基于高通量测序解析UHT灭菌乳品质劣变关联微生物.pdf
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1、20235139基于高通量测序解析 UHT 灭菌乳品质劣变关联微生物娄梦雪1,2,贺凯茹1,2,韩琦1,3,刘晓燕1,2,朴瑜琼1,2,刘至立1,3,臧健4,武俊瑞1,2,3(1.沈阳农业大学食品学院,沈阳 110866;2.辽宁省食品发酵技术工程研究中心,沈阳 110161;3.沈阳市微生物发酵技术创新重点实验室,沈阳 110866;4.沈阳农业大学 分析测试中心,沈阳 110866)摘要:针对超高温灭菌(ultra-high temperature treated,UHT)乳在货架期内出现的脂肪上浮、水乳分离、沉淀等品质劣变问题,利用高通量测序和生物信息学等技术方法,对大型乳企采集的 9
2、份在货架期内品质劣变的 UHT 乳和正常质量的 UHT 乳样品的理化指标、酶活性、微生物菌群进行了分析比较,并通过关联分析解析 UHT 灭菌乳品质劣变的关联微生物。结果表明:品质劣变 UHT 乳在理化指标、酶活性和微生物群分布方面与正常 UHT 乳有明显不同,假单胞杆菌、不动杆菌为品质劣变 UHT 乳中核心功能微生物且均属于常见的嗜冷菌,能够产生耐热酶,这可能是导致 UHT 乳腐败变质的主要原因。本研究为进一步解决 UHT 乳品质劣变问题提供了参考。关键词:超高温灭菌乳;品质劣变;微生物多样性;戴尔福特菌属;假单胞菌属;不动杆菌属中图分类号:TS252.42文献标识码:A文章编号:1001-2
3、230(2023)10-0004-11doi:10.19827/j.issn1001-2230.2023.10.001Analysis of microorganisms associated with quality deterioration of UHTsterilized milk based on High-throughput sequencingLOU Mengxue1,2,HE Kairu1,2,HAN Qi1,3,LIU Xiaoyan1,2,PIAO Yuqiong1,2,LIU Zhili1,3,ZANG Jian4,WU Junrui1,2,3(1.College of
4、 Food Science,Shenyang Agricultural University,Shenyang 110866,China;Liaoning Engineering ResearchCenter of Food Fermentation Technology,Shenyang 110161,China;3.Shenyang Key Laboratory of Microbial Fermen原tation Technology Innovation,Shenyang 110866,China;4.Analytical and Testing Center,Shenyang Agr
5、icultural Univer原sity,Shenyang 110866,China)Abstract:In view of the quality problems of ultra-high temperature treated(UHT)milk,such as fat floating,slight precipitation and water emul原sion separation during the shelf life,high-throughput sequencing and bioinformatics were used to compare and analyz
6、e the quality characteristicsand microbial flora of 9 UHT milk samples with poor quality and normal quality during the shelf life collected by large dairy enterprises,and thecorrelation between them was studied.The results showed that the quality deterioration UHT milk was significantly different fr
7、om the normalUHT milk in terms of physical and chemical indicators,enzyme activity and microbial population distribution.Pseudomonas and Acinetobacter werethe core functional microorganisms in the quality deterioration UHT milk and were common psychrophilic bacteria,which could produce ther原mostable
