丁酰胆碱酯酶在胃癌中的预后价值及其生物学功能分析.pdf
《丁酰胆碱酯酶在胃癌中的预后价值及其生物学功能分析.pdf》由会员分享,可在线阅读,更多相关《丁酰胆碱酯酶在胃癌中的预后价值及其生物学功能分析.pdf(10页珍藏版)》请在咨信网上搜索。
1、基金项目国家自然科学基金(82273196)通信作者(Corresponding author),Email:zhaowei_.丁酰胆碱酯酶在胃癌中的预后价值及其生物学功能分析何继凯1,瞿文豪2,贾佳琦1,杨小兵3,王彬3,贾立周2,黄衍强1,赵薇3*1右江民族医学院研究生院,广西百色533000;2巴彦淖尔市医院中心实验室,内蒙古巴彦淖尔015000;3南京医科大学附属南京医院病理科,江苏南京210006摘要 目的:探究丁酰胆碱酯酶(bcylcholinesterase,BCHE)在胃癌(gastric cancer,GC)中的预后价值,验证和分析BCHE对胃癌细胞生物学功能的影响。方法:采
2、用Lasso回归法筛选预后基因,并利用卡方检验验证BCHE表达水平与临床病理参数之间的关系;利用TIMER2.0数据库和CIBERSORT算法研究BCHE和免疫细胞浸润之间的相关性,WGCNA算法和DAVIDBioinformatics Resources数据库进行富集分析;qRTPCR检测正常人胃上皮细胞系(GES1)及人胃癌细胞系(HGC27和MKN1)中BCHE的表达情况;在HGC27和MKN1细胞系中瞬时转染小干扰RNA敲减BCHE后,利用CCK8和克隆形成实验检测细胞增殖能力,黏附实验检测细胞黏附能力,Transwell和划痕实验检测细胞迁移、侵袭能力等功能变化情况。结果:利用Las
3、so回归分析筛选出15个与GC患者预后相关的基因,其中BCHE具有最佳的预测价值;进一步分析表明BCHE在胃癌组织中的表达水平显著高于其在癌旁组织中的表达水平,且BCHE在肿瘤细胞中的表达与免疫细胞浸润密切相关。富集分析结果显示BCHE高表达与细胞增殖、细胞迁移和细胞黏附等有关。体外实验进一步证实降低BCHE的表达显著抑制胃癌细胞系的恶性生物学功能。结论:BCHE可作为GC的预后生物标志物,且可促进肿瘤内免疫细胞浸润;此外,降低BCHE表达可抑制其介导的恶性生物学功能。关键词 BCHE;胃癌;预后;肿瘤浸润免疫细胞中图分类号 R735.2文献标志码 A文章编号 10074368(2023)10
4、135610doi:10.7655/NYDXBNS20231004The prognostic value and biological functions of butyrylcholinesterase in gastric cancerHE Jikai1,QU Wenhao2,JIA Jiaqi1,YANG Xiaobing3,WANG Bin3,JIA Lizhou2,HUANG Yanqiang1,ZHAO Wei3*1Graduate School of Youjiang Medical University for Nationalities,Baise 533000;2Cent
5、ral Laboratory,BayannurHospital,Bayannur 015000;3Department of Pathology,the Affiliated Nanjing Hospital of Nanjing MedicalUniversity,Nanjing 210006,ChinaAbstract Objective:This study aims to explore the prognostic value of butyrylcholinesterase(BCHE)in gastric cancer(GC)andanalyze its impact on the
6、 biological functions of gastric cancer cells.Methods:Firstly,Lasso regression method was used to screenprognostic genes,and the relationships between BCHE expression levels and clinical pathological parameters were verified usingchisquare test.In addition,TIMER 2.0 database and CIBERSORT algorithm
7、were utilized to investigate the correlation betweenBCHE and immune cell infiltration,and enrichment analysis was performed using WGCNA algorithm and DAVID BioinformaticsResources database.Finally,the expression levels of BCHE in normal gastric epithelial cell line(GES1)and gastric cancer cell lines
