淮安市1起由奥密克戎变异株BA.5.2引起的聚集性疫情的调查分析.pdf
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1、疾病防治608Jiangsu JPrevMeVo1.34.No.5江苏预防医学2 0 2 3年9 月第34卷第5期淮安市1起由奥密克戎变异株BA.5.2引起的聚集性疫情的调查分析许磊,高强,蔡永丽,张正,杨鹏飞,夏文玲,于浩”,蔡元兰4,方允静,潘恩春1.淮安市疾病预防控制中心,江苏准安2 2 30 0 3;2.淮阴师范学院;3.淮安市清江浦区疾病预防控制中心;4.淮安市淮安区疾病预防控制中心;5.淮准安经济技术开发区社会事业局摘要:目的了解1起由奥密克戎变异株引起的新型冠状病毒肺炎(简称“新冠”)聚集性疫情流行病学特点。方法对本起疫情进行流行病学调查、实验室检测和序列分析,并进行溯源分析。结
2、果本起疫情持续时间为2 0 2 2 年11月1一6 日,报告新冠感染者13例,以男性为主(占6 1.5%),中位年龄为52 岁;包括无症状感染者10 例(占7 6.9%)、确诊病例轻型2 例(占15.4%)和普通型1例(占7.7%)。病例病毒基因测序结果显示为奥密克戎变异株BA.5.2与邻省“10.0 4 疫情1例本土病例感染毒株高度同源。结论本起疫情高度怀疑为外省输入引发,病毒株为奥密克戎变异株BA.5.2。关键词:新型冠状病毒;奥密克戎;聚集性疫情;基因测序中图分类号:R373.1文献标识码:B文章编号:10 0 6-9 0 7 0(2 0 2 3)0 5-0 6 0 8-0 32022年
3、11月1日2 0:0 0 淮安市清江浦区社区接到自称邻省A市新型冠状病毒肺炎(简称“新冠”)混管阳性人员的报告,清江浦区疾病预防控制中心立即核实,为一行4人驾车在长深高速淮阴区境内,随即通报准阴区。2 0:30 人员停靠高速查验点报备后单独采样,2 1:0 0 闭环转运至集中隔离点,2 2:10 淮阴区收到A市跨省协查结果。11月2 6 日又在前往A市参加婚礼“回门宴”人员及其密切接触者中检出核酸阳性9例。经基因测序分析,判定本起疫情为奥密克戎变异株引起的新冠病毒感染聚集性疫情,共13例。现对该起疫情的调查、处置进行回顾性分析,旨在为呼吸道传染病的防控工作提供参考1材料与方法1.1资料来源疫情
4、和病例资料来自突发公共卫生事件报告信息系统、现场个案调查表及流行病学调查报告,新冠病毒感染传染病报卡等。本研究通过伦理审核。1.2定义木根据新型冠状病毒感染的肺炎防控方案(第九版)和新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第九版)规定,病例分为确诊病例(轻型、普通型、重型、危重型)和无症状感染者。聚集性疫情是指1周内在同一学校、居民小区、工厂、自然村、医疗机构等范围内发现2 例及以上病例和无症状感染者1.3流行病学调查充分运用公安、工信大数据技术,并结合现场和电话流行病学调查,收集感染者的流行病学史及其临床诊疗信息进行分析研判,明确病例暴露史及存在的危险因素。采集病例及其密切接触者鼻咽拭子和全血标本,另
5、对多辆乘坐的汽车,包括方向盘、显示屏、桌椅、门把手等点位,以及部分感染者及其密切接触者的家庭、就餐店铺、工作场所等点位进行环境采样。同时在全市分区域分时段采集人群咽拭子,开展核酸筛查。1.4实验室检测将采集的鼻咽拭子浸入含2 3mL病毒保存液管中,尾部弃去后旋紧管盖、编号,4保存,按感染性生物材料运输要求送检。通过2 个靶标(ORFIab、N)特异性实时荧光RT-PCR进行新冠病毒核酸检测。抗体检测采用化学发光法,全血标本采集离心后,利用新型冠状病毒总抗/IgA/IgG/IgM试剂盒,在化学发光仪(万泰凯瑞)上检测血清抗体含量。病毒基因测序分析由江苏省疾病预防控制中心、中国疾病预防控制中心完成
6、。1.5统计分析利用Excel2016软件整理分析数据,采用描述性流行病学方法对聚集性疫情三间分布特征进行描述,通过XMind软件绘制疫情感染者关系及时间分布图、感染者桌坐分布图。D01:10.13668/j.issn.1006-9070.2023.05.030基金项目:国家自然科学基金(12 0 7 117 3);准安市社科研究公共卫生服务专项课题(2 0 2 2 WSB06)作者简介:许磊(19 9 5一),男,江苏兴化人,医师,主要从事传染病防控工作通信作者:高强,主任医师,E-mail:2 6 0 8 19 9 8 1 q q.c o mJiangsuJ PrevMed,Vol.34,
7、No.5江苏预防医学2 0 2 3年9 月第34卷第5期6092结果2.1疫情概况共报告新冠病毒感染者13例(编号:HA001HA013)。11月1、2、3、4、6 日分别报告4、4、2、2、1例,见图1。病例年龄8 8 0 岁,中位年龄为52 岁;男性8 例,女性5例。集中隔离7 例(占53.8%),闭环管理重点人员筛查6 例(占46.2%)。无症状感染者10例(占7 6.9%),确诊轻型2 例(占15.4%),确诊普通型1例(占7.7%)。均接种过新冠疫苗,其中接种3针剂11例(占8 4.6%),均在2 0 2 2 年7 月16 日前完成;2 针剂2 例(占15.4%),均在2 0 2 1
8、年接种。准安“11.0 2”疫情感染者时间分布(n=13)女性:核酸(+)OHA001岳母男性:核酸(+)11月1日HA002岳父OHA008(4例)OHA003一妻子父女关系HA006(新娘)HA007(新郎)11月2 日(4例)OHA004一同学关系侄叔关系OHA005OHA009一新郎母亲11月3日OHA010一新郎发小(2例)夫妻关系111月4日OHAO1母子关系(2例)OHA012411月6 日OHA013新郎父亲一(1例)图1疫情感染者关系及时间分布2.2潜伏期和续发情况13例中,11例为赴宴成员(H A 0 0 1 H A 0 10、H A 0 13),为一代病例,2 例家庭成员
9、为续发病例(HA011、H A 0 12),属于二代病例,均为HA005的密切接触者。其他病例密切接触者中未发现续发病例。2.3抗体检测结果13例中,HA008的新冠总抗体水平最高,为17 38.6 6 COI(+),Ig G 也最高,为32.0 7 COI(+);H A 0 0 5、H A 0 0 6、H A 0 0 7、H A 0 0 9、H A 0 0 1的总抗体/IgG依次为7 9 4.41COI(+)/2 0.2 2(+)、8 0 4.13CO I(+))/19.68(+)、2 7 6.35CO I(+)/15.54(+)、157.55CO I(+)/8.62(+)、10 1.0 1
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