肺结节超高分辨率CT靶扫描影像组学联合机器学习在原位腺癌与微浸润腺癌鉴别中的价值.pdf
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1、临床研究1294浙江临床医学2023年9月第25卷第9期肺结节超高分辨率CT靶扫描影像组学联合机器学习在原位腺癌与微浸润腺癌鉴别中的价值胡栩晟 郭艺帆 李鲁 陈晓珺*【摘要】目的 基于肺结节超高分辨率CT(UHRCT)靶扫描影像组学特征,分别采用Logistic回归(LR)和支持向量机(SVM)构建机器学习模型,以鉴别磨玻璃结节(GGN)中的原位腺癌(AIS)和微浸润腺癌(MIA)。方法 回顾性分析手术病理证实肺腺癌的198例患者(AIS56例;MIA142例),按分层抽样将患者随机分为训练组(n=138)和验证组(n=60)。手动分割GGN,从中提取影像组学特征。采用最小冗余最大相关性算法和
2、套索算法对影像组学特征进行降维,分别使用LR和SVM构建预测模型。采用受试者操作特征(ROC)曲线评价模型的预测性能。结果 在训练组中,LR和SVM曲线下面积(AUC)分别为0.787(95%CI:0.7120.863)和0.896(95%CI:0.8420.951)。在验证组中,LR和SVM的AUC分别为0.824(95%CI:0.7130.936)和0.839(95%CI:0.7340.945)。结论 基于肺结节UHRCT靶扫描影像组学结合机器学习能较好鉴别AIS与MIA,为患者GGN个性化分析提供潜在方法。【关键词】肺结节 影像组学 超高分辨率CT 靶扫描【Abstract】Object
3、ive Todiscriminatebetweenadenocarcinomainsitu(AIS)andminimallyinvasiveadenocarcinoma(MIA)withinground-glassnodules(GGN),machinelearningmodelswereconstructedusinglogisticregression(LR)andsupportvectormachine(SVM)basedonradiomicsfeaturesextractedfromultra-high-resolutionCT(UHRCT)targetscanimages.Metho
4、ds 198patientswithsurgicallyandpathologicallyconfirmedlungadenocarcinomawereretrospectivelyincluded(AIS56cases;MIA142cases),patientswererandomlydividedintoatraininggroup(n=138)andavalidationgroup(n=60)accordingtostratifiedsampling.ManuallysegmentedtheGGNandextractedtheradiomicsfeaturesfromit.Themini
5、mumredundancyandmaximumrelevancealgorithmandtheLassoalgorithmwereusedtoreducethedimensionalityoftheradiomicsfeatures,andthepredictionmodelwasconstructedusingLRandSVMrespectively.Thepredictiveperformanceofthemodelwasevaluatedbyreceiveroperatingcharacteristic(ROC)curve.Results Inthetraininggroup,thear
6、eaunderthecurve(AUC)ofLRandSVMwere0.787(95%CI:0.7120.863)and0.896(95%CI:0.8420.951),respectively.Inthevalidationgroup,theAUCofLRandSVMwere0.824(95%CI:0.7130.936)and0.839(95%CI:0.7340.945),respectively.Conclusion UHRCTtargetscanofpulmonarynodules-basedradiomicscombinedwithmachinelearningcanidentifyAI
