医院病理科分子病理实验室实施专业方案.doc
《医院病理科分子病理实验室实施专业方案.doc》由会员分享,可在线阅读,更多相关《医院病理科分子病理实验室实施专业方案.doc(27页珍藏版)》请在咨信网上搜索。
1、SEEPOO TECH*医院病理科分子病理试验室推荐方案目录第一部分 分子病理概述31.1分子病理诊疗应用范围51.2常见分子病理技术51.3 FISH-荧光原位杂交61.4部分FISH产品对比(厂家提供,仅供参考)71.5实时荧光定量PCR91.6 基因测序10第二部分 分子病理试验室设施和环境11第三部分 病理科试验室质量管理标准12第四部分 分子病理常见检测设备131、荧光显微镜原位杂交图像分析系统132、Leica Bond-Max全自动免疫组化和原位杂交多功效染色机133、罗氏LightCycler 480 模块式高通量实时荧光定量PCR系统144、罗氏BenchMark GX 全自
2、动多功效组织病理检测系统155、Illumina HiSeq 高通量测序仪156、NatureGene TermoBrite 原位杂交仪167、力康HFsafe-1200 Class Type A2 生物安全柜178、Neofuge1600 Healforce 台式高速冷冻大容量离心机18第五部分 分子病理试验室推荐设备型号及预算19方案一 初级配置方案19方案二 专业性配置方案19方案三 科研型配置方案20第六部分 分子病理常见试剂及价格20第七部分 分子病理经济效益分析257.1荧光原位杂交(FISH)检测项目标经济价值257.2 实时荧光定量PCR项目标经济价值27第一部分 分子病理概述
3、病理为医之本 As is our pathology, so is our medicine器官病理学组织细胞病理学临床病理免疫组化分子病理18-19世纪19世纪19世纪中叶取活体病变组织做病检提升病理诊疗正确性20世纪早期诊疗、靶向诊疗20世纪手术切除组织标本病理检测病理学发展过程分子病理学中常见分子生物学技术关键有核酸分子杂交、PCR相关技术、免疫荧光化学、基因芯片和DNA序列分析等。因为分子病理学应用,使得我们对疾病本质认识愈加深化,对于肿瘤诊疗和诊疗也取得很大进展。关键表现在以下多个方面:1、肿瘤易感基因检测:肿瘤遗传相关易感基因检测对于肿瘤高危人群筛检含有实用价值,已明确肿瘤易感基因
4、及其相关肿瘤有Rb1(视网膜母细胞瘤)、WT1(肾母细胞瘤)等。除了检测高危人群易感基因外,有方法也应用于正常人群肿瘤易感性检测,如检测Ret基因突变用于诊疗型多发性内分泌肿瘤,经过分析GST基因型以判定个体暴露于致癌物时致癌危险性等。2、肿瘤相关病毒检测:如HPV病毒和宫颈癌发生有很大关系,经过对HPV病毒检测可起到预防和提早诊疗作用。而目前国际上诊疗HPV感染以DNA检测为主。3、肿瘤早期诊疗:K-ras基因突变在结肠癌、胰腺癌和肺癌等肿瘤中发生率较高。应用细针穿刺活检材料检测胰腺癌第12密码子变突。应用PCR-RFLP方法检测结肠癌患者粪便中Ras基因突变,其检出率和瘤组织中相同,可用于
5、高危人群筛选。4、疑难肿瘤诊疗和分类:传统病理学诊疗关键经过形态学和免疫表型来判定淋巴细胞增生和淋巴细胞性肿瘤,但对对医生经验要求较高,且难度较大。应用RFLP分析免疫球蛋白或T细胞受体基因重排,含有判别诊疗作用,且这种分子病理分型比免疫学分型更为正确。对Bcr区基因重排检测,可对慢性粒细胞性白血病和急性粒细胞性白血病进行判别诊疗。N-myc和C-myc扩增和表示检测,对判别神经母细胞瘤和神经上皮瘤含有应用价值,因前者N-myc显著扩增,以后者则为C-myc显著扩增。 5、肿瘤预后监测:利用癌症患者全基因序列开发出个性化血液检测方法有利于医生调整癌症患者诊疗方案,能够监测癌症诊疗后情况和发觉癌
