l a t et h eb i o l ogi c a l f u n c t i o no fL U S Cc e l l st h r
12、 o ughA T AD R e s u l t sT h em i R pw a ss ign i f i c a n t lyd o w n r egu l a t e di nL U S Ct i s s u e sa n dc e l l s O v e r e xpr e s s i o no fm i R pc o u l ds ign i f i c a n t lyi n h i b i tt h epr o l i f e r a t i o na n di n v a s i o no fL U S Cc e l l s A T AD,i t sd o w n s t r
13、e a mr egu l a t o ryt a rge tge n e,w a s s ign i f i c a n t lyupr egu l a t e di nL U S C,a n dm i R pa n d A T AD e xpr e s s i o n s w e r ei n v e r s e lyc o r r e l a t e d G S E A e n r i c h m e n tr e s u l t ss h o w e d t h a t A T AD w a ss ign i f i c a n t lye n r i c h e di nt h ec
14、e l lcyc l es ign a lpa t h w ay T h ed o u b l el u c i f e r a s ee xpe r i m e n tpr o v e dt h a tm i R pt a rge t e dA T AD,a n dt h er e c o v e rye xpe r i m e n t s h o w e dt h a tm i R pr egu l a t e dt h epr o l i f e r a t i o na n di n v a s i o no f期刘浩杰,王德才,李树斌 m i R p通过靶向A T A D 抑制肺鳞癌
15、细胞的侵袭本刊网址:h t t p:/y x x b x j t u e d u c n微信公众号:西安交通大学学报医学版L U S Cc e l l sbyt a rge t i ngA T AD C o n c l u s i o nI nt h i ss t u dy,w ef o u n dt h a tm i R ph a dl o we xpr e s s i o ni nL U S C,a n dt h a t m i R pd e c r e a s e dt h epr o l i f e r a t i o na n di n v a s i o no fL U S C c
16、 e l l sbyt a rge t e di n h i b i t i o no fA T AD K E Y WO R D S:m i c r o RNA p(m i R p);A T P a s ef a m i lyAAA d o m a i n c o n t a i n i ng(A T AD);l u ngsqu a m o u s c e l l c a r c i n o m a(L U S C);pr o l i f e r a t i o n;i n v a s i o n肺鳞状细胞癌(l u n gs q u a m o u sc e l lc a r c i n o
17、 m a,L U S C)是世界第二常见的肺部恶性肿瘤,占非小细胞肺癌(n o n s m a l lc e l l l u n gc a r c i n o m a,N S C L C)病例的 ,每年致全球约 万人死亡 .L U S C的治愈率较低,年生存率仅为.针对L U S C的治疗主要是手术以及放化疗,但对晚期患者的疗效有限,而早期诊断和早期治疗是改善L U S C患者生存状态的有效途径.而目前F D A批准的靶向药 物 治 疗,如 表 皮 生 长 因 子 受 体(e p i d e r m a lg r o w t hf a c t o rr e c e p t o r,E G F
18、R)突变或EML A L K融合靶向治疗,主要适用于肺腺癌(l u n ga d e n o c a r c i n o m a,L UA D),而不适用于L U S C患者.因此,寻找新的生物标志物应用于L U S C早期诊断和靶向治疗,有助于改善L U S C患者的生存现状.M i c r o R NA s(m i R NA s)是一种小的非编码R NA(约 个核苷酸),通过与靶基因的 非翻译区(u n t r a n s l a t e dr e g i o n,UT R)不完全结合,诱导翻译抑制调节靶基因的表达 .大量证据表明m i R NA s的失调与多种癌症的发生和转移有关,m i
19、 R NA s可能是癌症潜在的治疗靶点.已有研究表明,m i R p通过靶向抑制C C R 表达,降低了A 细胞的增殖、迁移和侵袭能力,而m i R p则在三阴性乳腺癌中通过调控MA P K 参与了乳腺癌患者的疾病进展,同时m i R p 通过靶向T R A F 抑制人胃癌细胞的迁移和侵袭能力.其中,m i R p作为m i R NA家族中的重要一员,对多种癌症具有重要调节作用.有研究发现,m i R p通过靶向C X C L 抑制宫颈癌细胞的生长和转移.m i R p的异位表达减弱了乳腺癌细胞的侵袭性表型,如增殖、迁移和侵袭.在肾透明细胞癌(c l e a rc e l l r e n a
20、lc e l lc a r c i n o m a,c c R C C)中,m i R p的表达导致c c R C C细胞周期阻滞和凋亡.但m i R p在L U S C中作用机制并不清楚.因此,本研究通过生物信息学分析及体外实验探究m i R p/AT A D 轴调控L U S C的机制,并为寻求临床治疗的有效靶点提供数据支持和参考.材料与方法细胞培养与转染正常人肺上皮细胞系B E A S B(C )购自于中国科学院上海生命科学研究院细胞资源中心;L U S C细胞系H (C C C C )、H (C C C C )购自中国医学科学院基础医学研究所细胞资源中心;L U S C细胞系S K M