8、(HGC27 and MKN1)were detected by realtime qPCR.Following transient transfection of small interfering RNA was conducted toknockdown the expression of BCHE in HGC27 and MKN1 cell lines.Cell proliferation was detected by CCK8 and colony formationassay.Cell adhesion ability was detected by adhesion assa
9、y.Cell migration and invasion were detected by transwell and scratch assay.Results:Fifteen genes related to the prognosis of GC patients were screened out using Lasso regression analysis.Among them,BCHEhas the best predictive value.Further analysis indicated that the expression level of BCHE in GC t
10、issues was higher than those in theadjacent tissues or healthy controls,while the expression of BCHE in tumor cells was closely related to immune cell infiltration related基础研究南京医科大学学报(自然科学版)Journal of Nanjing Medical University(Natural Sciences)第43卷第10期2023年10月1356molecules.Enrichment analysis showe
11、d that the high expression of BCHE was related to cell proliferation,migration and adhesion.Theresults of in vitro experiments further confirmed that reducing the expression of BCHE significantly inhibited the malignant biologicalfunction of gastric cancer cell line.Conclusion:BCHE serve as a progno
12、stic biomarker for GC and can promote immune cellinfiltration in tumors.In addition,reducing the expression of BCHE can inhibit its mediated malignant biological function.Key words BCHE;gastric cancer;prognosis;tumorinfiltrating immune cellJ Nanjing Med Univ,2023,43(10):13561365GC(gastric cancer,GC)
13、是全球第5大癌症,死亡率居全球第4位1-2。目前,GC的治疗方法主要包括手术、放疗和化疗,但术后局部复发或远处转移的发生率超过40%3。此外,放疗和化疗后会出现明显的不良反应,导致晚期GC患者的5年生存率仅约20%4-5。因此,寻找GC新的治疗和预后靶点以提高患者的生存率,已成为一项迫切的公共卫生问题。为筛选出与GC预后相关的基因,本研究采用多种分析方法发现,在GC中丁酰胆碱酯酶(bcylcholinesterase,BCHE)具有良好的预后价值。BCHE是一种由肝脏合成并分泌到血液中的血浆酶,主要表达于外泌体和内质网6,其半衰期约为 12 d,参考值为5 90013 200 U/L7-8。研
14、究表明,口腔癌和乳腺癌患者血清中BCHE 的表达水平明显升高9-10。然而,BCHE 基因在GC中的表达水平、调控机制,以及与临床治疗和预后的相关性仍不清楚。1材料和方法1.1材料本研究的GC患者临床病理信息和基因转录组数据都来源于UCSC Xena数据库的肿瘤基因组图谱(TCGA)11。人GC细胞系HGC27、MKN1和人正常胃上皮细胞系GES1(武汉普诺赛生命科技有限公司)。qRTPCR试剂(南京诺唯赞生物科技股份有限公司);小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)(上海吉玛制药技术有限公司);Lipo6000、CCK8试剂(上海碧云天生物公司);基质凝胶(厦
