基于网络药理学数据挖掘探讨中药复方治疗前列腺癌的作用机制.pdf
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1、泌尿外科杂志(电子版)年期?临床研究?基于网络药理学数据挖掘探讨中药复方治疗前列腺癌的作用机制盛梦钰,叶和松朱旭东,沈场,杨明(南京中医药大学 第二附属医院泌尿外科,江苏南京)摘要:目的基于网络药理学数据挖掘临床研究中运用的中药复方,探讨其治疗前列腺癌(,)的作用机制。方法基于网络药理学研究的临床治疗中运用的中药复方活性成分、药物作用靶点集作用通路。通过中 国知网(,)筛选治疗复方;通过中医传承计算平台(,)统计分析药物;通过美国国家生物信息技术中心的髙通量基因表达(,)数据库筛选前列腺癌的疾病靶点;通 过中药系统 药理学数据 库与分析平台(,)数据筛选治疗药物。进而对这 些耙点进行基因本体论
2、(,)富集和京都基因和基因组编码(,)通路富集分析,从而揭示 现阶段中医药治疗的作用机制。结果共纳入味药药次,其中 出现次及以上的共味,其中黄芪、熟地黄、姜 黄出现频次排名前三位。从个活性成分中找到对应病变的 个靶点富集分析得到个生物过程(,)、个细胞组成(,)、个分子功能(,)富集通路,富集分析得到最显著富集的 个通路。结 论网络药理学为阐明 中药复发治疗作用机制提供了新方法,有助于中医药现代化研究的开展。关键词:网络药理学;中药;前列腺癌;作用机制;通路中 图分类号:文献标识码:文章编 号:():,:,:()()()(),()(),通信作者:叶 和松,:?泌尿外科杂志(电子 版)年期,()
3、(),(),(),:;前列腺癌(,)是一种常见的男性肿瘤,在全球范围内影响着数以百万计的男性。年全球最新癌症负担数据显示,在男性新发癌症居第二位,是仅次于肺癌的男性第二大常见癌症,占全球男性新诊断癌症的(中国为)。年诊断出超过万例新病例,全球与相关的死亡人数超过 ,使其成为男性与癌症相关的死亡的主要原因之一。因此,亟需寻找经济有效的治疗方法。在中医古籍考证中缺乏对的早期认识,但在的综合治疗过程中,中医药的地位日益显著。根据其症状描述与临床表现多归于“癃闭”、“淋证”、“血尿”、“癥瘕”等疾病的范畴,其公认的病因病机主要以本虚标实,虚实夹杂,以虚为主。大量临床研究发现,运用中医药治疗,特别是中晚
4、期能够有效提高患者生活质量,延长生存期。本文旨在通过运用生信分析手段探索近十年中医药汤药、方剂对的治疗机制,探讨中医药临床治疗的作用机制,为的中医药提供思路参考。材料与方法药物的筛选检 索中国知网(,)(:)年至今收录的有关中医药治疗的有关临床研究,收集其中的中药复方。采用专业检索,检索字段为:(前列腺癌前列腺 肿 瘤)(中医中医药中药方剂汤方)(临床研究经验医案案例报告),逐篇阅读,人工筛选出合格的文献及相关引文。纳人标准为实验室检查有明确诊断为;预计生存期大于个月的临床研究文献,并有明确的诊断依据;有明确的方剂组成;将筛选出的中药复方按要求格式导人中医传承计算平台(,),分析药物功效及组方
5、规则分析。关键基因筛选利用高通量基因表达(,)数据库(:),筛选组织芯片,检索细节()为:(“”)(),通过人工筛选出符合要求的样本。通过构建一个基因与样品对应的分组表达文件矩阵。运用对数据进行差异分析(按筛选)。药物活性化合物的筛选基于中药系统药理学数据库与分析平台(,)对筛选出的药物进行成分检索,对筛选出符合条件的成分作为潜在活性化合物进行分析。,通过计算化合物的分子药代动力学参数,设置筛选体系的阈值为生物利用度(,)、类药性(,),获得候选作用靶点。拓扑关系 网络构建取差异靶点 与药物作用靶点两者交集,确定药物作用于的核心靶点。运用软件构建复方中药调控网络,说明候选化合物 和潜在 靶点之
6、间的关系。并运用、软件进行 拓扑关系网络构建,通过确定连接节点数目多或相互作用 紧密的靶点,构建互作网络并运用应用进行拓扑分析。通路富集分析核心靶点集进行基因本体论(,)富集和京都基因和基因组编码(,)富集分析,从生物过程(,)、个细胞组成(,)、个分子功能(,)三个方面定义潜在基因功能及靶点的功能。并校正从而得到 集合和通路集合基于通路靶点网络整合“通路”。结果复方中药物基本特征统计与规则分析共泌尿外 科杂志(电子版)年期?集分析(,)柱状图数据 库检索 结果罌圍:;篇:團备一:差异基因热图 富图纳入味药药次,其中 出现次及以上的共味,出现频次排名前三位的药物为黄芪(次)、熟地黄(次)、姜黄
7、(次)(表);复方中药物功效以补虚类为主,其次为清热类、活血化瘀类、利水渗湿类;药物归经以脾、肺、肝、肾居多;常用药物组合中频次最高的药物组合为“熟地黄一姜黄、黄芪一党参、黄苠一白术”为次(表)。表复 方药物频次 统计比较序号中药名分类频次黄芪补气药熟地黄补血药姜黄活血化白花蛇舌草清热药茯苳利水渗湿药补骨脂补阳药白术补气药党参补气药山药补气药炙甘草补气药活性化合物的筛选与鉴定从中药复方中的味药材中分离得到 个潜在活性化合物,用于进一 表复 方药物核心 组合(支持度)频次统计序号药对频次熟地黄,姜黄黄芪,党参黄芪,白术熟地黄,茯菩茯荟,山药熟地黄,补骨脂黄芪,茯苓茯苳,白术姜黄,补骨脂黄芪,白花
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