6、症是否复发。6、为肿瘤个体化和预见性诊疗提供依据:肿瘤在发生、发展不一样时期,可能包含不一样基因不一样改变形式,而这种改变和肿瘤临床诊疗敏感性亲密相关,如能在分子水平对肿瘤基因改变提供指标,对肿瘤个体化和预见性诊疗含有指导意义。如在90%胰腺癌、50%结肠癌、30%非小细胞肺癌中存在Ras基因激活,50%左右肿瘤有P53基因不一样形式突变,这些基因异常,使肿瘤对一些放疗或化疗方法含有抵御性,如能从基因水平上改变异常基因状态,则可提升放、化疗敏感性。 7、肿瘤预后判定:肿瘤基因突变、扩增及过表示等改变常和肿瘤预后亲密相关。如HER2基因扩增和乳腺癌发生发展及临床预后亲密相关, HER2阳性表示提
7、醒预后不良,可经过荧光原位杂交(FISH)技术进行检测,配合术后诊疗,指导临床用药。组织病理学诊疗免疫病理学诊疗分子病理学诊疗病理学诊疗及判别诊疗肿瘤“个体化”靶向诊疗断药品疗效评价临床预后评定及估计1.1分子病理诊疗应用范围n 人类遗传病基因诊疗和产前诊疗 n 肿瘤分子靶向诊疗 n 明确感染性疾病病源体(细胞、真菌、病毒) n 多基因病研究 n 组织器官移植配型 n 辅助病理诊疗 n 法医学 n 性别判定 n 基础研究经过PCR技术确定Ig和TCR基因是否发生重排,判定淋巴造血系统疾病良恶性。FISH法检测乳腺癌her-2基因是否发生扩增,指导临床靶向药品(赫赛汀)诊疗。FISH法检测滑膜肉
8、瘤SYT基因是否发生易位,帮助临床诊疗。经过对结直肠癌KRAS基因突变测序分析,指导靶向用药(爱比妥)。HPV多亚型检测,提醒宫颈癌发病风险。肺癌分子靶向诊疗 EGFR酪氨酸激酶抑制剂:吉非替尼(gefitinib, 商品名Iressa) 、埃罗替尼 (Erlotinib, 商品名Tarceva)检测HER2状态临床价值胃癌靶向诊疗患者筛选、疗效估计 1.2常见分子病理技术免疫组织化学(IHC)技术检测蛋白 分子原位杂交DNA,RNA 荧光原位杂交(FISH)技术DNA,RNA多聚酶链式反应PCR技术DNA,RNA 荧光定量PCRDNA,RNADNA测序技术DNA突变 生物芯片技术DNA,RN
9、A,蛋白质等DNA印迹(Southern blot)微卫星不稳定检测(MSI) 医院病理科开展分子病理试验项目,通常从实用出发,二级医院关键开展荧光原位杂交(FISH)项目,三级医院关键开展荧光原位杂交(FISH)、荧光定量PCR项目,有条件三级医院能够开展DNA基因测序项目。1.3 FISH-荧光原位杂交FISH技术是一个经过荧光标识DNA探针和细胞核内DNA靶序列杂交,在荧光显微镜下能原位显示细胞核内杂交信号分子细胞遗传学技术。FISH技术检测基因扩增正确性比其它检测技术高,能够避免因为染色体多体而展现假阳性,被誉为“金标准”。试验步骤 FISH样本制备-探针制备-探针标识-杂交-(染色体
10、显带)-荧光显微镜检测-结果分析FISH优点1.荧光探针商业化、采购方便、保留安全。2.试验周期短、特异性好、定位正确。3.可定位1KBDNA序列,灵敏度高4.一次染色可获取24种不一样颜色染色体,对于隐匿性缺失、异位诊疗正确。FISH技术在医院利用 一切和染色体相关科室。尤其是病理科、血液科、妇产科、生殖中心(产前诊疗、植入前诊疗)等。现在应用于临床检测FISH基因探针有靠近于一百种。在美国,FISH探针已被FDA列为“特异性分析试剂”,不需同意即可用于临床医学检测。所以,FISH检测在国外应用很广泛和快速。如Vysis、Cytocell等企业,其产品已遍布全球,但其价格较贵,严重阻碍了在中
