生存分析与cox回归.ppt
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1、生存分析与生存分析与cox回归回归2024/5/24 周五周五生存分析与生存分析与Cox回归回归2生存分析与生存分析与生存分析与生存分析与CoxCox回归回归回归回归生存资料概述生存资料概述生存资料概述生存资料概述生存分析的基本概念生存分析的基本概念生存分析的基本概念生存分析的基本概念生存资料的统计描述生存资料的统计描述生存资料的统计描述生存资料的统计描述生存曲线的比较生存曲线的比较生存曲线的比较生存曲线的比较CoxCox回归回归回归回归2024/5/24 周五周五生存分析与生存分析与Cox回归回归3一、生存资料概述一、生存资料概述一、生存资料概述一、生存资料概述 举例举例举例举例 某医师分别
2、用中药、西药各治疗急性肝炎病人某医师分别用中药、西药各治疗急性肝炎病人4040例,结果如下表,试问:哪种药物的治疗效果好?例,结果如下表,试问:哪种药物的治疗效果好?2024/5/24 周五周五生存分析与生存分析与Cox回归回归4一、生存资料概述一、生存资料概述一、生存资料概述一、生存资料概述随访研究随访研究随访研究随访研究 (follow up)(follow up)是医学研究中常用的设计方法是医学研究中常用的设计方法是医学研究中常用的设计方法是医学研究中常用的设计方法随访研究不仅要考虑观察对象的结局,还要考虑出现结随访研究不仅要考虑观察对象的结局,还要考虑出现结随访研究不仅要考虑观察对象的
3、结局,还要考虑出现结随访研究不仅要考虑观察对象的结局,还要考虑出现结局所经历的时间局所经历的时间局所经历的时间局所经历的时间这类这类这类这类(既要考虑结局又要考虑结局出现的时间既要考虑结局又要考虑结局出现的时间既要考虑结局又要考虑结局出现的时间既要考虑结局又要考虑结局出现的时间)资料称为资料称为资料称为资料称为生存资料生存资料生存资料生存资料 (survival data)(survival data)生存分析生存分析生存分析生存分析(survival analysis)(survival analysis)是将观察的结局和出现结局是将观察的结局和出现结局是将观察的结局和出现结局是将观察的结局
4、和出现结局所经历的的时间结合起来进行分析的统计方法。所经历的的时间结合起来进行分析的统计方法。所经历的的时间结合起来进行分析的统计方法。所经历的的时间结合起来进行分析的统计方法。2024/5/24 周五周五生存分析与生存分析与Cox回归回归5一、生存资料概述一、生存资料概述一、生存资料概述一、生存资料概述医学随访研究一般有两种医学随访研究一般有两种医学随访研究一般有两种医学随访研究一般有两种所有研究对象同时进入研究所有研究对象同时进入研究所有研究对象同时进入研究所有研究对象同时进入研究(观察起始时间相同观察起始时间相同观察起始时间相同观察起始时间相同)例如,队列研究、动物的随访观察例如,队列研
5、究、动物的随访观察例如,队列研究、动物的随访观察例如,队列研究、动物的随访观察被研究对象逐个进入研究被研究对象逐个进入研究被研究对象逐个进入研究被研究对象逐个进入研究(观察起始时间不同观察起始时间不同观察起始时间不同观察起始时间不同)例如,临床随访研究例如,临床随访研究例如,临床随访研究例如,临床随访研究由于受经费和时间的限制,最终观察时间不能无限延长由于受经费和时间的限制,最终观察时间不能无限延长由于受经费和时间的限制,最终观察时间不能无限延长由于受经费和时间的限制,最终观察时间不能无限延长2024/5/24 周五周五生存分析与生存分析与Cox回归回归81.1.基本概念基本概念基本概念基本概
6、念 起始事件与终点事件起始事件与终点事件起始事件与终点事件起始事件与终点事件起始事件起始事件起始事件起始事件反映研究对象生存过程的起始特征事件。反映研究对象生存过程的起始特征事件。反映研究对象生存过程的起始特征事件。反映研究对象生存过程的起始特征事件。终点事件终点事件终点事件终点事件(outcome event)(outcome event)又称失效事件又称失效事件又称失效事件又称失效事件(failure event)(failure event)或死亡事件或死亡事件或死亡事件或死亡事件(death event)(death event)终点事件终点事件终点事件终点事件研究者所关心的研究对象的
