第六章原核生物基因表达调控.pptx
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1、第六章原核生物基因表达调控前言前言一、基因表达一、基因表达(gene expression)在一定调节机制控制下在一定调节机制控制下,基因通过转录和基因通过转录和翻译而产生其蛋白质产物翻译而产生其蛋白质产物,或转录后直接产生其或转录后直接产生其RNARNA产物产物,如如tRNAtRNA、rRNArRNA等得过程等得过程 。大多数基因得表达产物就是蛋白质大多数基因得表达产物就是蛋白质,部分基部分基因如因如tRNAtRNA和和rRNArRNA基因表达产物就是基因表达产物就是RNARNA。一个典型得原核生物基因得结构一个典型得原核生物基因得结构二、基因表达调控二、基因表达调控围绕基因表达过程中发生得
2、各种各样得调节围绕基因表达过程中发生得各种各样得调节方式都通称为基因表达调控、方式都通称为基因表达调控、转录水平得调控转录水平得调控转录后得调控转录后得调控翻译水平得调控翻译水平得调控DNADNA水平水平 基因丢失基因丢失;基因扩增基因扩增基因重排基因重排;甲基化修饰甲基化修饰;染色质得结构状态染色质得结构状态RNARNA水平水平转录水平调控转录水平调控;RNARNA得转录后加工得转录后加工;mRNAmRNA从核内向胞浆转运从核内向胞浆转运;mRNAmRNA稳定性稳定性蛋白质水平蛋白质水平翻译过程翻译过程;翻译后加工翻译后加工;蛋白质得稳定性蛋白质得稳定性大家学习辛苦了,还是要坚持继续保持安静
3、继续保持安静三、基因表达得特性三、基因表达得特性:1)时间特异性或阶段特异性时间特异性或阶段特异性2)空间特异性或组织细胞特异性空间特异性或组织细胞特异性1 1、时间特异性、时间特异性按功能需要按功能需要,某一特定基因得表达严格按特某一特定基因得表达严格按特定得时间顺序发生定得时间顺序发生,称之为基因表达得称之为基因表达得时间特异时间特异性性(temporal specificity)。多细胞生物基因表达得时间特异性又称阶多细胞生物基因表达得时间特异性又称阶段特异性段特异性(stage specificity)。n2 2、空间特异性、空间特异性(spatial specificityspati
4、al specificity):在在个个体体生生长长全全过过程程,某某种种基基因因产产物物在在个个体体按按不不同同组组织织空空间间顺顺序序出出现现,称称之之为为基基因因表表达达得得空空间间特异性特异性(spatial specificity)。基基因因表表达达伴伴随随时时间间顺顺序序所所表表现现出出得得这这种种分分布布差差异异,实实际际上上就就是是由由细细胞胞在在器器官官得得分分布布决决定定得得,所所以以空空间间特特异异性性又又称称细细胞胞或或组组织织特特异异性性(cell or tissue specificity)。四、基因表达得方式四、基因表达得方式组成性基因表达组成性基因表达适应性表达
5、适应性表达(诱导和阻遏表达诱导和阻遏表达)1、组成性基因表达、组成性基因表达 某些基因在一个生物个体得几乎所有细某些基因在一个生物个体得几乎所有细胞中持续表达胞中持续表达,通常被称为管家基因通常被称为管家基因(house-keeping gene)。无论表达水平高低无论表达水平高低,管家基因较少受环境管家基因较少受环境因素影响因素影响,而就是在个体各个生长阶段得大而就是在个体各个生长阶段得大多数或几乎全部组织中持续表达多数或几乎全部组织中持续表达,或变化很或变化很小。区别于其她基因小。区别于其她基因,这类基因表达被视为这类基因表达被视为组成性表达。组成性表达。2、诱导和阻遏表达、诱导和阻遏表达