11、国中国推广。中国厂家,如金菩嘉和广州安必平,多年来发展快速,品种覆盖范围较广,且产品质量确保、性价比高。而且,更为有利是,中国企业供货快速立即、售后服务好。因为中国厂家崛起,多年来中国医院开展FISH检测速度大大加紧。FISH技术试验室基础要求试验室环境:样本准备区、暗室(10-15平米左右);试验设备:荧光显微镜和荧光成像分析系统、水浴锅、原位杂交仪、冰箱、离心机、恒温箱办公设备:电脑、打印机试验耗材:FISH探针,进口如雅培、罗氏 细胞类探针:诸如血液病类,如白血病、淋巴瘤、骨髓瘤等。其次,产前诊疗和产后筛查类;实体肿瘤类探针:病理科在检测乳腺癌、子宫颈癌、膀胱癌、肺癌、宫颈癌、软组织肉瘤
12、、前列腺癌、甲状腺癌等方面。技术人员:1人1.4部分FISH产品对比(厂家提供,仅供参考)品牌比较广州安必平金菩嘉雅培(Vysis)探针种类覆盖70种肿瘤探针,品种齐全,覆盖了实体瘤及血液疾病。约40种,部分肿瘤没有覆盖。覆盖70种肿瘤探针,品种齐全,覆盖了实体瘤及血液疾病。探针质量用多个克隆标识探针,信号灵敏,背景低,质量和国外相当。实体瘤探针质量和国外相当,但血液病探针信号不佳。探针信号灵敏,背景低,质量好。价格因为有自己研发团体,探针全部为自产,成本较低,含有强大价格竞争力,本企业出现也打破了中国企业一家独大垄断。价格比雅培低,但高于安必平。因为异国操作,运行成本高,价格高。操作便利性即
13、用型探针:探针溶液已包含杂交液组分,可直接点样杂交,无需杂交前溶解探针和混匀探针及杂交液,方便操作和降低犯错。探针和杂交液分开,杂交前需在黑暗环境中混合二者,操作不变、轻易犯错。探针和杂交液分开,杂交前需在黑暗环境中混合二者,操作不变、轻易犯错。辅助试剂配送FISH所需常规试剂(蛋白酶K或胃蛋白酶、NP-40、多聚甲醛、20SSC等),节省用户采购时间及成本。搭配蛋白酶K一起销售。搭配蛋白酶K、NP-40等一起销售。荧光显微系统配置从用户出发,帮用户选择性价比高荧光显微镜及图像分析软件,操作便利,性价比高。满足要求,但价格较高。满足要求,但价格较高,且用户可能需自己配置系统。显微镜明场观察配相
14、差功效,可镜下仔细观察蛋白酶消化状态,对小体积样本及珍贵样本处理尤其有效,避免消化不佳造成杂交结果不好。不配相差功效。不配相差功效。标配滤块对新用户标配四种颜色荧光滤块(DAPI、绿、红、青),可同时满足实体瘤及产前诊疗。只标配三种颜色滤块(DAPI、绿、红),如需开展产前诊疗话用户还要额外购置青色滤块。只标配三种颜色滤块(DAPI、绿、红);如需开展产前诊疗话用户还要额外购置青色滤块,且需用到金色滤块(轻易出现窜色),滤块配置要求太高。检测靶标因为标配了四种滤块,可同时检测三个靶标(绿红青),临床检测效率高、能降低试剂成本、且能应用于多靶标检测科研课题。只有两个靶标试剂(绿红),靶向选择及组
15、合受限。有同时检测三个靶标试剂,但因为不是标配,应用受限。图像分析软件有自主研发图像分析软件,降低用户采购成本。外购。外购。品种设计因为全部探针全部为自主研发,可为用户灵活设计产品探针组成,方便临床、科研充足使用及降低试剂成本探针不能依据用户需求进行调整,可能存在试剂成本较高风险。探针不能依据用户需求进行调整,可能存在试剂成本较高风险。特色产品能设计多个“二合一”探针组合;15种微缺失探针(用于流产原因筛查及其它少见综合症);只有部分基因探针。不能依据用户需求设计“二合一”探针。中国SFDA证书两个产品取得注册受理号,立即取得注册证书。多个产品取得注册证书。两个产品取得注册证书。地理位置在广州