7、特定结局,可以研究者所关心的研究对象的特定结局,可以研究者所关心的研究对象的特定结局,可以研究者所关心的研究对象的特定结局,可以标志某种处理措施失败或失效的特征事件标志某种处理措施失败或失效的特征事件标志某种处理措施失败或失效的特征事件标志某种处理措施失败或失效的特征事件起始事件和终点事件是由研究目的决定的,在设计时就起始事件和终点事件是由研究目的决定的,在设计时就起始事件和终点事件是由研究目的决定的,在设计时就起始事件和终点事件是由研究目的决定的,在设计时就明确规定,并在研究期间严格遵守不能随意改变明确规定,并在研究期间严格遵守不能随意改变明确规定,并在研究期间严格遵守不能随意改变明确规定,
8、并在研究期间严格遵守不能随意改变2024/5/24 周五周五生存分析与生存分析与Cox回归回归91.1.基本概念基本概念基本概念基本概念 举例举例举例举例 说明下列研究的起始事件与终点事件说明下列研究的起始事件与终点事件说明下列研究的起始事件与终点事件说明下列研究的起始事件与终点事件急性白血病患者进行骨髓移植后以是否复发来评价骨急性白血病患者进行骨髓移植后以是否复发来评价骨急性白血病患者进行骨髓移植后以是否复发来评价骨急性白血病患者进行骨髓移植后以是否复发来评价骨髓移植效果髓移植效果髓移植效果髓移植效果职业性铅中毒的危险因素职业性铅中毒的危险因素职业性铅中毒的危险因素职业性铅中毒的危险因素(开
9、始职业性接触至出现铅开始职业性接触至出现铅开始职业性接触至出现铅开始职业性接触至出现铅中毒症状中毒症状中毒症状中毒症状)冠心病患者两次发病的时间间隔冠心病患者两次发病的时间间隔冠心病患者两次发病的时间间隔冠心病患者两次发病的时间间隔大肠癌患者手术后存活情况大肠癌患者手术后存活情况大肠癌患者手术后存活情况大肠癌患者手术后存活情况(手术、死亡手术、死亡手术、死亡手术、死亡)接受健康教育对青少年戒烟到复吸的影响因素分析接受健康教育对青少年戒烟到复吸的影响因素分析接受健康教育对青少年戒烟到复吸的影响因素分析接受健康教育对青少年戒烟到复吸的影响因素分析接受某种保险方式后的中途退保分析接受某种保险方式后的
10、中途退保分析接受某种保险方式后的中途退保分析接受某种保险方式后的中途退保分析2024/5/24 周五周五生存分析与生存分析与Cox回归回归101.1.基本概念基本概念基本概念基本概念 生存时间生存时间生存时间生存时间(survival time)(survival time)或失效时间或失效时间或失效时间或失效时间(failure time)(failure time)生存时间指观察到的存活时间生存时间指观察到的存活时间生存时间指观察到的存活时间生存时间指观察到的存活时间常用符号常用符号常用符号常用符号 t t 表示表示表示表示生存时间是生存分析中的重要信息,必须准确生存时间是生存分析中的重要
11、信息,必须准确生存时间是生存分析中的重要信息,必须准确生存时间是生存分析中的重要信息,必须准确明确规定起始事件、终点事件明确规定起始事件、终点事件明确规定起始事件、终点事件明确规定起始事件、终点事件时间的测度单位时间的测度单位时间的测度单位时间的测度单位(年、月、日年、月、日年、月、日年、月、日)2024/5/24 周五周五生存分析与生存分析与Cox回归回归111.1.基本概念基本概念基本概念基本概念 整个研究的观察时间整个研究的观察时间整个研究的观察时间整个研究的观察时间研究开始到研究结束的时间研究开始到研究结束的时间研究开始到研究结束的时间研究开始到研究结束的时间因为有起始事件发生时间、终
12、点事件发生时间、观察开因为有起始事件发生时间、终点事件发生时间、观察开因为有起始事件发生时间、终点事件发生时间、观察开因为有起始事件发生时间、终点事件发生时间、观察开始时间、观察结束时间,生存资料数据分为完全数据始时间、观察结束时间,生存资料数据分为完全数据始时间、观察结束时间,生存资料数据分为完全数据始时间、观察结束时间,生存资料数据分为完全数据(complete datacomplete data)和截尾数据和截尾数据和截尾数据和截尾数据(censored data)(censored data)2024/5/24 周五周五生存分析与生存分析与Cox回归回归121.1.基本概念基本概念基本
