生物化学复习重点.doc
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1、生物化学第1章 蛋白质的结构与功能1.蛋白质:是由许多氨基酸通过肽键相连形成的高分子含氮化合物2.蛋白质的主要成分:C、H、O、N、S 含氮量:16% *微量凯式定氮法:蛋白质含量(g)=每克样品含氮克数*6.253.组成人体蛋白质的氨基酸有20种,均属于L-氨基酸(甘氨酸除外) 非极性氨基酸(7)4.氨基酸根据R侧链基团可分为: 不带电的极性氨基酸(8) 极性氨基酸 带负电酸性氨基酸(2) 带正电碱性氨基酸(3)5.非极性疏水性氨基酸:甘氨酸 Gly 异亮氨酸 Ile 丙氨酸 Ala 苯丙氨酸 Phe 缬氨酸 Val 脯氨酸 Pro 亮氨酸 Leu 极性中性氨基酸: 丝氨酸 Ser 天冬酰胺
2、 Asn 苏氨酸 Thr 谷氨酰胺 Gln 酪氨酸 Tyr 半胱氨酸 Cys 色氨酸 Trp 蛋氨酸 Met酸性氨基酸:天冬氨酸 Asp 碱性氨基酸:赖氨酸 Lys 谷氨酸 Glu 精氨酸 Arg (*天谷酸-天上的谷子很酸) 组氨酸 His 6.氨基酸的理化性质: (1)等电点:在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势和程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点pI。 (2)两性解离性:所有氨基酸都含有酸性的-羧基和碱性的-氨基,使氨基酸在酸性条件下与H+ 结合而带正电荷(NH3+),在碱性溶液中释出H+ 带负点荷(COO-),因此氨基酸是一种两性电解
3、质,具有两性解离的特性,其解离方式取决于所处溶液的H+ 浓度,即pH。 *pHpI:阴离子 移向正极 (3)含共轭双键的氨基酸据具有紫外吸收性质 色氨酸、酪氨酸 具有共轭双键 在中性pH条件下,其紫外吸收峰在280nm 可凭此对溶液中蛋白质进行定性定量分析 (4)氨基酸与茚三酮反应生成蓝紫色化合物 在弱酸性溶液中氨基酸与茚三酮水合物共热,生成蓝紫色化合物 此化合物最大吸收峰在波长570nm处 可作为氨基酸定量分析的方法7.肽键:是指由一个氨基酸的-羧基与另一个氨基酸的-氨基脱水缩合形成的酰胺键8.肽:由氨基酸通过肽键缩合相连而形成的化合物9.氨基酸残基:肽链中的氨基酸分子因脱水缩合而基团不全的
4、氨基酸10.谷胱甘肽:由谷氨酸、半胱氨酸、甘氨酸组成 (谷氨酸的-羧基形成肽键)11.蛋白质的一级结构 定义:蛋白质多肽链中氨基酸的排列顺序,20n 化学键:只要是肽键,有些蛋白质还包括二硫键12.蛋白质的二级结构 定义:蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象 类型:-螺旋、-折叠、-转角、有序非重复结构(无规卷曲) 化学键:氢键 *肽单元(肽平面):是蛋白质构象的基本结构单位肽键具有部分双键的性质,参与肽键构成的六个原子被束缚在同一平面上13.二级结构的主要形式 (1)-螺旋 多肽链主链围绕中心轴形成右手螺旋,侧链伸向螺旋外侧
5、 每圈螺旋含3.6个氨基酸,螺距为0.54nm 每个肽键的亚氨氢和第四个肽键的羰基氧形成的氢键保持螺旋稳定,氢键与螺旋长轴基本平行 *每个氨基酸残基沿中心轴上升0.15nm,旋转100,氢键与长轴平行 (2)-折叠 由若干肽段或肽链排列起来所形成的扇面状片层构象,是多肽链主链的另一种有规律的结构单元 相邻两肽键平面间折叠成锯齿状,并构成110夹角,氨基酸残基侧链位于锯齿状结构的上下方 两条以上肽链或一条肽链的若干肽段的锯齿状结构平行排列,两条肽链走向可相同(顺向平行),也可相反(反向平行【更稳定】) 稳定因素是链间肽键的羰基C=O与亚氨基N-H形成的氢键,氢键与螺旋长轴垂直 (3)-转角 多肽
