第三章-酶-本.ppt
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1、概念:是由活细胞合成的,对其特异底概念:是由活细胞合成的,对其特异底物起高效催化作用的生物催化剂,主要物起高效催化作用的生物催化剂,主要是蛋白质。是蛋白质。核酶核酶(ribozyme):具有高效、特异催化作具有高效、特异催化作用的核酸用的核酸(RNA和和DNA)。自然界中主要作自然界中主要作用于核酸。用于核酸。第三章第三章 酶(酶(enzymeenzyme)概概述述一、什么是酶?一、什么是酶?酶学研究简史酶学研究简史公元前两千多年,我国已有酿酒记载。公元前两千多年,我国已有酿酒记载。一一百百余余年年前前,Pasteur认认为为发发酵酵是是酵酵母母细细胞胞生生命命活活动动的的结果。结果。1877
2、年,年,Kuhne首次提出首次提出Enzyme一词。一词。1897年年,Buchner兄兄弟弟用用不不含含细细胞胞的的酵酵母母提提取取液液,实实现现了发酵。了发酵。1926年,年,Sumner首次从刀豆中提纯出脲酶结晶。首次从刀豆中提纯出脲酶结晶。1982年年,Cech首首次次发发现现RNA也也具具有有酶酶的的催催化化活活性性,提提出核酶出核酶(ribozyme)的概念的概念。1995年年,JackW.Szostak研研究究室室首首先先报报道道了了具具有有DNA连连接酶活性接酶活性DNA片段,称为片段,称为脱氧核酶脱氧核酶(deoxyribozyme)。1930年彻底弄清了发酵的代谢途径。年彻
3、底弄清了发酵的代谢途径。葡萄糖葡萄糖乙醇乙醇CO211个化学反应个化学反应11种酶种酶1897年年Buchner兄弟两人发现磨碎兄弟两人发现磨碎的酵母细胞也可引起发酵,说明引起发的酵母细胞也可引起发酵,说明引起发酵的物质存在与酵母细胞内。产生了酶酵的物质存在与酵母细胞内。产生了酶的科学术语(的科学术语(enzyme=en+zyme)。)。酶促反应酶促反应:由酶催化的化学反应。:由酶催化的化学反应。脲酶脲酶尿素尿素 2NH2NH3 3 COCO2 2 底物底物 H H2 2O O 产物产物 底物(底物(substrate):指酶所催化的指酶所催化的物质,物质,又称又称作用物。作用物。产物产物:指
4、反应生成的物质。:指反应生成的物质。酶活性:酶活性:酶催化化学反应的能力。酶催化化学反应的能力。第一节第一节 酶的分子结构与功能酶的分子结构与功能The Molecular Structure and Function of Enzyme 酶是球状蛋白质,构象可变性较酶是球状蛋白质,构象可变性较大,大,按其分子结构分为:按其分子结构分为:酶的蛋白质结构特点酶的蛋白质结构特点按酶的分子结构分为按酶的分子结构分为:单体酶单体酶(monomericenzyme):仅具有三级结仅具有三级结构的酶。构的酶。寡聚酶寡聚酶(oligomericenzyme):由多个相同或不由多个相同或不同亚基以非共价键连接
5、组成的酶。同亚基以非共价键连接组成的酶。多酶体系多酶体系(multienzymesystem):由几种不同由几种不同功能的酶彼此聚合形成的多酶复合物。功能的酶彼此聚合形成的多酶复合物。多功能酶多功能酶(multifunctionalenzyme)或串联酶或串联酶(tandemenzyme):一些多酶体系在进化过程一些多酶体系在进化过程中由于基因的融合,多种不同催化功能存在中由于基因的融合,多种不同催化功能存在于一条多肽链中,这类酶称为多功能酶。于一条多肽链中,这类酶称为多功能酶。按酶的分子组成分为:按酶的分子组成分为:单纯酶单纯酶(simpleenzyme):仅由氨基酸残基构成仅由氨基酸残基构