13、概念基本概念完全数据:指从观察起点到发生死亡事件所经历的时间,完全数据:指从观察起点到发生死亡事件所经历的时间,完全数据:指从观察起点到发生死亡事件所经历的时间,完全数据:指从观察起点到发生死亡事件所经历的时间,生存时间是完整确切的。生存时间是完整确切的。生存时间是完整确切的。生存时间是完整确切的。截尾数据或截尾值截尾数据或截尾值截尾数据或截尾值截尾数据或截尾值(censored value)(censored value),又称删失值或终检,又称删失值或终检,又称删失值或终检,又称删失值或终检值。值。值。值。生存时间观察过程的截止不是由于死亡生存时间观察过程的截止不是由于死亡生存时间观察过程
14、的截止不是由于死亡生存时间观察过程的截止不是由于死亡/终点事件,而终点事件,而终点事件,而终点事件,而是由于其他原因引起的,称为截尾是由于其他原因引起的,称为截尾是由于其他原因引起的,称为截尾是由于其他原因引起的,称为截尾(censored)(censored)从观察起点到截尾时点所经历的生存时间称为截尾数据,从观察起点到截尾时点所经历的生存时间称为截尾数据,从观察起点到截尾时点所经历的生存时间称为截尾数据,从观察起点到截尾时点所经历的生存时间称为截尾数据,习惯上在生存时间右上角标注习惯上在生存时间右上角标注习惯上在生存时间右上角标注习惯上在生存时间右上角标注“”表示表示表示表示2024/5/
15、24 周五周五生存分析与生存分析与Cox回归回归131.1.基本概念基本概念基本概念基本概念 截尾的主要原因:截尾的主要原因:截尾的主要原因:截尾的主要原因:失访失访失访失访(withdrawal):(withdrawal):失去联系,如信访无回音、电话采失去联系,如信访无回音、电话采失去联系,如信访无回音、电话采失去联系,如信访无回音、电话采访不应答、上门采访找不到人、搬迁没留地址等访不应答、上门采访找不到人、搬迁没留地址等访不应答、上门采访找不到人、搬迁没留地址等访不应答、上门采访找不到人、搬迁没留地址等 退出退出退出退出:死于非研究因素或非处理因素而退出研究,如死死于非研究因素或非处理因
16、素而退出研究,如死死于非研究因素或非处理因素而退出研究,如死死于非研究因素或非处理因素而退出研究,如死于意外或其他疾病于意外或其他疾病于意外或其他疾病于意外或其他疾病 终止终止终止终止:设计时规定的研究时限已到而终止观察,但研究设计时规定的研究时限已到而终止观察,但研究设计时规定的研究时限已到而终止观察,但研究设计时规定的研究时限已到而终止观察,但研究对象仍然存活对象仍然存活对象仍然存活对象仍然存活2024/5/24 周五周五生存分析与生存分析与Cox回归回归161.1.基本概念基本概念基本概念基本概念完全数据提供了观察对象确切的生存时间,是生存分析完全数据提供了观察对象确切的生存时间,是生存
17、分析完全数据提供了观察对象确切的生存时间,是生存分析完全数据提供了观察对象确切的生存时间,是生存分析的主要依据;的主要依据;的主要依据;的主要依据;截尾数据仅提供了部分信息,研究者并不知道观察对象截尾数据仅提供了部分信息,研究者并不知道观察对象截尾数据仅提供了部分信息,研究者并不知道观察对象截尾数据仅提供了部分信息,研究者并不知道观察对象确切的生存时间。截尾数据太多会影响生存分析的效果确切的生存时间。截尾数据太多会影响生存分析的效果确切的生存时间。截尾数据太多会影响生存分析的效果确切的生存时间。截尾数据太多会影响生存分析的效果那么截尾数据能不能删除?那么截尾数据能不能删除?那么截尾数据能不能删
18、除?那么截尾数据能不能删除?2024/5/24 周五周五生存分析与生存分析与Cox回归回归171.1.基本概念基本概念基本概念基本概念 对生存资料的两种错误分析对生存资料的两种错误分析对生存资料的两种错误分析对生存资料的两种错误分析抛弃抛弃抛弃抛弃截尾截尾截尾截尾数据,只考虑确切数据数据,只考虑确切数据数据,只考虑确切数据数据,只考虑确切数据 损失样本含量、损失了信息,截尾数据提供部分信息,损失样本含量、损失了信息,截尾数据提供部分信息,损失样本含量、损失了信息,截尾数据提供部分信息,损失样本含量、损失了信息,截尾数据提供部分信息,说明在某时刻之前仍存活说明在某时刻之前仍存活说明在某时刻之前仍
