现代医学信息资源概述.ppt
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1、李健康李健康南方医科大学南方医科大学医学情报学教研室医学情报学教研室一、互联网信息被利用的现状及发展趋势一、互联网信息被利用的现状及发展趋势二、二、网上资源分类网上资源分类三、三、网上生物医学信息资源介绍网上生物医学信息资源介绍(一)生物医学数据库资源(一)生物医学数据库资源(一)生物医学数据库资源(一)生物医学数据库资源 (二)医学会议信息资源(二)医学会议信息资源(二)医学会议信息资源(二)医学会议信息资源(三)医学专利信息资源(三)医学专利信息资源(三)医学专利信息资源(三)医学专利信息资源(四)电子出版物资源(四)电子出版物资源(四)电子出版物资源(四)电子出版物资源四、四、网上生物网
2、上生物医学信息资源检索工具医学信息资源检索工具 (一)通用搜索引擎(一)通用搜索引擎(一)通用搜索引擎(一)通用搜索引擎 (二)生物医学信息搜索引擎(二)生物医学信息搜索引擎(二)生物医学信息搜索引擎(二)生物医学信息搜索引擎一、一、互联网信息被利互联网信息被利用的现状及发展趋势用的现状及发展趋势(一)现状(一)现状 最新(最新(2005)证据显示:)证据显示:美国医师现在主要利用互联美国医师现在主要利用互联网来获得所需的医学信息。网来获得所需的医学信息。美国美国TPMG医师教育和发展训练部博士医师教育和发展训练部博士PhilipBellman在在2005年对美国医师的调查发年对美国医师的调查
3、发现:现:89%的美国医师已经主要使用在线信息的美国医师已经主要使用在线信息资源来提高医疗知识、决定临床治疗方案、资源来提高医疗知识、决定临床治疗方案、更新自己的知识或其他临床目的。更新自己的知识或其他临床目的。20062006年我国约年我国约2626的科技人员对情报的科技人员对情报检索、科技查新还一无所知,有将近一检索、科技查新还一无所知,有将近一半的科技人员不知道或从未使用过国外半的科技人员不知道或从未使用过国外科技报告、标准、专利等价值较高的文科技报告、标准、专利等价值较高的文献。献。对重庆医科大学对重庆医科大学12001200多名教师和多名教师和2500025000名学生的随机调查证明
4、:大部分师名学生的随机调查证明:大部分师生对于检索方式不太熟悉,对于高级检生对于检索方式不太熟悉,对于高级检索方式都处于模糊认知的阶段。索方式都处于模糊认知的阶段。(二)趋势(二)趋势现代医生必须具备一种新的职业现代医生必须具备一种新的职业素质素质信息素养和知识更新模式,才信息素养和知识更新模式,才能跟上时代的发展。信息素养的重要能跟上时代的发展。信息素养的重要内容就是检索技能,特别是从互联网内容就是检索技能,特别是从互联网检索特定信息的技能。检索特定信息的技能。专家认为,医生如果不能及时检专家认为,医生如果不能及时检索、评价和获得可靠的和最新的相关索、评价和获得可靠的和最新的相关信息,就不可
5、能成为一名合格的信息,就不可能成为一名合格的现代现代全球医生全球医生。查询能力是一个查询能力是一个成功人士的基本功。成功人士的基本功。传统的手工检索已完全被现代的传统的手工检索已完全被现代的计算机检索方式所取代。对用户来说,计算机检索方式所取代。对用户来说,从网上获取信息逐步替代从图书馆获从网上获取信息逐步替代从图书馆获取信息而成为主流方式(信息的去中取信息而成为主流方式(信息的去中介化介化)。)。随着全球网络化、信息化的发展随着全球网络化、信息化的发展,信息泛滥和信息过载问题凸现,医生获信息泛滥和信息过载问题凸现,医生获得有用信息愈加困难,建立在关键词基得有用信息愈加困难,建立在关键词基础上
6、的全文检索、数据检索等传统信息础上的全文检索、数据检索等传统信息检索,对语义匹配的支持能力较差,所检索,对语义匹配的支持能力较差,所提供的信息检索查全率和查准率难以令提供的信息检索查全率和查准率难以令人满意。因此人满意。因此支持知识、语义匹配的支持知识、语义匹配的智智能信息检索能信息检索(二代智能检索)已成为今(二代智能检索)已成为今天信息检索研究的重点。天信息检索研究的重点。所谓智能检索,是指检索与基于中所谓智能检索,是指检索与基于中文词义概念的传统检索不同,它以文献文词义概念的传统检索不同,它以文献和检索词的相关度为基础,综合考查文和检索词的相关度为基础,综合考查文献的重要性等指标,将与用