6、诱导表达诱导表达(induction)(induction)指在特定环境因素刺激下指在特定环境因素刺激下,基基因被激活因被激活,从而使基因得表达产物增加。这类基因称从而使基因得表达产物增加。这类基因称为可诱导基因。为可诱导基因。阻遏表达阻遏表达(repression)(repression)指在特定环境因素刺激下指在特定环境因素刺激下,基基因被抑制因被抑制,从而使基因得表达产物减少。这类基因称从而使基因得表达产物减少。这类基因称为可阻遏基因。为可阻遏基因。在一定机制控制下在一定机制控制下,功能上相关得一组基功能上相关得一组基因因,无论其为何种表达方式无论其为何种表达方式,均需协调一致、均需协调
7、一致、共同表达共同表达,即为协调表达即为协调表达(coordinate(coordinate expression),expression),这种调节称为协调调节这种调节称为协调调节(coordinate regulation)(coordinate regulation)。协调表达协调表达五、基因表达调控得基本原理五、基因表达调控得基本原理:1、基因表达调控得多层次和复杂、基因表达调控得多层次和复杂性性2、基因转录激活调节基本要素基因转录激活调节基本要素1 1、基因表达调控得多层次和复杂性、基因表达调控得多层次和复杂性四个基本调控点四个基本调控点(1)(1)基因结构得活化基因结构得活化(2)
8、(2)转录起始转录起始:最有效得调节环节最有效得调节环节(3)(3)转录后加工及转运转录后加工及转运(4)(4)翻译及翻译后加工翻译及翻译后加工DNADNA水平水平 基因丢失基因丢失;基因扩增基因扩增基因重排基因重排;甲基化修饰甲基化修饰;染色质得结构状态染色质得结构状态RNARNA水平水平转录水平调控转录水平调控;RNARNA得转录后加工得转录后加工;mRNAmRNA从核内向胞浆转运从核内向胞浆转运;mRNAmRNA稳定性稳定性蛋白质水平蛋白质水平翻译过程翻译过程;翻译后加工翻译后加工;蛋白质得稳定性蛋白质得稳定性2、基因转录激活调节基本要素基因转录激活调节基本要素 基因表达得调节与基因得结
9、构、性质基因表达得调节与基因得结构、性质,生物生物个体或细胞所处得内、外环境个体或细胞所处得内、外环境,以及细胞内所以及细胞内所存在得转录调节蛋白有关。存在得转录调节蛋白有关。三个基本要素三个基本要素:1)1)特异得特异得DNADNA调节序列调节序列2)2)调节蛋白调节蛋白3)RNA3)RNA聚合酶聚合酶基因转录激活调节基本要素基因转录激活调节基本要素1 1、特异、特异DNADNA序列序列原核生物得原核生物得操纵子操纵子操纵子操纵子真核生物得真核生物得顺式作用元件顺式作用元件(cis-cis-acting element)acting element)2 2、调节蛋白、调节蛋白-操纵子操纵子(
10、operon)结构基因结构基因 启动子启动子 操纵基因操纵基因 调节基因调节基因 (promoter)(operator)阻抑蛋白阻抑蛋白-操纵子操纵子(operon)-操纵子操纵子(operon)由操纵基因以及相邻得若干结构基因所组由操纵基因以及相邻得若干结构基因所组成得功能单位成得功能单位,其中结构基因转录受操纵基其中结构基因转录受操纵基因所控制。因所控制。操纵基因就是顺式控制元件操纵基因就是顺式控制元件,阻抑蛋白就是阻抑蛋白就是反式作用因子反式作用因子 就是指可影响自身基因表达活性得特异就是指可影响自身基因表达活性得特异DNA 序列。通常就是非编码序列。包括启动子、增序列。通常就是非编码