8、 enzymes,which may be the main cause of the spoilage of UHT milk.This study provides an important theoretical basis for completelysolving the problem of UHT milk quality deterioration.Key words:ultra-high temperature sterilized milk;quality deterioration;microbial diversity;Delftia;Pseudomonas;Acine
9、tobacter0引言超高温灭菌(ultra-high temperature treated,UHT)乳因具有品质高、方便饮用等特点而在我国乳品行业广受欢迎,现已成为人们日常饮食中的重要角色1。目前 UHT 乳货架期虽然能够延长至 6 个月以上,但是某些环节控制不当仍会造成 UHT 乳在货架期内出现一些质量问题,如脂肪上浮、凝块、变味、褐变、坏包等2,影响产品价值甚至危害人体健康。在超高温灭菌乳的长期储存期间,影响其口感和感官质量的主要过程是蛋白质分解、脂肪分解、氧化和美拉德反应3。Caldera 等研究了来自不同食品的 66 个假单胞菌菌株的酶解腐败活性,发现在 UHT 乳中测得的蛋白质分
10、解活性变化很大4。UHT 乳中残留的微生物也与乳品质密切相关,黄卫强等5采用 16S rDNA高通量测序技术比较了 2 个不同品牌 UHT 乳中的微生物多样性,通过对两份 UHT 牛乳样品进行高通量测序分析发现,两份 UHT 牛乳中的生物多样性丰度收稿日期:2023-01-16基金项目:国家自然科学基金面上项目(31871831;32172279);宁夏自治区重点研发计划农业农村领域项目(2022BBF03021);沈阳市科技创新平台项目(21-103-0-14;21-104-0-28)。作者简介:娄梦雪(2000-),女,硕士研究生,研究方向为乳制品。通讯作者:武俊瑞(1977-),男,教授
11、,研究方向为发酵乳制品。Vol.51,No.10 2023(total 395)存在一定的差异,但差异不显著。张敏等6应用高通量测序技术分析了新疆 2 地区的 7 种乳制品,结果表明,牛奶的优势菌门是变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes),优势菌属是假单胞杆菌属(Pseu原domonas)。目前,高通量测序技术已经广泛用于分析生乳及巴氏杀菌乳中微生物群落组成,并用于确定有益和有害细菌的存在7,但研究品质正常 UHT 乳与品质劣变 UHT 乳的微生物多样性差异的研究较少。本研究以某大型乳品企业采集的 9 份在货架期内品质劣变和正常质量的 UHT 乳为研究对象,
12、通过高通量测序和生物信息学等技术方法研究样品乳在质量特征、微生物群谱方面的差异及两者之间的相关性,为探索品质劣变问题产生的原因提供新的见解,并分析与 UHT 乳品质劣变等质量问题相关的核心微生物群。1 材料与方法1.1 材料与试剂UHT 乳来自于同一品牌的某大型乳企。产地 1、产地 2、产地 3 按照相同的工艺生产,每个产地分别采集 3 个批次的样品进行检测分析。产地 1 为正常产品乳(SZ1、SZ2、SZ3)、产地 2(WY1、WY2、WY3)和产地3(QY1、QY2、QY3)在货架期内观察到品质劣变现象,样品形态如图 1 所示。DNA 提取试剂盒,上海美吉生物有限公司;脂肪酶(LPS)活性
13、检测试剂盒,北京索莱宝科技有限公司。1.2 仪器与设备ALC-1100.2H-2050R 型超速冷冻离心机,湖南湘仪公司;2720 型 PCR 扩增仪,南京贝登电子商务有限公司;DYY-6C 型电泳仪,济宁市翰业机械设备有限公司;凝胶成像系统,上海勤翔科学仪器有限公司;电子 pH 计,湖南湘仪公司;Mastersizer 2000 纳米粒径电位分析仪,英国马尔文仪器有限公司;120 乳品综合成分指标分析仪,山东国康电子科技有限公司。1.3 实验方法1.3.1 色差的测定采用 pH 计和色差仪测定 9 份样品 pH 值及色泽,确定其亮度值(L*)、红绿值(a*)、黄蓝值(b*)。样品中的蛋白质、