6、链180回折部分形成的一种二级结构 肽链内形成180回折 通常有4个氨基酸残基构成,第一个氨基酸残基与第四个形成氢键 第二个氨基酸残基常为脯氨酸(Pro) (4)有序非重复结构(无规卷曲) 指多肽链主链部分形成的无确定规律的卷曲构象 (5)模体(超二级结构) 蛋白质分子中,若干个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个特殊的空间构象14.蛋白质的三级结构 定义:指整条肽链所有原子在三维空间的整体排布位置,即在二级结构和模体等结构层次的基础上,侧链R基团的相互作用,整条肽链的折叠和盘曲,不包括亚基间的相互作用 化学键:非共价键(次级键)如:疏水键(主要作用力)、离子键(盐键)、氢键、范德华
7、力、(二硫键) *结构域:分子量大的蛋白质可在三级结构层次上形成多个结构较为紧密的独立折叠单位或局部区域,每个区域具有独立的功能 实质:是二级结构的组合体,充当三级结构的构件,每逢结构域分别代表一种功能 *分子伴侣:有些蛋白质被合成以后,自己不能独立形成自由能量最低的立体结构,需要一类蛋白质来帮助折叠,这类蛋白质成为分子伴侣15.蛋白质的四级结构 定义:蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用 作用力:(主要)疏水作用 (其次)氢键、离子键、范德华力。二硫键 *蛋白质的亚基:参与构成蛋白质四级结构的,每条具有完整的三级结构的多肽链16.一级结构中关键部位氨基酸残基改变引起蛋白
8、质功能异常 “分子病”:镰刀形红细胞贫血 病因:基因突变17.肌红蛋白:只具有三级结构的单链蛋白质 血红蛋白:具有四级结构,由4个亚基组成的四聚体18.协同效应:一个亚基与其配体(Hb中的配体为O2)结合后,能影响此寡聚体中另一亚基与配体的结合能力的现象 变构效应:蛋白质与它的配体结合后,空间结构发生改变,从而调节了蛋白质的生物学功能,使它更适合于功能的需要的一类变化19.蛋白质的理化性质 (1)两性电解质:蛋白质分子两端的氨基和羧基及氨基酸残基侧链中的某些基团,在一定pH的溶液中可解离成带负电荷或正电荷的基团,因此蛋白质具有两性解离的性质 (2)等电点:当蛋白质溶液处于某一pH时,蛋白质解离
9、成正、负离子的趋势相等,即所带正、负电荷相等,此时蛋白质成为兼性离子,净电荷为零,此时溶液的pH称为蛋白质的等电点 (3)胶体性质:亲水溶胶的性质 蛋白质属于生物大分子,分子的颗粒为1-100nm,处于胶体颗粒的范围蛋白质胶体稳定的因素 蛋白质分子表面的水化膜和表面电荷是稳定蛋白质亲水溶胶的两个重要因素 (4)空间结构被破坏引起蛋白质变性 变性:在某些物理或化学因素作用下,蛋白质特定的空间构象被破坏,从而导致其理化性质改变和生物活性丧失的现象 复性:若蛋白质变性程度较轻,去除变性因素后,有些蛋白质仍可恢复或部分恢复其原有的构象和功能 (5)芳香族氨基酸使蛋白质具有紫外吸收的性质 含有共轭双键的
10、酪氨酸和色氨酸,在280nm波长处有特征性紫外吸收峰 (6)呈色反应可用于蛋白质的定性和定量 Folin-酚试剂反应:含酚羟基的酪氨酸残基 生成蓝色化合物(钼蓝) 茚三酮反应:-氨基酸 生成蓝紫色化合物双缩脲反应:肽键+硫酸铜(Cu+) 生成紫红色产物20.盐析:在蛋白质溶液中加入大量中性盐使蛋白质从溶液中析出的现象21.电泳:通过带电粒子在电场中泳动而达到分离各种蛋白质的技术第2章 核酸的结构与功能1.组成核酸的元素:C、H、O、N、P(含量较多且恒定)2.核苷酸是核酸的基本单位,可进一步水解产生核苷和磷酸,核苷还可再水解,产生戊糖和含氮碱基3.常见的碱基:(嘌呤碱)鸟嘌呤G、腺嘌呤A (嘧