11、序列。包括启动子、增强子及沉默子等。强子及沉默子等。真核生物得真核生物得顺式作用元件顺式作用元件BADNA编码序列编码序列转录起始点转录起始点2 2、调节蛋白、调节蛋白 就是调节基因转录得蛋白因子就是调节基因转录得蛋白因子,如原核生如原核生物得阻遏蛋白和物得阻遏蛋白和CAPCAP蛋白蛋白(降解物基因活化降解物基因活化蛋白蛋白)、真核生物得基本转录因子和特异转、真核生物得基本转录因子和特异转录因子等。录因子等。3 3、RNA RNA聚合酶聚合酶 启动序列影响其与启动序列影响其与RNA聚合酶得亲和力聚合酶得亲和力,而亲而亲和力大小则直接影响转录起动得频率。和力大小则直接影响转录起动得频率。原核原核
12、启动序列或启动序列或真核真核启动子就是由转录起始启动子就是由转录起始点、点、RNA聚合酶结合位点及控制转录得调节组聚合酶结合位点及控制转录得调节组件组成。件组成。真核生物真核生物RNARNA聚合酶聚合酶六、基因表达调控得生物学意义六、基因表达调控得生物学意义1、适应环境、维持生长和增殖、适应环境、维持生长和增殖2、维持个体发育与分化、维持个体发育与分化第一节第一节 原核基因表达调控总论原核基因表达调控总论533355DNARNA转录方向转录方向反义链反义链 模板链、模板链、()链链正义链、正义链、编码链、编码链、(+)链链基因表达基因表达l l转录水平上得调控转录水平上得调控转录水平上得调控转
13、录水平上得调控l l转录后水平上得调控转录后水平上得调控转录后水平上得调控转录后水平上得调控基因表达调控基因表达调控原原核核生生物物主主要要就就是是在在转转录录水水平平上上调调控控基基因因得表达。得表达。当当需需要要某某种种基基因因产产物物时时,就就大大量量合合成成这这种种mRNA,mRNA,当当不不需需要要这这种种基基因因产产物物时时就就抑抑制制这这种种mRNAmRNA得转录得转录,就就是让相应得基因不表达。就就是让相应得基因不表达。通常所说得基因不表达通常所说得基因不表达,并不就是说这个基并不就是说这个基因就完全不转录为因就完全不转录为mRNA,mRNA,而就是转录得水平而就是转录得水平很
14、低很低,维持在一个基础水平维持在一个基础水平(本底水平本底水平)。基因表达完全关闭得情况使极为少见得。基因表达完全关闭得情况使极为少见得。l真核生物基因表达得调控可发生在不同水平上一、原核基因调控机制得类型与特点一、原核基因调控机制得类型与特点(一一)原核基因调控机制得类型原核基因调控机制得类型负调控负调控正调控正调控gene ON gene ON OFFOFF阻遏蛋白阻遏蛋白阻遏蛋白阻遏蛋白gene OFF gene OFF ONON激活蛋白激活蛋白激活蛋白激活蛋白基因表达量基因表达量基因表达量基因表达量特别低特别低特别低特别低1、负调控、负调控 negative regulation在没有
15、调节蛋白质存在时基因就是表达得在没有调节蛋白质存在时基因就是表达得在没有调节蛋白质存在时基因就是表达得在没有调节蛋白质存在时基因就是表达得,加入加入加入加入某种调节蛋白质后基因活性就被关闭某种调节蛋白质后基因活性就被关闭某种调节蛋白质后基因活性就被关闭某种调节蛋白质后基因活性就被关闭,这样得控这样得控这样得控这样得控制系统就叫做负控系统制系统就叫做负控系统制系统就叫做负控系统制系统就叫做负控系统 。其调节蛋白质叫做阻遏蛋白其调节蛋白质叫做阻遏蛋白其调节蛋白质叫做阻遏蛋白其调节蛋白质叫做阻遏蛋白 两种类型两种类型两种类型两种类型:负控诱导和负控阻遏负控诱导和负控阻遏负控诱导和负控阻遏负控诱导和负