21、 E S (C )、H (C )购自中国典型培养物保藏中心细胞库.将各细胞系接种于含有青霉素(I n v i t r o g e n英杰公司,美国)和 m L/L胎牛血清(f e t a lb o v i n es e r u m,F B S)的R PM I 培养基(大岛生物公司,G i b c o,美国),于、m L/LC O恒温箱中培养.m i R pm i m i c、m i m i c N C、m i R pi n h i b i t o r、i n h i b i t o r N C、o e A T A D、o e N C、s i A T A D、s i N C购于上海吉玛制药技术有
22、限公司.根据参考说明书使用L i p o f e c t a m i n e (I n v i t r o g e n英杰公司,美国)转染模拟物、小干扰R NA(s m a l l i n t e r f e r i n gr i b o n u c l e i ca c i d,s i R NA)、抑制剂(i n h i b i t o r)、重组载体和各自阴性对照至L U S C细胞中.生物信息学分析从癌症基因组图谱(T h eC a n c e rG e n o m eA t l a s,T C GA)(h t t p s:/p o r t a l g d c c a n c e r g
23、 o v/)下 载T C GA L U S C中 的m i R NA成 熟 体 表 达 数 据(总m i R NA数据癌组织样本 个,癌旁组织样本 个)和总R NA的测序数据(总R NA测序数据癌组织样本 个,癌旁组织样本 个),基于下载数据对m i R p表达进行分析,使用W i l c o x o n法进行检验.利用R包e d g e R,以正常组织样本为对照,对肿瘤组织中差异表达的mR NA进行分析,引用负二项分布模型检验,l o g(F o l dC h a n g e)绝对值大于,校正P值(Pa d j)小于 的基因被确定为差异表达的mR NA,通过m i R T a r B a s
24、 e和T a r g e t S c a n数据库对m i R p进行靶基因预测,并与上调的差异表达的mR NA取交集,获得与m i R p具有靶向结合位点的差异mR NA,利用相关性分析最终确定获得靶基因.单基因富集分析(g e n es e te n r i c h m e n ta n a l y s i s,G S E A),以AT A D 表达的中位值将样本分为高表达组和低表达组,从M S i g D B下载K E G G通路的基因集,以低表达组为对照,分析高低表达组的各通路基因集在两组间表达差异,采用软件G S E A对西 安 交 通 大 学 学 报(医 学 版)第 卷本刊网址:h
25、 t t p:/y x x b x j t u e d u c n微信公众号:西安交通大学学报医学版各通路基因集在两组中表达进行分析,选择富集评分绝对值大于,校正P值小于 的基因集进行研究,研究靶基因在肿瘤发生发展中的作用机制.实时荧光定量聚合酶链式反应用T r i z o l(I n v i t r o g e n公 司,美 国)分 别 从H 、H 、S K ME S 和H 细胞中提取总R NA.根据制造商的指示,使用P r i m e S c r i p tR T试剂盒T a K a R a(宝)生物股份有限公司,日本 合成c D NA,随后使用S Y B RP r e m i xE xT
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- miR 101 通过 靶向 ATAD2 抑制 癌细胞 侵袭
1、咨信平台为文档C2C交易模式,即用户上传的文档直接被用户下载,收益归上传人(含作者)所有;本站仅是提供信息存储空间和展示预览,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对上载内容不做任何修改或编辑。所展示的作品文档包括内容和图片全部来源于网络用户和作者上传投稿,我们不确定上传用户享有完全著作权,根据《信息网络传播权保护条例》,如果侵犯了您的版权、权益或隐私,请联系我们,核实后会尽快下架及时删除,并可随时和客服了解处理情况,尊重保护知识产权我们共同努力。
2、文档的总页数、文档格式和文档大小以系统显示为准(内容中显示的页数不一定正确),网站客服只以系统显示的页数、文件格式、文档大小作为仲裁依据,个别因单元格分列造成显示页码不一将协商解决,平台无法对文档的真实性、完整性、权威性、准确性、专业性及其观点立场做任何保证或承诺,下载前须认真查看,确认无误后再购买,务必慎重购买;若有违法违纪将进行移交司法处理,若涉侵权平台将进行基本处罚并下架。
3、本站所有内容均由用户上传,付费前请自行鉴别,如您付费,意味着您已接受本站规则且自行承担风险,本站不进行额外附加服务,虚拟产品一经售出概不退款(未进行购买下载可退充值款),文档一经付费(服务费)、不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
4、如你看到网页展示的文档有www.zixin.com.cn水印,是因预览和防盗链等技术需要对页面进行转换压缩成图而已,我们并不对上传的文档进行任何编辑或修改,文档下载后都不会有水印标识(原文档上传前个别存留的除外),下载后原文更清晰;试题试卷类文档,如果标题没有明确说明有答案则都视为没有答案,请知晓;PPT和DOC文档可被视为“模板”,允许上传人保留章节、目录结构的情况下删减部份的内容;PDF文档不管是原文档转换或图片扫描而得,本站不作要求视为允许,下载前自行私信或留言给上传者【自信****多点】。
5、本文档所展示的图片、画像、字体、音乐的版权可能需版权方额外授权,请谨慎使用;网站提供的党政主题相关内容(国旗、国徽、党徽--等)目的在于配合国家政策宣传,仅限个人学习分享使用,禁止用于任何广告和商用目的。
6、文档遇到问题,请及时私信或留言给本站上传会员【自信****多点】,需本站解决可联系【 微信客服】、【 QQ客服】,若有其他问题请点击或扫码反馈【 服务填表】;文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“【 版权申诉】”(推荐),意见反馈和侵权处理邮箱:1219186828@qq.com;也可以拔打客服电话:4008-655-100;投诉/维权电话:4009-655-100。