14、脂肪、非乳脂固体和乳糖采用乳品综合成分指标分析仪进行测定。每个样品都进行 3 次平行测试。1.3.2 酒精阳性乳的测定9 份样品分别取 5 mL,加入 5 mL 70%的酒精。若牛乳产生微细颗粒或絮状凝块,则可判定为酒精阳性乳。反之,则是非阳性乳。试验重复 3 次。1.3.3Zeta 电位的测定9 份样品分别取适当体积于烧杯中,去离子水稀释 1 000 倍,用 0.45 滋m 的微孔滤膜过滤后使用纳米粒径电位分析仪进行 3 次重复测定,取平均值。1.3.4 蛋白酶活性的测定通过福林酚法测定样品中的蛋白酶活性。具体步骤参见杨旭等8研究。UHT 乳中蛋白酶活力为:X=AKL/T式中:X 为样品的蛋
15、白酶活力(U/mL);A 为样品的吸光度;K 为吸光常数;L 为反应试剂的总体积;T为反应时间。1.3.5脂肪酶活性的测定使用脂肪酶活性检测试剂盒测定脂肪酶活力。计算公式:酶活力=x/Tm式中:x 为吸光度;T 为催化反应时间;m 为发酵液稀释倍数。1.3.6微生物学检测1.3.6.1 基因组 DNA 提取将 20 mL UHT 乳置于 20 mL 的离心管中。离心后去除乳脂层,再 12 000 g 离心 20 min 收集菌体沉淀。使用 DNA 提取试剂盒提取 UHT 乳样品中的细菌 DNA,并利用 1%的琼脂糖凝胶电泳进行检测。1.3.6.2PCR 扩增采用细菌 338F 和 806R 通
16、用引物对 16S rDNA的 V3耀V4 可变区进行扩增,PCR 产物利用 2%的琼脂糖凝胶电泳进行检测。1.3.6.3荧光定量电泳及 Miseq 文库构建将 PCR 产物用荧光定量系统进行检测定量,根据每个样品的测序量进行相应比例的混合后,最后采用 Illumina 系统进行文库构建并测序。1.4 数据分析数据采用 SPSS 软件进行处理,P0.05 为差异显著。利用 Majorbio 云平台()将样本的序列数据进行分离,以 97%相似度区分有效 OTU数目。基于 OTU 聚类分析结果,通过 alpha 多样性指数反映微生物群落的丰富度和多样性,包括一系列统计学分析指数 Sobs 和 Sha
17、nnon。同时在 OTU 水平上进行 beta 多样性分析。基于分类学信息,在门和属分类水平上进行群落结构的统计分析,对样本的群落组成进行一系列深入的统计学和可视化分析。最后进行相关的热力图分析。2结果与讨论2.1UHT 乳样品的质量特性分析2.1.1色差值的测定结果利用色差仪对 9 份样品的颜色进行检测分析。其中 L*值表示亮度,L*值越大,代表样品越亮。由图 2可知,与正常 UHT 乳 SZ 相比,WY 和 QY2 亮度均显著性升高(P约0.05),QY1 和 QY3 亮度显著降低。牛乳的 L*值与牛乳的成分组成有关,光线的聚集程度决定牛乳的亮度,酪蛋白和脂肪球的分散则会对其造成图 1 样
18、品形态Research Papers研究报告20235139影响9。由图 3、图 4 可知,品质劣变 UHT 乳的 a*和b*值与正常 UHT 乳的 a*和 b*值有统计学差异(P0.05)。品质劣变 UHT 乳的 a*绝对值明显下降,而 b*值明显上升,说明品质劣变 UHT 乳 WY 和 QY 在颜色上都发生了较大变化,并向黄褐色转变,如图 1。一些研究表明,b*值的增加与美拉德反应有关,它导致了牛乳颜色的变化10。2.1.2 pH 值测定结果由图 5 可知,样品的 pH 值为 6.536.78 之间,处于正常乳所要求的 pH 值(6.46.8)区域内,即样品均符合标准。品质劣变 UHT 乳
19、与正常 UHT 乳相比有统计学差异(P0.05),pH 值都在一定程度上呈现下降趋势。Devi 等11也发现液态配方奶储存期间 pH 值呈下降趋势,推测是因为脂肪与氧气接触产生游离脂肪酸,从而使 pH 值下降。2.1.3 营养成分测定结果通过乳品成分分析仪对 UHT 乳中常规营养成分进行检测,结果如图 6 所示。从图 6 可以看出,品质劣变乳的基础营养物质含量与正常 UHT 乳相比,变化不显著。品质劣变乳的蛋白质和脂肪含量略有下降,推测是乳中存在尚具有一定活性的嗜冷菌能够产生耐热酶类物质,从而分解蛋白质和脂肪,最终影响 UHT 乳品质。图 2 亮度值测定结果图 3 红绿值测定结果图 4 黄蓝值
20、测定结果图 5 样品的 pH 值测定结果图 6 常规营养成分测定结果Research Papers研究报告Vol.51,No.10 2023(total 395)表 3 脂肪酶活性测定结果样品编号脂肪酶活/(U/mL)SZ10.28依0.03cSZ20.27依0.02cdSZ30.25依0.01fWY10.26依0.01deWY20.24依0.02gWY30.28依0.01cQY10.34依0.01aQY20.26依0eQY30.31依0.01b注:不同的上标字母代表有统计学差异(P0.05)。表 2 蛋白酶活性的测定样品编号蛋白酶活/(U/mL)SZ18.494 0依0.0349fSZ29.