16、控阻遏负控诱导系统负控诱导系统负控阻遏系统负控阻遏系统2、正调控、正调控 positive regulation在没有调节蛋白质存在时基因就是关闭得在没有调节蛋白质存在时基因就是关闭得在没有调节蛋白质存在时基因就是关闭得在没有调节蛋白质存在时基因就是关闭得,加入加入加入加入某种调节蛋白质后基因活性就被开启某种调节蛋白质后基因活性就被开启某种调节蛋白质后基因活性就被开启某种调节蛋白质后基因活性就被开启,这样得控这样得控这样得控这样得控制系统就叫做正控系统。制系统就叫做正控系统。制系统就叫做正控系统。制系统就叫做正控系统。其调节蛋白质叫做无辅基诱导蛋白其调节蛋白质叫做无辅基诱导蛋白其调节蛋白质叫做
17、无辅基诱导蛋白其调节蛋白质叫做无辅基诱导蛋白(激活蛋白激活蛋白激活蛋白激活蛋白)两种类型两种类型两种类型两种类型:正控诱导和正控阻遏系统正控诱导和正控阻遏系统正控诱导和正控阻遏系统正控诱导和正控阻遏系统(二二)特殊代谢物调节基因表达得类型特殊代谢物调节基因表达得类型可诱导调节可诱导调节可阻遏调节可阻遏调节1 1、可诱导调节、可诱导调节l一些基因在特殊得代谢物或化合物得作用一些基因在特殊得代谢物或化合物得作用下下,由原来关闭得状态转变为工作状态由原来关闭得状态转变为工作状态,即在某即在某些物质得诱导下使基因活化、些物质得诱导下使基因活化、l调节分解代谢得操纵子调节分解代谢得操纵子,同时受同时受c
18、AMP-CAPcAMP-CAP得活性调节得活性调节l可诱导调节可诱导调节可诱导调节可诱导调节无诱导物时无诱导物时无诱导物时无诱导物时gene OFFgene OFFl可诱导调节可诱导调节可诱导调节可诱导调节有诱导物时有诱导物时有诱导物时有诱导物时gene ONgene ON+转录转录无葡萄糖无葡萄糖,cAMP浓度高时浓度高时有葡萄糖有葡萄糖,cAMP浓度低时浓度低时lCAPCAP得正性调节得正性调节ZYAOPDNACAPCAPCAPCAPCAPCAP2 2、可阻遏调节、可阻遏调节l一些基因在特殊得代谢物或化合物得作用下一些基因在特殊得代谢物或化合物得作用下,由原来开启得状态转变为关闭状态由原来
19、开启得状态转变为关闭状态,基因得表基因得表达被阻遏、达被阻遏、l调节合成代谢得操纵子调节合成代谢得操纵子(三三)原核生物基因表达调控得特点原核生物基因表达调控得特点l调节得主要环节在转录水平上进行调节得主要环节在转录水平上进行调节得主要环节在转录水平上进行调节得主要环节在转录水平上进行l 因子决定因子决定因子决定因子决定RNARNARNARNA聚合酶识别特异性聚合酶识别特异性聚合酶识别特异性聚合酶识别特异性l主要通过操纵子模式进行调节主要通过操纵子模式进行调节主要通过操纵子模式进行调节主要通过操纵子模式进行调节l阻遏蛋白对转录得抑制作用阻遏蛋白对转录得抑制作用阻遏蛋白对转录得抑制作用阻遏蛋白对
20、转录得抑制作用(阻遏机制阻遏机制阻遏机制阻遏机制)就是普就是普就是普就是普遍存在得负调控作用遍存在得负调控作用遍存在得负调控作用遍存在得负调控作用原核生物中基因得组织形式原核生物中基因得组织形式几个作用相关得基因在染色体上串连排列在几个作用相关得基因在染色体上串连排列在一起一起,由同一个调控系统来控制。由同一个调控系统来控制。这样得一个整体称为一个操纵元这样得一个整体称为一个操纵元(operon)(operon)。原原 核核 在在在在 转转转转 录录录录水水水水 平平平平 上上上上 调调调调 控控控控 因子因子大肠杆菌至少有大肠杆菌至少有6 6种种 因子因子70负责识别一般得启动子负责识别一般