19、存活说明在某时刻之前仍存活将将将将截尾截尾截尾截尾数据当作确切数据处理数据当作确切数据处理数据当作确切数据处理数据当作确切数据处理 低估了生存时间的平均水平,截尾数据中存在生存时低估了生存时间的平均水平,截尾数据中存在生存时低估了生存时间的平均水平,截尾数据中存在生存时低估了生存时间的平均水平,截尾数据中存在生存时间较长的数据,如果损失,会使结果产生偏性间较长的数据,如果损失,会使结果产生偏性间较长的数据,如果损失,会使结果产生偏性间较长的数据,如果损失,会使结果产生偏性2024/5/24 周五周五生存分析与生存分析与Cox回归回归181.1.基本概念基本概念基本概念基本概念对截尾数据进行分析
20、是生存分析的重要特点,在生存分对截尾数据进行分析是生存分析的重要特点,在生存分对截尾数据进行分析是生存分析的重要特点,在生存分对截尾数据进行分析是生存分析的重要特点,在生存分析中,结局变量常以析中,结局变量常以析中,结局变量常以析中,结局变量常以1 1表示出现结局,表示出现结局,表示出现结局,表示出现结局,0 0表示截尾。表示截尾。表示截尾。表示截尾。应变量有应变量有应变量有应变量有2 2个个个个:生存时间生存时间生存时间生存时间 t t 和结局变量和结局变量和结局变量和结局变量(0-1)(0-1)2024/5/24 周五周五生存分析与生存分析与Cox回归回归192.2.生存资料的特点生存资料
21、的特点生存资料的特点生存资料的特点 蕴涵有结局和时间两个方面的信息;蕴涵有结局和时间两个方面的信息;蕴涵有结局和时间两个方面的信息;蕴涵有结局和时间两个方面的信息;结局为两分类互斥事件;结局为两分类互斥事件;结局为两分类互斥事件;结局为两分类互斥事件;一般是通过随访收集得到,随访观察往往是从某统一一般是通过随访收集得到,随访观察往往是从某统一一般是通过随访收集得到,随访观察往往是从某统一一般是通过随访收集得到,随访观察往往是从某统一时间点时间点时间点时间点(如确诊、入院或实施手术等某种处理措施后如确诊、入院或实施手术等某种处理措施后如确诊、入院或实施手术等某种处理措施后如确诊、入院或实施手术等
22、某种处理措施后)开开开开始,观察到某规定时间点截止;始,观察到某规定时间点截止;始,观察到某规定时间点截止;始,观察到某规定时间点截止;常因失访等原因造成某些研究对象的生存时间数据不常因失访等原因造成某些研究对象的生存时间数据不常因失访等原因造成某些研究对象的生存时间数据不常因失访等原因造成某些研究对象的生存时间数据不完整;完整;完整;完整;分布类型复杂,需用生存分析分布类型复杂,需用生存分析分布类型复杂,需用生存分析分布类型复杂,需用生存分析2024/5/24 周五周五生存分析与生存分析与Cox回归回归203.3.生存资料的数据形式生存资料的数据形式生存资料的数据形式生存资料的数据形式202
23、4/5/24 周五周五生存分析与生存分析与Cox回归回归214.4.生存分析的基本内容生存分析的基本内容生存分析的基本内容生存分析的基本内容 描述生存过程:研究生存时间的分布特点,估计生描述生存过程:研究生存时间的分布特点,估计生描述生存过程:研究生存时间的分布特点,估计生描述生存过程:研究生存时间的分布特点,估计生存率及其标准误、绘制生存曲线等。存率及其标准误、绘制生存曲线等。存率及其标准误、绘制生存曲线等。存率及其标准误、绘制生存曲线等。例如,根据乳腺癌患者手术后的生存资料,可以估计例如,根据乳腺癌患者手术后的生存资料,可以估计例如,根据乳腺癌患者手术后的生存资料,可以估计例如,根据乳腺癌
24、患者手术后的生存资料,可以估计不同时间点的生存率及其标准误,如不同时间点的生存率及其标准误,如不同时间点的生存率及其标准误,如不同时间点的生存率及其标准误,如1 1年生存率、年生存率、年生存率、年生存率、3 3年生年生年生年生存率、存率、存率、存率、5 5年生存率等,还可以绘制生存曲线,观察乳腺年生存率等,还可以绘制生存曲线,观察乳腺年生存率等,还可以绘制生存曲线,观察乳腺年生存率等,还可以绘制生存曲线,观察乳腺癌患者手术后的生存过程。癌患者手术后的生存过程。癌患者手术后的生存过程。癌患者手术后的生存过程。常用方法有乘积极限法和寿命表法。常用方法有乘积极限法和寿命表法。常用方法有乘积极限法和寿
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