6、成 (只含蛋白质部分只含蛋白质部分)。结合酶结合酶(conjugatedenzyme):属结合蛋白质属结合蛋白质一、酶的分子组成中常含有辅助因子一、酶的分子组成中常含有辅助因子蛋白质部分:酶蛋白蛋白质部分:酶蛋白 (apoenzyme)辅助因子辅助因子(cofactor)金属离子金属离子小分子有机化合物小分子有机化合物全酶全酶(holoenzyme)决定反应的种类和性质决定反应的种类和性质决定反应的特异性决定反应的特异性只有全酶才有催化功能只有全酶才有催化功能辅助因子辅助因子(cofactor)1.金属离子金属离子金属辅助因子金属辅助因子:K+、Na+、Mg+、Fe2+(Fe3+)等等金属酶金
7、属酶:金属离子与酶蛋白:金属离子与酶蛋白结合牢固结合牢固。金属激活酶金属激活酶:本身不含金属离子,但必须:本身不含金属离子,但必须有金属离子的存在才具有活性,与酶蛋白有金属离子的存在才具有活性,与酶蛋白结合松弛结合松弛。小分子有机化合物小分子有机化合物金属离子金属离子1 1)作为酶活性中心的组成部分参与)作为酶活性中心的组成部分参与 催化反应,催化反应,传递电子传递电子 酶酶-FeFe3+3+e e-酶酶-FeFe2+2+2 2)连接酶与底物的桥梁(连接酶与底物的桥梁(MgMg2+2+)3 3)稳定酶蛋白的构象(稳定酶蛋白的构象(ZnZn2+2+)4 4)中和负电荷,降低静电斥力(中和负电荷,
8、降低静电斥力(ZnZn2+2+)金属辅助因子金属辅助因子的作用的作用2)小分子有机化合物小分子有机化合物(常含维生素常含维生素):NAD+、NADP+、FMN、FAD、CoA等等作用:传递电子、质子、或一些化学作用:传递电子、质子、或一些化学基团。基团。辅助因子辅助因子(cofactor)小分子有机化合物小分子有机化合物(常含常含维生素维生素)金属离子金属离子小分子有机化合物在催化中的作用小分子有机化合物在催化中的作用 金属离子多金属离子多为辅为辅基基广义上辅酶包括辅基广义上辅酶包括辅基辅助因子分类辅助因子分类(按其(按其与酶蛋白结合的紧密程度与酶蛋白结合的紧密程度)辅酶辅酶(coenzyme
9、):与酶蛋白结合与酶蛋白结合疏松,可用疏松,可用透析或超滤的透析或超滤的方法除去。方法除去。辅基辅基(prostheticgroup):与酶蛋白结合与酶蛋白结合紧密,不能用紧密,不能用透析或超透析或超滤的方法除去滤的方法除去。必需基团:必需基团:(essentialgroup)酶分子中氨基酸残酶分子中氨基酸残基侧链的化学基团中基侧链的化学基团中,一些与酶活性密切相一些与酶活性密切相关的化学基团关的化学基团。目目录录二、酶的活性中心是酶分子中执二、酶的活性中心是酶分子中执行其催化功能的部位行其催化功能的部位(Activecenter/site)或称活性部位或称活性部位(activesite),指
10、必需基指必需基团在一级结构上可能相距团在一级结构上可能相距很远,但在空间结构上彼很远,但在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空此靠近,组成具有特定空间结构的区域,能与底物间结构的区域,能与底物特异结合并将底物转化为特异结合并将底物转化为产物。产物。酶的活性中心酶的活性中心(activecenter)活性中心内的必需基团活性中心内的必需基团结合基团结合基团(bindinggroup)与底物相结合与底物相结合催化基团催化基团(catalyticgroup)催化底物转变成产物催化底物转变成产物 位于活性中心以外,维持酶活性位于活性中心以外,维持酶活性中心应有的空间构象所必需。中心应有的空间构象所必需。