21、得启动子54识别与氮代谢有关得基因启动子识别与氮代谢有关得基因启动子32识别热激识别热激(heat shock)蛋白质基因启动子蛋白质基因启动子二、弱化子对基因活性得影响二、弱化子对基因活性得影响1、弱化子、弱化子在操纵区与结构基因之间得一段可以终止转录作在操纵区与结构基因之间得一段可以终止转录作用得核苷酸序列用得核苷酸序列,当操纵子被阻遏时当操纵子被阻遏时,RNA合成被终止合成被终止,这段核苷酸起终止转录信号作用、这段核苷酸起终止转录信号作用、UUUU RNA RNA聚合酶聚合酶 起调节作用得就是某种氨酰起调节作用得就是某种氨酰起调节作用得就是某种氨酰起调节作用得就是某种氨酰-tRNA-tR
22、NA得浓度得浓度得浓度得浓度RNA分子在分子内采用不同得碱基配对方式分子在分子内采用不同得碱基配对方式,形成形成不同得二级结构而参与调控。不同得二级结构而参与调控。当不同得结构对就是否允许终止存在差异时当不同得结构对就是否允许终止存在差异时,改变改变二级结构可对转录终止进行调控二级结构可对转录终止进行调控2、弱化子作用机制、弱化子作用机制UUUUUUUU调节区调节区 结构基因结构基因 trpROP前导序列前导序列 弱化子区域弱化子区域 UUUU前导前导mRNA1234弱化子结构弱化子结构 第第1010、1111密码子为密码子为trptrp密码子密码子 终止密码子终止密码子 14aa14aa前导
23、肽编码区前导肽编码区:包含序列包含序列1 1 形成发夹结构能力强弱形成发夹结构能力强弱:序列序列1/21/2序列序列2/32/3序列序列3/4 3/4 trp 密码子密码子 UUUU5 trp trp mRNA mRNA trptrpL L1 21 23 43 4寡聚寡聚寡聚寡聚U U区区区区trpE(a)(a)正常正常正常正常 (b)(b)高高高高 Trp Trp1 12 2转录终止转录终止转录终止转录终止3 4(C)(C)低低低低Trp Trp 1 12 32 34 4转录延伸转录延伸转录延伸转录延伸UUUU34UUUU 334核糖体核糖体 前导肽前导肽 前导前导mRNA1 1、当色氨酸浓
24、度高、当色氨酸浓度高时时 转录衰减机制转录衰减机制 125 trp 密码子密码子 衰减子结构衰减子结构就就是终止子就就是终止子可使转录可使转录前导前导DNA UUUU 3 RNA RNA聚合酶聚合酶 终止终止UUUU342423UUUU核糖体核糖体 前导肽前导肽 前导前导mRNA 15 trp 密码子密码子 结构基因结构基因前导前导DNA RNA RNA聚合酶聚合酶 2 2、当色氨酸浓度低、当色氨酸浓度低时时 Trp合成酶系相关合成酶系相关结构基因被转录结构基因被转录 序列序列3 3、4 4不能形成衰减子结构不能形成衰减子结构 三、降解物对基因活性得调节三、降解物对基因活性得调节1 1、葡萄糖
25、效应、葡萄糖效应、葡萄糖效应、葡萄糖效应(降解物抑制作用降解物抑制作用降解物抑制作用降解物抑制作用)就是指当葡萄糖和其她糖类一起作为细菌得就是指当葡萄糖和其她糖类一起作为细菌得就是指当葡萄糖和其她糖类一起作为细菌得就是指当葡萄糖和其她糖类一起作为细菌得碳源时葡萄糖总就是优先被利用碳源时葡萄糖总就是优先被利用碳源时葡萄糖总就是优先被利用碳源时葡萄糖总就是优先被利用,葡萄糖得存葡萄糖得存葡萄糖得存葡萄糖得存在阻止了其她糖类得利用得现象。在阻止了其她糖类得利用得现象。在阻止了其她糖类得利用得现象。在阻止了其她糖类得利用得现象。2 2、降解物对基因活性得调节、降解物对基因活性得调节葡萄糖通过降低葡萄糖
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