11、啶碱)胞嘧啶C、尿嘧啶U、胸腺嘧啶T *DNA:A、G、C、T RNA:A、G、C、U4.核苷酸通过3,5-磷酸二酯键连接成多聚核苷酸链5.DNA的B型双螺旋结构模型的要点 1)DNA是反向平行的右手双螺旋结构 螺距为3.4nm;每个螺旋含有10个碱基对两股链之间在空间上形成一条大沟和一条小沟2)DNA双链之间形成了互补碱基对脱氧核糖和磷酸基团组成的亲水性骨架位于双螺旋的外侧碱基位于双螺旋的内侧;氢键相连A与T之间形成两个氢键;C与G之间形成三个氢键碱基对平面与螺旋轴垂直 3)氢键和碱基堆积力维系DNA双螺旋的稳定 * DNA,双螺旋,正反向,互补链。 A对T,GC连,配对时,靠氢键,AT2,
12、GC3。 十碱基,转一圈,螺距34点中间。碱基力和氢键,维持螺旋结构坚。6.DNA是遗传信息的载体7.基因组:一个细胞或生物所含的全套基因8.参与蛋白质合成的RNA主要有三种:信使RNA(mRNA)转运RNA(tRNA)核糖体RNA(rRNA)9. mRNA从DNA转录遗传信息指导蛋白质合成 tRNA是蛋白质合成的接合器分子 rRNA参与蛋白质合成的场所核糖体的组成10.tRNA具有类似于三叶草型的二级结构11.DNA和RNA具有紫外吸收特性,最大吸收峰在260nm(因为其所含有的碱基都有共轭双键的性质)12.DNA变性:指DNA分子由稳定的双螺旋结构松解为无规则线性结构的现象12.增色效应:
13、指变性后DNA溶液的紫外吸收作用增强的效应13.核酸的解链温度(融解温度):50%DNA变性时的温度14.复性:指变性DNA在适当条件下,两条互补链全部或部分恢复到天然双螺旋结构的现象15.退火:热变性DNA一般经缓慢冷却后即可复性的过程第3章 酶和维生素1.酶:由生物活细胞产生的具有高效催化功能和高度专一性的有机生物大分子,又叫生物催化剂 *酶的本质:绝大多数的酶都是蛋白质 少数是以核酸为主要结构的酶,又称核酶2.关键酶:某一代谢途径中,控制整个代谢途径反应方向和速率的酶,又称限速酶3.酶的必需基团:酶分子整体构象中对于酶发挥活性所必需的基团4.酶的活性中心:酶的必需基团在空间结构上彼此靠近
14、,组成具有特定空间结构的区域,能与底物特异结合并将底物转化为产物的区域5.酶的分类(按照酶促反应的性质):氧化还原酶类、转移酶类、水解酶类、裂解酶类、异构酶类、合成酶类6.酶促反应的特点: 酶具有高效催化效率:显著降低反应的活化能酶催化作用具有高度专一性:绝对专一性和相对专一性、立体异构体专一性、光学异构体专一性7.诱导契合学说:酶与底物相互接近时,通过相互诱导、相互变形和相互适应,才使酶与底物相互结合形成ES复合物8.酶动力学:指定量研究酶催化反应的特征,包括各种影响因素下的催化反应特征9.影响酶促反应的因素:酶浓度、底物浓度、pH、温度、抑制剂、激活剂10.米氏方程: * S:底物浓度 K
15、m:米氏常数(酶的特征常数) V:不同S时的反应速度 Vmax:最大反应速度11.Km:在数值上等于酶促反应速度为最大反应速度一半时对应的底物浓度12.米氏酶:动力学特征可以用米氏方程描述的酶又称米氏酶13.温度对酶促反应速度存在双重影响 温度升高,酶促反应速度升高;由于酶的本质是蛋白质,温度升高,可引起酶的变性,从而反应速度降低 *最适温度:酶促反应速度最快时的温度(不是酶的特征性常数) 大多在35-40(37)14.pH可影响酶分子结构而影响酶促反应速度 最适pH:能使酶催化活性达到最大的反应体系的pH(不是酶的特征性常数)15.酶抑制剂:凡能使酶的催化活性下降而不引起酶蛋白构象发生非常显