21、890 0依0.0533dSZ39.094 0依0.2627eWY113.086 7依0.0882bWY214.378 3依0.1726aWY313.112 7依0.1214bQY19.068 3依0.1926eQY210.67 3依0.3056cQY310.059 7依0.0610d注:不同的上标字母代表有统计学差异(P0.05)。表 1 9 份样品乳的酒精阳性乳结果样品编号酒精阳性乳结果SZ1不是阳性乳SZ2不是阳性乳SZ3不是阳性乳WY1沉淀较多,是阳性乳WY2沉淀较多,是阳性乳WY3沉淀较多,是阳性乳QY1不是阳性乳QY2沉淀较少,是阳性乳QY3不是阳性乳2.1.4 酒精阳性乳测定结果
22、将 70%酒精与 9 份样品 1颐1 混合,出现沉淀即为酒精阳性乳。由表 1 可知,品质劣变乳 WY 和 QY2 均出现酒精阳性乳现象。酒精阳性乳试验是检验蛋白质稳定性的重要指标,目前使用酒精试验主要目的是检测牛乳中蛋白质的热稳定性,而牛乳中的蛋白质 85%为酪蛋白。有研究表明,阳性结果的絮状沉淀物就是酪蛋白胶束的凝集物12,因此酪蛋白含量改变可能是引起品质劣变产品乳产生酒精阳性乳现象的原因。2.1.5 Zeta 电位测定结果表征牛乳体系稳定性的指标之一就是 Zeta 电位,牛乳的体系稳定性与 Zeta 电位的绝对值呈正相关。由图 7 可知,所有样品的 Zeta 电位值均为负数,且与正常 UH
23、T 乳相比,品质劣变乳 WY1、WY2、WY3 和QY2 样品的 Zeta 电位绝对值较低,与正常产品乳具有统计学差异(P约0.05)。推测品质劣变 UHT 乳 Zeta电位绝对值降低,体系稳定性下降的原因是牛乳中乳糖分解产生乳酸,使得乳的酸度增加,从而导致体系电位不稳定。2.1.6 蛋白酶活性测定结果样品中的蛋白酶活性通过福林酚法测定,结果如表 2。品质劣变 UHT 乳 WY 与 QY2 的蛋白酶活性显著高于正常产品乳 SZ(P约0.05)。这表明品质劣变产品乳出现的原因可能与乳中残留的耐热蛋白酶相关,乳中的一些嗜冷菌会产生耐热蛋白酶,耐热酶经 UHT杀菌处理并不能完全失活,而未失活的耐热酶
24、在货架期内分解乳蛋白质,从而造成蛋白沉淀现象。2.1.7 脂肪酶活性测定结果脂肪酶活性由脂肪酶活性检测试剂盒进行测定,结果如表 3。品质劣变乳 WY 和 QY2 与正常产品乳相比不具有显著差异(P跃0.05),而品质劣变乳 QY1 和QY3 的脂肪酶活性显著升高(P0.05)。这可能是由于嗜热菌产生的耐高温脂肪酶分解了牛乳脂肪球膜,并聚集成大分子脂肪球,导致 UHT 乳在货架期内出现脂肪上浮和脂肪氧化等异常现象。2.2 UHT 乳微生物学检测结果2.2.1 细菌 PCR 扩增结果PCR 产物经 2%琼脂糖凝胶电泳检测,检测的电泳图如图 8 所示。由图 8 可知,8 份 UHT 乳样品细菌 16
25、S V3-V4区在 750 bp 处扩增条带明显,可进行后续试验。此外,SZ3 样品 DNA 提取未成功。2.2.2 细菌的稀释曲线从每个样本中随机抽取一定数量的序列,统计该序列所代表的 OTU 数目,从而判断样本测序数据的合理性。由图 9 可知,当样品细菌菌落测序碱基量较小时,图 7 Zeta 电位测定结果图 8 8 份样品乳的 PCR 扩增电泳Research Papers研究报告20235139OTU 数目随着测序碱基量呈抛物线增长趋势迅速增加,当测序量达到 400 左右时,稀释曲线总体趋势增长缓慢并趋于平缓,说明测序数据量合理,序列数基本可以反映出每组样品中的菌群结构,满足了后续生物信
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