7、户愿望最相献的重要性等指标,将与用户愿望最相关的文献排到最前面,提高检索效率。关的文献排到最前面,提高检索效率。相关性采用各字段加权混合索引,相关相关性采用各字段加权混合索引,相关性分析更准确;文献的重要性指通过对性分析更准确;文献的重要性指通过对文献来源权威性分析和引用关系分析等文献来源权威性分析和引用关系分析等实现对文献质量的评价。实现对文献质量的评价。对应于智能检索的垂直搜索引擎近对应于智能检索的垂直搜索引擎近年来不断涌现。垂直搜索引擎针对通用年来不断涌现。垂直搜索引擎针对通用搜索引擎的信息量大、查询不准确、深搜索引擎的信息量大、查询不准确、深度不够等问题提出来的新的搜索引擎服度不够等问
8、题提出来的新的搜索引擎服务模式,通过针对某一特定领域、某一务模式,通过针对某一特定领域、某一特定人群或某一特定需求提供的有一定特定人群或某一特定需求提供的有一定价值的信息和相关服务。其特点就是价值的信息和相关服务。其特点就是“专、精、深专、精、深”,且具有行业色彩,且具有行业色彩,特别特别是在医学领域。因此,人们给它一个美是在医学领域。因此,人们给它一个美名,叫做专业化的名,叫做专业化的垂直搜索垂直搜索。“一站式一站式”(All-in-One)(All-in-One)服务成为一种服务成为一种时尚。时尚。即利用最新因特网技术,将同一领域即利用最新因特网技术,将同一领域的各种载体、各种来源的资源,
9、依据一定的的各种载体、各种来源的资源,依据一定的需要,进行评价、类聚、排序、建库等,重需要,进行评价、类聚、排序、建库等,重新组合成一个效能更高的信息资源体系,实新组合成一个效能更高的信息资源体系,实现跨平台、跨数据库的信息无缝链接。检索现跨平台、跨数据库的信息无缝链接。检索时,读者在一个入口、一个检索界面,经一时,读者在一个入口、一个检索界面,经一次检索就能够获得全方位的文献资源和全面次检索就能够获得全方位的文献资源和全面的相关信息的一体化集成式服务。的相关信息的一体化集成式服务。二、网上资源分类二、网上资源分类(一)按传递空间分类(一)按传递空间分类本地数据库资源本地数据库资源异地数据库资
10、源(虚拟资源)异地数据库资源(虚拟资源)门户网站资源门户网站资源搜索引擎资源搜索引擎资源(二)按内容分类(二)按内容分类社会科学和自然科学的全部资源社会科学和自然科学的全部资源(三)按用途分类(三)按用途分类通用资源通用资源专业资源专业资源二、网上资源分类二、网上资源分类二、网上资源分类二、网上资源分类(四)按获得的方式分类(四)按获得的方式分类免费的,共享型,自由获取;免费的,共享型,自由获取;付费的,产权型,租用、购买。付费的,产权型,租用、购买。(四)网上医学资源分类(四)网上医学资源分类 1 1、生物医学数据库资源、生物医学数据库资源 1 1)文献型数据库:题录文摘数据库和全文)文献型
11、数据库:题录文摘数据库和全文数据库。数据库。2 2)数值事实型数据库:主要包括基因库、)数值事实型数据库:主要包括基因库、核酸序列、蛋白质结构库等分子生物学数据库,核酸序列、蛋白质结构库等分子生物学数据库,以及毒理学、药物方面的事实型数据库。以及毒理学、药物方面的事实型数据库。3 3)多媒体数据库:包括化学物质或药物三)多媒体数据库:包括化学物质或药物三维立体结构数据库、各种医学图谱库、医学影像维立体结构数据库、各种医学图谱库、医学影像库(库(X X线片、线片、CTCT片、核磁共振图像)、病理切片片、核磁共振图像)、病理切片库等。库等。二、网上资源分类二、网上资源分类二、网上资源分类二、网上资
12、源分类 2 2、医学会议信息资源、医学会议信息资源 3 3、医学专利信息资源、医学专利信息资源 4、电子出版物资源电子出版物资源 1 1)电子期刊;)电子期刊;2 2)电子图书;)电子图书;3 3)电子报纸。)电子报纸。5 5、医学研究机构资源,如研究院所、学协会、医学研究机构资源,如研究院所、学协会 6 6、网络医学新闻资源、网络医学新闻资源 7 7、网络医学教育信息资源、网络医学教育信息资源 主要有医学继续教育和病人教育两类资源。主要有医学继续教育和病人教育两类资源。8 8、医药市场信息资源、医药市场信息资源 9 9、生物医学软件资源、生物医学软件资源 10 10、循证医学资源、循证医学资
13、源 11 11、联机馆藏目录、联机馆藏目录 联机馆藏目录是揭示图书馆馆藏内容、提供联机馆藏目录是揭示图书馆馆藏内容、提供馆际互借、资源共享的现代化服务手段。馆际互借、资源共享的现代化服务手段。12 12、其他医学信息资源、其他医学信息资源 标准、学位论文资源;医院信息资源;科研标准、学位论文资源;医院信息资源;科研基金申请、求职信息等等。基金申请、求职信息等等。二、网上资源分类二、网上资源分类二、网上资源分类二、网上资源分类三、网上生物三、网上生物医学医学信息资源介绍信息资源介绍 1 1)南方医科大学图书馆数据库资源南方医科大学图书馆数据库资源 2)2)国家科技成果库国家科技成果库http:/