11、活性中心外的必需基团活性中心外的必需基团底底物物活性中心以外活性中心以外的必需基团的必需基团结合基团结合基团催化基团催化基团活性中心活性中心目目录录溶菌酶的活性中心溶菌酶的活性中心*谷谷氨氨酸酸35和和天天冬冬氨氨酸酸52是是催催化化基团;基团;*色色氨氨酸酸62和和63、天天冬冬氨氨酸酸101和和色色氨氨酸酸108是是结结合基团;合基团;*AF为为底底物物多多糖糖链链的的糖糖基基,位位于于酶酶的的活活性性中中心心形成的裂隙中。形成的裂隙中。三、同工酶是催化相同化学反应三、同工酶是催化相同化学反应但一级结构不同的一组酶但一级结构不同的一组酶概念:指同一种属或同一个体中概念:指同一种属或同一个体
12、中催化相同催化相同的化学反应,而酶蛋白的的化学反应,而酶蛋白的分子结构、理分子结构、理化性质乃至免疫学性质不同的一组化性质乃至免疫学性质不同的一组酶。酶。分布:分布:不同个体的不同组织中;不同个体的不同组织中;同一个体的不同组织中;同一个体的不同组织中;同一细胞的不同亚细胞结构中。同一细胞的不同亚细胞结构中。来源:来源:不同基因编码不同基因编码等位基因编码等位基因编码同一基因转录生成不同同一基因转录生成不同mRNA的的翻译(翻译后修饰性的不在此范翻译(翻译后修饰性的不在此范畴)畴)两种亚基两种亚基:H型(心肌型)、型(心肌型)、M型(骨骼肌型)型(骨骼肌型)种类:种类:LDH1LDH2LDH3
13、LDH4LDH5(H4)(H3M)(H2M2)(H1M3)(M4)分布:分布:心肌心肌肝肝,骨骼肌骨骼肌生理生理利于乳酸利于乳酸利于产利于产意义:氧化供能意义:氧化供能生乳酸生乳酸临床临床检测检测检测检测意义:意义:心肌损害心肌损害肝损害肝损害举例举例1乳酸脱氢酶(乳酸脱氢酶(LDH)LDH1丙酮酸丙酮酸乳酸乳酸LDH5举例举例2肌酸激酶肌酸激酶(creatinekinase,CK)同工酶同工酶B BB BB BMMMM MMCK1(BB)CK2(MB)CK3(MM)脑脑心肌心肌骨骼肌骨骼肌*生理及临床意义:生理及临床意义:在代谢调节上起在代谢调节上起着重要的作用;着重要的作用;用于解释发育过
14、用于解释发育过程中阶段特有的代谢程中阶段特有的代谢特征;特征;同工酶谱的改变同工酶谱的改变有助于对疾病的诊断;有助于对疾病的诊断;同工酶可以作为同工酶可以作为遗传标志,用于遗传遗传标志,用于遗传分析研究。分析研究。心肌梗死和肝病病人血清心肌梗死和肝病病人血清LDHLDH同工酶谱的变化同工酶谱的变化1 1酶酶活活性性心肌梗死酶谱心肌梗死酶谱正常酶谱正常酶谱肝病酶谱肝病酶谱2 23 34 45 5在反应前后没有质和量的变化;在反应前后没有质和量的变化;只能催化热力学允许的化学反应;只能催化热力学允许的化学反应;只能加速可逆反应的进程,只能加速可逆反应的进程,降低反应降低反应的活化能的活化能。而而不
15、改变反应的平衡点。不改变反应的平衡点。酶与一般催化剂的共同点:酶与一般催化剂的共同点:第二节第二节酶的工作原理酶的工作原理TheMechanismofEnzymeAction一、酶促反应的特点一、酶促反应的特点1 1)极高的催化效率)极高的催化效率2 2)高度特异性)高度特异性 3 3)可调节性)可调节性酶的催化效率通常比非催化反应高酶的催化效率通常比非催化反应高1081020倍,倍,比一般催化剂高比一般催化剂高1071013倍。倍。如尿酶催化尿素如尿酶催化尿素水解速度比水解速度比H催化作用快催化作用快71012倍,比无催化倍,比无催化剂时快剂时快1014倍倍酶的催化不需要较高的反应温度。酶的