16、,华南地域用户地理位置近,送货及服务立即到位。在北京,华南地域服务不便。在国外,中国虽有代理,但售后服务及技术支持不能最快反应。平台支持有多年其它产品网络支持,如病理科中液基细胞学平台,和用户建立了多年来良好关系。产品单一,只有FISH试剂,设备、人员投入高。有其它试剂,但病理科中只有FISH,无其它平台支持。售后服务借助于广泛液基细胞学网络及合作企业达安基因全国网络,售后服务快速周到。售后服务网络单一,售后服务风险较高。售后服务网络单一,售后服务风险较高。优势资源和达安基因合资,充足利用全国广泛销售及技术支持资源。特殊资源有自己学术关键期刊分子诊疗和诊疗,方便用户课题研究。无无1.5实时荧光
17、定量PCR实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最终经过标准曲线对未知模板进行定量分析方法。临床疾病诊疗:各型肝炎、艾滋病、禽流感、结核、性病等传染病诊疗和疗效评价;地中海贫血、血友病、性别发育异常、智力低下综合症、胎儿畸形等优生优育检测;肿瘤标志物及瘤基因检测实现肿瘤病诊疗;遗传基因检测实现遗传病诊疗。实时荧光定量PCR分子病理诊疗应用 绝对定量(Absolute Quantification) 病原体检测(HiV,HBV,结核杆菌,H1N1等) 基因表示研究(白血病融合基因表示检测) 相对定量(Relative Quantifi
18、cation) 肿瘤组织中特定基因表示(EGFR,VEGFR,BRCA1&2,ERCC1&2,RRM1) 肿瘤Bio-Marker特定miRNA检测1900多个试剂盒 CNV研究超出160万个TaqMan Copy Numer Assay 药品疗效考评 突变分型(Allelic Discrimination) 基因突变分析-肿瘤个体化医疗 SNP研究2600 个药品代谢试剂盒,个体化医疗 物种判定、菌株判定 阴阳性检验(Plus/Minus with IPC) 稀有突变检测(早期肿瘤诊疗:外周血痕量肿瘤细胞等荧光定量PCR显著优点 (1)、能够进行正确定量检测,可适适用于基因诊疗多种疾病; (
19、2)、定量范围极宽,样品无需做梯度稀释; (3)、特异性更强,克服了假阳性关键起源; (4)、操作快速,无需PCR后处理; (5)、技术简单,易于学习和掌握; (6)、安全,对操作员和环境全部无危害。 (7)、易于进行电脑化操作和数据管理,有利于医院现代化建设。实时荧光定量PCR检测肿瘤相关项目 CEA mRNA、 AFP mRNA、uPA mRNA、CK19 mRNA、CK20 mRNA、 MDRI mRNA。1.6 基因测序DNA 测序技术关键依据 Sanger 双脱氧链终止法。以 DNA 单链为模板,在特定条件下,用特异引物在测序级 DNA 聚合酶作用下,依据碱基互补配对标准,不停将 4
20、 种脱氧核糖核苷酸 (dNTP) 加到引物 3- 羟基末端并使引物链得到延伸。将测序结果用DNA sequencing analysis 5.1软件自动分析原始测序数据,获取测序电泳图和序列图。临床基因测序检测对病理科形态诊疗金标准含金量提升和分子病理技术开发及经济效益改善有现实意义。对于可疑癌前病变患者能够明确其病变标本是否真正含有候选基因突变,以解除大量由免疫组化标识癌基因阳性患者心理恐慌和经济负担。对癌症家族有血缘关系亲属检测相关癌基因突变或多态性,含有亚健康诊疗和体检意义。第二部分 分子病理试验室设施和环境1、布局合理、试验室各区域划分;2、水电、照明、通风符合试验室基础要求;3、消防