15、门模基生物科技有限公司)。1.2方法1.2.1生信数据处理首先使用Lasso回归筛选预后基因12,并采用KaplanMeier生存曲线和单因素、多因素Cox回归分析BCHE基因表达在GC中的预后价值;其次采用卡方检验验证BCHE mRNA与临床病理参数之间的关系,使用TIMER2.0数据库(https:/cistrome.shinyapps.io/timer/)13和 CIBERSORT 算法研究 BCHE 和免疫细胞浸润之间相关性,此外,利用 WGCNA 算法和DAVID Bioinformatics Resources数据库(https:/david.ncifcrf.gov/)14对BCH
16、E基因进行Gene Ontology(GO)和 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)分析。1.2.2qRTPCR使用细胞 RNA 提取试剂盒提取人 GC 细胞HGC27、MKN1和人正常胃上皮细胞GES1的RNA,再用逆转录试剂将RNA逆转录成cDNA,以GAPDH作为内参对BCHE进行qRTPCR扩增。BCHE R:5TGTTGCAGAGAATCGGAAATCAA3,F:5CCCAATAAGCATGCAGAGCA3。GAPDH R:5GAAGGTGAAGGTCGGAGTC3,F:5GGCTGTTGTCATACTTCTCATGG3。采用2-
17、Ct计算相对表达量。1.2.3细胞转染利用siRNA靶向敲减BCHE基因。将细胞分为对照组、空载组(siNC)和实验组(siBCHE),收集处理后的HGC27和MKN1细胞,并配制成2105个/mL的细胞悬液,铺入6孔板中,每孔2 mL。培养24 h后,每孔滴加7.5 L Lipo6000和7.5 L siRNA,在培养箱中培养48 h后进行下一步实验。1.2.4CCK8和克隆形成实验CCK8 实验:收集处理后的 HGC27 和 MKN1细胞,并配制成2104个/mL的细胞悬液,铺入96孔板中,每孔100 L,分别在24、48、72、96 h后加入10 L CCK8试剂,在37 下孵育2 h后
18、检测450 nm的吸光度值。克隆形成实验:收集处理后的HGC27和MKN1细胞,并配制成1103个/mL的细胞悬液,铺入6孔板中,每孔1 mL,观察到克隆体的外观后使用甲醛固定细胞,再用1%结晶紫对细胞进行染色,最后PBS洗涤3次并拍照。1.2.5细胞黏附实验96孔板每孔加入100 L的1 4基质凝胶,凝胶第43卷第10期2023年10月何继凯,瞿文豪,贾佳琦,等.丁酰胆碱酯酶在胃癌中的预后价值及其生物学功能分析 J.南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(10):1356-13651357南京医科大学学报第43卷第10期2023年10月ABCDEF182421021226418330
19、521P=0.002HR=1.89,95CI%:1.252.880306090120低高疾病特异性生存率(%)低表达组(n=203)高表达组(n=204)时间(月)151050癌(n=407)P0.001癌旁(n=143)/期(n=159)/期(n=182)P=0.020BCHE mRNA表达水平11931721116120224111220306090120低高低表达组(n=120)高表达组(n=121)P=0.004HR=2.48,95CI%:1.314.69时间(月)1953152119442102121660306090120低高低表达组(n=203)高表达组(n=204)100755
20、0250总生存率(%)时间(月)P 0.001HR=1.77,95CI%:1.282.401944910212264194255210306090120低高P=0.001HR=1.77,95CI%:1.252.51低表达组(n=203)高表达组(n=204)时间(月)log2221 201 184 152 131 95 63 42 26 21 15 8 3 3 00.750.650.550.45-5.5-5.0-4.5-4.0-3.5-3.0部分似然偏差A:Lasso回归模型筛选GC预后相关基因;B:生存曲线分析BCHE表达与GC患者的总生存期情况;C:生存曲线分析BCHE表达与GC患者疾病无
21、进展生存期情况;D:生存曲线分析BCHE表达与GC患者疾病特异性生存期情况;E:生存曲线分析BCHE表达与GC患者无病生存期情况;F:BCHE mRNA在癌/癌旁组织和早期(/)/晚期(/)GC患者癌组织中的表达水平。图1BCHE mRNA在GC中的表达水平及相关生存分析Figure 1The expression of BCHE mRNA and related survival analysis in GC凝固后,收集处理过的HGC27和MKN1细胞,并配制成1105个/mL的细胞悬液,铺入96孔板中,每孔100 L,随后置于细胞培养箱中孵育2、4和8 h,PBS洗涤3次后,更换新的培养基
22、后进行CCK8检测。1.2.6迁移和侵袭实验迁移实验:收集处理后的 HGC27 和 MKN1 细胞,并配制成2105个/mL的细胞悬液,铺入6孔板中,每孔2 mL,24 h后使用灭菌的200 L枪头垂直于6孔板底部横线划线,更换无血清培养基,分别在0、12、24 h后使用荧光倒置显微镜拍照。侵袭实验:收集处理后的HGC27和MKN1细胞,并配制成1106个/mL 的无血清细胞悬液,将细胞加入铺有1 8基质凝胶的Transwell上层小室中,每孔100 L。小室的底部加入500 L 20的血清培养基。培养48 h后,使用甲醛固定细胞,再用0.1%结晶紫对细胞进行染色,最后PBS洗涤3次并拍照。1