16、催化不需要较高的反应温度。酶和一般催化剂加速反应的机理都是降低反应酶和一般催化剂加速反应的机理都是降低反应的活化能的活化能(activationenergy)。酶比一般催化。酶比一般催化剂更有效地降低反应的活化能。剂更有效地降低反应的活化能。(一)酶具有极高的催化效率(一)酶具有极高的催化效率酶酶的的催催化化效效率率可可用用酶酶的的转转换换数数(turnovernumber)来来表表示示。酶酶的的转转换换数数是是指指在在酶酶被被底底物物饱饱和和的的条条件件下下,每每个个酶酶分分子子每每秒秒钟将底物转化为产物的分子数。钟将底物转化为产物的分子数。概念:一种酶只作用于一种或一类化概念:一种酶只作用
17、于一种或一类化合物,或一定的化学键,合物,或一定的化学键,催化一定的催化一定的化学反应并产生一定的产物,称。化学反应并产生一定的产物,称。酶的特异性分为酶的特异性分为:1 1)绝对特异性)绝对特异性(absolutespecificity)2 2)相对特异性)相对特异性(relativespecificity)3 3)立体异构特异性)立体异构特异性(stereospecificity)(二)酶的(二)酶的高度特异性高度特异性(专一性专一性,specificity)1 1、绝对特异性绝对特异性:一种酶只能一种酶只能作用于作用于 一种特定结构底物,一种特定结构底物,产生一种反产生一种反应,生成特定
18、结构的产物,称之应,生成特定结构的产物,称之。如脲酶、琥珀酸脱氢酶等。如脲酶、琥珀酸脱氢酶等。2 2、相对特异性:相对特异性:一种酶一种酶作用于一类作用于一类 化合物或一种化学键,化合物或一种化学键,这种不太这种不太 严格的选择性称之严格的选择性称之。蔗糖酶:水解蔗糖和棉子糖中相蔗糖酶:水解蔗糖和棉子糖中相同的糖苷键同的糖苷键磷酸酶:水解各种磷酸酯的酯键磷酸酶:水解各种磷酸酯的酯键胰蛋白酶:水解由胰蛋白酶:水解由LysLys和和ArgArg的羧的羧 基组成的肽键基组成的肽键3 3、立体异构特异性:立体异构特异性:一种酶只一种酶只作作用于立体异构体中的一种,用于立体异构体中的一种,这这种对分子构
19、型的特异性称之。种对分子构型的特异性称之。如乳酸脱氢酶只催化如乳酸脱氢酶只催化L-乳酸脱氢,乳酸脱氢,L-氨基酸氧化酶只作用氨基酸氧化酶只作用L-氨基酸。氨基酸。(三)酶的(三)酶的可调节性可调节性通过改变酶的构象或含量可以通过改变酶的构象或含量可以改变酶的催化能力。改变酶的催化能力。对酶生成与降解量的调节对酶生成与降解量的调节酶催化效力的调节酶催化效力的调节通过改变底物浓度对酶进行调节等通过改变底物浓度对酶进行调节等包括三方面的调节包括三方面的调节:二、酶通过促进底物形成过渡态二、酶通过促进底物形成过渡态而提高反应速率而提高反应速率(一)(一)酶比一般催化剂更有效地降低反应活化能酶比一般催化
20、剂更有效地降低反应活化能酶和一般催化剂一样,加速反应的作酶和一般催化剂一样,加速反应的作用都是通过降低反应的用都是通过降低反应的活化能活化能(activationenergy)实现的。实现的。活化能活化能:底物分子从初态转变到活化底物分子从初态转变到活化态所需的能量态所需的能量。反应总能量改变反应总能量改变 非催化反应活化能非催化反应活化能 酶促反应酶促反应 活化能活化能 一般催化剂催一般催化剂催化反应的活化能化反应的活化能 能能量量反反 应应 过过 程程 底物底物 产物产物 酶促反应活化能的改变酶促反应活化能的改变 (二)酶(二)酶-底物复合物的形成有利于底底物复合物的形成有利于底物转变成过