14、 3)万方数据资源系统万方数据资源系统 4)4)国家科技图书文献中心国家科技图书文献中心 5 5)中国中医药文献数据库中国中医药文献数据库 6)6)中国医药信息网中国医药信息网三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源 (一一一一)生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资源源源源(一)生物医学数据库资源(一)生物医学数据库资源1 1、专业文献型数据库与网站资源、专业文献型数据库与网站资源1 1、南方医科大学图书馆南方医科大学图书馆数据库资源数据库资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息
15、资源三、网上生物医学信息资源 (一一一一)生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资源源源源 国家科技成果网,查询科技成果的权威网站。国家科技成果网,查询科技成果的权威网站。收录全国各地区、各行业经省、市、部委认定收录全国各地区、各行业经省、市、部委认定的科技成果的科技成果3030多万项,每年新增约多万项,每年新增约3 3万项。万项。1999 1999年年6 6月向社会开放。月向社会开放。三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源 (一一一一)生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资源源源源2
16、2、国家科技成果库、国家科技成果库http:/三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源 (一一一一)生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资源源源源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源 (一一一一)生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资源源源源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源 (一一一一)生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资源源源源3、万方
17、数据资源系统、万方数据资源系统4 4、国家科技图书文献中心国家科技图书文献中心http:/http:/三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源 (一一一一)生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资源源源源l国家科技图书文献中心(国家科技图书文献中心(NSTLNSTL)20002000年年6 6月国务院批月国务院批准组建的一个虚拟的科技文献信息服务机构。准组建的一个虚拟的科技文献信息服务机构。成员成员:中科院文献情报中心、工程技术图书馆(中国科学技术信息研究中科院文献情报中心、工程技术图书馆(中国科学技术信息研究所、
18、机械工业信息研究院、冶金工业信息标准研究院、中国化工信息中心)所、机械工业信息研究院、冶金工业信息标准研究院、中国化工信息中心)、中国农业科学院图书馆、中国医学科学院图书馆。、中国农业科学院图书馆、中国医学科学院图书馆。l宗旨目标宗旨目标 统一采购、规范加工、联合上网、资源共统一采购、规范加工、联合上网、资源共享,理、工、农、医各学科领域的科技文献信息资享,理、工、农、医各学科领域的科技文献信息资源收藏和服务中心。源收藏和服务中心。l网络服务系统网络服务系统 2000 2000年年1212月月2626日开通,现已建成为一日开通,现已建成为一站式检索服务系统。站式检索服务系统。三、网上生物医学信
19、息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源 (一一一一)生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资源源源源l 该网站开通了收录近万种外文科技期刊的该网站开通了收录近万种外文科技期刊的刊名数据库、外文会议论文数据库、外文科技刊名数据库、外文会议论文数据库、外文科技图书数据库、中文会议论文数据库、图书数据库、中文会议论文数据库、近千万近千万条数据的中文学术论文数据库。条数据的中文学术论文数据库。l 24 24小时全天候联机免费检索,满足注册用小时全天候联机免费检索,满足注册用户的文献全文请求。户的文献全文请求。三、网上生物医学信息资源三、网