21、设施齐全、消防通道通畅;4、石蜡组织、DNA样本存放;5、试验室统计、操作手册等文件存放;6、试验室耗材、试剂存放;7、安装生物安全防护设施;8、废弃物处理9、试验室清洁和日常消毒、并有相关统计其中:PCR试验环境要求明确分区,通常分为4个工作区;各区独立,互不相通;设置缓冲间,设置传输窗;单一方向FISH试验环境要求:需要避光独立暗室,专门荧光显微镜观察室第三部分 病理科试验室质量管理标准1、卫生部【】31号文件病理科建设和管理指南(试行)2、6月1日实施医疗机构临床试验室管理措施3、全国各省市相关临床病理专业质量检验及评价标准4、美国CAP认可标准5、欧洲NordiQC认证标准6、国际标准
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 医院 理科 分子 病理 实验室 实施 专业 方案
1、咨信平台为文档C2C交易模式,即用户上传的文档直接被用户下载,收益归上传人(含作者)所有;本站仅是提供信息存储空间和展示预览,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对上载内容不做任何修改或编辑。所展示的作品文档包括内容和图片全部来源于网络用户和作者上传投稿,我们不确定上传用户享有完全著作权,根据《信息网络传播权保护条例》,如果侵犯了您的版权、权益或隐私,请联系我们,核实后会尽快下架及时删除,并可随时和客服了解处理情况,尊重保护知识产权我们共同努力。
2、文档的总页数、文档格式和文档大小以系统显示为准(内容中显示的页数不一定正确),网站客服只以系统显示的页数、文件格式、文档大小作为仲裁依据,个别因单元格分列造成显示页码不一将协商解决,平台无法对文档的真实性、完整性、权威性、准确性、专业性及其观点立场做任何保证或承诺,下载前须认真查看,确认无误后再购买,务必慎重购买;若有违法违纪将进行移交司法处理,若涉侵权平台将进行基本处罚并下架。
3、本站所有内容均由用户上传,付费前请自行鉴别,如您付费,意味着您已接受本站规则且自行承担风险,本站不进行额外附加服务,虚拟产品一经售出概不退款(未进行购买下载可退充值款),文档一经付费(服务费)、不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
4、如你看到网页展示的文档有www.zixin.com.cn水印,是因预览和防盗链等技术需要对页面进行转换压缩成图而已,我们并不对上传的文档进行任何编辑或修改,文档下载后都不会有水印标识(原文档上传前个别存留的除外),下载后原文更清晰;试题试卷类文档,如果标题没有明确说明有答案则都视为没有答案,请知晓;PPT和DOC文档可被视为“模板”,允许上传人保留章节、目录结构的情况下删减部份的内容;PDF文档不管是原文档转换或图片扫描而得,本站不作要求视为允许,下载前自行私信或留言给上传者【快乐****生活】。
5、本文档所展示的图片、画像、字体、音乐的版权可能需版权方额外授权,请谨慎使用;网站提供的党政主题相关内容(国旗、国徽、党徽--等)目的在于配合国家政策宣传,仅限个人学习分享使用,禁止用于任何广告和商用目的。
6、文档遇到问题,请及时私信或留言给本站上传会员【快乐****生活】,需本站解决可联系【 微信客服】、【 QQ客服】,若有其他问题请点击或扫码反馈【 服务填表】;文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“【 版权申诉】”(推荐),意见反馈和侵权处理邮箱:1219186828@qq.com;也可以拔打客服电话:4008-655-100;投诉/维权电话:4009-655-100。