21、渡态物转变成过渡态 酶底物复合物酶底物复合物E+SE+PES(过渡态过渡态过渡态过渡态)1.诱导契合作用使酶与底物密切结合诱导契合作用使酶与底物密切结合酶与底物相互接近时,其结构相互诱导、酶与底物相互接近时,其结构相互诱导、相互变形和相互适应,进而相互结合。这相互变形和相互适应,进而相互结合。这一过程称为酶一过程称为酶-底物结合的底物结合的诱导契合诱导契合(induced-fit)。目目录录酶的诱导契合动画酶的诱导契合动画羧羧肽肽酶酶的的诱诱导导契契合合模模式式底物底物目目录录2.邻近效应与定向排列使诸底物正确邻近效应与定向排列使诸底物正确定位于酶的活性中心定位于酶的活性中心 酶在反应中将诸底
22、物结合到酶的活性中心,使它酶在反应中将诸底物结合到酶的活性中心,使它们相互接近并形成有利于反应的正确定向关系。们相互接近并形成有利于反应的正确定向关系。这种这种邻近效应邻近效应(proximityeffect)与与定向排列定向排列(orientationarrange)实际上是将分子间的反应变实际上是将分子间的反应变成类似于分子内的反应,从而提高反应速率。成类似于分子内的反应,从而提高反应速率。n邻近效应与定向排列:邻近效应与定向排列:酶的活性中心多是酶分子内部的疏水酶的活性中心多是酶分子内部的疏水“口袋口袋”,酶反应在此疏水环境中进行,使底物分子酶反应在此疏水环境中进行,使底物分子脱溶剂脱溶
23、剂化化(desolvation),排除周围大量水分子对酶和底物,排除周围大量水分子对酶和底物分子中功能基团的干扰性吸引和排斥,防止水化分子中功能基团的干扰性吸引和排斥,防止水化膜的形成,利于底物与酶分子的密切接触和结合。膜的形成,利于底物与酶分子的密切接触和结合。这种现象称为这种现象称为表面效应表面效应(surfaceeffect)。3.表面效应使底物分子去溶剂化表面效应使底物分子去溶剂化(三)酶的催化机制呈多元催化作用(三)酶的催化机制呈多元催化作用1.一般酸一般酸-碱催化作用碱催化作用(generalacid-basecatalysis)2.共价催化作用共价催化作用(covalentcat
24、alysis)3.亲核催化作用亲核催化作用(nucleophiliccatalysis)第三节第三节 酶促反应动力学酶促反应动力学 Kinetics of Enzyme-Catalyzed Reaction 概念:概念:研究各种因素对酶促反应速率研究各种因素对酶促反应速率的影响,并加以定量的阐述。的影响,并加以定量的阐述。n影响因素包括:影响因素包括:酶浓度、底物浓度、酶浓度、底物浓度、pH、温度、抑制剂、激活剂等。温度、抑制剂、激活剂等。酶促反应速度:以一段时间内反应酶促反应速度:以一段时间内反应体系的底物减少量或产物的生成量体系的底物减少量或产物的生成量来表示。来表示。意义:对研究酶的结构
25、与功能的意义:对研究酶的结构与功能的关系、酶在物质代谢中的作用、关系、酶在物质代谢中的作用、药物和毒物的作用机理,以及临药物和毒物的作用机理,以及临床应用都有重要意义。床应用都有重要意义。影响酶促反应速度的因素影响酶促反应速度的因素1 1)底物浓度底物浓度2 2)酶浓度酶浓度3 3)温度温度4 4)PH PH 5 5)抑制剂抑制剂6 6)激活激活剂剂研究一种因素研究一种因素的影响时,其余的影响时,其余各因素均恒定。各因素均恒定。I.单底物、单产物反应单底物、单产物反应II.酶酶促促反反应应速速度度一一般般在在规规定定的的反反应应条条件件下下,用用单单位位时时间间内内底底物物的的消消耗耗量量和和
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