7、SandMIAwell,providingapotentialmethodforGGNpersonalizedanalysisinpatient.【Key word】Pulmonarynodule Radiomics UltrahighresolutionCT Targetscan2021 年 WHO 对肺腺癌进行重新分类,取消了2015 年浸润前病变和浸润性病变的概念,将不典型腺瘤增生(atypicaladenomahyperplasia,AAH)、原位腺癌(adenocarcinomainsitu,AIS)归类为腺体前驱病变,腺癌则包括微浸润腺癌(minimallyinvasiveaden
8、ocarcinoma,MIA)和侵袭性腺癌(invasiveadenocarcinoma,IAC)1。MIA 病理表现为肿瘤组织穿透基底膜,浸润纤维间质,肿瘤细胞分层表现2-4,应归为肺腺癌。临床实践中,通过肺结节超高分辨率CT(ultrahighresolutioncomputedtomography,UHRCT)靶扫描能够细致观察磨玻璃结节(ground-glassnodule,GGN)结节外观形态特征,进而诊断肺结节良恶性。该检查技术具有小视野、多矩阵、小间距等特点5,但目前在独立鉴别 AIS 和 MIA 中的价值有限6。影像组学可定量分析并提取医学图像中肉眼无法识别的潜在定量特征,通过
9、机器学习方法构建相关预测模型以达到疾病诊断、疗效或预后预测等目的7。在本研究基于肺结节 UHRCT 靶扫描,从 GGN中提取影像组学特征,构建 Logistic 回归(LR)和支持向量机(SVM)模型用于鉴别 AIS 和 MIA。1 资料与方法1.1 临床资料 回顾性分析 2018 年 112 月 198 例经手术治疗并病理证实为 AIS 或 MIA 的 GGN 患者。纳入标准:胸部 CT 发现孤立性 GGN(包括纯 GGN 和部分实性结节),并接受肺结节 UHRCT 靶扫描;术前无化疗、放疗或远处转移;无其他恶性肿瘤病史;肺结节 UHRCT 靶扫描 DICOM 格式数据完整。排除标准:同一肺
10、叶存在多个 GGN;GGN 伴有空洞或实性结节;CT 检查前行肺恶性肿瘤活检;肺结节UHRCT 靶扫描图像中存在呼吸运动伪影。根据分层抽样,以 7 3 将所有患者划分为训练组和验证组。1.2 图像采集 应用飞利浦 Brilliance64CT 机进行肺结节 UHRCT 靶扫描成像。患者取仰卧位,扫描时保持深吸气。扫描参数如下:探测器准直 0.625mm6mm;螺距 0.64;管电压 120kV;管电流 300mA;重建层厚、层间距均为0.67mm;FOV250mm;矩阵=1,0241,024;重构卷积函数为 A。基金项目:金华市科技重点项目(2021-3-041)作者单位:310003 浙江省
11、中医院(胡栩晟 郭艺帆)321099 浙江省金华市中心医院(李鲁 陈晓珺)*通信作者1295浙江临床医学2023年9月第25卷第9期1.3 GGN 标注 GGN 感兴趣区域(ROI)分割在 ITK-SNAP3.6.0(www.itksnap.org)上完成。在轴位图像上,沿着 GGN 的轮廓进行手动描绘(见图 1),最终获得整个 GGN的 3D-ROI。由 1 名具有 5 年胸部 CT 诊断经验的放射科医师经培训后完成所有 GGN 的 ROI 标注。在1 个月后,由上述医师和另一名具有 10 年胸部 CT 诊断经验的放射科医师再次对所有患者进行标注,用于评估观察者内和观察者间的一致性。若影像组
12、学特征的组内和组间相关系数(ICC)均 0.75 则认为具有较好的可信度。注:A.图像放大并显示边缘,B.进行逐层勾画图1 肺结节勾画示意图1.4 影像组学特征提取 将 GGN 的 CT 图像和相应标注导入 AK 软件(AnalysisKit,GEHealthcare,US)进行特征提取,可分为以下几大类:一阶特征,形状特征,灰度共生矩降,灰度尺寸区域矩阵,灰度游程度矩阵,邻域灰度差矩阵,灰度相关矩阵。见 PyRadiomics文档(http:/pyradiomics.readthedocs.io)。1.5 特征选择和模型构建 筛选出组内和组间 ICC 均0.75 的影像组学特征。采用最小冗余
13、度和最大相关性(mRMR)算法对这些特征进行排序,获取相关度最高的前 20 个特征。采用套索(LASSO)算法进一步筛选剩余影像组学特征。采用LR和SVM从中选择与分类结果最相关的特征并计算相应的系数,构建用以鉴别 AIS和 MIA 的机器学习模型。1.6 统计学分析 采用 R 软件(版本 3.5.0)。计量资料以(xs)表示,用 Mann-WhitneyU 检验,计数资料以 n(%)表示,用 2检验。对机器学习模型进行受试者操作特征(ROC)分析,并计算曲线下面积(AUC)。基于 Youden 指数计算模型的准确性、敏感性、特异性、阳性预测值(PPV)和阴性预测值(NPV)。P0.75 的影
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