16、著变化的物质16.酶的可逆性抑制及其特点:(1)竞争性抑制:Vmax不变,Km增大(2)非竞争性抑制:Vmax降低,Km不变(3)反竞争性抑制 :Vmax降低,Km降低17.酶原:有些酶在细胞内合成或初分泌时,没有催化活性,无活性状态的酶的前体18.酶原的激活:酶原向有活性的酶转化的过程,其本质是酶的活性中心形成或暴露19.酶共价修饰:酶蛋白肽链上的一些基团在特定酶催化下,可与某种化学基团发生可逆的共价结合,快速改变酶的活性的过程20.酶级联(放大)效应:生物细胞内酶的修饰需由另一种酶催化,由多种酶串联成一系列连续的酶催化酶的修饰反应,可以使最终酶的催化效应获得极度放大,这种效应成为酶级联效应
17、21.同工酶:能催化相同的化学反应,但在蛋白质分子的结构、理化性质和免疫性能等方面都存在明显差异的一组酶 *生理意义:在体内适应不同组织或不同细胞器在代谢上的不同需要第5章 糖代谢1.直链的化学键:-1,4糖苷键 支链的化学键:-1,6糖苷键2.糖酵解:缺氧情况下,葡萄糖或糖原在胞液中通过糖酵解途径分解生成乳酸,并产生能量的过程 【环境:细胞液 过程:由葡萄糖分解成丙酮酸由丙酮酸转变成乳酸】3.糖酵解的反应特点: (1)全过程无O2 参加,终产物为乳酸 (2)净生成ATP数量:从G(葡萄糖)开始 2*2-2=2ATP 从Gn(糖原)开始 2*2-1=3ATP (3)三个关键酶:不可逆的单向反应
18、 已糖激酶、磷酸果糖激酶-1、丙酮酸激酶 (4)产能方式:底物水平磷酸化4.底物水平磷酸化:底物氧化过程中产生的能量直接将ADP磷酸化生成ATP的过程5.多酶复合体:催化功能上有联系的几种酶彼此嵌合形成的复合体,每一个酶都有其特定的催化功能和辅酶6.糖的有氧氧化:葡萄糖在有氧条件下彻底氧化成H2O和CO2,并产生大量能量的过程,是集体主要供能方式,部位:胞液及线粒体7.糖的有氧氧化包括的阶段:1)葡萄糖或糖原在胞液中经糖酵解途径分解成丙酮酸 2)丙酮酸进入线粒体,氧化脱羧生成乙酰CoA进入三羧酸循环 3)乙酰CoA进入三羧酸循环氧化生成H2O和CO2,并释放出大量能量8.三羧酸循环(TAC):
19、乙酰CoA进入由一连串反应构成的循环体系,被氧化生成H2O和CO2。这个循环反应开始于乙酰CoA与草酰乙酸缩合生成含有三个羧基的柠檬酸,在线粒体中进行9.三羧酸循环反应过程的特点: (1)三羧酸是乙酰辅酶A的彻底氧化过程 (2)三羧酸循环是能量的产生过程 消耗1分子乙酰CoA,经2次脱羧,生成2个CO2 ;4次脱氢产生3*NADH,1*FADH2 ;1次底物水平磷酸化,产生1GTP;共产生12个ATP(3)不可逆,关键酶:柠檬酸合酶、异柠檬酸脱氢酶、-酮戊二酸脱氢酶系10.TAC的能量计量11.葡萄糖完全氧化产生的ATP: *糖原完全氧化产生31ATP或33ATP12.TAC的全过程:13.糖
20、有氧氧化和糖酵解之间的互相调节14.磷酸戊糖途径(1)氧化阶段:(原料)6磷酸葡萄糖 (产物)5磷酸核酮糖、NADPH、CO2(2)非氧化阶段15.磷酸戊糖途径的生理意义(1)5磷酸核糖:为核酸的生物合成提供核糖(2)提供NADPH作为供氢体参与多种代谢反应 NADPH是体内许多合成代谢的供氢体用于维持谷胱甘肽的还原状态NADPH参与体内羟化反应,是加单氧酶系的供氢体,参与激素、药物、毒物的生物转化过程16.糖异生:从非糖物质转变为葡萄糖或糖原的过程 其主要原料:生糖氨基酸、乳酸、甘油 其主要发生器官:肝脏 (其次在肾脏)其过程的关键酶:丙酮酸羧化酶、磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶、果糖-1,6-磷酸
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