20、上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源 (一一一一)生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资源源源源四、数据库信息资源四、数据库信息资源四、数据库信息资源四、数据库信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源 (一一一一)生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资源源源源5、中国医药在线、中国医药在线(原(原中国中医药文献数据库)中国中医药文献数据库) 中国中医研究院
21、中医药信息研究所开发的中医药学期刊文献信息库,涵中国中医研究院中医药信息研究所开发的中医药学期刊文献信息库,涵盖国内出版的生物医学及其它相关期刊千余种,收录了盖国内出版的生物医学及其它相关期刊千余种,收录了19841984年以来的中医药年以来的中医药文献题录文献题录5353余万篇,其中余万篇,其中505070%70%附有文摘。覆盖中医中药各个方面。数据附有文摘。覆盖中医中药各个方面。数据库每季度更新一次,每年约增加文献库每季度更新一次,每年约增加文献4 4万篇。万篇。三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源 (一一一一)生物医学数据库资生
22、物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资源源源源6 6、中国医药信息网中国医药信息网http:/三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源 (一一一一)生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资源源源源l 中国医药信息网由国家药品监督管理局主管、中国医药信息网由国家药品监督管理局主管、国家药品监督管理局信息中心主办的全国医药综合国家药品监督管理局信息中心主办的全国医药综合信息服务网站,面向全国医药行业联机查询。信息服务网站,面向全国医药行业联机查询。l 涵盖:药品监督管理、药品、医疗器械、药学涵盖:药品监督管理、
23、药品、医疗器械、药学文献、医药专利、医药进出口、医药包装以及国内文献、医药专利、医药进出口、医药包装以及国内国际医药经贸、科研教育、医药企业和产品等各个国际医药经贸、科研教育、医药企业和产品等各个方面。方面。l 提供医药数据库、中国医疗器械信息服务数据提供医药数据库、中国医疗器械信息服务数据库查询与检索服务。库查询与检索服务。三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源 (一一一一)生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资源源源源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信息资源三、网上生物医学信
24、息资源 (一一一一)生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资生物医学数据库资源源源源 基因库、核酸序列库、蛋白质结构库等数值型数据库,基因库、核酸序列库、蛋白质结构库等数值型数据库,以及毒理学和药物方面的事实型数据库:以及毒理学和药物方面的事实型数据库:Protein NucleotideProtein Nucleotide Structure Genome Structure Genome CancerChromosomesCancerChromosomes Conserved Domains(Conserved Domains(保守保守 Gene Gene 性结构域性结构域)GEO
25、 Datasets GEO ProfilesGEO Datasets GEO Profiles OMIM OMIM HomoloGeneHomoloGene PubChemPubChem BioAssayBioAssay PMC PMC PubChemPubChem Substance Substance PubChemPubChem Compound Compound SNP Taxonomy SNP Taxonomy UniGeneUniGene UniSTSUniSTS 这些数据库都属于美国国家生物技术信息中心这些数据库都属于美国国家生物技术信息中心(NCBI)NCBI)的的Entrez
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