23、.3统计学方法所有统计分析都使用 R 软件(4.1.2 版本)和GraphPad Prism 8进行,符合正态分布的数据资料以均数标准差(x s)表示,两组间比较采用独立样本t检验,多组间比采用单因素方差分析,组间两两比较采用LSDt检验。根据中位数将BCHE mRNA在GC组织中的表达水平分为高表达组和低表达组15-18。生存分析采用 KaplanMeier 法并进行 logrank 检验。使用R包“forestplot”进行单因素和多因素Cox回归分析,并将单因素分析中差异具有统计学意义(P 0.05)的变量纳入多因素分析。BCHE表达高低与临床病理参数的关系采用卡方检验。P 0.05为差
24、异有统计学意义,每组实验重复3次。2结果2.1BCHE与GC患者预后及临床病理参数的关联性分析首先通过Lasso回归分析筛选出15个与GC患者 总 生 存 期(overall survival,OS)有 关 的 基 因:BCHE、GPX3、ADAMTS18、ASPA、CD36、SERPINE1、CYP19A1、LRAT、CGB5、ANO3、SOX14、CYMP、CFHR4、F13B和OTX2(图1A);其次,根据生存曲线分析筛选出影响预后差异最显著的基因BCHE(P 0.001,图1B),且发现BCHE mRNA高表达的GC患者无进展生存期(P=0.001)、疾病特异性生存期(P=0.002)
25、和无病生存期(P=0.004)更短(图1CE)。进一步分析发现,BCHE mRNA在肿瘤组织中的表达水平高于癌旁组织(P 0.001),同时 BCHEmRNA在晚期GC(/期)患者中的表达水平高于早期 GC(/期)患者(P=0.020,图 1F)。根据BCHE mRNA在GC组织中表达水平的中位数将患者分为高表达组和低表达组,分析BCHE mRNA的表达与GC患者临床病理学参数之间的关系。结果表明,BCHE mRNA 的高表达与 T 分期(P=0.029)、1007550250无病生存率(%)1007550250无进展生存率(%)10075502501358表1BCHE mRNA与GC患者临床
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 胆碱酯酶 胃癌 中的 预后 价值 及其 生物学 功能分析
1、咨信平台为文档C2C交易模式,即用户上传的文档直接被用户下载,收益归上传人(含作者)所有;本站仅是提供信息存储空间和展示预览,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对上载内容不做任何修改或编辑。所展示的作品文档包括内容和图片全部来源于网络用户和作者上传投稿,我们不确定上传用户享有完全著作权,根据《信息网络传播权保护条例》,如果侵犯了您的版权、权益或隐私,请联系我们,核实后会尽快下架及时删除,并可随时和客服了解处理情况,尊重保护知识产权我们共同努力。
2、文档的总页数、文档格式和文档大小以系统显示为准(内容中显示的页数不一定正确),网站客服只以系统显示的页数、文件格式、文档大小作为仲裁依据,个别因单元格分列造成显示页码不一将协商解决,平台无法对文档的真实性、完整性、权威性、准确性、专业性及其观点立场做任何保证或承诺,下载前须认真查看,确认无误后再购买,务必慎重购买;若有违法违纪将进行移交司法处理,若涉侵权平台将进行基本处罚并下架。
3、本站所有内容均由用户上传,付费前请自行鉴别,如您付费,意味着您已接受本站规则且自行承担风险,本站不进行额外附加服务,虚拟产品一经售出概不退款(未进行购买下载可退充值款),文档一经付费(服务费)、不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
4、如你看到网页展示的文档有www.zixin.com.cn水印,是因预览和防盗链等技术需要对页面进行转换压缩成图而已,我们并不对上传的文档进行任何编辑或修改,文档下载后都不会有水印标识(原文档上传前个别存留的除外),下载后原文更清晰;试题试卷类文档,如果标题没有明确说明有答案则都视为没有答案,请知晓;PPT和DOC文档可被视为“模板”,允许上传人保留章节、目录结构的情况下删减部份的内容;PDF文档不管是原文档转换或图片扫描而得,本站不作要求视为允许,下载前自行私信或留言给上传者【自信****多点】。
5、本文档所展示的图片、画像、字体、音乐的版权可能需版权方额外授权,请谨慎使用;网站提供的党政主题相关内容(国旗、国徽、党徽--等)目的在于配合国家政策宣传,仅限个人学习分享使用,禁止用于任何广告和商用目的。
6、文档遇到问题,请及时私信或留言给本站上传会员【自信****多点】,需本站解决可联系【 微信客服】、【 QQ客服】,若有其他问题请点击或扫码反馈【 服务填表】;文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“【 版权申诉】”(推荐),意见反馈和侵权处理邮箱:1219186828@qq.com;也可以拔打客服电话:4008-655-100;投诉/维权电话:4009-655-100。